Nano, Bio, Info y Cogno - IBERO-NBIC @ Inicio
Transcripción
Nano, Bio, Info y Cogno - IBERO-NBIC @ Inicio
Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC) Conceptos y Aplicaciones. Redes CYTED NANOROADMAP e IBERO-NBIC JORDI AGUILÓ LLOBET ALBERT FIGUERAS DAGÀ ANA MARÍA FREIRE VEIGA DIANA DE LA IGLESIA JIMÉNEZ FERNANDO MARTÍN SÁNCHEZ ALEJANDRO PAZOS SIERRA 2011 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). FICHA EDITORIAL AGUILÓ LLOBET, Jordi FIGUERAS DAGÀ, Albert FREIRE VEIGA, Ana María DE LA IGLESIA JIMÉNEZ, Diana MARTÍN SÁNCHEZ, Fernando PAZOS SIERRA, Alejandro Autores: Diana de la Iglesia, Fernando Martín, Ana Freire, Alejandro Pazos, Julián Dorado, Albert Figueras, Victoria López, Guillermo López, Raúl Isea, Joel P. Arrais, Sérgio Matos, José L. Oliveira, Víctor Maojo, Miguel García Remesal, Álvaro Margolis, Antonio López, Vanessa Aguiar, Juan R. Rabuñal, Sonia Benítez, Daniel Luna, Paula Otero, Fernán Quirós, María D. Pérez, Walter E. Triaca, Gustavo Andreasen, Consuelo Montes, Tomás Vargas, Irán David, Ana B. Porto, Javier Pereira. Ilustración y Maquetado: Ana María Freire Veiga. ISBN: 978-84-15413-00-4 Reservados todos los derechos. De conformidad con lo dispuesto en el artículo 534 bis del Código Penal vigente, podrán ser castigados con penas de multa y privación de libertad los que, sin la preceptiva autorización, reprodujeran o plagiaran, en todo o en parte, una obra literaria, artística o científica fijada en cualquier tipo de soporte. Edita Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED) Amaniel, 4 - 28015 Madrid Tel.: 91 5316213 Fax: 91 5227845 [email protected] www.cyted.org Copyright: Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED) Imprime: Tórculo, Artes Gráficas. A Coruña I.S.B.N.: 978-84-15413-00-4 Depósito Legal.: C 2375-2011 3 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). PRÓLOGO Este libro surge con el afán de aportar diversas perspectivas de investigación centradas en los cuatro pilares NBIC: Nanotecnología, Biotecnología, Tecnologías de la Información y las Comunicaciones y Tecnologías del Conocimiento. Cada uno de los capítulos que se integran en este libro se asocia a una o varias de estas disciplinas, de modo que queda patente la sinergia existente entre ellas y la necesidad de la mutidisciplinariedad para abordar problemas complejos. Las tecnologías NBIC son uno de los principales aportes al desarrollo del panorama científico y tecnológico actual. Por su actualidad e importancia, resulta imprescindible su divulgación a todos los ámbitos de la sociedad, para que conozca y tome conciencia del surgimiento de estas nuevas tecnologías y del potencial de su uso conjunto para mejorar el bienestar de las personas, sobre todo en lo referente al ámbito de la calidad de vida y a la salud personal y poblacional. Ese es, precisamente, uno de los objetivos prioritarios de CYTED al apoyar las Redes NanoRoadmap e Ibero-NBIC. En la portada de este libro, compendio de las aportaciones científicas de los grupos participantes en el workshop de las redes Ibero-NBIC y NanoRoadmap 5 que tuvo lugar Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). recientemente en la península de Yucatán, tierra de los Mayas, figuran 4 vértices dobles de imágenes. Los dibujos interiores representan los dioses Bacab, pertenecientes a la mitología maya, que representaban los cuatro puntos cardinales. Siguiendo la orientación de cada uno de estos dioses, aparecen otros cuatro símbolos que representan los cuatro pilares NBIC: Nanotecnología, Biotecnología, Tecnologías de la Información y las Comunicaciones y Tecnologías del Conocimiento, que serían los puntos cardinales de la Ciencia actual para avanzar en la solución de problemas complejos y concretos en el ámbito de la salud, como pueden ser el cáncer, las patologías neuropsiquiátricas, las patologías cardiovasculares, etc. Adentrándose en los capítulos del libro, el lector podrá hacer un recorrido por algunos de los aspectos de las tecnologías NBIC, desde una perspectiva de I+D y, sobre todo, educativa o formadora y divulgadora. En los primeros capítulos, se ha realizado un recorrido por algunas aplicaciones de la Nanotecnología: conversión electroquímica de energía en base a hidrógeno, aplicaciones fotovoltaicas y tratamiento de aguas residuales. 6 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). En los capítulos centrales, del cuarto al séptimo, se hace una exposición de los cuatro pilares NBIC y las sinergias entre ellos con aplicaciones en el ámbito de la salud, desde la perspectiva de generación de información y conocimiento Informática biomédica en nanomedicina mediante minería de textos y extracción de información mediante computación evolutiva, integración de datos y acceso a recursos, etc. También se presenta una aplicación específica referente al problema de la malaria y posibles candidatos a combatirla mediante la búsqueda computacional de proteínas antigénicas. Para finalizar, los capítulos noveno y décimo nos presentan la experiencia del Hospital Italiano de Buenos Aires poniendo en práctica proyectos de integración de información molecular y la propuesta desde el sector empresarial, en concreto desde la empresa uruguaya Evimed, de estrategias de formación y divulgación de estas tecnologías convergentes. Considero que este documento presenta una amplia, aunque obviamente incompleta, y didáctica panorámica de la potencialidad de estas tecnologías emergentes. Y no solo se queda en el mundo de lo posible, sino que también da cuenta el documento de aplicaciones actuales que ya presentan importantes utilidades prácticas. 7 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Espero que sea del agrado de los lectores y que sirva para dar a conocer algunas de las oportunidades que ofrecen estas nuevas tecnologías a todos los colectivos implicados: profesionales, usuarios, directivos de las empresas, dirigentes políticos y a todos los sectores de la sociedad que, más pronto que tarde, verán como estas tecnologías entrarán inexorablemente en el mundo de lo cotidiano para ayudarnos en muchas de las facetas de nuestro quehacer diario. Fernando Aldana Secretario General del Programa CYTED 8 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). TABLA DE CONTENIDOS Capítulo 1 Nanotecnología en energía: aplicaciones fotovoltaicas ......... 13 María D. Pérez, Centro Atómico Constituyentes (Argentina). Capítulo 2 La Nanotecnología En La Conversión Electroquímica De Energía En Base A Hidrógeno ....................................................... 35 Walter E. Triaca y Gustavo A. Andreasen, Universidad Nacional de La Plata-CONICET (Argentina). Capítulo 3 Remediación de aguas residuales mediante el uso de Nanotecnología ............................................................................. 77 Consuelo Montes et col., Universidad de Antioquía (Colombia). Capítulo 4 La Informática Biomédica como camino crítico para conseguir la Convergencia de Tecnologías NBIC en Salud ....................... 99 Victoria López et col., Instituto de Salud Carlos III (España). 9 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Capítulo 5 Informática Biomédica en Nanomedicina: Minería de textos, Integración de Datos y Acceso a Recursos ............................. 121 Víctor Maojo et col. Universidad Politécnica de Madrid (España). Capítulo 6 Búsqueda computacional de proteínas antigénicas candidatas para el diseño de vacuna contra la malaria ...... 139 Raúl Isea, Instituto de Estudios Avanzados (Venezuela). Capítulo 7 Extracción de información mediante comput. evolutiva ....... 157 Ana Freire et col., Universidad de A Coruña (España). Capítulo 8 Integração de dados biomédicos ............................................. 185 Joel P. Arrais et col., Universidade de Aveiro (Portugal). 10 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Capítulo 9 Proyectos de integración de información molecular en un Hospital académico .................................................................... 225 Sonia Benítez et col., Hospital Italiano de Buenos Aires (Argentina). Capítulo 10 Comunidades de práctica: estrategia para la generación y diseminación de conocimiento científico ................................ 253 Álvaro Margolis y Antonio Lµpez, EviMed (Uruguay). 11 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). NANOTECNOLOGÍA EN ENERGÍA: APLICACIONES FOTOVOLTAICAS María Dolores Pérez E-mail: [email protected] CONICET Comisión Nacional de Energía Atómica – Centro Atómico Constituyentes 1.1 INTRODUCCIÓN Las energías sustentables serán las protagonistas del desarrollo energético global en una sociedad responsable de sus recursos naturales. Las fuentes de energía que utilicen combustibles limpios y renovables son la esperanza para reducir el impacto ambiental asociado a un creciente consumo de energía. En una proyección conservadora, considerando sólo el crecimiento poblacional y sin tomar en cuenta el consumo de las economías emergentes, se estima que la demanda eléctrica llegará a 30 terawatts, para el año 2050 (1 terawatt (TW) = 1012 Watts = 1012 J/s ), es decir que aumentará casi al doble del consumo actual. La demanda energética es hoy en día satisfecha principalmente por energías que utilizan combustibles fósiles (no renovables) con 13 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). alto porcentaje de emisiones contaminantes, de manera que un aumento de la producción energética tendría consecuencias ambientales gravísimas para la salud de nuestro planeta. Es por esto que el desafío primordial de los años por venir es la implementación de energías alternativas que reduzcan el impacto ambiental. El sol constituye la mayor fuente de energía del planeta tierra. La superficie terrestre recibe en una hora tanta energía lumínica proveniente del sol como la energía consumida anualmente en todo el planeta (~ 14 TW/h). La energía solar puede satisfacer las crecientes necesidades energéticas humanas de manera sostenible, segura y limpia con balance cero de emisiones de carbono. Sin embargo, no es aún una fuente eléctrica de consumo masivo debido a la elevada relación costo-eficiencia de las tecnologías existentes. Por ejemplo, las instalaciones de alta eficiencia de conversión solar necesarias para abastecer el consumo hogareño son altamente costosas, con una recuperación de la inversión a largo plazo que resulta privativo para muchos sectores que no cuenten con subsidios estatales. Es imperativo que la ciencia desarrolle nuevos materiales y estudie las reacciones y procesos que permitan que la energía solar sea económicamente accesible de modo de penetrar en los mercados globales y así reemplazar las actuales energías 14 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). contaminantes. En este sentido, la nanotecnología presenta un escenario de oportunidades únicas para el desarrollo de sistemas fotovoltaicos altamente eficientes y de muy bajos costos. La nanotecnología ofrece la posibilidad de desarrollar materiales mínimamente tóxicos que aprovechen eficientemente las materias primas utilizando muy poco material, a la vez que se reducen los costos de producción y se incrementan las eficiencias energéticas. Asimismo permite imaginar la utilización de sistemas solares en múltiples y novedosas aplicaciones, como ser aquellos que involucren sustratos livianos y flexibles (plásticos, telas, etc.) o integrados a la construcción. 1.2 ENERGÍA SOLAR FOTOVOLTAICA Las tecnologías de conversión fotovoltaica se han clasificado según tres clases, las de primera, segunda y tercera generación (Fig. 1).1 La primera, basada en silicio cristalino, presenta eficiencias relativamente altas (hasta un 25% a nivel laboratorio) y gran estabilidad. Sin embargo, los costos de producción son aún relativamente elevados. Es la tecnología de más larga data y con mayor capacidad instalada debido a que la elevada eficiencia sumada a la robustez y estabilidad de los paneles han permitido su dominio del mercado a pesar de los altos costos. 15 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 1: Análisis de la relación costo-eficiencia para las distintas generaciones de tecnologías fotovoltaicas. Reproducido de Ref. 1 La segunda generación de celdas fotovoltaicas, de desarrollo más reciente que la anterior, presentan eficiencias de conversión fotovoltaica no tan elevadas como las de primera generación pero con costos marcadamente reducidos. Esta disminución de los costos ha permitido un creciente consumo instalándose cada vez más como alternativa solar. Abarca a las llamadas celdas de película delgada que utilizan materiales como el CdTe, CIGS (Copper Indium Gallium Selenide), o Si amorfo. Los paneles son delgados, utilizan muy poco material fotoactivo y su reducción de costos compensa 16 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). sus menores eficiencias de manera que resulta una tecnología viable económicamente. Por último, la tercera generación de dispositivos fotovoltaicos corresponde a aquellas celdas solares que utilicen nuevas tecnologías, como generación de semiconductores ser celdas la nanotecnología. solares tradicionales va más La allá inorgánicos, tercera de los incorporando materiales orgánicos y semiconductores procesados en dimensiones nanométricas. Debido a las propiedades únicas de estos sistemas, se estima que la tercera generación de dispositivos presenta un inmenso potencial de elevar la eficiencia de fotoconversión acompañada de una reducción de costos de producción y que tienden al uso de dispositivos ultra delgados. Los dispositivos de tercera generación prometen superar el límite teórico de eficiencia de 31% conocido como Shockley- Queisser aplicable a las celdas de Si. Por ejemplo, si el exceso de energía de las cargas fotogeneradas en comparación con el band-gap se aprovecha para generar más potencial, o multiplicar el número de electrones generados, se puede llegar a una eficiencia del 60%, apenas inferior al límite termodinámico absoluto, que para una intensidad de irradiación de 1 Sol sería del orden del 68%.2 Sumado a esto hay que recalcar que esta tecnología incorpora mínimas 17 cantidades de recursos Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). abundantes y poco tóxicos. Además, atrae particularmente la atención la posible aplicación en sustratos flexibles y livianos, telas y plásticos que darían la posibilidad de novedosos y variados usos. Por todo esto, la aplicación de la nanotecnología en dispositivos solares es un área de creciente atención científica. A pesar de que por ahora los logros alcanzados en términos de elevar las eficiencias están aún lejos de los deseados para su comercialización, es de fundamental importancia dedicar crecientes esfuerzos en el desarrollo de esta prometedora rama de los dispositivos solares. 1.3 NANOTECNOLOGÍA EN APLICACIONES FOTOVOLTAICAS La nanotecnología aplicada a la energía solar es sumamente atractiva debido a sus enormes potenciales beneficios. En principio se estima que se podría reducir inmensamente los costos de fabricación de dispositivos y que se utilizarían materiales en mucha menor escala y con menor impacto ambiental. También se pueden concebir aplicaciones en sustratos mucho más livianos y flexibles por lo que los costos de instalación también se verían ampliamente reducidos. A todo esto se le suma la posibilidad de elevar las eficiencias de 18 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). conversión fotovoltaica mediante la superación del límite Shockley-Queisser. Entre las nanotecnologías solares, los dispositivos más conocidos y con mayor avance son las desarrolladas por Grätzel en lo que se denomina las celdas solares sensibilizadas con colorante (dye sensitized solar cells). Estas celdas presentan eficiencias relativamente elevadas, de alrededor del 10%3. Por otro lado, están las celdas de estado sólido basadas en heterojunturas donor/aceptor (tipo p-n) que utilizan pigmentos poliméricos o colorantes de bajo peso molecular como elementos fotoactivos. Estas celdas solares orgánicas presentan eficiencias aún menores, alrededor del 56%, ya que no están tan desarrolladas como las de Grätzel.4-8 Las bajas eficiencias (lejos de los límites teóricos) se deben en parte a que es un área de investigación muy reciente ya que ha comenzado a ser explorada recién a partir de la última década. Recientemente se ha dado una carrera para la comercialización de estas celdas, también llamadas “celdas solares plásticas”, por lo que empresas como Konarka y Solarmer han reportado récords de alrededor del 8%.9, 10 Sumado a estos dispositivos tenemos las celdas solares que utilizan materiales fotoactivos de confinamiento cuántico o puntos cuánticos (quantum dots). Éste área de la fotovoltaica 19 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). es también relativamente reciente pero en crecimiento y presenta eficiencias aún bastante pobres estando muy lejos de ser comercialmente viables. Sin embargo, han recibido una gran atención debido a que se estima que el límite termodinámico estaría alrededor del 66% pudiendo ser posible la realización de celdas de alta eficiencia. Los puntos cuánticos pueden ser aplicados en diversas configuraciones como ser: en un arreglo para producir fotoelectrodos, como sensibilizador (colorante) en DSCC, dispersas en matrices de semiconductores orgánicos, etc.11 Figura 2: Diagrama esquemático de energías y principio de operación de las celdas sensibilizadas por colorante. Reproducido de Ref. 12 20 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). A continuación se presenta una breve introducción a cada una de esta nanotecnologías aplicadas a la energía solar. Celdas sensibilizadas por colorante ó celdas de Grätzel. Las celdas sensibilizadas por colorante, han recibido una gran atención desde que Grätzel desarrolló la primer celda de muy alta eficiencia en el año 1991.12 Estas celdas se basan en el aprovechamiento de las cargas fotogeneradas (e-,h+) por el colorante, adsorbido a las nanopartículas de TiO 2. Estas cargas circulan a través de la celda mediante un sistema electroquímico de cascada de niveles energéticos que favorecen la movilidad de las cargas hacia el ánodo y el cátodo respectivamente (Fig. 2). A pesar la alta eficiencia fotovoltaica alcanzada de estas celdas, persiste el inconveniente práctico del electrolito soporte en fase líquida. La presencia de una fase líquida disminuye la estabilidad de las celdas frente a exposiciones prolongadas al sol y requeriría de diseños más elaborados para su efectiva comercialización y uso en grandes escalas. Muchos avances han sido demostrados en el campo del diseño de los colectores nanoestructurados de TiO2 así como también en el diseño y síntesis de los colorantes. Hoy en día, los mayores esfuerzos científicos están dedicados al desarrollo de eficientes electrolitos sólidos (principalmente poliméricos) que permitan 21 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). el desarrollo de las celdas sensibilizadas por colorante de estado sólido.13 Las eficiencias alcanzadas hasta ahora distan aún de las de fase líquida debido principalmente a la alta velocidad de recombinación de cargas en la interfaz orgánica-inorgánica. Sólidas tipo p-n Las celdas de estado sólido basadas en heterojunturas donor/aceptor (tipo p-n) utilizan pigmentos poliméricos o colorantes, y son las llamadas celdas solares orgánicas (CSO). Esta tecnología cuenta con la ventaja de la robustez del estado sólido Figura 3: Representación esquemática de celdas solares híbridas (CSH) y celdas solares orgánicas (CSO). pudiéndose desarrollar celdas extremadamente delgadas con materiales ecológicamente amigables. El avance de esta tecnología se concentra por un lado en el desarrollo de nuevos materiales que maximicen la fotoconversión eléctrica y que aseguren el libre flujo de cargas a través del dispositivo. 22 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Asimismo, existen grandes esfuerzos en la ingeniería y diseño de las celdas de manera de optimizar las diversas características de los materiales, como ser el diseño de las interfaces, la superposición de absorción con el espectro solar, la movilidad de cargas, difusividad del estado excitado, cargas atrapadas, etc. Por otro lado, también se han demostrado importantes esfuerzos en el área de las celdas híbridas de estado sólido (CSH). Estas celdas combinan el uso de materiales fotoactivos inorgánicos y orgánicos, aprovechando las ventajas de ambos materiales. La problemática principal de las CSOs se basa en la baja conductividad de los materiales orgánicos. La movilidad de cargas en estos sistemas sólidos amorfos es mucho menor a la de los semiconductores inorgánicos siendo necesario el uso de películas subnanométricas para evitar efectos resistivos, con la desventaja de que se reduce la magnitud de absorción de fotones. Esta problemática se aborda de dos maneras, por un lado se puede modificar el material químicamente de manera tal de que se mejoren sus propiedades de empacamiento, ordenamiento y por lo tanto de movilidad de cargas y difusión de excitones.14-16 Por otro lado, se puede solucionar de un punto de vista “arquitectónico” mediante el aumento del 23 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). área superficial en la interfaz donor/aceptor usando heterojunturas “bulk” lo que permite el uso de mayor cantidad de material, evitando problemas resistivos y optimizando la transferencia de carga en la interfaz. La combinación de materiales orgánicos e inorgánicos en la construcción de celdas híbridas surge como una alternativa natural para resolver las problemáticas de ambos sistemas. Las celdas solares híbridas (CSH) permiten aprovechar las ventajas únicas de cada material. Por un lado, los semiconductores inorgánicos otorgan robustez y estabilidad al mismo tiempo que ofrecen novedosas estructuras tridimensionales que permiten interfaces del tipo “bulk” altamente controladas. Por otro lado, los materiales orgánicos consisten en una opción de bajo costo para el mejor aprovechamiento de la luz solar en toda su extensión espectral. En las CSH se aprovecha la alta versatilidad y flexibilidad de los materiales orgánicos, con la robustez y capacidad de diseño tridimensional de los materiales mesoporosos. En particular, la fabricación de óxidos mesoporosos que presentan una enorme superficie específica (150-2000m2/g), y poros monodispersos de diámetro controlado en la escala del nanómetro por combinación de técnicas sol-gel y moldeado supramolecular ha sido ampliamente estudiada.17 Los sistemas solares híbridos ya han sido exitosamente probados como posibles tecnologías 24 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). fotovoltáicas,18-20 sin embargo las eficiencias resultan todavía relativamente bajas. Es necesario, tanto un estudio sistemático de las estructuras y propiedades de las matrices inorgánicas, así como de los materiales sensibilizadores para entender aquellos parámetros que resulten en eficiencias elevadas. Éste área constituye gran parte del esfuerzo de los laboratorios de nanoquímica con énfasis en aplicaciones fotovoltaicas. Celdas solares basadas en puntos cuánticos (quantum dots) Los puntos cuánticos son semiconductores inorgánicos confinados en dimensiones reducidas de tamaños menores a los 10-25 nm. Las propiedades ópticas que resultan de este confinamiento cuántico son sumamente interesantes para diversas aplicaciones. Tanto la absorción como la emisión pueden ser fácilmente modificadas mediante la variación del tamaño de confinamiento del punto cuántico. De esta manera se pueden sintetizar partículas de una elevada intensidad de absorción en el rango visible lo cual es de suma relevancia para aplicaciones fotovoltaicas. Los puntos cuánticos se aplican a las celdas solares jugando diversos roles en varias funciones. Por ejemplo, se los puede usar como fotoelectrodos en arreglos homogéneos bidimensionales sobre un sustrato transparente; o también se los puede aplicar en celdas solares híbridas del tipo heterojuntura “bulk”. Estos 25 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). últimos se obtienen dispersando los puntos cuánticos en matrices poliméricas fotoactivas (P3HT, PPV, etc). Asimismo, grandes esfuerzos se han reportado en el uso de puntos cuánticos como sensibilizadores en celdas de Grätzel. Sin embargo, en todos los casos, las eficiencias distan aún de ser relevantes en aplicaciones tecnológicas por lo que el desarrollo de esta área requiere todavía de mucha atención del campo científico. Estos nanomateriales son sumamente atractivos porque ofrecen la promesa de celdas solares más eficientes que aquellas de materiales convencionales. Se estima que el límite termodinámico de eficiencia para los puntos cuánticos estaría alrededor del 66%, casi el doble del límite Shockley-Queisser para el silicio monocristalino. El incremento del límite teórico tiene origen en la generación múltiple de excitones a partir de la incidencia de un solo fotón, en lo que se conoce como generación de cargas “calientes”. Este excedente de cargas fotogeneradas se traduce necesariamente en un aumento de la fotocorriente y por ende en la eficiencia de conversión fotovoltaica. 11 26 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 4: Representación esquemática de la generación múltiple de excitones en un punto cuántico (Izquierda). Tres posibles configuraciones genéricas de celdas solares de puntos cuánticos (derecha). Reproducido de Ref. 11 Otras nanotecnologías: El futuro nanotecnológico de las celdas inorgánicas En un novedoso punto de vista, se ha comenzado a explorar recientemente el uso de la nanotecnología en celdas de naturaleza similar a las tradicionales de Si monocristalino. Esta innovación en la nanotecnología revolucionaría la elaboración de los dispositivos solares clásicos dando lugar a celdas más eficientes y de mucho menor costo. De esta manera, la facilidad de preparación de Si monocristalino implicaría menores requerimientos energéticos para la fabricación así como también una reducción del impacto 27 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). ambiental. El peculiar diseño de las estructuras nanométricas fotoactivas provee un escenario único para el mejoramiento de las propiedades ópticas del material y en consecuencia de las eficiencias de conversión fotovoltaica. De esta manera se presenta un escenario ideal para la obtención futura de celdas eficientes, estables y de bajos costos. Se han desarrollado construcciones de arreglos (“arrays”) de alambres de silicio embebidos en una matriz polimérica, al estilo de lo que muestra la Figura 5.21 La fila superior muestra una vista desde arriba, la fila inferior una vista con un ángulo de 20º. La técnica de síntesis es proceso de crecimiento vapor-líquido-sólido (VLS) decorado por fotolitografía. Como resultado se obtienen arreglos de Si monocristalino con una elevada absorción de luz solar visible (incluyendo radiación infrarroja) (Fig. 5), demostrando la factibilidad de desarrollar celdas solares de Si altamente eficientes. 28 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 5: Composición y orden de los arreglos de alambres de Silicio. Arriba: Vista superior SEM, Abajo: Vista SEM a ángulos de 20ª. Asimismo, se ha comenzado a explorar la posibilidad de construir celdas basadas en nanotubos de silicio. Como muestra la Figura 6, es posible armar dos tipos de junturas, axiales (a) y radiales (b) de acuerdo al sentido con la que se obtendría la separación y extracción de las cargas eléctricas. Con rosa se representa un segmento de diodo de tipo p y en celeste uno de tipo n. La síntesis de los nanotubos 22 se basan en técnicas de crecimiento VLS catalizados por nanoclústers metálicos.23 El dispositivo se desarrolla de manera tal que cada nanotubo representa una celda por sí sola formando parte de un arreglo eficiente de nanotubos que resulta en una celda solar en tándem. En resumen, se ha dado un breve panorama del potencial de la nanotecnología en sus diversas aplicaciones a la energía solar. El desarrollo de la nanotecnología solar se encuentra en 29 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 6: Arreglos de nanotubos de Si de tipo p-n para aplicaciones en celdas solares. Reproducido de Ref. 22 una etapa previa, de exploración y optimización de la síntesis y fabricación de dispositivos, pero constituye un gran desafío para el futuro del abastecimiento energético global. La promesa de altas eficiencias y disminución de costos permiten imaginar un futuro energético solar que satisfaga las crecientes necesidades energéticas de manera limpia con balance cero de emisiones de carbono. 30 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Ginley, D., Green, M. A. and Collins, R., Solar energy conversion toward 1 terawatt. MRS Bulletin, 2008. 33(4): p. 355. [2] Nathan S. Lewis, Toward Cost-Effective Solar Energy Use, Science, 2007, 315, p.798 [3] Nazeeruddin, M. K., De Angelis, F., Fantacci, S., Selloni, A., Viscardi, G., Liska, P., Ito, S., Takeru, B. and Gratzel, M., Combined Experimental and DFT-TDDFT Computational Study of Photoelectrochemical Cell Ruthenium Sensitizers. Journal of the American Chemical Society, 2005. 127(48): p. 16835. [4] Ma, W., Yang, C., Gong, X., Lee, K. and Heeger, A. J., Thermally Stable, Efficient Polymer Solar Cells with Nanoscale Control of the Interpenetrating Network Morphology. Advanced Functional Materials, 2005. 15(10): p. 1617. [5] Reyes-Reyes, M., Kim, K. and Carroll, D. L., High-efficiency photovoltaic devices based on annealed poly(3- hexylthiophene) and 1-(3-methoxycarbonyl)-propyl-1- phenyl(6,6)C[sub 61] blends. Applied Physics Letters, 2005. 87(8): p. 083506. 31 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [6] Peet, J., Kim, J. Y., Coates, N. E., Ma, W. L., Moses, D., Heeger, A. J. and Bazan, G. C., Efficiency enhancement in lowbandgap polymer solar cells by processing with alkane dithiols. Nat Mater, 2007. 6(7): p. 497. [7] Peumans, P. and Forrest, S. R., Very-high-efficiency doubleheterostructure copper phthalocyanine/C-60 photovoltaic cells. Applied Physics Letters, 2001. 79(1): p. 126. [8] Xue, J. G., Uchida, S., Rand, B. P. and Forrest, S. R., 4.2% efficient organic photovoltaic cells with low series resistances. Applied Physics Letters, 2004. 84(16): p. 3013. [9] http://www.konarka.com/ [10] http://www.solarmer.com/ [11] A.J. Nozik, Semiconductor Quantum Dots and Quantum Dot Arrays and Applications of Multiple Exciton Generation to ThirdGeneration Photovoltaic Solar Cells, Chemical Reviews, 2010, 110, 6873 [12] O'Regan B., Grätzel M., A low-cost, high-efficiency solar cell based on dye-sensitized colloidal TiO2 films. Nature, 1991. 353, 6346 32 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [13] Handbook of photovoltaic science and engineering. Luque A. y Hegedus S. John Wiley & Sons Ltd, Chichester, England. [14] Perez, M. D., Borek, C., Djurovich, P. I., Mayo, E. I., Lunt, R. R., Forrest, S. R. and Thompson, M. E., Organic Photovoltaics Using Tetraphenylbenzoporphyrin Complexes as Donor Layers. Advanced Materials, 2009. 21(14-15): p. 1517. [15] Perez, M. D., Borek, C., Forrest, S. R. and Thompson, M. E., Molecular and Morphological Influences on the Open Circuit Voltages of Organic Photovoltaic Devices. Journal of the American Chemical Society, 2009. 131(26): p. 9281. [16] Wang, S. Y., Mayo, E. I., Perez, M. D., Griffe, L., Wei, G. D., Djurovich, P. I., Forrest, S. R. and Thompson, M. E., High efficiency organic photovoltaic cells based on a vapor deposited squaraine donor. Applied Physics Letters, 2009. 94(23). [17] Soler-Illia, G. J. d. A. A., Sanchez, C., Lebeau, B. and Patarin, J., Chemical Strategies To Design Textured Materials: from Microporous and Mesoporous Oxides to Nanonetworks and Hierarchical Structures. Chemical Reviews, 2002. 102(11): p. 4093. 33 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [18] Coakley, K. M. and McGehee, M. D., Photovoltaic cells made from conjugated polymers infiltrated into mesoporous titania. Applied Physics Letters, 2003. 83(16): p. 3380. [19] Wang, Z. J., Qu, S. C., Zeng, X. B., Liu, J. P., Zhang, C. S., Tan, F. R., Jin, L. and Wang, Z. G., Hybrid bulk heterojunction solar cells from a blend of poly(3-hexylthiophene) and TiO2 nanotubes. Applied Surface Science, 2008. 255(5, Part 1): p. 1916. [20] Williams, S. S., Hampton, M. J., Gowrishankar, V., Ding, I. K., Templeton, J. L., Samulski, E. T., DeSimone, J. M. and McGehee, M. D., Nanostructured Titania-Polymer Photovoltaic Devices Made Using PFPE-Based Nanomolding Techniques. Chemistry of Materials, 2008. 20(16): p. 5229. [21] M.D. Kelzenberg, S.W. Boettcher, J.A. Petykiewicz, D.B. TurnerEvans, M.C. Putnam, E.L.Warren, J.M. Spurgeon, R.M. Briggs, N.S. Lewis y H.A. Atwater, Enhanced absorption and carrier collection in Si wire arrays for photovoltaic applications, Nature Materials, 2010, 9, p.239 [22] B. Tian, Th.J. Kempa y C.M. Lieber, Single nanowire photovoltaics. Chemical Society Reviews, 2009, 38, p.16–24 [23] A. Morales y C. M. Lieber, Science, 1998, 279, 208–211 34 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). LA NANOTECNOLOGÍA EN LA CONVERSIÓN ELECTROQUÍMICA DE ENERGÍA EN BASE A HIDRÓGENO W. E. Triaca y G. A. Andreasen E-mail: [email protected] Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas (INIFTA), Universidad Nacional de La Plata-CONICET, La Plata, Argentina. 2.1 INTRODUCCIÓN El uso de fuentes de energía primarias renovables ha sido ya ampliamente reconocido como la alternativa más viable para solucionar los problemas asociados a la creciente demanda de energía, la necesidad de proteger el medio ambiente y el requerimiento de una mejor calidad de vida. En la actualidad, la mayor parte de la energía que se consume mundialmente proviene de la combustión térmica de fuentes fósiles, i.e., petróleo, carbón, gas natural, etc. (Tabla 1). En Argentina la situación es similar, ya que se consumen anualmente aproximadamente 6 x 10 7 toneladas 35 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de combustibles fósiles, principalmente para la producción de electricidad en usinas térmicas y en el transporte vehicular. Fuente Mundo Argentina Combustibles Fósiles 84% 94% Energía Nuclear 8,5% 2% Energías Renovables 7,5% 4% Tabla 1: Contribución de fuentes primarias en el suministro global de energía. La producción de electricidad mediante la combustión térmica convencional de fuentes fósiles presenta serias desventajas, ya que es un método indirecto e ineficiente que implica una etapa intermedia de conversión de calor en trabajo mecánico con un límite de eficiencia intrínseca impuesto por el ciclo de Carnot. Así, por ejemplo, una máquina térmica que opera entre 350 ºC y 100 ºC tiene una eficiencia máxima intrínseca de 40% y, en la práctica, existen otras pérdidas de energía extrínsecas, tales como disipación de calor a los alrededores, calor generado por fricción en las partes móviles, combustión incompleta, etc., que disminuyen aún más el rendimiento. De este modo, en los motores de combustión interna, la eficiencia práctica es del 15 % al 20 %, 36 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). esto es, se desperdicia más del 80% de la energía química contenida en el combustible. Además, como productos de la combustión se arrojan al ambiente principalmente agua y dióxido de carbono, que contribuye al calentamiento global, y otros contaminantes, tales como monóxido de carbono, óxidos de nitrógeno (NOx), óxidos de azufre (SOx), hidrocarburos no saturados, material particulado, etc., que provocan desequilibrios ecológicos (lluvias ácidas, reducción de la capa de ozono, formación de smog, etc.) y/o dañan la salud. Por otra parte, debido a la baja eficiencia de conversión del método, se desaprovechan las limitadas reservas de combustibles fósiles, que han tardado millones de años en formarse. Para resolver estos problemas se han desarrollado sistemas para el aprovechamiento integral de fuentes primarias de energía limpias y renovables que puedan sustituir a los combustibles fósiles, tales como energías solar, eólica, hidráulica, geotérmica, mareomotriz, etc. [1]. Si bien se puede imaginar un escenario futuro donde las fuentes primarias renovables, principalmente energías eólica y solar, ocupen un lugar predominante en la matriz energética sustituyendo a los combustibles fósiles, existen problemas relacionados con el almacenamiento y el transporte de la energía primaria y la facilidad de su conversión de acuerdo a 37 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). la demanda. En este aspecto, debe señalarse que, en el lugar de consumo final, sólo el 25 % de la energía primaria se usa como electricidad y el 75 % restante como combustible. Por lo tanto, las energías primarias renovables deben usarse tanto para generar electricidad como para manufacturar combustibles. Es en este escenario donde aparece el hidrógeno como combustible ideal para el reemplazo de los combustibles fósiles fluidos (gases y líquidos), ya que puede obtenerse fácilmente por electrólisis del agua a partir de fuentes primarias convenientemente renovables. El almacenado, hidrógeno ya sea electrolítico, como gas comprimido, líquido a bajas temperaturas o en estructuras sólidas bajo la forma de hidruro metálico, puede transportarse al centro de consumo donde su combustión produce energía útil. 2.2 CICLO DEL HIDRÓGENO El hidrógeno se encuentra en abundancia en la naturaleza, principalmente como constituyente del agua. Además, almacena mayor cantidad de energía por unidad de peso (33,3 kWh/kg) que cualquier otra sustancia y su combustión produce agua, sin contaminar el ambiente. Por otra parte, puede almacenarse fácilmente como gas comprimido (~200 38 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). bar), como líquido a bajas temperaturas (-253 ºC) o como hidruro metálico formando estructuras sólidas. El hidrógeno es también fácilmente transportable por tuberías y se puede usar directamente en quemadores o motores produciendo calor por combustión limpia, o convertir directamente su energía química en electricidad en dispositivos electroquímicos, conocidos como celdas de combustible, en un proceso de alta eficiencia. Puesto que el hidrógeno no se encuentra libre en la naturaleza, se debe gastar energía para producirlo, tal como en el caso de la electricidad. El hidrógeno no es una fuente energética sino un intermediario entre la fuente primaria y el dispositivo de conversión de energía donde se lo utilice, i.e., es un vector o portador de energía. Por tanto, para una utilización masiva del hidrógeno en sistemas sostenibles de energía se lo debe producir a bajo costo. En sistemas sostenibles complementación de de energía, dispositivos de la necesaria funcionamiento intermitente, tales como convertidores solares fotovoltaicos o turbinas eólicas, puede lograrse en base a la producción de hidrógeno mediante electrólisis de agua fuera de las horas de pico, esto es, en base a la conversión de energía eléctrica en energía química del hidrógeno (Fig. 1). El hidrógeno producido y convenientemente almacenado, en alguna de las formas 39 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). ya descriptas, puede posteriormente transportarse al centro de consumo, donde su combustión térmica produce calor y agua, aunque también se genera algo de NOx si se utiliza aire como comburente, o alternativamente, alimentar a celdas de combustible produciendo directamente electricidad y agua, que vuelve al ambiente, sin emisión de contaminantes. De este modo, el ciclo del hidrógeno constituye un sistema cerrado, a diferencia del ciclo de combustibles fósiles (Fig. 1), ya que el combustible se regenera. Cabe también señalar que, alternativamente, con el excedente de electricidad se pueden cargar baterías electroquímicas de tecnología de avanzada, cuya energía puede utilizarse necesario. Figura 1. Sistemas de energía. 40 cuando sea Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). En cada una de las etapas de conversión de energía del ciclo del hidrógeno se encuentran involucrados dispositivos, en su mayor parte electroquímicos, tales como electrolizadores, almacenadores de hidrógeno, celdas de combustible y baterías. Para alcanzar alta eficiencia de conversión y máxima velocidad de drenaje de corriente en los dispositivos electroquímicos se requiere minimizar las pérdidas de energía de los procesos que tienen lugar. De ahí, la necesidad de desarrollar nuevos materiales de electrodo de composición y estructura superficial adecuadas para optimizar los procesos de conversión y almacenamiento de energía. Se ha producido en este aspecto un gran salto adelante mediante estudios combinados de cinética electroquímica, ciencia de materiales y ciencia de superficies, que han permitido la comprensión de procesos electroquímicos a nivel atómico y posibilitado establecer la correlación entre la nanoestructura superficial y la composición química del material de electrodo con su actividad catalítica y selectividad para una reacción particular [2]. A través de estos estudios se han podido establecer bases racionales para el diseño y fabricación de materiales nanoestructurados, particularmente nanocatalizadores, de óptimo comportamiento en sistemas avanzados de conversión y almacenamiento electroquímicos de energía en base a tecnologías de hidrógeno. Estas 41 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). tecnologías comprenden la producción, almacenamiento y combustión del hidrógeno. 2.3 PRODUCCIÓN DE HIDRÓGENO Existen diversos métodos de producción de hidrógeno: reformado de gas natural, alcoholes y productos de gasificación de la hulla, electrólisis del agua, termólisis y procesos termoquímicos, fotoquímicos y fotobiológicos. De todos ellos, la electrólisis del agua y el reformado de gas natural son los únicos métodos que han alcanzado un alto grado de desarrollo y competitividad para aplicarse a la producción de hidrógeno en gran escala. El reformado de gas natural es, al presente, el método más económico para la producción de hidrógeno, pero tiene la desventaja, anteriormente mencionada, de la emisión de dióxido de carbono, el cual debe ser removido por procedimientos complejos. Sin embargo, si el proceso global incluye la combustión electroquímica en celdas de combustible del gas rico en hidrógeno producido, se logra reducir a un tercio la emisión de contaminantes. Las tecnologías avanzadas de electrólisis del agua, ya sea a baja (75-85ºC, electrolito alcalino o de polímero sólido) o a alta temperatura (1000ºC, electrolito de óxido sólido), son 42 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). procesos limpios con rendimientos superiores al 85-90 %. Las investigaciones actuales se orientan hacia nuevos conceptos en diseños de electrodos y mejoras en los materiales de celda, para bajar costos y aumentar la eficiencia, confiabilidad y durabilidad del proceso. La descripción detallada de las diversas tecnologías de producción de hidrógeno y de los materiales empleados es vasta y no se contempla en esta revisión. El estado actual del arte en esta área se describe en una excelente revisión [3]. El costo de producción de hidrógeno es, al presente y según la fuente primaria utilizada, aproximadamente dos a tres veces superior al de la gasolina. Debe recordarse que al costo de producción debe sumarse u$s 6-8 por GJ de energía producida por los gastos adicionales de compresión, almacenamiento, transporte y distribución local de hidrógeno gaseoso. Sin embargo, si se tiene en cuenta que la eficiencia de conversión de hidrógeno a electricidad en celdas de combustible es, al menos, tres veces mayor que la correspondiente a la combustión térmica de la gasolina, surge que el hidrógeno sería competitivo en costo con los combustibles actuales, tales como gasolina y gasoil. Esta situación resulta más favorable al hidrógeno si se tiene en cuenta el costo del daño ambiental derivado del uso de combustibles fósiles fluidos [4]. 43 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 2.4 ALMACENAMIENTO DE HIDRÓGENO Se ha señalado anteriormente que en sistemas sostenibles de energía en base a hidrógeno, este combustible debe almacenarse para cubrir las diferencias diarias y estacionales entre la disponibilidad de la fuente primaria de energía y la demanda. Los tanques de acero clásicos permiten almacenar hidrógeno comprimido usualmente a aproximadamente 200 bar. El uso de cilindros de aluminio reforzado con fibras de carbono posibilita aumentar la cantidad de hidrógeno almacenado de 1 % a 4 % con respecto al peso del recipiente. También se han desarrollado materiales compuestos reforzados con fibras de carbono que permiten fabricar tanques que soportan presiones de 600 bar y se llenan hasta a 450 bar para uso regular [5]. Para prototipos de vehículos a hidrógeno se han desarrollado más recientemente tanques de nuevos materiales compuestos livianos que operan entre 350 y 700 atmósferas y que han sido certificados según la norma ISO 11439 (Europa) [6]. El almacenamiento de hidrógeno como líquido resulta particularmente atractivo para algunas aplicaciones (transporte aéreo y espacial) por la mayor densidad de energía volumétrica (2,4 kWh/l) respecto a la del hidrógeno comprimido (0,6 kWh/l a 170 bar). El almacenamiento 44 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). criogénico presenta, sin embargo, la desventaja que el proceso de licuefacción del hidrógeno (temperatura de condensación -253 °C a 1 bar) y su mantenimiento insumen 35-40 % de su contenido energético. De ahí, que se hayan desarrollado nuevas técnicas de licuefacción y sistemas de almacenamiento a baja temperatura superaislados, particularmente para la tecnología espacial [5]. La aplicación de la nanotecnología al almacenamiento de hidrógeno en estructuras sólidas ha conducido a desarrollos muy promisorios. Así, materiales que ofrecen una gran área específica, tales como carbón activado, carbono nanoestructurado y nanotubos de carbono son sustratos adecuados para la fisisorción de hidrógeno, donde se ponen en juego fuerzas de van der Waals. El interés en estos materiales surge del hecho que en sólidos porosos con capilares de diámetro del orden de magnitud del de la molécula de hidrógeno (0,41 nm), los campos de potencial de paredes opuestas se superponen, lo cual resulta en un aumento de las fuerzas atractivas que actúan sobre el hidrógeno adsorbido en comparación con las de una superficie plana de carbono [6]. Cabe destacar que sobre carbono grafítico nanoestructurado a la temperatura de nitrógeno líquido (-196 ºC), la cantidad de hidrógeno adsorbido reversiblemente es 1,5 % en masa 45 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). para un área específica de 1000 m2/g. Para grafito nanoestructurado sometido a 80 h de tratamiento en un molino de bolas de alta energía a temperatura ambiente en una atmósfera de hidrógeno de 10 bar se consigue adsorber hasta 0,96 átomos de hidrógeno por átomo de carbono (7,4 % en masa). Sin embargo, el 80 % del hidrógeno se desorbe solamente a temperaturas superiores a 600 º C [6]. Se sigue trabajando activamente en este campo, ya que la fisisorción de hidrógeno presenta las ventajas de la baja presión de operación, el diseño simple del sistema de almacenamiento y el costo relativamente bajo de los materiales de construcción. Por el contrario, se tienen las desventajas de la baja masa de hidrógeno almacenado respecto a la masa y volumen del contenedor y de las temperaturas bajas de operación requeridas. Otro procedimiento que ha recibido atención preferente es el almacenamiento del hidrógeno en aleaciones metálicas bajo la forma de hidruro. hidruración/deshidruración son Las reacciones procesos reversibles de que permiten absorber y desorber hidrógeno por variación de la temperatura y presión [7]. El interés de este método de almacenamiento se basa en que ciertos metales y aleaciones pueden acomodar intersticialmente más átomos de hidrógeno que los correspondientes al mismo volumen de 46 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). hidrógeno líquido. Así, el hidruro de composición LaNi 5H6 tiene una densidad de energía volumétrica de 3,3 kWh/l que supera a las del hidrógeno líquido e hidrógeno comprimido, como así también a la del metano a 170 bar (1,7 kWh/l), aunque es más baja que los 8.8 kWh/l que provee la gasolina (Tabla 2). Para algunas aplicaciones donde el espacio disponible para el tanque de combustible está limitado, como en el caso de los automóviles, el almacenamiento de hidrógeno como hidruro metálico en estructuras sólidas constituye así una alternativa confiable y segura. Tabla 2: Densidades de energía de combustibles Durante la transformación de fase que ocurre en el proceso de hidruración, cantidades de los hidruros hidrógeno pueden a 47 absorber presión grandes constante. Las Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). características de la adsorción y desorción de hidrógeno, e.g., la presión de equilibrio, la cinética del proceso, etc., se pueden ajustar “a medida” por sustitución parcial de los elementos constituyentes de la red del material formador del hidruro. De este modo, se han diseñado y preparado compuestos intermetálicos basados en LaNi 5 y ZrCr2, capaces de absorber y desorber hidrógeno a presiones cercanas a 1 atm y temperatura ambiente. Así, se han desarrollado aleaciones de multicomponentes optimizadas en cuanto a su composición y estructura con alta capacidad de almacenamiento de hidrógeno, tales como Zr0.9Ti0.1CrNi y MmNi3.5Co0.8Mn0.4Al0.3 (Mm: mischmetal = La, Ce, Pr, Nd) [8-10]. Las aleaciones desarrolladas presentan características de estabilidad y vida útil que posibilitan también su uso como electrodo negativo en baterías alcalinas recargables de níquel-hidruro metálico [11]. Estas baterías tienen una alta energía específica ( 80-100 Wh/kg), alta densidad de energía volumétrica (200 Wh/l), larga vida bajo ciclado de carga– descarga y son ecocompatibles. Para la optimización de estos sistemas se requieren todavía avances en algunos aspectos relacionados principalmente a características del electrodo de hidruro metálico, tales como aumentar la capacidad de absorción de hidrógeno durante la carga y mejorar la cinética de los procesos de hidruración/deshidruración. 48 Resulta Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). también de interés para el almacenamiento de hidrógeno desde la fase gaseosa el empleo de hidruro de magnesio o de alguno de sus compuestos intermetálicos preparados mediante el aleado mecánico con fases catalíticas en molino de bolas que produce un polvo muy fino de compuesto nanoestructurado que permite disminuir la temperatura de desorción a un valor del orden de los 200 °C o aún menor, con las correspondientes presiones de equilibrio mayores que la presión atmosférica, y mejora también significativamente la correspondiente cinética [6]. Por otra parte, los hidruros complejos, tales como LiBH4 con 18 % de hidrógeno en masa, son promisorios como nuevos compuestos almacenadores con altas densidades gravimétrica y volumétrica de hidrógeno. 2.5 COMBUSTIÓN ELECTROQUÍMICA DE HIDRÓGENO Celdas de combustible La forma más eficiente para utilizar la energía química del hidrógeno es su conversión directa a electricidad en celdas de combustible [2]. Estos dispositivos operan con alta eficiencia de conversión no limitada por la restricción de Carnot, ya que no existen etapas intermedias de conversión de calor a trabajo mecánico. En una celda de combustible, 49 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). los reactivos (hidrógeno y oxígeno del aire) alimentan a los correspondientes electrodos, constituidos por materiales porosos catalizados que se encuentran en un electrolito adecuado, estableciéndose una diferencia de potencial que mantiene un flujo de electrones, esto es, una corriente eléctrica, que puede efectuar trabajo útil. Las reacciones anódica y catódica son las siguientes: La H 2 o 2H 2e (1) 1/2 O 2 2H 2e o H 2 O (2) reacción global de combustión electroquímica de hidrógeno puede escribirse conforme a: H 2 1/2 O2 o H 2 O electricid ad (3) En la celda se genera también una cierta cantidad de calor debido al cambio entrópico (T'S) asociado a la reacción de combustión electroquímica del hidrógeno, por lo cual la eficiencia teórica de conversión a electricidad es algo inferior al 100 %. De este modo, para la celda de combustible de hidrógeno/oxígeno, la eficiencia máxima intrínseca es de 91 % a 150 °C. En la práctica, cuando se drenan corrientes apreciables existen otras pérdidas de energía, que se manifiestan como calor liberado, 50 conocidas como Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). sobrepotenciales, asociadas a la irreversibilidad de las reacciones que ocurren en la celda, esto es, procesos de transferencia de carga y reacciones asociadas y de transporte de materia, y a caídas óhmicas, que disminuyen la eficiencia práctica a valores de 50-70 %, según las condiciones de operación. Estas características determinan que las celdas de combustible sean útiles también como sistemas de cogeneración de electricidad y calor, alcanzándose en este caso eficiencias totales de 80-85 %. El otro producto es agua, que no contamina el ambiente. Además, las celdas de combustible carecen de partes móviles, por lo que funcionan silenciosamente y sin desgaste mecánico. Los distintos tipos de celda de combustible actuales se clasifican por el tipo de electrolito empleado, que define la temperatura de operación de la celda. Así, existe un amplio espectro de celdas que utilizan distintos electrolitos: membrana de intercambio de protones (60-80 °C), álcali acuoso (80 °C), ácido fosfórico (190-200 °C), carbonato fundido (650 °C) y óxido sólido (700-1000 °C). Cabe destacar que en los últimos años se ha prestado una atención preferente a las celdas que utilizan alcoholes, tales como metanol y etanol, como combustible. Estos alcoholes son sustancias parcialmente oxigenadas con alto contenido de 51 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). hidrógeno que poseen densidades de energía que alcanzan el 50-60% de la correspondiente a la gasolina, y que al ser líquidas a temperatura ambiente constituyen una forma de almacenamiento de hidrógeno segura y de fácil manejo, muy atractiva para aplicaciones en el transporte vehicular. En esta revisión se hará referencia, en particular, a las celdas de tecnología de membrana de intercambio de protones (PEM) y a las celdas de óxido sólido, que son las que han alcanzado al presente un alto grado de desarrollo y la competitividad necesaria para su utilización en generación descentralizada de electricidad y en el transporte vehicular. Electrodos y nanocatalizadores de celdas de combustible de temperaturas bajas e intermedias El diseño del electrodo debe cumplir con el requisito de minimizar las pérdidas de energía extrínsecas de la celda de combustible, optimizando los procesos de transporte de materia y de transferencia de carga. En este aspecto, la estructura del electrodo juega un papel fundamental en el proceso de producción de electricidad. Así, se han desarrollado electrodos con estructuras macro y microporosas con una alta disponibilidad de sitios de contacto triple de las fases gaseosa (electrodo), (reactivo), que permiten líquida (electrolito) aumentar 52 y sólida notablemente la Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). velocidad del proceso de transporte de materia en las celdas que emplean reactivos gaseosos al disminuir en varios órdenes de magnitud el espesor de la película de difusión con respecto al correspondiente a electrodos planos. La introducción de politetrafluoretileno (PTFE) hidrofóbico en los sistemas de baja temperatura ha simplificado la fabricación de estructuras porosas de difusión de gas con sitios de contacto trifásico estables no inundables por electrolitos acuosos, e.g., ácido fosfórico. Los caminos de conducción electrónica son proporcionados por sustratos en base a polvos metálicos o de carbono sinterizados (o a los denominados “carbon paper” y “carbon cloth”) y, para reducir aún más la resistencia óhmica, se incorpora usualmente a la estructura una malla metálica [2,12]. Para las reacciones electródicas de interés en la conversión de energía a temperaturas bajas e intermedias se requieren electrocatalizadores para aumentar la velocidad de la reacción de transferencia de carga. Para la mayoría de estas reacciones los mejores electrocatalizadores son metales nobles, tales como Pt, Ru, Pd y otros. De ahí, que se realicen esfuerzos para encontrar sustitutos adecuados de bajo costo de estos materiales, tales como complejos macrocíclicos metálicos (porfirinas, ftalocianinas, etc.) fijados sobre grafito, aunque los resultados hasta ahora no son completamente 53 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). satisfactorios. Por lo tanto, se ha tratado de utilizar más eficazmente a los metales nobles preparándolos con una nanoestructura adecuada que presente una mayor actividad catalítica y vida útil. Así, se han desarrollado distintos métodos para la preparación de electrocatalizadores de tamaño de partícula del orden del nanometro, de modo de ofrecer una alta área superficial y una morfología apropiada, que se dispersan sobre soportes conductores y que han permitido obtener altos rendimientos en reacciones de conversión de energía a valores de carga de nanocatalizador tan bajos como 0,05 mg/cm2. Estudios recientes han mostrado la influencia, además de las variables ya citadas, del tamaño de la nanopartícula del metal y de las interacciones metalsoporte sobre la actividad de los electrocatalizadores dispersados [2]. Sin embargo, existen todavía pérdidas de energías importantes asociadas a problemas de electrocatálisis de las reacciones electródicas que disminuyen la eficiencia de conversión a electricidad. Para reducir estas pérdidas se requiere el desarrollo de electrocatalizadores selectivos con nanoestructuras superficiales de alta actividad catalítica que permitan minimizar las pérdidas de energía relacionadas con los sobrepotenciales de electrodo, principalmente, los correspondientes a la electroreducción de oxígeno y a la 54 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). electrooxidación de metanol y de etanol, y así conducir los procesos de conversión de energía a velocidad y eficiencia máximas. Al respecto, investigaciones realizadas en los últimos años con electrodos de monocristales con superficies bien definidas y caracterizadas a nivel atómico con modernas técnicas de análisis de superficies, tales como LEED, AES, TEM, STM, etc., permitieron la realización de estudios de procesos electrocatalíticos de alta confiabilidad, los cuales muestran que su actividad catalítica depende fuertemente de la nanoestructura superficial, particularmente, de la orientación cristalográfica de los sitios activos y de la presencia de defectos. Asi, se ha demostrado recientemente que la electroreducción de oxígeno en ácido perclórico 0,1 M a 60 º C resulta favorecida sobre superficies (111) de Pt3Ni [13]. En el diseño y construcción de electrodos de alta tecnología, uno de los mayores desafíos consiste en depositar, sobre soportes electrocatalizador requerida, tal adecuados, nanopartículas del dispersadas con la estructura superficial como la determinada en estudios con electrodos de monocristales de baja área superficial, para un óptimo comportamiento en operación. Es también crucial la determinación del tamaño óptimo de las nanopartículas para una reacción particular, usualmente entre 2 y 5 nm, ya que por debajo de 1 nm la mayor parte de los átomos se 55 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). encuentran en la superficie del nanocatalizador y puede disminuir la actividad catalítica como consecuencia de la pérdida del carácter “metálico” asociado a los átomos en el seno del metal. Las superficies de las nanopartículas se pueden describir como una serie de pequeños dominios locales (111) y (100) conectados por sitios cuyos átomos tienen un bajo número de coordinación. De este modo, debido al pequeño tamaño de las nanopartículas se tiene un ordenamiento complejo de terrazas, escalones, esquinas, etc., que exhiben diferentes planos cristalográficos. La respuesta característica de los sitios superficiales, ordenados en modos diferentes, se puede analizar comparándola con la de electrodos de superficies escalonadas, los cuales consisten de una sucesión regular de terrazas con una determinada simetría separada por escalones monoatómicos con una diferente simetría controlada [14]. Se debe señalar en esta línea de trabajo un desarrollo reciente de nuestro grupo de trabajo del INIFTA que permite obtener nanopartículas de Pt facetadas sobre soportes conductores mediante la aplicación de electrólisis pulsante a alta frecuencia en soluciones conteniendo complejos del metal [15]. Se determinó que la respuesta voltamperométrica de las nanopartículas se aproximaba a la de superficies 56 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). escalonadas de monocristales de Pt con terrazas angostas (111). Los estudios posteriores de caracterización de los electrodepósitos de Pt mediante las técnicas de STM, TEM y SEM revelaron la presencia de nanopartículas de Pt altamente facetadas con orientación cristalográfica preferente (111), las cuales mostraron una actividad catalítica para la reacción de electroreducción de oxígeno que era superior a la de nanopartículas de Pt policristalino soportadas sobre carbón comerciales. Por otra parte, el estudio del comportamiento a 60 ºC de una celda de combustible PEM de hidrógeno/oxígeno que utilizaba electrodos porosos de difusión de gas con nanopartículas de Pt facetadas tipo (111) incorporadas en el cátodo, mostró un rendimiento superior al de una celda con nanopartículas de Pt policristalino altamente dispersadas sobre soportes carbonosos [16]. El mejor comportamiento en operación de la celda de combustible con nanopartículas de Pt facetadas tipo (111) se debe a que la presencia de este tipo de nanopartículas en el cátodo favorece la ruta directa de 4 electrones en el proceso global de electroreducción de oxígeno, a través de la disminución del efecto de bloqueo de la superficie del electrodo por intermediarios peroxídicos producidos durante la reacción. De este modo, a través de este tipo de investigaciones, se pueden diseñar racionalmente 57 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). electrodos de alta tecnología para uso en celdas de combustible de avanzada. Celdas de combustible de tecnología PEM En los últimos años se han producido avances importantes en el desarrollo de celdas de combustible de hidrógeno/oxígeno y de metanol/oxígeno que emplean la tecnología de membrana de intercambio de protones, con la cual se alcanzan eficiencias de conversión y densidades de potencia altas. Entre estos avances se deben destacar: i) el desarrollo de membranas fluorsulfónicas y de polibenzoimidazol dopado, ii) la reducción en dos órdenes de magnitud de la carga de Pt en los electrodos mediante la utilización de nanopartículas soportadas en carbón de alta área especifica y el impregnado de la capa activa del electrodo con electrolito de conducción protónica para extender la zona de reacción, iii) el desarrollo de ensambles electrodo-membrana-electrodo eficientes, que han permitido alcanzar altas densidades de corriente superiores a 1 A/cm2 [2,12]. Estas mejoras han posibilitado una sustancial reducción del costo por kilovatio de potencia, lo cual permite la aplicación de las celdas PEM como fuente de potencia para vehículos eléctricos y una amplia variedad de sistemas portátiles. 58 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Pese a estas mejoras, para una introducción masiva de las celdas de combustible PEM en el mercado, debe bajarse aún más el costo de producción que en la actualidad es de aproximadamente u$s 1800/kW, donde el 40% de ese valor corresponde a la manufactura del ensamble electrodomembrana-electrodo [12]. De ahí la importancia del diseño y construcción de una estructura adecuada del ensamble que permita bajar el costo de fabricación, manteniendo el nivel de performance. El alcance de este objetivo constituye un desafío singular en la aplicación de la nanotecnología a la conversión electroquímica de energía , ya que la optimización de la estructura del ensamble requiere arquitecturas en la escala del nanometro que proporcionen caminos adecuados para el transporte molecular eficiente de los reactivos y productos hacia y desde la interfase nanocatalizadorelectrolito. Por otra parte, la capa activa que contiene el nanocatalizador debe construirse cuidadosamente para mantener interfases múltiples en contacto íntimo (reactivos en fase gaseosa, fase metálica catalítica y fase electrolítica) y debe poseer nanoporos y límites de fase para el transporte de reactivos gaseosos. performance y Además, larga vida para útil, las mantener una nanopartículas alta del electrocatalizador deben conservar su actividad específica y estructura superficial durante todo el tiempo de operación. 59 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Esto requiere el conocimiento y la comprensión de los mecanismos a nivel atómico de los fenómenos que provocan la degradación de la capa activa, tales como, entre otros, el sinterizado y la disolución de las nanopartículas, para establecer las bases que posibiliten el desarrollo de nanoestructuras superficiales del electrocatalizador estables. Celdas de combustible de oxidación directa de alcoholes Las celdas constituyen de combustible sistemas que generadores emplean de alcoholes electricidad muy atractivos, ya que permiten operar a temperaturas bajas con combustibles líquidos fáciles de almacenar manteniendo performances satisfactorias. Sin embargo, presentan la desventaja de que las sustancias orgánicas se adsorben disociativamente sobre el ánodo de Pt originando residuos fuertemente adsorbidos tipo CO que, en el caso de metanol, inactivan el electrodo o bien resulta difícil la ruptura de la unión C-C, como en el caso del etanol, por lo que no se logra su oxidación total a CO2, con la consiguiente pérdida de energía. Por otra parte, la electroreducción de oxígeno que ocurre en el cátodo tiene una cinética lenta y compite con la oxidación de alcohol, que llega desde el ánodo a través de la membrana conductora. 60 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). En el caso de la oxidación de alcoholes, como así también en la de combustibles provenientes del proceso de reformado con trazas de CO, la cinética de remoción de la especie CO adsorbida sobre Pt es lenta y se facilita por la presencia de especies OH adsorbidas adyacentes. De ahí, que el metal Ru sea el componente más eficiente de catalizadores binarios ya que permite la formación de especies OH adsorbidas a bajos potenciales [2]. Las investigaciones actuales están orientadas al desarrollo de nanocatalizadores de Pt/Ru y de otras aleaciones ternarias como Pt/Ru/Co y Pt/Ru/W, tolerantes al CO. El desempeño de los nanocatalizadores depende de su morfología, parámetros de la red metálica, orientación cristalográfica, tamaño de partícula, etc. La oxidación de etanol sobre Pt ha sido ampliamente estudiada estableciéndose que sólo una pequeña cantidad del compuesto adsorbido produce CO2, mientras que, por el contrario, hay una alta producción de acetaldehido y ácido acético debido a la dificultad de la ruptura de la unión C-C [17]. De este modo, se han propuesto aleaciones binarias y ternarias en base a Pt, donde cada componente contribuye ya sea por: i) proporcionar una distancia Pt-Pt adecuada para favorecer la adsorción y ruptura de la molécula de etanol, ii) proporcionar especies oxigenadas para facilitar la oxidación del adsorbato tipo CO, o iii) modificar la estructura electrónica 61 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). del Pt para debilitar la unión Pt-adsorbato [18]. En un estudio teórico reciente sobre la influencia de la estructura superficial del Pt sobre la oxidación del etanol se ha encontrado que la superficie abierta (100) es la faceta más favorable para la oxidación total a CO2 a bajos cubrimientos superficiales [19]. Las investigaciones realizadas en el área han demostrado que los catalizadores más eficientes para la oxidación directa de etanol están constituidos por materiales nanoestructurados en base a combinaciones ternarias de PtMxMy, donde Mx y My: Sn, Rh, Ir, Ru, Fe, Co, Ni, etc. En particular, nanopartículas de PtSnRh, con relación atómica 3:1:1, soportadas sobre carbono y de tamaño entre 3 y 5 nm han mostrado un alto rendimiento y estabilidad en operación [20]. En la actualidad, se presta también una atención preferente a la influencia de la orientación cristalográfica de las facetas expuestas de los nanocatalizadores y del tamaño de partícula sobre su actividad catalítica [14]. Con respecto a la electroreducción de oxígeno se ha encontrado que algunos metales de transición, tales como Fe y Co, inhiben la formación de especies oxigenadas y, por lo tanto, mantienen la ocupación de la banda d del Pt, favoreciendo el proceso global de electroreducción [2]. El aumento de la actividad catalítica con respecto a la del Pt 62 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). puro se ha explicado también en base a la favorable distancia interatómica Pt-Pt [21]. Las investigaciones actuales en esta línea de trabajo están dirigidas al desarrollo de nuevos materiales nanoestructurados que posibiliten una combinación exitosa entre sus propiedades intrínsecas y sus propiedades superficiales. Así, se ha encontrado que aleaciones binarias de PtCo 3:1 y de PtFe 3:1 bajo la forma de nanopartículas de tamaño promedio 3 nm dispersadas sobre soportes conductores muestran un excelente comportamiento en la electroreducción de oxígeno, al tiempo que exhiben una adecuada tolerancia al metanol proveniente del ánodo [22]. Se trabaja también actualmente en desarrollar nuevas membranas de intercambio de protones que permitan trabajar a temperaturas más altas que las permitidas con la clásica de Nafion® para favorecer la cinética de remoción del CO. Se han obtenido resultados satisfactorios con el uso de membranas de Nafion® modificadas y de membranas alternativas como las de polibenziimidazol (PBI) dopadas con ácido fosfórico. Celdas de combustible de óxido sólido Las celdas de óxido sólido convencionales son dispositivos electroquímicos construídos con óxidos cerámicos que se 63 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). diseñan para operar en un amplio intervalo de temperatura (700-1000 ºC). La alta temperatura de operación posibilita que la cinética de las reacciones electroquímicas involucradas sea rápida y, de este modo, para alcanzar altas densidades de potencia no se requieren electrocatalizadores de alto costo como los metales nobles, aunque se presentan todavía algunos problemas relacionados con la estabilidad de los materiales. Por otra parte, debido a que el proceso electroquímico implica el transporte de iones O 2- del cátodo al ánodo, en lugar del transporte de protones en sentido opuesto como en las celdas de combustible de hidrógeno/oxígeno convencionales, resulta posible oxidar también hidrocarburos fósiles livianos como el gas natural o los provenientes de la biomasa, como el biogas. De este modo, la celda de óxido sólido constituye un sistema puente entre la actual tecnología de producción de electricidad en base a fuentes fósiles y la futura tecnología en base a hidrógeno. Las celdas de óxido sólido clásicas operan a 900-1000 ºC y usan electrolitos cerámicos, usualmente ZrO2 estabilizado con Y2O3 en su fase cúbica, que es conductora por ion O2- a temperaturas altas. La reacción de reducción de O2 a O2- se produce en el cátodo y se cataliza usualmente con manganitas, e.g., (La;Sr)MnO3 con estructura tipo perovskita [23]. En el ánodo se produce la oxidación del combustible y se 64 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). usan materiales de base Ni para catalizar el reformado (interno) de CH4 a H2 y CO en presencia de H2O ó CO2 según: CH4 + H2O o 3H2 + CO (4) CH4 + CO2 o 2H2 + 2CO (5) La aplicación de la nanotecnología a estos sistemas ha permitido desarrollar celdas de óxido sólido diseñadas y construídas con nanomateriales que permiten operar a temperaturas intermedias (500-700°C ). Se emplean electrolitos nanoestructurados de CeO2 dopado con Sm2O3, Gd2O3 o Y2O3 y perovskitas de (La;Sr)(Ga;Mg)O3. En el cátodo se usan cobaltitas, tipo (La;Sr)CoO3 o favorecen la reducción del oxígeno (Sm;Sr)CoO3, que a temperaturas intermedias. Hasta ahora no se han encontrado materiales completamente adecuados para el ánodo, ya que el reformado interno requiere altas temperaturas. En consecuencia, se analizan nuevos conceptos, tales como celdas que trabajan por oxidación directa de hidrocarburos [24] o celdas de una cámara que trabajan con mezclas de hidrocarburo y aire [25] y que usan nanocatalizadores selectivos cada para las reacciones en electrodo. Usualmente, el combustible y el O2 (aire) están en cámaras separadas (celdas de dos cámaras), pero el empleo de 65 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). celdas de una cámara tiene las ventajas de la simplificación del diseño y la reducción del tamaño y peso, que redundan en un menor costo, aunque hay pocos trabajos sobre el tema [26]. En el ánodo, en lugar del reformado interno, se usa el O 2 del aire para producir la oxidación parcial del hidrocarburo, que en el caso del CH4 es: CH4 + ½O2 o 2H2 + CO (6) Avances recientes están relacionados con el desarrollo de nuevos ánodos constituídos por un material compuesto nanoestructurado de NiO y ZrO2-CeO2 con PdO, que cataliza la oxidación del metano a temperaturas intermedias [23,27]. El interés en estos nuevos ánodos se debe además a que los materiales ZrO2-CeO2 resultan conductores mixtos (por O2- y e), produciéndose la reacción de oxidación del combustible sobre toda la superficie del electrodo, a diferencia de los conductores electrónicos donde el proceso ocurre sólo en los sitios triples (ánodo/electrolito/gas). Con el desarrollo de estos nuevos materiales de electrodo se han logrado alcanzar densidades de potencia del orden de 0,1 W/cm2 a 600 ºC. De este modo, el desarrollo de materiales nanoestructurados que incluyen nanocatalizadores selectivos 66 posibilita bajar la Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). temperatura de operación de la celda de óxido sólido sin comprometer la cinética electródica. 2.6 OPORTUNIDADES PARA LA APLICACIÓN DE TECNOLOGÍAS DE HIDRÓGENO Generación descentralizada Las plantas descentralizadas de generación de electricidad en base a fuentes primarias de energía renovables (eólica, solar, hidráulica, etc.) pueden tener aplicaciones de alto impacto económico-social en algunos paises de la región iberoamericana de gran extensión territorial, particularmente, Argentina, Brasil y México, como sistemas de abastecimiento de electricidad en zonas rurales o aisladas, distantes de las centrales eléctricas de base, si se tienen en cuenta las pérdidas de energía y el alto costo de capital asociados con la transmisión y distribución de electricidad por líneas de alta tensión. Pero cualquier diferencia diaria o estacional entre la generación de electricidad y su demanda ocasiona la necesidad de disponer de sistemas de almacenamiento de electricidad adecuados. De ahí, que las plantas generadoras de electricidad deben complementarse, como se ha señalado anteriormente, con baterías recargables avanzadas o bien derivando parte de la energía producida durante los 67 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). periodos de baja demanda para electrolizar agua generando hidrógeno, el cual puede posteriormente reconvertirse en electricidad en celdas de combustible de alta eficiencia durante las horas de alta demanda, falta de luz o ausencia de viento. De este modo, las tecnologías de hidrógeno permiten resolver el problema del almacenamiento de las energías primarias y equilibrar el desfase entre generación y consumo. Alternativamente, para generación dispersa, la tecnología de celdas de combustible puede utilizarse para cogeneración de electricidad, calor y vapor de agua, ya sea con fines industriales o para uso doméstico (Fig. 2). En este caso, se admite el uso de otros combustibles, aparte del hidrógeno, tales como gas natural, biogas, metanol, etanol, cortes livianos de petróleo, los cuales, en el estado actual de la tecnología, deben ser previamente reformados en el caso de su utilización en celdas de combustible de baja temperatura como las de tipo PEM. 68 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 2. Planta de celda de combustible. A nivel mundial, entre los desarrollos más recientes en sistemas avanzados de conversión electroquímica de energía para generación dispersa, se pueden mencionar: i.- Generadores de electricidad (tecnología PEM) de potencia entre 1 y 20 kW (Plug Power,Inc., EE.UU.) fabricados para uso en redes de telefonía celular, estaciones de monitoreo y protección catódica de redes de tuberías. Se ha estimado que el mercado potencial de este nuevo nicho está en el orden de varios millones de dólares. ii.- Sistemas de cogeneración de electricidad y calor. Se testean actualmente en EE.UU. y Alemania más de cien unidades de celdas de combustible, desarrolladas por la compañía RWE Fuel Cells para cogeneración doméstica de 69 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). electricidad y calor, con una eficiencia eléctrica de 30-40 % y una eficiencia total de 80-84 %. Transporte vehicular Es un hecho bien conocido que en ciudades densamente pobladas, una de las principales fuentes de contaminación ambiental está constituida por las emisiones (gases tóxicos y material particulado) provenientes de los escapes de los motores de combustión interna de los vehículos de transporte. Cada 160.000 km, el automóvil a gasolina promedio emite 1.300 kg de contaminantes orgánicos gaseosos, 1.250 kg de monóxido de carbono y 85 kg de óxidos de nitrógeno, más cantidades apreciables de material particulado. En este aspecto, la introducción gradual de sistemas de celdas de combustible de tecnología de avanzada para el reemplazo de los motores de combustión interna en la propulsión de vehículos, ofrece las ventajas de un alto rendimiento, funcionamiento silencioso y emisión nula de contaminantes (el producto de reacción es generalmente agua), contribuyendo así a la preservación del medio ambiente. Cabe también mencionar que la alta eficiencia de conversión de las celdas de combustible permite un aprovechamiento máximo de la energía química contenida en los combustibles (hidrógeno, 70 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). biocombustibles, gas natural, etc.), asegurando de este modo el uso racional de los recursos. La tecnología PEM de celdas de combustible se aplica ya en diversos vehículos eléctricos prototipo sin emisión de contaminantes fabricados por las principales compañías que dominan el mercado de automotores mundial. Si bien las celdas de combustible PEM han alcanzado un alto grado de desarrollo, la principal limitación para su aplicación masiva en el transporte vehicular está relacionada con el sistema de almacenamiento de hidrógeno. En el transporte vehicular no sólo importa la energía específica (kWh/kg) y, en este caso, la del hidrógeno es tres veces mayor que la de los hidrocarburos líquidos que constituyen la gasolina (Tabla 2), sino también la densidad de energía volumétrica (kWh/l), ya que interesa el tamaño del tanque de combustible frente al tamaño total del vehículo. De ahí, que además de fabricarse modelos que usan como combustible hidrógeno comprimido a distintas presiones se ha ensayado también el empleo de hidrógeno líquido y de hidruros metálicos que poseen densidades de energía volumétrica mayores. Alternativamente, se ha planteado el uso como combustible de alcoholes líquidos con alto contenido de hidrógeno, ya que, por ejemplo, el metanol tiene una densidad de energía volumétrica de 4,4 kWh/l frente a los 8,8 kWh/l de la gasolina, 71 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). esto es, se requiere un tanque de almacenamiento sólo dos veces mayor. Por otra parte, si el metanol, previo reformado, abastece una celda de combustible, la mayor eficiencia de conversión de este dispositivo, aproximadamente tres veces mayor que la de un motor de combustión interna, hace que para igual autonomía de recorrido sin recarga de combustible, el tanque de almacenamiento de metanol sea del orden o menor que el tanque de gasolina. Así, el vehículo prototipo Necar 5 (con tecnología PEM de Ballard), desarrollado hace unos años, utiliza un sistema de celdas de combustible de 75 kW abastecidas con hidrógeno proveniente del reformado a bordo de metanol, y alcanza una velocidad almacenamiento máxima de de 150 metanol km/h. es de El tanque sólo 40 de litros, proporcionando una autonomía de 450 km, superior a la de un vehículo de combustión interna a gasolina. Por otra parte, emite menos del 10 % de las emisiones tóxicas de los motores de combustión interna. De todos modos, para evitar algunos problemas asociados al uso de un reformador de metanol a bordo, otros fabricantes han privilegiado el desarrollo de vehículos eléctricos impulsados por celdas de combustible de muy alta eficiencia y alimentación directa con hidrógeno comprimido a alta presión. Al respecto, uno de los vehículos eléctricos que al 72 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). momento exhibe el mejor rendimiento, es el Honda FCX, prototipo totalmente calificado para uso en ruta. Pesa 1.670 kg, su autonomía es de 430 km (hidrógeno a 350 bar) y desarrolla una velocidad máxima de 150 km/h. La fuente de potencia es una celda de combustible de 50 kW, con un volumen de 33 litros y un peso de 48 kg. El excelente rendimiento alcanzado se debe al empleo de una nueva membrana de electrolito tipo C-H con grupos sulfonato, con una conductividad eléctrica que es el doble de la de la clásica membrana de Nafion® a -20 °C. El bajo peso de la celda de combustible se ha logrado mediante la fabricación de placas separadoras de metal estampado que ofrecen una menor resistencia de contacto (1/4) y pesan un 20 % menos que las placas de carbón convencionales. En la temporada 2008-2009 Honda ha lanzado al mercado, en California, una versión certificada de línea de producción, denominada FCX Clarity, que se puede arrendar por 3 años a u$s 600/mes. La fuente de potencia es una celda de combustible de 100 kW de 57 litros de volumen y 67 kg de peso que proporciona una autonomía de 410 km y una velocidad máxima de 160 km/h. El vehículo también posee una batería de ion litio como fuente suplementaria de potencia para capturar la energía de la desaceleración y del frenado. 73 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). AGRADECIMIENTOS Los autores agradecen al Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), a la Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT), a la Comisión de Investigaciones Científicas (CIC PBA) y a la Universidad Nacional de La Plata (UNLP) por la financiacion recibida. Se agradece también a los Dres. H.A. Peretti, N.B. Walsoe de Reca y A.M. Castro Luna por la información proporcionada. 74 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. Q. Schiermeier, J. Tollefson, T. Scully, A. Witze y O. Morton, Nature, 454, 816 (2008). S. Srinivasan, Fuel Cells: From Fundamentals to Applications, Springer, New York (2006). D. Haeseldonckx y W. D’haeseleer, Hydrogen from renewables, en Security of Energy Supply in Europe, Editores F. Lévêque, J-M. Glachant, J. Barquín, C. von Hirschausen, F. Holz y W.J. Nuttall, Edward Elgar Publishing Ltd., Cheltenham ,UK (2010). P. Hoffmann, Tomorrow’s Energy, The MIT Press, Cambridge, Massachusets (2002). A. Züttel, Materials Today, Review Features, 24-23 (2003). H.A. Peretti, A. Visintin, M.P. Soriaga y J.H. Baricuatro, Philipp. Scient., 46, 1 (2009). M.V.C. Sastri, B.Viswanathan y S. Srinivasa Murthy, Metal Hydrides. Fundamentals and Applications, Springer Verlag, Berlin (1998). W. E. Triaca, H. A. Peretti, H. L. Corso, A. Bonesi y A. Visintin, Journal of Power Sources, 113, 151 (2003). D.R. Barsellini, A. Visintin, W.E. Triaca y M.P. Soriaga, Journal of Power Sources, 124, 309 (2003). A. Visintin, H.A. Peretti, F. Ruiz, H.L. Corso y W.E. Triaca, Journal of Alloys and Compounds, 428, 244 (2007). F.C. Ruiz, E.B. Castro, S.G. Real, H.A. Peretti, A. Visintin, W.E. Triaca, International Journal of Hydrogen Energy, 33, 3576 (2008). J.P. Meyers, Interface, 17, 36 (2008). V.R. Stamenkovic, B. Fowler, B.S. Mun, G. Wang, P.N. Ross, C.A. Lucas y N.M. Markovic, Sciencexpress, p. 1, January 11 (2007). J. Solla-Gullón, P. Rodriguez, E. Herrero, A. Aldaz y J.M. Feliu, Phys. Chem. Chem. Phys., 10, 1359 (2008). 75 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. A.J. Arvia, R. Salvarezza y W. E. Triaca. Journal of New Materials for Electrochemical Systems, 7, 133 (2004). G. Andreasen, D. R. Barsellini, A. Visintin y W.E. Triaca, World Hydrogen Technologies Convention 2007, Proceedings WHTC 2007, Montecatini, Italia. G.A. Camara y T. Iwasita, J. Electroanal. Chem., 578, 315 (2005). E. Antolini, J. Power Sources, 170, 1 (2007). H-F. Wang y Z-P. Liu, J. Am. Chem. Soc., 130, 10996 (2008). F. Colmati, E. Antolini y E.R. Gonzalez, J. Alloys and Compounds, 456, 264 (2008). J.R. Salgado, E. Antolini y E.R. Gonzalez, Appl. Catal. B. Environ., 57, 283 (2005). A.M. Castro Luna, A. Bonesi, W.E. Triaca, V. Baglio, V. Antonucci y A.S. Aricò, J. Solid State Electrochem., 12, 643 (2008). N. E. Walsöe de Reca, Anales Acad. Nac. Cs. Ex. Fis. y Nat., 59, 59 (2007). S. Park, J. M. Vohs y R. J. Gorte, Nature, 404, 265 (2000). T. W. Napporn, X. Jacques-Bédard, F. Morin y M. J. Meunier, J. Electrochem. Soc., 151, A 2088 (2004). M. D. Cabezas, D. G. Lamas, M. G. Bellino, R. O. Fuentes y N. E. Walsöe de Reca, ECS Transactions, Solid Oxide Fuel Cells, 7, 955 (2007). J.I. Ruiz de Larramendi, D. Lamas, A. Fernández, T. Rojo y N. E. Walsöe de Reca, ECS Transactions, Solid Oxide Fuel Cells, 7, 1147 (2007). 76 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REMEDIACIÓN DE AGUAS RESIDUALES MEDIANTE EL USO DE NANOTECNOLOGÍA Consuelo Montes de Correa E-mail: [email protected] Universidad de Antioquía (Colombia). 3.1 Los INTRODUCCIÓN problemas de escasez del agua, fuentes de abastecimiento poco confiables y mala calidad del recurso son tres grandes obstáculos para alcanzar el desarrollo sostenible. Millones de niños mueren al año por falta de agua o por la exposición a enfermedades relacionadas con ella. La ONU pronostica que hacia 2025 más de la tercera parte de la población mundial (es decir, más de 3.500 millones de personas) afrontará serios problemas de escasez de agua. La lucha por asegurar que toda la población tenga acceso al agua potable ha sido consagrada en los Objetivos de Desarrollo del Milenio de la ONU, al proponer que en 2015 se reduzca a la mitad la cantidad de personas carentes de acceso sostenible al agua potable. Según el Programa 77 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Mundial de Evaluación de los Recursos Hídricos, lograrlo significaría mejorar el abastecimiento de agua de 1.500 millones de personas. El mundo se enfrenta a enormes desafíos en el cumplimiento de las crecientes demandas de agua potable, así como de los suministros disponibles de agua dulce que están disminuyendo debido a sequías prolongadas y el crecimiento demográfico. Por otra parte, la creciente contaminación de las aguas subterráneas y superficiales con una amplia variedad de fuentes industriales, municipales y agrícolas ha contribuído a reducir el suministro de agua dulce para uso humano. Aunque la naturaleza de los problemas de contaminación puede variar, por lo general se deben a un saneamiento inadecuado, las floraciones de algas por el fósforo y el nitrógeno contenido en los desechos humanos y animales, detergentes y fertilizantes, plaguicidas, productos químicos, metales pesados, la salinidad causada por el riego generalizado e ineficiente y las cargas de sedimentos resultantes de la erosión del suelo. Dada la importancia del agua potable y teniendo en cuenta las preocupaciones sobre la viabilidad de las prácticas actuales y de la creciente demanda del agua, existe una clara necesidad de desarrollar 78 nuevas tecnologías y Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). materiales para el suministro de agua potable. La nanotecnología se ha identificado como una tecnología que podría desempeñar un papel importante para resolver o mitigar muchos de los problemas relacionados con la purificación y la calidad del agua. El desarrollo potencial de la nanotecnología en este campo es en 3 áreas: Tratamiento y remediación, censado y detección, prevención de polución. El desarrollo se traduce en costos más bajos, mayor sensibilidad (en el caso de sensores) y efectividad a la hora de aplicar los métodos. La nanotecnología abarca la creación y utilización de materiales, dispositivos y sistemas a nivel de átomos y moléculas, que abarcan disciplinas como la química, física, biología, ingeniería y ciencia de los materiales. Los nanomateriales y nanoestructuras tienen dimensiones que van desde 1 a 100 nm, y con frecuencia muestran propiedades físicas, químicas y biológicas únicas como resultado de su estructura, mayor superficie por unidad de volumen y los efectos cuánticos que ocurren en la nanoescala. El rápido crecimiento de la nanotecnología ha estimulado gran interés en las aplicaciones ambientales de nanomateriales. En particular, su potencial de revolucionar procesos convencionales de tratamiento de agua ha sido anunciada recientemente. Los nanomateriales son excelentes 79 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). adsorbentes, catalizadores y sensores debido a su gran área superficial específica y de alta reactividad. Más recientemente, varios nanomateriales naturales y artificiales también han demostrado propiedades antimicrobianas, incluyendo quitosano, nanopartículas de plata (NAG), el TiO2 fotocatalítico, fulerol, nanopartículas acuosas de fulereno (NC60), y los nanotubos de carbono (CNT). A diferencia de desinfectantes químicos convencionales, estos nanomateriales antimicrobianos no son oxidantes fuertes y son relativamente inertes en el agua. Por tanto, se espera que no produzcan subproductos de desinfección nocivos. Si se incorporan adecuadamente en los procesos de tratamiento, tienen el potencial de sustituir o mejorar la desinfección por métodos convencionales. Esto es de particular interés para las regiones que no tienen acceso a un suministro confiable de agua potable. Se prevé que los nanomateriales funcionales, incluyendo aquellos con propiedades antimicrobianas, se pueden aplicar a sistemas a pequeña escala no conectados a una red central. También tendrían aplicación potencial para responder a emergencias debido a eventos catastróficos. Por ejemplo, cuando una inundación o un tifón interrumpen el suministro de agua. 80 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 3.2 TECNOLOGÍAS EXISTENTES Entre las áreas de aplicación de la nanotecnología para el tratamiento de aguas residuales se encuentran las nanopartículas utilizadas como adsorbentes potentes, en algunos casos en combinación con partículas magnéticas para facilitar la separación de partículas; nanopartículas utilizadas como catalizadores para la industria química o destrucción de los contaminantes fotoquímicos; hierro zerovalente nanométrico utilizado para la remoción de metales y compuestos orgánicos en agua, y las membranas de nanofiltración. 3.3 ADSORCIÓN DE LOS CONTAMINANTES Los adsorbentes como el carbón activado y las resinas de intercambio iónico se usan ampliamente en el tratamiento y purificación de agua para remover contaminantes orgánicos e inorgánicos. No obstante, el uso de nanopartículas puede tener ventajas sobre los materiales convencionales debido a la mayor área superficial de las nanopartículas por unidad de masa. Además, las propiedades estructurales y electrónicas únicas de algunas nanopartículas las hace adsorbentes poderosos. Muchos materiales 81 tienen propiedades que Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). dependen del tamaño. Las partículas de hematita con un diámetro de 7 nm, por ejemplo, adsorbieron los iones Cu a menores valores de pH que las partículas de 25 o 88 nm de diámetro, lo que indica la singularidad de reactividad en la superficie de partículas de óxidos de hierro con la disminución del diámetro. Varios tipos de nanopartículas se han investigado como adsorbentes: partículas que contienen metales, principalmente óxidos, nanotubos de carbono y fulerenos, los nanomateriales orgánicos y zeolitas. Para la eliminación de metales y otros iones inorgánicos, se han investigado principalmente óxidos de metales nanométricos, y arcillas nanométricas naturales. Por otra parte, los nanotubos de carbono (CNTs) oxidados e hidroxilados son buenos adsorbentes de metales. Esto se ha encontrado para diversos metales como el Cu, Ni, Cd y Pb. La adsorción de los compuestos organometálicos en CNT puros de varias paredes se encontró que es más fuerte que para el negro de carbón. Los nanomateriales químicamente modificados también han llamado mucho la atención, sobre todo materiales nanoporosos debido a su superficie excepcionalmente alta. Sin embargo, el tamaño de partícula de estos materiales no está en el nano-rango, pero normalmente entre 10químicamente las nanopartículas. El TiO2 funcionalizado con 82 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). etilendiamina se ensayó para retirar metales aniónicos de las aguas subterráneas. Los nanotubos de carbono han atraído mucho la atención como adsorbentes muy poderosos para una amplia variedad de compuestos orgánicos en agua. Los ejemplos incluyen las dioxinas, hidrocarburos aromáticos polinucleares (HAP), el DDT y sus metabolitos, los PBDE, clorobencenos y clorofenoles, trihalometanos, el bisfenol A y nonilfenol, ftalato ésteres, colorantes, pesticidas (tiametoxam, imidacloprid y acetamiprid) y herbicidas, tales como: los derivados de Sulfuron, la atrazina y dicamba. Los polímeros nanoporosos entrecruzados copolimerizados con nanotubos de carbón funcionalizados tienen alta capacidad de adsorción para una variedad de compuestos orgánicos, tales como p nitro fenol y tricloroetileno. A diferencia del caso de los fulerenos, no se observó histéresis indicando adsorción reversible. Los fulerenos también han sido probados para la adsorción de compuestos orgánicos. La adsorción depende en gran medida del estado de dispersión de C60, que es virtualmente insoluble en agua. Debido a que las formas C60 presentan agrupaciones en el agua, hay espacios intersticiales dentro de los agregados en los cuales los compuestos se pueden difundir, lo que conduce a histéresis de adsorción y desorción. 83 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Los fulerenos son sólo sorbentes débiles para una amplia variedad de compuestos orgánicos (por ejemplo fenoles, hidrocarburos aromáticos policíclicos, aminas), mientras que son muy eficaces para la eliminación de los compuestos organometálicos (por ejemplo, organo-plomo). Zeolitas Nanocristalinas Las zeolitas son sustancias cristalinas a base de aluminio, silicio y oxígeno muy conocidas por sus aplicaciones petroquímicas como catalizadores. Entre las propiedades más interesantes se encuentran: gran área y estabilidad hidrotérmica. El área se atribuye a la cantidad de poros que poseen. Aunque son de tamaños muy grandes (1,000 a 10,000 nm, o 1 consideran nanomateriales. A nivel de investigación se obtienen de 100 nm y ofrecen propiedades muy diferentes a las de gran tamaño como mejor área y hasta 50% mayor adsorción. En el tema de remediación las zeolitas tienen la capacidad de atrapar los compuestos catiónicos como el amonio y metales pesados por ejemplo 157 Cs y 90 Sr que son elementos radioactivos y el MTBE que es un aditivo de gasolinas. Es importante tener en cuenta que hoy día se investiga en emulsiones que contienen zeolitas (SMZ). 84 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Monocapas Autoensambladas en Soportes Mesoporosos (Samms) Las monocapas autoensambladas en soportes mesoporosos (SAMMS) básicamente consisten en un cerámico donde se depositan ordenadamente moléculas con grupos funcionales alternados, generalmente el arreglo es en forma de panal de abeja. Su producción no es nada fácil y requiere de varios pasos para obtener un buen arreglo. Las SAMMS son muy variadas en el tipo de moléculas empleadas y por tanto, pueden atrapar una infinidad de contaminantes en especial metales de todo tipo desde los metales de transición hasta los 85 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). actínidos y lantánidos. Este tipo de técnicas sólo se han llevado a nivel de laboratorio y pocas veces en plantas piloto. Polímeros y dendrímeros Los polímeros especialmente diseñados y dendrímeros se explotan para la eliminación potencial de metales y compuestos orgánicos. Los dendrímeros son polímeros con arreglos espaciales y formas determinadas, su arreglo es altamente manejable propiedades que va lo que a tener permite la establecer las macromolécula. Los dendrímeros están constituidos de un núcleo y ramificaciones internas. Su diámetro está entre 2 a 20 nm y las formas más comunes son conos, cuadrados y discos. Algunos ejemplos de dendritas Al igual que las SAMMS las dendrímeros poseen un uso muy amplio que permite aplicaciones casi en cualquier campo (hay una empresa que ofrece más de 40 tipos de dendrímeros), por ejemplo las poli(amidoaminas) PAMAM son 86 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). especialmente diseñadas para el tratamiento de aguas con el fin de capturar los metales de transición. Nanoparticulas Poliméricas Las nanopartículas poliméricas son sustancias muy similares a los surfactantes que poseen una cabeza y una cola, por tanto son efectivas para formar micelas. La única diferencia con los surfactantes es la forma como se sintetizan. El tipo de molécula que se utiliza para la remediación de aguas son los poliuretanos polímeros es amfifílicos que (APU). permite La importancia reemplazar los de estos tradicionales surfactantes utilizados en sistemas de “ Bombear y tratar (pump and treat)”. Estas tecnologías cada vez van siendo más implementadas para disminuir la ineficiencia de este tipo de plantas. Nanoparticulas Enzimáticas (SENs) Las enzimas tienen un gran campo de acción en ciencias como el biosensado, conversión química y bioremediación, además de ser excelentes catalizadores (mucho mejores que los sintéticos). Sin embargo, las enzimas tienen un período de vida útil muy corto lo cual crea una gran desventaja respecto a otros catalizadores. Las SENs consisten de enzimas rodeadas 87 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de capas de silicio que evitan la descomposición de la enzima. Los estudios de las SENs son muy recientes, la primera de estas fue producida en 2003 a base de quimotripsina. El proceso consiste de 3 etapas: modificación de la enzima, el mezclado de los monómeros de silicio con la enzima y por último hidrólisis para la deposición del silicio. En cuanto a remediación estas enzimas actúan muy bien degradando los compuestos recalcitrantes, es claro que para un contaminante específico se deba utilizar una enzima específica. Entre las características más importantes de las enzimas cabe mencionar que resisten variaciones de pH y cambios de temperatura. Entre las más conocidas se encuentran: peroxidasa, polifenol oxidasa, tirosina, deshalogenasa, etc. Polímeros Sintonizados En la tecnología de polímeros sintonizados se pretende sintetizar proteínas de la manera más organizada posible utilizando técnicas de recombinación del ADN, el fin es determinar tamaño, funciones, composición y orden dentro de la proteína a sintetizar. Dichas modificaciones traen consecuencias como solubilidad, forma de la proteína al aumentar la temperatura, cambios 88 moleculares al ser Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). sometidos a condiciones diferentes de pH, presión y otros. Estos polímeros solo han sido sintetizados en laboratorio con el fin de atrapar o bloquear metales en aguas residuales, tales como cadmio y cobre. El ejemplo más relevante es la proteína MerR la cual se creó para atrapar específicamente el mercurio incluso en soluciones donde había presentes otros metales. Nanopartículas Magnéticas Las nanopartículas magnéticas ofrecen ventajas con respecto a las no-magnéticas porque pueden ser fácilmente separadas del agua usando un campo magnético. La separación usando gradientes magnetic gradient magnéticos como separation (HGMS) el llamado es un High proceso ampliamente usado en medicina y en procesamiento de minerales. Esta técnica permite diseñar procesos donde las partículas no solo remueven compuestos del agua sino que también pueden ser removidas de nuevo, luego recicladas o regeneradas. Esta estrategia ha sido propuesta nanopartículas de magnetita (Fe3O4 con -Fe2O3) and jacobsita (MnFe2O4) para la remoción de cromo (VI) de aguas residuales. Los nanotubos de carbón han sido funcionalizados con nanopartículas magnéticas de hierro 89 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). para la remoción de compuestos aromáticos de agua y la separación fácil del agua para reuso. Fotocatálisis Los métodos fotocatalíticos emplean reacciones activadas por el sol para eliminar los contaminantes y microorganismos. Estos incluyen el uso de nanopartículas de dióxido de titanio (TiO2) que puede estar recubierto de varios materiales de sustrato. Las partículas de TiO2 pueden eliminar organismos como Clostridium perfringens, que es resistente al cloro. La velocidad de degradación de varias tintas con nanopartículas de TiO2 fue de 1.6-2.0 veces mayor que con partículas granulares. Varios tipos de compuestos tales como tintas y ácidos orgánicos han demostrado que se degradan rápidamente. Un tipo especial de fotocatalizadores son los nanotubos de TiO2 que han demostrado actividad muy superior en la degradación de contaminantes. Hierro Cerovalente El hierro metálico nanoescalar es muy efectivo en la destrucción de una gran variedad de contaminantes comunes tales como compuestos clorados, brominados, trihalometanos hidrocarburos policlorados, pesticidas y tintas. 90 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La base para la reacción es la corrosión del hierro cerovalente en el ambiente. Contaminantes tales como tetracloretano pueden aceptar fácilmente los electrones de la oxidación del hierro y ser reducido a eteno. Los derivados del hierro pueden llegar a ser más eficientes y económicos que el ZVI por ejemplo el Nanoscale Zero Valent Iron (nZVI) con un diámetro que oscila entre 100 y 200 nm (en laboratorio se obtienen con un diámetro de 100 nm el 90% de las partículas). Puede producirse por medio de la reacción química: Fe(H2O)63+ + 3BH4 + 3H2O ÆFe0 + 3B(OH)3 + 10.5H2 El nZVI puede reducir no solo contaminantes orgánicos sino también aniones inorgánicos como: nitrato que es reducido a amoníaco, perclorato que es reducido a cloro, selenato, 91 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). arsenato, arsenito y cromato. nZVI también es eficiente para remover metales disueltos en solución, por ejemplo Pb y Ni. Las velocidades de reacción de nZVI son al menos 25-30 veces más rápidas y la capacidad de adsorción es mucho mayor comparada con la de hierro granular. Los metales son reducidos a los metales cerovalentes o estados de oxidación menores. El Cr (III) puede formar complejos con óxidos de hierro que se forman durante la reacción. Algunos metales pueden incrementar la velocidad de declorinación de los orgánicos para la obtención de productos más benignos, mientras que otros metales decrecen la reactividad. Otra técnica utilizada es Reactive Nanoscale Iron Product (RNIP) es una mezcla de hierro y magnetita (Fe 3O4), en donde el núcleo es un átomo de α-Fe rodeado por una capa de (Fe3O4). Estas partículas pueden tener diámetros de 70 nm y un 2 área de 28.8 m /g. En estudios recientes donde se han comparado el (nZVI) y el (RNIP) sugieren que el primero tiene una mayor área inicialmente debido a la presencia de boro en su capa externa y declora rápidamente al tricloroetano (TCE). El problema es que la molécula no dura activa mucho tiempo. En cambio el (RNIP) muestra una decloracion lenta con el (TCE) y no reacciona con el agua debido a su capa de magnetita. 92 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Una técnica más avanzada que las ya expuestas es la Bimetallic Nonsocial Iron Particles (BNIP) en donde una partícula como el ݁ܨ se cubre con una capa de paladio (Pd). Pueden utilizarse más metales como plutonio, oro y níquel. Las investigaciones demuestran que los (BNIP) decloran compuestos entre 10 y 100 veces más rápido que el (ZVI). El uso de emulsiones de hierro Zero Valente (EZVI) que se preparan con aceites biodegradables, agua y nZVI pueden tener diámetros de 40 nm y con una gravedad específica de 1,1 lo que las hace muy reactivas por su gran área. En la siguiente tabla se muestran los contaminantes que pueden ser atacados por nano partículas de hierro. Tetracloruro de carbono Chloroformo Diclorometano Crisoidina cis-Dicloroeteno Tropaeolina trans-Dicloroeteno Naranja ácido 1,1-Dicloroeteno Clorometano Rojo ácido Cloruro de Vinilo Hexaclorobenceno Mercurio PCBs Pentaclorobenceno Niquel Dioxinas Tetraclorobencenos Plata Pentacloropenol Triclorobencenos Cadmio 93 N-Nitrosodimetilamina NDMA Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Diclorobencenos Clorobenceno DDT Lindano Naranja II 3.4 Bromoformo Dibromoclor ometano Diclorobrom ometano Tetracloroet ano Tricloroeten o TNT Dicromato Arsenico Perclorato Nitrato VENDEDORES COMPAÑIA PRODUCTO PRECIO POR LIBRA (us) Polyflon Company nZVI PARS Environmental, Inc. NanoFe Wei-xiang Zhang of Lehigh nZVI 45 University OnMaterials Z-loy 20 Toda Kogyo Corporation RNIP 26 a 34 Nanitech LLC Polymetallix 94 77 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 3.5 PARTICULAS BIMETÁLICAS Y OTROS METALES Como ya se había dicho antes en partículas bimetálicas se pueden utilizar diferentes metales al hierro y el paladio, por ejemplo, el zinc tiene propiedades similares al hierro y metales como el níquel, cobalto, plata y cobre pueden llegar a sustituir al paladio sin desmejorar la efectividad. Pero metales inertes como el aluminio y oro no muestran buenos resultados al cubrir el hierro. Una nueva combinación de metales muy prometedora es el paladio recubierto con átomos de oro (Au) puesto que el Au mejora considerablemente las propiedades catalíticas del paladio, dicha combinación puede ser 100 veces más efectiva que el mismo paladio, dicha efectividad se alcanza cuando se forma una monocapa superficial de oro. Otra de las grandes ventajas que tiene esta combinación es que no se desgasta como el nZVI y Pd-ZVI y por lo tanto puede reutilizarse. El problema radica en su inversión inicial ya que el oro y paladio son costosos pero si se analiza a largo alcance la inversión es baja comparada con los beneficios. El Pd-ZVI habría que reemplazarlo regularmente lo que lo vuelve más costoso que el Pd-Au. Pero en el caso de hacer una inyección, sería más conveniente hacerla con nZVI ya que este no es necesario recuperarlo. Actualmente, se trabaja en dos proyectos: el primero consiste en poner nanopartículas en 95 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). membranas para filtrar aguas residuales o de suelo y así luego de hacer la filtración se recogen las nanopartículas. La segunda tecnología consiste en usar nanopartículas en polvo que al final se recogen por filtración. Ferritina La ferritina es una proteína de la mayoría de seres vivos como plantas y animales, cuya función principal es guardar hierro, además de controlar la formación de estructuras minerales. Aprovechando esta capacidad se puede utilizar la ferritina para encapsular las nanopartículas. Una macromolécula puede contener hasta 4500 átomos de hierro. La ferritina tiene aplicaciones en el área de fotocatálisis, ya que el hierro se reduce en presencia de luz y la ferritina actúa libremente en la luz debido al efecto de encapsulamiento. Por último, se ha demostrado experimentalmente que la ferritina es capaz de reducir el cromo Cr(VI) a Cr(III). La ferritina también ataca al Tecnecio proveniente de desechos nucleares, el cual es fuertemente contaminante. Nanofiltración Las membranas de nanofiltración (NF) son usadas en el tratamiento de aguas para la obtención de agua potable y 96 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). para el tratamiento de aguas residuales. Las membranas de NF son membranas sujetas a presión con propiedades entre las de ósmosis inversa y ultrafiltración y tienen poros entre 0.2 y 4 nm. Se ha demostrado que las membranas de NF remueven iones inorgánicos, tales como: Ca y Na, la turbidez y microorganismos. Las membranas de NF se usan para el ablandamiento de aguas subterráneas (reducción de la dureza del agua), para la remoción de materia orgánica disuelta y trazas de contaminantes de aguas superficiales, para tratamiento de aguas residuales (contaminantes orgánicos, inorgánicos y carbón orgánico) y para tratamiento previo a la desalación de agua de mar. 3.6 TOXICIDAD Y SEGURIDAD La investigación acerca de esta temática ha sido poca ya que algunas sustancias presentan propiedades similares a sus elementos en forma común (propiedades toxicológicas no físicas, ni químicas) además estas tecnologías son muy recientes y solo se estudian a nivel de laboratorio. Sin embargo, se cree que en poco tiempo salgan publicaciones y estudios referentes a cómo las nanopartículas pueden afectar el medio ambiente, la vida animal, vegetal y humana. “Las cadenas alimenticias en sus niveles primarios pueden ser gravemente afectadas por la inyección de nanopartículas” 97 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). pues las mismas propiedades que pueden ser perjudiciales para el medio ambiente pueden ser una ventaja para aplicaciones técnicas y explotadas para el tratamiento y remediación. subterráneas Para la recuperación eficiente de aguas son necesarias partículas con una gran movilidad, pero al mismo tiempo, esta característica hará que sean más difíciles de eliminar durante tratamiento de agua. La actividad catalítica de una nanopartícula puede ser ventajosa cuando se utilizan para la degradación de los contaminantes, pero puede inducir una respuesta tóxica en las células. La alta capacidad de adsorción de ciertas nanopartículas se explota para la contaminantes orgánicos e inorgánicos eliminación de mientras que esta propiedad puede movilizar contaminantes secuestrados en el medio ambiente. 98 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). LA INFORMÁTICA BIOMÉDICA COMO CAMINO CRÍTICO PARA CONSEGUIR LA CONVERGENCIA DE TECNOLOGÍAS NBIC EN SALUD Victoria López Alonso, Guillermo López Campos y Fernándo Martín Sanchez. E-mail: [email protected] Área de Bioinformática Médica- Instituto de Salud Carlos III 4.1 INTRODUCCIÓN. CONVERGENCIA DE TECNOLOGIAS EN SALUD Los importantes avances que se están produciendo en los últimos años en nanotecnología (Nano), biotecnología (Bio), tecnologías de la información (Info/TICs), y nuevas tecnologías basadas en las ciencias cognitivas (Cogno), llevan a esperar que la convergencia de estas ciencias y tecnologías, convergencia NBIC, produzca importantes desarrollos tecnológicos innovadores que contribuyan a la mejora de la calidad de vida, con fuertes impactos tanto económicos como sociales. Desde hace unos años se han elaborado a 99 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). nivel internacional los primeros informes y propuestas para determinar las sinergias entre estas tecnologías. En el año 2001 la Fundación Nacional de Ciencias (NSF) de Estados Unidos fué la primera en elaborar el informe “Convergencia NBIC, campo de investigación multidisciplinar de las interacciones entre sistemas vivos y sistemas artificiales para el diseño de dispositivos que biotecnología, combinen la tecnologías telecomunicaciones y de las nanotecnología la ciencias información cognitivas” con la y las [1] y posteriormente en Canadá en el año 2003 se elaboró el documento “Bio-Systemics Synthesis” [2]. En el año 2004, la Comisión Europea (CE) creó también un grupo de trabajo, denominandolo con el término nuevo CTEKS (Tecnologías Convergentes para la Sociedad de Conocimiento Europeo), englobando también aspectos de prevención y de hábitos de vida que abarcan la sociología, la antropología y la filosofía [3]. El objetivo final de todos estos informes era definir la convergencia NBIC, asesorando e impulsando acciones en Investigación (herramientas tecnologías, materiales para cada área), Infraestructura y educación. Parece claro que la integración de tecnologías NBIC debería producirse en la nanoescala donde átomos, código de ADN, neuronas y bits podrían llegar a ser intercambiables, sin embargo en la actualidad 100 y gracias al gran poder Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). computacional es en la escala giga donde se está produciendo ya la integración, debido a los avances en tecnologías de la información y las comunicaciones. Uno de los claros escenarios de aplicación de la convergencia NBIC es el de la biomedicina, para el estudio de los mecanismos moleculares, bioquímicos y celulares de las enfermedades, su prevención y tratamiento, la medicina clínica, y en general la salud pública. Ya se está produciendo la convergencia aunque a un nivel todavía incipiente y se están impulsando proyectos abordados en gran medida por Redes de investigación que facilitan las interacciones de grupos que trabajan en las distintas disciplinas. 4.2 CONVERGENCIA BIO-INFO EN SALUD La genómica y las tecnologías postgenomicas se han desarrollado como consecuencia de la convergencia entre biotecnología e informática. Gracias a los avances realizados en Bioinformática se ha podido obtener la secuencia del genoma humano en el año 2003, encontrando diferencias tan sólo del 0.5% para el genoma entre dos personas, debidas en muchos casos a los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) que condicionan la susceptibilidad o resistencia genética a una enfermedad, así como el metabolismo y las reacciones 101 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). adversas a fármacos. La investigación actual en biomedicina está dirigida a este tipo de estudios así como hacia la transcriptómica, proteómica y metabolómica para encontrar marcadores de enfermedades y terapia individualizada (Medicina personalizada), requiriendo el uso de la Bioinformática para poder interpretar, almacenar y utilizar toda la información disponible [4]. En diciembre de 2001, la Comisión Europea (CE) organizó la reunión científica denominada "La sinergia entre la investigación en Informática Médica, Bio-informática y NeuroInformática: Conocimiento de Salud Individual y el bienestar", para explorar la convergencia de estas disciplinas en el marco de la medicina personalizada. Esta reunión fue el inicio del proyecto BIOINFOMED [5] que elaboró un Libro Blanco para estudiar la sinergia Bioinformática entre proponiendo la Informática Médica una Agenda europea y la de Investigación en Informática Biomédica (BMI). En octubre del 2004, la CE organizó otro Taller denominado "Las TICs en la encrucijada con las Ciencias de la Vida" [6] cuyo objetivo fue llevar a cabo un debate científico sobre la vision y nuevos desafíos entre las TICs y la Bio, e identificar una agenda de investigación para informar sobre las posibles áreas a tratar en las convocatorias futuras de proyectos de inestigación. Posteriormente el proyecto, “Beyond the Horizon” [7], estudió 102 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). la convergencia Info-Bio desde la perspectiva opuesta, centrandose en el análisis de la diversidad, modelos y comportamientos biológicos que podrían servir de inspiración para generación de sistemas informáticos (informática Bioinspirada) [8]. Estas dos formas de abordar la convergencia se muestran en la Figura 1. Figura 1. Tanto la Bioinformática como la computación B ioinspirada resultan de la convergancia de las tecnologías Bio e Info con numerosas aplicaciones en medicina. 103 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La C.E. también financió el proyecto SYMBIOmatics “Analizando las Sinergias entre la Informática Médica y la Bioinformática” [9], coordinado por el EBI (Insitituto Europeo de Bioinformática), que elaboró un Libro Blanco con el objetivo de acelerar la innovación y la investigación en informática biomédica, para mejorar la eficiencia en el desarrollo de sistemas y herramientas para la prevención, diágnóstico y tratamiento de enfermedades [10]. Tras decadas de avances en el desciframiento de los componentes moleculares de los seres vivos, los biologos moleculares y los investigadores computacionales están ahora utilizando la información acumulada y representándola en complejas redes de células, tejidos, organismos y poblaciones. 4.3 CONVERGENCIA BIO-NANO EN SALUD En el año 2007 se celebró en Arlington el primer “Workshop on Nanoinformatics Strategies” [11] y desde entonces los Institutos Nacionales de Salud y el Instituto Nacional del cancer de EEUU han financiado iniciativas relacionado con la aplicación de la Nanoinformática en medicina. En Europa, el proyecto ACTIÓN Grid [12] iniciado en junio del 2008 con el apoyo de la Comisión Europea, ha configurado un plan de trabajo en Informática Biomédica y la tecnología Grid, para promover el desarrollo de la Nanoinformática. En el análisis realizado por 104 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). ACTIÓN Grid, se han puesto de relieve las posibilidades futuras de la Nanoinformática: bases de datos y de conocimiento de las nanopartículas (modelos e interacciones biológicas), integración basada en ontologías y minería de texto, estándares, normativas de seguridad…. La nanotecnología perspectivas a la también industria está en abriendo nuevas nanocomputación, nanoelectrónica y nanofotónica como posibles alternativas para las nuevas arquitecturas y diseños para las próximas generaciones de ordenadores, que seguramente será también aplicada al análisis computacional de la información generada en la investigación biomédica [13]. Los nuevos avances en nanomedicina [14] abarcan desde las imágenes generadas mediante la utiliación conjunta de nuevos agentes moleculares y técnicas de imagén médica para la visualización de procesos biológicos, celulares o moleculares, hasta las aplicaciones de la nanotecnología para desarrollar nuevos sistemas de liberación de fármacos. La aplicación de nuevas tecnologías a la medicina regenerativa es también un área emergente que busca fundamentalmente la reparación o reemplazamiento de tejidos y organos mediante la aplicación de métodos procedentes de terapia génica, terapia celular, dosificación 105 de sustancias Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). bioregenerativas e ingeniería tisular. En todos estos nuevos avances de la medicina la nanoinformática tendrá un papel clave para ayudar a organizar, estandarizar, comparar, analizar y visualizar la gran cantidad de datos obtenidos. En el terreno de la seguridad en nanomedicina proyectos como NanoSOST [15] se realizaron con el objetivo de crear el conocimiento y garantizar uso el establecer seguro las de bases científicas para nanopartículas, materiales nanoestructurados en general y su comportamiento tanto de forma aislada como en el proceso productivo final, con el fin de favorecer un desarrollo industrial sostenible que esté en consonancia con las consideraciones sociales y que garantice la salud y seguridad tanto de trabajadores como de consumidores. 4.4 Se CONVERGENCIA INFO-COGNO espera que los logros que se EN SALUD produzcan en la convergencia Info-Cogno en salud contribuyan a la mejora a nivel de prevención, diagnóstico o tratamiento de los trastornos del sistema nervioso. Los neurocientíficos ya están utilizando métodos de imagen y análisis en el laboratorio para investigar el cerebro cada vez con un mayor nivel de detalle, generando una avalancha 106 de datos complejos y Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). heterogéneos que deben ser procesados y analizados. Esta investigación ha provocado enorme interés en neuroinformática, especialidad que se ha definido como la fusión de las ciencias de la información con las neurociencias [16]. En julio de 2005, investigadores de la École Polytechnique Fédérale de Lausana e IBM anunciaron una nueva iniciativa de investigación, un proyecto para crear un modelo funcional del cerebro. Este proyecto suponía la primera iniciativa de investigación mediante ingeniería reversa del cerebro para entender su funcionamiento utilizando detalladas simulaciones. El “Human Cognome Project” se ha propuesto ayudar a trazar la estructura y función del cerebro humano [17]. Por otro lado la próxima generación de sistemas de apoyo a la toma de decisiones y los sistemas de inteligencia artificial pueden ayudar a complementar ciertos procesos cognitivos a través de interfaces neuronales híbridas, sensores ó fármacos. 4.5 CONVERGENCIA INFO-BIO-NANO EN SALUD El avance de las tecnologías de miniaturización ha facilitado el estudio de la diversidad biológica de la materia a escalas inimaginables. La posibilidad de visualizar moléculas biológicas en la escala nano abre la puerta al desarrollo de sistemas 107 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). artificiales que interactúan con la materia viva, contribuyendo de manera significativa al progreso en varios campos de la medicina. Diversas nanoherramientas se están desarrollando y aplicando al estudio de material biológico, permitiendo un enfoque que se puede definir como trabajar con un "Nanoscopio" que facilitara a los científicos visualizar y así manipular los sistemas vivos desde el nivel más bajo [18]. Algunos ejemplos de estas nuevas herramientas nanotecnológicas son los puntos cuánticos, utilizados para marcaje de biomoléculas, o los bionanosensores que utilizan moléculas biológicas como material de detección [19]. La biología también se puede tomar como un modelo para otras construcciones artificiales, como utilizar los virus para la fabricación de nanopartículas, o adaptar a los ribosomas funciones como interruptores moleculares. Ejemplos de convergencia Nano-Bio-Info con aplicaciones en medicina son por ejemplo sistemas inteligentes de administración de fármacos [20], imagen molecular [21], y los biosensores [22]. 108 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 4.6 RELEVANCIA DE LA CONVERGENCIA NANO-BIOINFO-COGNO (NBIC EN SALUD) El número de aplicaciones de las tecnologías convergentes en salud es muy amplio [23], ya que la miniaturización está facilitando la construcción de dispositivos a nivel nano que facilitan el desarrollo de la nanomedicina y la medicina regenerativa [24]. Las empresas farmacéuticas están evaluando la aplicación de estas tecnologías por ejemplo para el desarrollo y la reformulación de medicamentos. Algunos ejemplos son: - Investigación: el desarrollo de órganos artificiales facilitará el modelado de los efectos toxicológicos de sustancias químicas y medicamentos. Con los ultrasecuenciadores de ADN basados en nanoesferas o nanoporos se podrán leer genomas completos individuales en pocos días y a un precio asequible. - Test en el punto de atención al paciente: tecnologías como los nanoarrays lab-on-a-chip, los permitirán detección la microarrays y los rápida de enfermedades y los resultados obtenidos podrán incorporarse a sistemas para la toma de decisiones. 109 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). - Sensores: para la detección de biomarcadores de contaminación ambiental. Sensores en la ropa que permitan monitorizar propiedades fisiológicas o incluso que puedan transmitir datos on-line para seguimiento de pacientes. - Imagen: los métodos de imagen molecular ayudaran a poder obtener patrones de expresión y otros procesos biológicos “in vivo” que facilitaran la detección temprana de enfermedades. - Terapia: localizar las dianas para la liberación de los fármacos minimizará también los efectos secundarios. - Prótesis: nuevos materiales, ortopedia biocompatible, y prótesis inteligentes podrán interactuar con señales del cerebro del paciente y transmitir información sensorial. Los resultados de la ingeniería tisular permitirán la sustitución del órgano dañado, y las terapias genéticas y celulares ayudarán a recuperarse de la disminución o pérdida de la función biológica. - Cirujia: microrobots biocompatibles dentro del cuerpo podrán tener diversos usos en medicina. 110 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 2. Los biochips ó microarrays son un ejemplo de tecnología convergente NBIC para su uso en medicina. Los Biochips ó microarrays representan un buen ejemplo de tecnologías convergentes NBIC (Figura 2). Los primeros microarrays surgieron de la convergencia de tecnologías de la información (microelectrónica) y la biotecnología, utilizando la fotolitografía como método para la síntesis in situ de pequeñas moléculas de ADN. Aunque han sido ampliamente utilizados en la investigación biomédica, aún presentan limitaciones para poder utilizarse en la práctica clínica. Algunos de estas limitaciones podrían superarse a través de nuevas desarrollos procedentes de otras disciplinas convergentes. Los modelos 111 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de razonamiento médico cognitivos podrían añadir una capa inteligente a estos sistemas, lo que les haría más adecuados para su aplicación en entornos clínicos. Además, la miniaturización permitiría utilizar estos dispositivos en el punto de atención al paciente. 4.7 LA INFORMÁTICA BIOMÉDICA EN EL CONTEXTO DE LA CONVERGENCIA NBIC Podríamos decir que la Informática Biomédica juega un papel de “tejido convergente” de la oferta NBIC para la salud y la medicina (Figura 3) [25]. Los desarrollos más importantes en ciencia están teniendo lugar en la intersección de las distintas disciplinas con la informática. Partimos de las tecnologías más asentadas como la informática médica (sistemas de información hospitalaria, historia clínica electrónica, sistemas de gestión e imagen médica), y su proyección futura hacia la telemedicina o la consulta virtual. 112 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 3. La elipse representa el área que la informática biomédica abarca en relación al tetraedro NBIC indicándose las distintas especialidades de aplicación en salud. Desde un plano innovador más convergente encontramos la bioinformática con el tratamiento de datos genómicos y metabólicos. Los biochips, la predicción de actividad y funcionalidad de proteínas, la computación basada en ADN son campos abiertos a la investigación y a la innovación en este área. 113 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Los aspectos “cogno” de la informática generan oferta hacia la salud en el ámbito de la cibernética biológica o los sistemas inteligentes. La neuroinformática, aparece ligada a la innovación para mejorar las capacidades neurológicas y mentales del ser humano. En este sentido la convergencia NBIC aporta los sistemas de visión artificial, computadoras con capacidad de filogénesis, ontogénesis y epigénesis, basadas en tejidos electrónicos, vida artificial o inteligencia artificial. Los avances en neuroinformática están también orientados a paliar la discapacidad y la dependencia no sólo originada por el envejecimiento, sino también, y de manera creciente al desarrollo de métodos que faciliten la integración social de los discapacitados. 114 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 4. Modelo de convergencia de tecnologías e información en medicina. En relación a todas estas áreas nuevas aparecen nuevas preguntas relativas por ejemplo a las aplicaciones industriales a corto o medio plazo, los temas relativos a seguridad del paciente, implicaciones sociales, temas éticos y legales…. En cualquier circunstancia, un énfasis en investigación básica debería proveer contribuciones más concretas que soporten un plan de investigación más ambicioso y a largo plazo. Tanto 115 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). en investigación científica básica como aplicada en genómica y en nanomedicina el papel de la informática biomédica será decisivo para poder avanzar. Un modelo posible para esto se muestra en la Figura 4. Una atención especial debe darse a la educación, por ejemplo incluyendo modulos de nanotecnologías y tecnologías NBIC en programas educativos. AGRADECIMIENTOS Este trabajo ha sido financiado por la Red CYTED IBERO-NBIC, la RETIC COMBIOMED (FIS, Ministerio de Ciencia e innovación) y la Support Action INBIOMEDvision (Comisión Europea). 116 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Roco, M.C.; Bainbridge, W.S., editors. Converging technologies for improving human performance.Nanotechnology, biotechnology, information technology and cognitive science. Arlington, Virginia: National Science Foundation (NSF) / Department of Commerce (DOC); 2002. [2] R. Bouchard. Bio–Systemics Synthesis: Science and Technology Foresight Pilot Project. Technical report, Canadian Research Council, Ottawa; 2003. [3] EC Project Knowledge Politics and New Converging Technologies; A Social Science Perspective. Available from: http://www.convergingtechnologies.org/index.html. [4] Martin-Sanchez F, Iakovidis I, Norager S, Maojo V, de Groen P, Van der Lei J, et al. Synergy between medical informatics and bioinformatics: facilitating genomic medicine for future health care. J Biomed Inform 2004; 37(1):30-42. [5] http://bioinfomed.isciii.es/ [6] Meeting Report. “Extending the scope of ICT at the crossroads with life sciences”. An European Commission IST Workshop contributing to future research priorities October, Brussels, 2004. 117 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [7] http://www.ercim.eu/activity/projects/bth.html [8] Martin-Sanchez F. Bio-inspired computing. Final report of the European Project Beyond-The- Horizon. Thematic Group 4. ftp:// ftp.cordis.europa.eu/pub/ist/docs/fet/strat-4.pdf. [9] Rebholz-Schuhman D, Cameron G, Clark D, van Mulligen E, Coatrieux JL, Del Hoyo Barbolla E, Martin-Sanchez F, Milanesi L, Porro I, Beltrame F, Tollis I, Van der Lei J. SYMBIOmatics: synergies in Medical Informatics and Bioinformatics--exploring current scientific literature for emerging topics. BMC Bioinformatics. 2007 Mar 8;Suppl 1:S18. [10] Martín Sánchez, F. Convergencia de Tecnologías: nuevas oportunidades para el avance de la informática y de las ciencias biomédicas. Revista eSalud, Vol. 2, Número 6 (2006). [11] Workshop on Nanoinformatics Strategies. http://128.119.56.118/~nnn01/ Workshop.html. [12] ACTION-Grid project website. http://www.actiongrid. [13] Lopez-Alonso V, Hermosilla-Gimeno I, Lopez-Campos G, Maojo V, Martin-Sanchez F. ActionGRID: assessing the impact of Nanotechnology on Biomedical Informatics. AMIA Annu Symp Proc 2008. 118 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [14] Freitas RA. What is nanomedicine? Nanomed Nanotechnol. Biol Med 2005;1:2e9 [15] http://www.nanosost.es/ [16]Report on Neuroinformatics from The Global Science Forum Neuroinformatics Working Group of the Organization for Economic Co-operation and Development June; 2002. [17]Horn, RE. Visual Language and Converging Technologies in the Next 10-15 Years (and Beyond). A paper prepared for the National Science Foundation Conference on Converging Technologies (Nano-Bio-Info-Cogno) for Improving Human Performance. Dec. 3-4, 2001. [18] Chen JM, Ho CM. Path to bio-nano-information fusion. Ann N Y Acad Sci 2006;1093: 123-42. [19] Lymberis A. Converging Micro-Nano-Bio-Information & Communication Technologies towards Integrated Systems: the Contribution of the EU Information Society Technologies Program. Engineering in Medicine and Biology Society. EMBS 2007. 29th Annual International Conference of the IEEE 22-26 Aug 2007. p. 6445 119 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [20] Jain KK. The role of nanobiotechnology in drug discovery. Drug Discov Today 2005;10 (21):1435-42. [21] Weissleder R. Molecular imaging in cancer. Science 2006; 312(5777):1168-71. [22] Politz J, Pombo A. Genomics meets nanoscience: probing genes and the cell nucleus at 10-9 meters. Genome Biology 2002; 3(3):4007 [23] Martin-Sanchez F, Maojo V, Pazos A, Dorado J, Guerrero, A. Converging Technologies for the Improvement of Clinical Diagnosis and Management at the Point of Care (POC). Proceedings of the Workshop held at Converging Technologies Forum, 2007. Barcelona: CSIC-UAM, 2007. [24] European Technology Platform on NanoMedicine. Nanotechnology for Health: Vision Paper and Basis for a Strategic Research Agenda for NanoMedicine; 2005. Available from: http://cordis. europa.eu/nanotechnology/nanomedicine.htm. [25] Martín-Sánchez, F., Maojo V. Biomedical Informatics and the Convergence of Nano-Bio-Info-Cogno (NBIC) Technologies. IMIA Yearbook 2009: 134-142. 120 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). INFORMÁTICA BIOMÉDICA EN NANOMEDICINA: MINERÍA DE TEXTOS, INTEGRACIÓN DE DATOS Y ACCESO A RECURSOS Víctor Maojo, Diana de la Iglesia y Miguel García Remesal. E-mail: [email protected] Grupo de Informática Biomédica – Dept. Inteligencia Artificial Universidad Politécnica de Madrid 5.1 INTRODUCCIÓN Dentro de las tecnologías convergentes NBIC, este capítulo se centra en las áreas de Nanotecnología e Información, que definen y describen una nueva disciplina denominada Nanoinformática. En el capítulo se describe el trabajo realizado por el Grupo de Informática Biomédica de la UPM en esta área. En los últimos años, la nanotecnología ha sido “re- descubierta” por un amplio rango de áreas científicas y médicas, autoridades reguladoras y organismos de financiación. En el caso de la medicina, los resultados de disciplinas emergentes —como la nanomedicina— se deben emplear para hacer frente a la complejidad biológica de las 121 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). enfermedades. La figura 5.1 ofrece un cronograma resumido de la evolución de la nanotecnología, desde las primeras investigaciones del Nobel Richard Feynman hasta las nanomáquinas propuestas por Mihail Roco. La nanotecnología permite aprovechar las propiedades físicas, químicas, eléctricas, mecánicas y ópticas singulares que manifiestan los materiales a escala nanométrica [1]. Esta manifestación de nuevos fenómenos y propiedades incluye cambios en: x Propiedades físicas (por ejemplo, punto de fusión) x Propiedades químicas (reactividad) x Propiedades eléctricas (conductividad) x Propiedades mecánicas (fuerza) x Propiedades ópticas (emisión de luz) La gran superficie que ofrecen los nanomateriales en relación a su poco volumen permite el diseño de sistemas y dispositivos en miniatura pero con una gran funcionalidad. 122 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 5.1. Evolución cronológica de la nanotecnología. 5.2 NANOMEDICINA La nanomedicina es la aplicación de la nanotecnología en el campo de la medicina. Paradójicamente, al igual que el término "medicina genómica" está empezando a difundirse ampliamente, la nanomedicina emerge como una nueva y emocionante frontera de la biomedicina. Ambas disciplinas tienen como meta el desarrollo de métodos y tecnologías con finalidades muy ambiciosas, pero aún es necesario un mayor desarrollo de sus fundamentos teóricos para construir una 123 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). disciplina científica sólida, tema en el que pueden colaborar los investigadores que trabajan en Informática Biomédica. Para muchas enfermedades, la nanomedicina promete desarrollar soluciones para mejorar los métodos de diagnóstico y las terapias aplicadas actualmente. Aquí se muestran diversas áreas y ejemplos, que a su vez muestran la conexión entre esta disciplina y la informática (fig. 5.2): x Biofarmacéutica: el estudio de nuevos medicamentos basados en nanopartículas, así como de los nanosistemas desarrollados para la administración de fármacos a las células x Desarrollo de nanomateriales, para la reparación y sustitución de tejidos x Nanodispositivos para, por ejemplo, restaurar la función auditiva o visual x Nanocirugía: herramientas y dispositivos nano que pueden ser usados en tareas quirúrgicas x Herramientas de diagnóstico, como por ejemplo, nanosistemas para la captura de imágenes que pueden ayudar a identificar, lo antes posible, la existencia de un enfermedad 124 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x El mejor entendimiento de los procesos vitales básicos, haciendo uso de herramientas informáticas de modelización y simulación x Bases de datos de nanopartículas Figura 5.2.1. Áreas de colaboración entre nanomedicina y nanoinformática El número de publicaciones centradas en Nanomedicina ha crecido considerablemente en los últimos años, como se puede observar en el siguiente diagrama de barras (fig. 5.2.2). En este indexadas momento, en casi MedLine 2.000 bajo 125 el publicaciones término de aparecen búsqueda Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). “Nanomedicina”. Este alto número de publicaciones en un campo relativamente desconocido para los investigadores biomédicos indica el alto impacto que puede tener esta disciplina para las ciencias y tecnologías biomédicas. La primera publicación en MedLine que relacionaba y combinaba Informática Biomédica y Nanomedicina data de 2006, con participación de los autores [2]. Figura 5.2.2. Número de publicaciones indexadas en PubMed bajo el término “Nanomedicine” durante los últimos años e interés relativo de dichas publicaciones respecto a otras áreas de publicación. Gráfico generado mediante el uso de la herramienta GoPubMed (http://www.gopubmed.org/) 126 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 5.3 NANOINFORMÁTICA La nanoinformática es una nueva disciplina ligada a la Informática Biomédica y la Nanomedicina, cuyo objetivo es detectar las sinergias y construir nuevos puentes entre la medicina, la nanotecnología y la informática mediante la aplicación de herramientas y métodos computacionales para facilitar las tareas y resolver los problemas que surgen durante la investigación nanomédica. En esta sección describiremos las iniciativas actuales y los retos científicos que se presentan en esta área [3]. 5.3.1 Hombre Fisiológico Virtual (Virtual Physiological Human) Dentro de las iniciativas de investigación de la Comisión Europea, destaca el “Virtual Physiological Human” (Hombre Fisiológico Virtual o VPH), enfocada al desarrollo de modelos y simulaciones del cuerpo humano, a partir de datos clínicos y biológicos y a través de métodos y herramientas informáticas. La nanomedicina y la nanoinformática pueden extender este ámbito hacia el nivel nano, creando nuevos retos científicos para la investigación básica implicaciones de carácter clínico. 127 y aplicada, con claras Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Dentro de la iniciativa del VPH, varios grupos de la red IberoNBIC han trabajado en el proyecto ACTION-Grid [4], una acción cooperativa entre la Unión Europea, Iberoamérica, los países balcánicos y el norte de África que abarca las áreas de computación Grid, Informática Biomédica y Nanoinformática. El principal resultado de este proyecto es un “White Paper” que conecta las citadas áreas, extendiendo los métodos y herramientas de la Informática Biomédica hacia el contexto nano. Después de dos años de trabajo, ACTION-Grid ha conseguido proporcionar una visión global y coherente, basada en las sinergias existentes entre las distintas disciplinas y las áreas geográficas implicadas. Esta visión queda recogida en el White Paper anteriormente mencionado, el cual puede descargarse libremente de la página web de ACTION-Grid [5,6,7]. El White Paper propone 5 grandes retos en el área de la Nanoinformática claramente conectados con la Informática Biomédica desde el punto de vista científico. Con estos grandes retos se puede esbozar una agenda futura en el área, tal y como veremos a continuación. 128 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 5.3.2 Retos 1) Almacenamiento de datos y conocimiento, incluyendo la construcción de nuevos bionanorepositorios, el desarrollo de nuevos estándares y plataformas y la creación de bases de datos de ensayos clínicos en el área nano. En esta dirección, el Grupo de Informática Biomédica está desarrollando repositorios de herramientas y servicios de Informática Biomédica y Nanoinformática, construidos a partir de la literatura científica mediante el uso de técnicas de procesamiento de lenguaje natural y text mining [8,9]. 2) El desarrollo de nano-ontologías y tecnologías basadas en la web semántica para conseguir la interoperabilidad de datos y servicios, proporcionando nuevas infraestructuras y métodos para integrar datos a nivel nano en los sistemas de información existentes. El Grupo de Informática Biomédica de la UPM también está trabajando actualmente en este campo [10] 3) Por último, la extensión de la historia clínica digitalizada para incluir en ella información “nano”, la cual puede ser usada para diagnosis, terapia y también para el análisis de los efectos tóxicos de las nanopartículas. 129 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 5.4 NANOTOXICIDAD El impacto en determinados la salud asociado nanomateriales aún a es la exposición a desconocido. El siguiente diagrama muestra los peligros de la exposición de los seres vivos y el medio ambiente a nanomateriales y nanopartículas. Figura 5.4. Perspectiva del ciclo de vida de los nanomateriales en cuanto a sus riesgos para los consumidores y los trabajadores. Adaptado de [11] 130 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La toxicidad de las nanopartículas es un tema al que se están dedicando importantes esfuerzos en la actualidad. Nuestro grupo está investigando en la identificación de recursos como bases de datos, publicaciones y otras herramientas informáticas para tratar la gestión de datos y conocimiento relacionado con los aspectos de la nanotoxidad. En el grupo hemos desarrollado una aplicación capaz de recuperar información, a partir de la literatura científica, sobre la toxicidad asociada al uso de la nanotecnología en el dominio biomédico [12]. Está orientada a la clasificación de los textos y posterior recuperación de los mismos, mediante el uso de ontologías. Dichas ontologías ayudan a discernir qué términos pertenecen a un dominio y cuáles no. La herramienta se basa en tres procesos bien diferenciados: x Recuperar la información deseada de artículos científicos como, por ejemplo, los nombres de las nanopartículas, sus aplicaciones médicas y la toxicidad asociada a las mismas; x organizar y dar una estructura formal a esta información, mediante el uso de ficheros XML; x y, finalmente, almacenar la información relevante en una base de datos relacional. 131 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Para cada una de las publicaciones, el sistema ejecuta un análisis automático para extraer todos los términos encontrados en los documentos y relacionarlos con los términos presentes en las ontologías seleccionadas: la Nanoparticle Ontology [13] y el Foundational Model of Anatomy [14]. La NanoParticle Ontology representa conocimiento básico acerca de las propiedades físicas y químicas, así como de Ias características funcionales de las nanopartículas. Las nanopartículas se clasifican según sus: x Componentes químicos x Estructura y funcionalidad x Forma x Aplicaciones para diagnóstico y terapia médica x Estímulos necesarios para activar la funcionalidad de la nanopartícula Por otra parte, el Foundational Model of Anatomy es una representación del conocimiento existente sobre la anatomía humana. Es un recurso abierto, en forma de base de datos relacional, que contiene aproximadamente 750.000 clases, 120.000 términos y 210.000 relaciones con 168 tipos de 132 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). relaciones distintos, permitiendo la modelización de la organización estructurada del cuerpo humano Como ejemplo de uso de la herramienta, podemos citar el siguiente: un usuario quiere acceder a las publicaciones relativas a la molécula “Paclitaxel” y sus efectos en el cerebro. El usuario sólo necesitará introducir la palabra “Paclitaxel” como nombre y la palabra “cerebro” como objetivo/diana. El sistema devolverá una lista de las publicaciones relacionadas con la búsqueda, junto con un resumen de las mismas y un enlace a su registro bibliográfico en PubMed. 5.5 CONCLUSIONES Actualmente, existen muchos problemas asociados a la búsqueda de información llevada a cabo en los proyectos de investigación. Entre ellos destacan: x Grandes cantidades de información x Falta de información sobre las fuentes de datos más apropiadas x Dificultad de uso por la falta de destreza de los usuarios no especializados, la complejidad de las interfaces y la documentación pobre o inexistente 133 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x Las búsquedas no son inteligentes, sino que el usuario debe realizar búsquedas por palabra clave o formular consultas en formatos específicos x Problemas técnicos (conexiones lentas, etc.) x Acceso limitado o restringido a determinados recursos x Filtro de la información: distinción entre información esencial (respecto a la búsqueda) y no esencial La nanoinformática intenta dar solución a los problemas de búsqueda y gestión de la información generada durante la investigación nanomédica, explotando nuevas sinergias entre disciplinas ya consolidadas, como la Informática Biomédica y la Nanomedicina. Actualmente se desarrollan recursos y herramientas que pueden ser aplicados tanto en biomedicina como en nanomedicina [11], pero aún existen muchos retos para conectar —compartir, intercambiar y reutilizar— los objetivos, métodos y herramientas de la Informática Biomédica y la Nanoinformática. Las actividades relacionadas con aspectos tales como la investigación colaborativa y el desarrollo de aplicaciones, estándares, bases de datos y publicaciones han demostrado 134 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). la viabilidad de conectar investigadores con objetivos afines y trabajar hacia un objetivo común. 135 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Singh, S. Nanomedicine-nanoscale drugs and delivery systems. J Nanosci Nanotechnol. 10(12):7906-18 (2010). [2] Maojo, V. and Kulikowski C.A. Reflections on biomedical informatics: from cybernetics to genomic medicine and nanomedicine. Stud Health Technol Inform. 2006;124:19-24 [3] De la Iglesia D., Maojo V., Chiesa S., Martin-Sanchez F., Kern J., Potamias G., Crespo J., Garcia-Remesal M., Keuchkerian S., Kulikowski C. and Mitchell J.A. International efforts in nanoinformatics research applied to nanomedicine. Methods Inf Med. 50(1):84-95 (2011). [4] ACTION-Grid FP7 EC-funded Support Action: International cooperative action on grid computing and biomedical informatics between the European Union, Latin America, the Western Balkans and North Africa (FP7-224176). . Accedido en enero de 2011. URL: http://www.action-grid.eu [5] Maojo V., Martín-Sánchez F. et al. The ACTION-Grid White Paper: Linking Biomedical Informatics, Grid Computing and Nanomedicine (2010). Accedido en enero de 2011. 136 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). URL: http://www.action-grid.eu/index.php?url=whitepaper [6] Maojo V., de la Iglesia D., Martin-Sanchez F., García Remesal M., Crespo J. et al. Nanoinformatics in Europe: The ACTION Grid White Paper. Nanoinformatics 2010 Conference. 3-5 Noviembre 2010. Arlington, Virginia (USA). [7] Maojo V., Martin-Sanchez F., Kulikowski C., Rodriguez-Paton A. and Fritts M. Nanoinformatics and DNA-based computing: catalyzing nanomedicine. Pediatr Res.2010 May;67(5):481-9. [8] De la Calle G., García-Remesal M., Chiesa S., de la Iglesia D. and V. Maojo. BIRI: a new approach for automatically discovering and indexing available public bioinformatics resources from the literature. BMC Bioinformatics 10(1):320 (2009). [9] Chiesa S., García-Remesal M., de la Calle G., de la Iglesia D., Bankauskaite V. and Maojo V. Building an Index of Nanomedical Resources: An Automatic Approach Based on Text Mining. Proceedings of the KES 2008; 2: 50-57 (2008). [10] Maojo V., Crespo J., Garcia-Remesal M., de la Iglesia D., Pérez-Rey D. and Kulikowski C. Biomedical Ontologies: Toward scientific debate. Methods Inf Med. (2011). En prensa 137 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [11] Nanotechnology White Paper. Exposure of human and the environment to nanomaterials at different stages of product life cycle. US environmental protection agency, 2007 (epc.gov). Accedido en enero de 2011. URL: http://www.epa.gov/nanoscience/files/epa_nano_wp_2007.p df [12] Linares Quintana, A. Herramienta para el descubrimiento de efectos tóxicos de nanomateriales en aplicaciones médicas a partir de la literatura. Facultad de Informática, Universidad Politécnica de Madrid; Mayo 2010. [13] Thomas D.G., Pappu R.V. and Baker N.A. NanoParticle Ontology for cancer nanotechnology research. J Biomed Inform. 2010 Mar 6. [14] Rosse C. and Mejino J.V.L. A reference ontology for biomedical informatics: the Foundational Model of Anatomy. J Biomed Inform. 36:478-500 (2003). 138 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). BÚSQUEDA COMPUTACIONAL DE PROTEÍNAS ANTIGÉNICAS CANDIDATAS PARA EL DISEÑO DE VACUNA CONTRA LA MALARIA Raúl Isea E-mail: [email protected] Instituto de Estudios Avanzados (IDEA), Hoyo de la Puerta, Valle de Sartenejas. Baruta, Venezuela. 6.1 INTRODUCCIÓN La malaria o paludismo es una enfermedad tropical causada por un parásito del género Plasmodium a través de la picadura de un vector o mosquito infectado por Anopheles gambiae. Anualmente, mueren entre dos y tres millones de personas por esa causa y la mitad de toda la población mundial está en riesgo de contraer la enfermedad. Hasta ahora se conocen más de 170 especies de Plasmodium, pero de todas ellas solo cinco cepas diferentes afectan a la especie humana: P. falciparum, P. vivax, P. ovale, P. malariae 139 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). y, recientemente, P. knowlesi. Es interesante destacar que el primer caso de malaria producido por P. knowlesi, fue registrado en 1965 en Estados Unidos, y resultó asociado a un viajero que había estado en Malasia. De las cinco cepas antes citadas P. falciparum es la más virulenta: la mitad de sus víctimas, lamentablemente, son niños menores de cinco años. Recordemos que la palabra malaria proviene de los términos latinos malus aria, y luego del italiano mala aria, que significa mal aire, porque originalmente se pensaba que esta enfermedad era causada por los gases fétidos que emanaban de unos pantanos en las llanuras de Italia. No obstante, el conocimiento de la malaria se remonta a la época del primer Emperador Amarillo, gracias a los registros encontrados en el libro de medicina conocido como El Canon de la Medicina, de Nei Ching. En esa obra, se describía una enfermedad que provocaba continuas fiebres asociadas con bazos agrandados. Curiosamente, Hipócrates realizó observaciones similares en el siglo V a.C. Revisando la literatura científica, se encuentra que en Venezuela, en 1854, el médico de origen francés Luis Beauperthuy (1807-1871) publicó en la revista Gaceta de Cumaná la hipótesis de que los mosquitos eran los probables vectores de la malaria y la fiebre amarilla; pero ese trabajo no 140 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). tuvo el impacto esperado. En 1880, el francés Alfonso Laveran (1845-1922) descubre un parásito en sangre humana al examinar a soldados en Argelia, que denomina Hematozoario de Laveran. Diecisiete años después, el británico Ronald Ross establece que es un mosquito el agente transmisor cuando realizaba sus estudios de malaria en aves, y en 1899, un italiano llamado Giovanni Battista Grassi (1854-1925) identificó al Anopheles como el responsable de la transmisión. Es lamentable que el trabajo de Beauperthuy pasara desapercibido, pues su valiosa contribución podría haber ahorrado cinco décadas de estudio contra este flagelo. En 2007, la Organización Panamericana de la Salud (OPS) indicó que la malaria afectaba a 21 países en las Américas con una población total de aproximadamente 880 millones de personas. De ellos, 236 millones habitan en zonas endémicas, mientras que otros 276 millones viven en áreas de riesgo de transmisión (esa información está disponible en la página web http://www.paho.org/English/AD/DPC/CD/malamericas-2007.pdf). En el caso de la República Bolivariana de Venezuela, según la información suministrada por la OPS, el 29% de la población está en riesgo de contraer la malaria. Considérese además que de la superficie total de Venezuela —916.000 Km2—, 141 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). aproximadamente la mitad (i. e., 430.000 Km2) es terreno selvático, zona propensa para la propagación de mosquitos contaminados con Anopheles. El ciclo de vida del Plasmodium (filum Apicomplexa) ocurre en dos hospederos diferentes, el vertebrado y el mosquito, por lo cual el Plasmodium desarrolla diferentes estrategias de supervivencia para evadir el sistema inmune en ambos hospederos. Cuando el mosquito hembra inyecta a través de sus glándulas salivales los esporozoitos en el torrente sanguíneo del hospedero vertebrado al momento de alimentarse de sangre, dichos esporozoitos llegan al hígado en aproximadamente horas. Una vez dentro del hígado, invaden los hepatocitos y llegan a la fase de esquizogonia pre-eritrocítica en un lapso de cinco a 15 días, tiempo durante el cual se desarrollan hasta alcanzar la forma de esquizontes maduros. Posteriormente, ocurre una ruptura de dichas células que libera a los merozoitos en el torrente sanguíneo y se apoderan de los glóbulos rojos. Los merozoitos dentro de los eritrocitos maduran en forma de anillos, conocidos como trofozoitos, donde se alimentan del citoplasma del eritrocito y depositan un sedimento llamado hemozoína. Eventualmente, se rompen y liberan nuevos merozoitos que invaden y lisian otros glóbulos rojos no142 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). infectados. Justamente durante este proceso se presenta la fase aguda de la enfermedad que se caracteriza por las continuas fiebres, escalofríos y dolor muscular, entre otros síntomas clínicos. Finalmente, los merozoitos se diferencian en las formas sexuales conocidas como macrogametocitos (femenino) y microgametocitos (masculino) con la particularidad de que no causan ninguna patología dentro del hospedero, pero desempeñan un rol importante para la transmisión de la enfermedad gracias a la picadura de otro mosquito hembra Anopheles, que puede estar infectado o no. En dicho mosquito se desarrolla un ciclo sexual que dará origen a cientos de esporozoitos los cuales invaden el epitelio glándulo-salivar para infectar posteriormente a otro hospedero invertebrado [1]. 6.1.1 Fármacos antimaláricos La cloroquina fue el medicamento por excelencia para combatir la malaria que se empleó un poco después de la segunda guerra mundial. Sin embargo, a solo diez años de su distribución como fármaco de carácter profiláctico así como medicamento para contrarrestar los síntomas clínicos, se observaron múltiples casos de resistencia en la mayoría de los países donde fue administrado. En el caso particular de la República Bolivariana de Venezuela, en 1960 se observó que 143 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). P. falciparum mostraba resistencia a la cloroquina. Quince años después se publicó un estudio que registraba que más del 93% de los casos eran resistentes a dicha droga en el estado Bolívar. Los medicamentos antimaláricos, como por ejemplo la cloroquina, quinina, amodiaquina, lumefantrina o mefloquina, entre otros, son, básicamente, derivados de la quinolona y parecen actuar en la ruta de degradación de la hemoglobina al unirse con la ferriprotoporfirina IX [2]. De hecho, pueden considerarse como esquizonticidas sanguíneos al ser efectivos contra las formas eritrocíticas de las especies de plasmodio, pero sin ninguna eficacia sobre los esporozoitos o hipnozoitos. Los compuestos derivados de la cloroquina se cree que actúan destoxificando el grupo hemo. De la misma manera, los antifolatos (como son las sulfamidas) inhiben la acción de la dihidropteroato sintasa, y la pirimetamina bloquea una enzima responsable de la regeneración del cofactor en estado reducido. Sin embargo, dichos tratamientos no han sido eficaces porque las proteínas blanco donde actúan esas drogas, han generado resistencia así como hipersensibilidad a dichos medicamentos durante el tratamiento profiláctico [3]. 144 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Gracias al trabajo de Fidock y colaboradores publicado en el año 2000 [4], se conoció que la causa de la resistencia a la cloroquina era una mutación que ocurre en el parásito, en la proteína transportadora de cloroquina PfCRT responsable de reducir la acumulación de esa sustancia en la vacuola digestiva del Plasmodium, hasta eliminarla. Dicha mutación ocurre en la posición 76 al darse el cambio del aminoácido lisina por una treonina. También se sabe que sí ocurre la mutación en la posición 163, es decir, la mutación S163R; se restaura la sensibilidad del parásito al medicamento sin pasar por alto el papel que tiene el pH en el transporte de la cloroquina. 6.1.2 ¿Es realmente factible una vacuna contra la malaria? Conociendo la complejidad del ciclo de vida del plasmodio así como los métodos que emplea para evadir el sistema inmune, surge la pregunta de si realmente es posible encontrar una vacuna que sea efectiva contra dicho flagelo, pues es un hecho que la mitad de la población en todo el mundo, es decir más de tres mil millones de habitantes, corre el riesgo de contraer la malaria. Es importante recordar los trabajos de Ruth Nussenzweig y colaboradores, publicados en 1967, donde se muestra que 145 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). realmente es factible encontrar una protección contra la malaria: ellos inocularon esporozoitos de P. bergei irradiados con rayos-X en roedores y lograron una defensa contra dicho flagelo [5]. Las esperanzas están puestas actualmente en una vacuna denominada RTS,S/AS02 (de entre un total de 17 que se están ensayando hoy día), cuyo estudio comenzó en 1985. Esta vacuna ha demostrado ser segura y, a su vez, produjo una disminución del número de episodios clínicos de un 30%, según datos del ensayo realizado en Mozambique con 2.022 afectados de edades comprendidas entre uno y cuatro años. El período de protección solo asciende a 45 meses [6]. Es un tiempo muy corto y por ello hay que continuar los estudios para generar potenciales vacunas más efectivas. 6.2 METODOLOGÍA COMPUTACIONAL El presente trabajo se planteó como objetivo identificar aquellas proteínas antigénicas que pudieran ser candidatas para desarrollar una nueva vacuna contra la malaria, mediante un análisis y procesamiento de datos caracterizados por presentar evidencia antigénica, y que además se haya mostrado que participan en uno de los cuatro estadios del ciclo de vida del parásito. 146 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Para lograrlo, la idea es obtener todas las secuencias anotadas en el genoma de Plasmodium falciparum de la cepa 3D7 disponible, a través de la base de datos PlasmoDB (con acceso gratuito a través de la página web http://plasmodb.org). Posteriormente, seleccionar aquellas secuencias con cierto grado de antigenicidad independientemente de los diferentes estadios del ciclo de vida del parásito, y que además esté predicho como un péptido de señal. Esta última condición impuesta en el presente trabajo, carece de cualquier evidencia experimental que pueda indicar su efectividad para eliminar definitivamente la enfermedad [7]. 6.3 RESULTADOS El genoma de Plasmodium falciparum de la cepa 3D7 fue secuenciado en 2002; consta de 23.26 Mb y está compuesto por 14 cromosomas lineales unidos en cada extremo a secuencias teloméricas, cuyos cromosomas oscilan entre 0.75 Mb (152 genes en el cromosoma 1) y 3.3 Mb (787 genes en el cromosoma 14). En total, dicho genoma consta de 5.510 genes, 11.220 proteínas, 112 seudogenes, 61 genes rARN, y 72 tARN. 147 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Se seleccionaron todas aquellas secuencias que presentaran un grado de evidencia antigénica, con especial atención en aquellas proteínas que puedan interferir en la ruta metabólica del parásito, pero que a su vez no estén presentes en el huésped. El primer paso fue seleccionar las proteínas que presentan una evidencia antigénica en todo el genoma del P. falciparum cepa 3D7; se obtuvieron 1.538 diferentes proteínas según la información contenida en la base de datos. 6.3.1 Predicción in silico de epítopos En el trabajo publicado por Isea en 2010 [7], se señaló cómo los métodos de predicción in silico de epítopos no concuerdan con los encontrados en la literatura científica. Asimismo, se destacó el alto número de falsos positivos generados por los diferentes programas computacionales, pero en el caso de P. falciparum no coincidieron con los datos obtenidos por métodos experimentales [7]. 6.3.2 Selección de proteínas antigénicas El próximo paso fue seleccionar todas las proteínas que están presentes en el genoma de P. falciparum con la peculiaridad de que se expresan en cualquiera de los cuatro estadios del 148 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). parásito, es decir, en los estadios esporozoito, merozoito, trofozoito y gametocito. De todas las proteínas seleccionadas en el paso previo se debió verificar que cumpliesen con estar ubicadas en la región externa de la membrana celular, y para ello se empleó el programa TMHMM2 que permite predecirlo [8]. Finalmente, se realizó la predicción que indica péptido señal gracias al servidor que se localiza en la página web http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/. Tras aplicar todo el procedimiento descrito, se obtuvieron 141 proteínas antigénicas, tal como se muestra en la tabla 1. En ella se señala el identificador (ID) de acuerdo con la base de datos PlasmoDB y dentro de un paréntesis se coloca en qué cromosoma está ubicada la proteína. Se requiere estudiarlas con más detalle para poder derivar, por ejemplo, criterios que permitan disminuir el número de proteínas blanco contra la malaria. 6.4 CONCLUSIONES Mediante la biología molecular y las ciencias ómicas como la proteómica y la transcriptómica, es posible plantear nuevas proteínas blanco que puedan ayudar a identificar a aquéllas que presentan evidencia antigénica con la condición de que 149 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). estén involucradas en el ciclo de vida del parásito; logrando de esa manera reducir el número de proteínas de 1.527 hasta 141. Dicho estudio pudiera estar vinculado con el desarrollo de una nueva vacuna contra la malaria más efectiva, en el sentido de que su rango de protección sea superior a los 45 meses, como el obtenido con la vacuna experimental llamada RTS,S/AS02. Por otra parte, se debe tener en cuenta que hasta la fecha no existe ningún medicamento que actúe en todos los estadios del ciclo vital del parásito, y no se pueden pasar por alto todos los esfuerzos desplegados para indagar en la aplicación de nuevos medicamentos, como por ejemplo los antibióticos tetraciclina y clindamicina [9]. AGRADECIMIENTOS Expresamos nuestro más profundo agradecimiento a todas aquellas personas e instituciones que nos permitieron incursionar en el tema del presente trabajo, cuyo origen coincide con el premio que nos fue otorgado por CAVEFACE en 1999, así como los diversos proyectos nacionales e internacionales —NBIC, EELA, EELA-2, WISDOM— en los que tomamos parte. Asimismo, queremos reconocer el apoyo 150 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). institucional recibido a lo largo de estos años de ejercicio profesional. A todos, muchas gracias. 151 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Ingraham, J.L.; Ingraham, C.A. Introducción a la microbiología. Vol. 2. Barcelona: Editorial Reverté, 1998. [2] Loria, P.; Miller, S.; Foley, M.; Tilley, L. Inhibition of the peroxidative degradation of haem as the basis of action of chloroquine and other quinoline antimalarials. Biochem J, 1999, 339, 363-370. [3] Astro-Sancho, J.; Munguia-Ramírez, M.; Ávila-Agüero, M. Malaria: una actualización. Acta Méd Costarrica, 2002, 44, 107-112. [4] Fidock, D.A.; Nomura, T.; Talley, A.K.; Cooper, R.A.; Dzekunov, S.M.; Ferdig, M.T. et al. Mutations in the P. falciparum digestive vacuole transmembrane protein PfCRT and evidence for their role in chloroquine resistance. Molec Cell, 2000, 6, 861-871. [5] Ménard, R.; Sultán, A.A.; Cortés, C.; Altszuler, R.; Van Dijk, M.R.; Janse, C.J. et al. Circumsporozoite protein is required for development of malaria sporozoites in mosquitoes. Nature, 1997, 385, 336-340. 152 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [6] Sacarlal, J.; Aide, P.; Aponte, J.J.; Renom, M.; Leach, A.; Mandomando, I. et al. LongಣTerm Safety and Efficacy of the RTS,S/AS02A Malaria Vaccine in Mozambican Children. J Infect Dis, 2009, 200, 329-336. [7] Isea, R. Identificación de once candidatos vacunales potenciales contra la malaria por medio de la Bioinformática. Vaccimonitor, 2010, 19, 15-19. [8] Moller, S.; Croning, M.D.R.; Apweiler, R. Evaluation of methods for the prediction of membrane spanning regions. Bioinformatics, 2001, 17, 646-653. [9] Friesen. J.; Silvie, O.; Putrianti, E.D.; Hafalla, J.C.; Matuschewski, K.; Borrmann, S. Natural immunization against malaria: causal prophylaxis with antibiotics. Sci Transl Med, 2010, 2, 40-49. 153 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). TABLA 1 Proteínas antigénicas que pueden ser candidata para el diseño de vacuna contra la malaria de acuerdo a la nomenclatura asignada en el PlasmoDB, y dentro del paréntesis se indica el cromosoma donde está presente. PFA0055c(1) PFA0125c(1) PFA0385w(1) PFA0635c(1) PFA0690w(1) PFB0205c(2) PFB0400w(2) PFB0760w(2) PFB0925w(2) PFC0125w(3) PFC0210c(3) PFC0490w(3) PFC0590c(3) PFC0710w-a(3) PFC0810c(3) PFC0835c(3) PFC0925w(3) PFC0975c(3) PFC1090w(3) PFD0075w(4) PFD0110w(4) PFD0210c(4) PFD0260c(4) PFD0295c(4) PFD0310w(4) PFD0440w(4) PFD0555c(4) PFD0690c(4) PFD0940w(4) PFD1037w(4) PFD1195c(4) PFE0120c(5) PFE0660c(5) PFE0710w(5) PFE1330c(5) PFE1510c(5) PFF0050c(6) PFF0620c(6) PFF0795w(6) PFF0800w(6) PFF1455c(6) PFF1475c(6) PFF0985c(6) PFF0995c(6) PFF1395c(6) PFF1535w(6) MAL7P1.3(7) MAL7P1.203(7) PF07_0061(7) MAL7P1.102(7) MAL7P1.119(7) PF07_0100(7) PF07_0113(7) MAL7P1.176(7) MAL8P1.10(8) PF08_0071(8) PF08_0068(8) PF08_0063(8) PF08_0052(8) PF08_0050(8) PF08_0011(8) PF08_0008(8) PF08_0005(8) PFI0210c(9) PFI0380c(9) PFI0640c(9) PFI0795w(9) PFI0900w(9) PFI0920c(9) PFI0960w(9) PFI1145w(9) PFI1475w(9) PFI1730w(9) PF10_0018(10) PF10_0053(10) 154 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). PF10_0084(10) PF10_0166(10) PF10_0168-a(10) PF10_0303(10) PF10_0313(10) PF10_0355(10) PF10_0356(10) PF10_0392(10) PF11_0023(11) PF11_0064(11) PF11_0224(11) PF11_0229(11) PF11_0246(11) PF11_0256(11) PF11_0344(11) PF11_0348(11) PF11_0381(11) PF11_0486(11) PF11_0503(11) PFL0070c(12) PFL0600w(12) PFL0655w(12) PFL0765w(12) PFL1045w(12) PFL1060c(12) PFL1415w(12) PFL1835w(12) PFL2505c(12) PFL2510w(12) MAL13P1.60(13) PF13_0066(13) PF13_0133(13) PF13_0141(13) PF13_0322(13) PFI0180w(13) MAL13P1.56(13) MAL13P1.193(13) MAL13P1.203(13) MAL13P1.210(13) PF13_0265(13) MAL13P1.262(13) PF13_0277(13) MAL13P1.285(13) MAL13P1.410(13) MAL13P1.319(13) MAL13P1.342(13) MAL13P1.465(13) PF14_0016(14) PF14_0045(14) PF14_0063(14) PF14_0116(14) PF14_0192(14) PF14_0199(14) PF14_0201(14) PF14_0249(14) PF14_0250(14) PF14_0275(14) PF14_0318(14) PF14_0342(14) PF14_0372(14) PF14_0415(14) PF14_0425(14) PF14_0440(14) PF14_0495(14) PF14_0541(14) PF14_0598(14) 155 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). EXTRACCIÓN DE INFORMACIÓN MEDIANTE COMPUTACIÓN EVOLUTIVA Ana Freire, Vanessa Aguiar-Pulido, Juan R. Rabuñal, Ana B. Porto, Javier Pereira. E-mail: [email protected] Depto. de Tecnologías de la Información y las Comunicaciones, Universidad de A Coruña (España) 7.1 INTRODUCCIÓN La hidrología se puede definir como la ciencia geográfica que se dedica al estudio de la distribución espacial y temporal y las propiedades del agua presente en la atmósfera y en la corteza terrestre. Esto incluye las precipitaciones, la escorrentía, la humedad del suelo, la evapotranspiración y el equilibrio de las masas glaciares. Una parte de la hidrología se centra en el estudio de la determinación de los caudales, cuya importancia reside en: 157 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 1. Determinar volúmenes disponibles para almacenamiento para riego, agua potable, agua industrial, turismo, actividades recreativas, etc. 2. Cuantificar los caudales mínimos, en época de estiaje, necesarios para abastecimientos de agua potable o la navegación. 3. Calcular las crecidas de un río, las alturas máximas a las que puede llegar y definir la radicación de poblaciones urbanas, construir defensas, zonificar áreas de riesgo hídrico con distintos usos del suelo asociados a esos riesgos, etc. Una de las zonas donde más incidencias se pueden producir debido a movimientos de agua en la corteza terrestre es una cuenca hidrográfica. Una cuenca hidrográfica es un área drenada por ríos y sus afluentes. En el caso de una cuenca urbana, los arroyos y ríos se sustituyen por un sistema de alcantarillado. En este tipo de cuenca, la escorrentía es la cantidad de lluvia que alcanza el caudal de los ríos o arroyos. El modelado del flujo de la escorrentía en una cuenca urbana típica es aquella parte de la hidrología que tiene por objeto modelar redes de aguas residuales. Su objetivo es predecir las condiciones de lluvia de la cuenca y activar una alarma para proteger de inundaciones o hundimientos. 158 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Modelizar o transformar la lluvia caída en una zona o cuenca en el caudal de agua derivado de dicha lluvia se conoce con el nombre de “transformación lluvia-escorrentía”, pudiendo desencadenar inundaciones y riadas en la cuenca. La transformación lluvia-escorrentía es un caso claro en que una variable (lluvia) se transforma en otra (caudal) mediante una función de transferencia cuyos condicionantes físicos son muchos y muy diversos (grado de impermeabilidad del entramado urbano, pendientes de las calles, irregularidad superficial de las aceras, tipo de tejados…) y que constituyen un sistema con tal cantidad de grados de libertad que es imposible pretender llegar a una ecuación que siguiendo leyes físicas represente el trayecto de una gota de agua desde que cae hasta que entra en la red de saneamiento. El propio trayecto del agua dentro de la red es complejo y, aunque sí hay ecuaciones que lo modelen, están sujetas al uso de parámetros de ajuste que las hace dependientes de un proceso de calibración. En general, el objetivo de este tipo de problemas es predecir y modelar el flujo de una cuenca urbana típica, midiendo tanto la lluvia recogida mediante un pluviómetro como la cantidad de agua detectada por un medidor de caudal situado en el punto de salida de la red de saneamiento. 159 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 7.2 MODELIZACIÓN La modelización consiste en el desarrollo de modelos hidrológicos simplificados que representen una parte del ciclo hidrológico. Se clasifican en dos categorías [10]: x Modelos basados en datos procedentes de la experimentación: consisten en sistemas de caja negra que mediante conceptos matemáticos y estadísticos vinculan una entrada (en este caso lluvia) a la salida del modelo (escorrentía). Estos modelos se conocen como modelos hidrológicos estocásticos. x Modelos basados en descripciones de procesos: tratan de representar los procesos físicos observados en el mundo real. Mediante fórmulas matemáticas representan la superficie de la escorrentía, canales de flujo, etc. Estos modelos se conocen como modelos hidrológicos deterministas. Por su parte, la calibración de los modelos consiste en un proceso mediante el cual, empleando datos históricos procedentes de la experimentación, se ajustan los valores de los parámetros de alguna técnica de pronóstico hidrológico como los hidrogramas unitarios. 160 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Un hidrograma unitario [6] es la escorrentía producida por un milímetro de agua de lluvia caída a un ratio constante de duración “D” distribuida uniformemente sobre una cuenca o, dicho de forma más simple, es una función de transferencia que permite pasar de una unidad de lluvia neta a su correspondiente escorrentía. Se acepta que una lluvia de valor doble a la unitaria generará un hidrograma cuyos valores serán dobles y el efecto conjunto de “n” unidades de lluvia se obtendrá sumando sus “n” hidrogramas unitarios considerando su desplazamiento temporal. Este método de hidrograma unitario se usa con más frecuencia en las cuencas rurales que en las urbanas; sin embargo, es común encontrar referencias a este método en la bibliografía y que los modelos de software comerciales incluyan un paquete de cálculo basado en esta filosofía. El hidrograma unitario tiene un número de parámetros limitado (entre 1 y no más de 3 ó 4), los cuales abarcan información hidráulica e hidrológica de la cuenca. Las variables puramente geométricas, como la superficie, son aceptadas, normalmente, como incuestionables, mientras que el resto de parámetros deben calcularse y estimarse. Cualquiera que haya trabajado con estos parámetros es consciente del grado de incertidumbre que se plantea una vez que estos han sido establecidos. 161 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Otra aproximación existente está basada en ecuaciones hidráulicas, cuyos parámetros vienen fijados por características morfológicas del área de estudio. Por lo tanto, estas ecuaciones sólo se aplican donde se conoce perfectamente la morfología del terreno, lo cual es poco frecuente. El uso de métodos de cálculo no basados en ecuaciones físicas, como Redes de Neuronas Artificiales y Programación Genética [3] está siendo comúnmente usado en campos como ingeniería civil e hidráulica. La Programación genética clásica (PG) es una técnica de búsqueda propuesta en [8]. Esta aproximación genera algoritmos y expresiones representados en estructura de árbol. En el problema particular de la modelización de la relación lluvia-escorrentía, la PG ha sido aplicada con el objetivo de realizar predicciones en localizaciones específicas [2, 12] teniendo como resultado expresiones complejas y difíciles de interpretar, sin desarrollar modelos conceptuales que pudieran ser usados en la comprensión de los procesos hidrológicos. 162 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 7.3 MÉTODO En este capítulo nos centraremos en un nuevo método [5] de computación evolutiva basado en el paradigma de evolución diferencial, añadiendo la característica de longitud de genotipo variable adaptado para trabajar con problemas de predicción de series temporales especiales. Esta aproximación se ha probado sobre datos de precipitaciones de lluvia para poder predecir en tiempo real los cambios en el nivel de agua de una cuenca y así poder construir un sistema de predicción de inundaciones. El término Evolución Diferencial (Differential Evolution, DE) fue nombrado por primera vez en 1998 por Kenneth Price y Rainer Storn [13]. Se trata de un potente algoritmo evolutivo utilizado para resolver problemas de optimización sobre espacios de búsqueda continuos. DE ha sido aplicado en diferentes campos en los que ha quedado patente su buen funcionamiento [4]. La esencia de esta técnica es la utilización de tres operadores que serán explicados a continuación: mutación, cruce y selección. Los dos primeros se utilizan para generar los vectores candidatos y la selección determina cuáles de ellos sobrevivirán a la siguiente generación. 163 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 7.3.1 Algoritmo de Evolución Diferencial básico Inicialización y mutación La población inicial se compone de un conjunto de NP individuos generados aleatoriamente (xi,G, i=1..NP). En cada generación, y para cada vector de la población, tres individuos diferentes entre sí (random vectors) se eligen aleatoriamente de la población anterior (estrategia general de mutación). Seguidamente, se genera un vector de mutación (mutant vector) del siguiente modo: ݒǡீାଵ ൌ ݔଵǡீ ܨȉ ሺݔଶǡீ െ ݔଷǡீ ሻ (1) i=1...NP Los vectores ݔǡீ son elegidos de nuevo para cada individudo de la población. El parámetro F (factor de escala) intenta controlar el equilibrio entre la explotación y exploración del espacio de búsqueda. Cruce Tras la generación de los vectores anteriores, se realiza la operación de cruce para incrementar la diversidad del espacio de búsqueda. Este paso se realiza en función de la 164 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). constante de cruce (CR), a la que se asigna un valor entre 0 y 1. Así, se generan los vectores de prueba ݑǡீ (trial vectors), donde cada una de sus componentes se calcula del siguiente modo: ݑǡீାଵ ݒۓǡீାଵ ǡ ܾ݀݊ܽݎሺ݆ሻ ݎܴܥ ۖ ݆ ൌ ݎܾ݊ݎሺ݅ሻ (2) ൌ ݔ ۔ǡீ ǡ ܾ݀݊ܽݎሺ݆ሻ ݎܴܥ ۖ ݆ ് ݎܾ݊ݎሺ݅ሻ ە j=1...D 1. D representa la dimensionalidad del problema. 2. randb(j) genera un entero aleatorio entre 0 y 1 para la componente j. 3. rnbr(i) genera un entero entre 1 y D, que asegura que ui,G+1 obtiene como mínimo un parámetro de ݒi,G+1. Selección Una vez que las dos operaciones previas han sido realizadas, el vector de prueba se compara con el vector objetivo (target vector); al tratarse de un problema de minimización, si el vector de prueba obtiene un valor menor en la función de 165 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). coste, será incluido en la siguiente generación; en caso contrario, se mantendrá el vector objetivo. Aunque aquí sólo se ha presentado un esquema de mutación, hay diferentes modos de implementar esta operación. Dependiendo del problema, una estrategia será más adecuada que otra. Algunos trabajos de investigación [11] alternan diferentes estrategias y valores de parámetros en diversas generaciones en función del valor de la función de coste. En [4] se establece una división de estrategias en los siguientes grupos: I. RAND: los individuos de prueba se generan sin información sobre los valores de la función objetivo. II. RAND/DIR: en este grupo las estrategias usan los valores de la función objetivo para determinar la dirección correcta. III. RAND/BEST: el mejor individuo se usa para construir el de prueba. IV. RAND/BEST/DIR: combina las ventajas de los últimos dos grupos. La estrategia a elegir viene determinada por el problema y la función objetivo. 166 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 7.3.2 Modificaciones incluidas en el método propuesto Para poder aplicar este algoritmo al campo de la hidrología hay que tener en cuenta algunas consideraciones. En primer lugar, para la resolución de problemas como el planteado en este capítulo es necesario calcular los parámetros que ajustan una función para poder establecer una predicción basada en correlaciones. Para ello una técnica habitual es establecer una ventana temporal que englobe los valores anteriores al instante temporal actual (t) para poder predecir el valor de la función en el instante temporal (t+1). Un ejemplo de este tipo de problemas sería la predicción de series temporales. Si se quiere aplicar la aproximación de evolución diferencial a este tipo de problemas, es necesario realizar una adaptación del algoritmo básico. Para ello, se propone que los individuos pueden tener diferentes longitudes. Por un lado, la longitud del mejor individuo proporcionará el tamaño de la ventana temporal y cada uno de sus genes corresponde a cada uno de los coeficientes que ponderan cada instante temporal. Para introducir la característica de longitud variable del genotipo, se han añadido algunos cambios a las estrategias generales de búsqueda explicadas anteriormente. Dado que cada individuo puede tener una longitud distinta, esta es una 167 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). característica que condiciona en gran medida los procesos de mutación y cruce: Con respecto a la mutación, ésta incluye operaciones aritméticas que deben ser definidas para ejecutarlas sobre individuos de longitud variable. Por ello, se procede del siguiente modo: x Los operandos (individuos) de menor longitud, serán completados con ceros hasta alcanzar la longitud del operando con el que se va a realizar la suma, resta o multiplicación. De este modo, el vector resultado tendrá la longitud del operando de mayor tamaño. El hecho de completar con ceros y no con valores aleatorios permite que el vector resultante se parezca lo máximo posible a sus antecesores. x Una vez que se obtiene el vector de mutación, y con el objetivo de evitar que la longitud de los vectores se incremente como resultado de la operación anterior, se aplica una operación de mutación de longitud: el vector de mutación puede mantenerse, incrementar o disminuir su longitud. El incremento/decremento escogido ha sido una unidad, que será completada con un valor aleatorio. En posteriores trabajos se plantearán incluyan ensayos con este parámetro. 168 experimentos que Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Xr1 Longitud = 4 xr1,G - xr3,G Xr2 Longitud = 7 Xr3 vi,G+1=F * (xr1,G - xr3,G)+(xr5,G - xr7,G) Xr4 ... Mutación de la longitud. Opciones: -Se mantiene (7) -Disminuye en una unidad (6) -Aumenta en una unidad (8) xr4,G - xrn,G Longitud = 7 Xrn Vector de Mutación Longitud = {6,7,8} Figura 1: Esquema general del proceso de mutación. En la figura 1 se representa un esquema general del proceso de mutación propuesto. Con respecto al cruce, se realiza como el clásico operador de recombinación, con la salvedad de que se completa la longitud del vector objetivo con ceros hasta alcanzar la del vector de mutación, resultante de la operación anterior. En cuanto a la operación de selección, se realiza como se ha explicado anteriormente. En este caso, la función de coste tiene en cuenta la longitud del individuo, penalizando a los de mayor longitud. 7.4 RESULTADOS Para evaluar el método los datos se han obtenido de forma sintética, simulando un escenario de lluvias en un modelo físico a escala situado en 169 el Centro de Innovación Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Tecnológica en Edificación e Ingeniería Civil [1]. Actualmente, en el laboratorio de Hidráulica del Centro de Innovación Tecnolóxica en Edificación e Enxeñería Civil (CITEEC) de la Universidade da Coruña, existe un modelo experimental que simula el efecto de la lluvia sobre una estructura metálica que actúa a modo de cuenca, generándose, de este modo, una escorrentía superficial. El montaje utilizado hoy en día consta de las siguientes partes: - Estructura metálica Se trata de una estructura metálica de planta rectangular de dimensiones 2.0x2.5m. Está compuesta de tres planos principales, cada uno de ellos con un 5% de pendiente. 170 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 2: Esquema y dimensiones de la estructura metálica. Alzado frontal de la estructura - Sistema hidráulico Se trata de un emparrillado metálico colocado a una altura de 70cm. A este emparillado se fija el sistema de simulación de lluvia, compuesto por tubos de polietileno conectados a un tubo principal que suministra el agua. En los tubos van enroscados diez difusores por línea separados entre sí unos 20 cm. Se 171 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). llevaron a cabo ensayos que demostraron que el agua se distribuye, para esta configuración elegida, con una adecuada homogeneidad. - Equipo para el registro de caudales Se cuenta con una probeta de más de 30 litros de capacidad que recoge el volumen de agua que sale. Sujeta a esta, se ha colocado una sonda de calado que, asociada al correspondiente software para PC, mide los sucesivos niveles de agua en la probeta, permitiendo conocer el caudal de salida. El agua saliente entra directamente en el fondo de la probeta a través de un embudo y un tubo conductor, tal como se muestra en la siguiente figura. De este modo, se minimizan las oscilaciones en la lámina de agua mejorando la calidad de las medidas de la sonda de calado. 172 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Entrada de auga Conexión software Sonda de calado Figura 3: Disposición de los elementos de recogida y medición de caudales de salida El procedimiento que se está siguiendo en la actualidad consiste en la apertura del sistema de difusión de agua durante un período determinado, para la posterior medición de los caudales de salida. Se obtiene, de este modo, un hidrograma que se utilizará en la validación de los modelos numéricos y de los modelos generados por los modelos de Inteligencia Artificial de transformación lluvia-escorrentía. La ventaja principal de este diseño es su simplicidad, y a la vez, la flexibilidad con la que permite simular situaciones un poco más complejas. En la figura 4 puede verse este diseño experimental en su actual ubicación, el CITEEC. 173 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 4: Colocación del diseño experimental en el laboratorio de hidráulica del CITEEC Hay varios métodos que calculan el proceso de lluviaescorrentía [14]. Para obtener una solución a este problema mediante evolución diferencial, en este trabajo se intentará aproximar la siguiente ecuación: 174 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). ݕ௧ ൌ σୀ ߠ ߝ௧ି σୀଵ ߮ ݕ௧ି (3) Como se puede ver en (3), es necesario encontrar los valores óptimos de p (tamaño de ventana temporal que engloba los valores previos de entrada de la función) y q (tamaño de ventana temporal que engloba los valores previos de salida de la función) y los de los coeficientes θ (ponderación de los valores anteriores de entrada) y φ (ponderación de los valores anteriores de salida), que son los parámetros cuyos valores se desean optimizar. Está claro que es necesaria la codificación en longitud variable del problema. 7.4.1 Modelo artificial y configuración de los parámetros El banco de pruebas usado en este trabajo ha sido obtenido de una simulación de lluvia sobre un modelo físico mostrado anteriormente. Como resultado se han obtenido las dos gráficas representadas en la figura 5. La primera de ellas representa la cantidad de lluvia caída en la cuenca. La segunda representa el caudal de agua producido consecuencia de las precipitaciones de lluvia. 175 a Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 5: Entrada y salida de la simulación. El algoritmo propuesto ha sido adaptado para que fuese consecuente con el problema descrito. En primer lugar, cada individuo es dividido en dos partes: una que representa los coeficientes ߮i (i=0..p) y otra que representa los coeficientes ߠj (j=1..q). Debido a la naturaleza del problema, no tendría sentido combinar ambas partes en el mismo proceso evolutivo. De este modo, cada parte de cada individuo evoluciona independientemente, pero la función de ajuste toma en consideración ambas partes conjuntamente. En segundo lugar, siguiendo las conclusiones obtenidas en [9] y [11] y en experimentos propios, la configuración de los parámetros es la siguiente: x Tamaño de población (NP) = 500 x Tasa de Cruce (CR) = 0.3 x Factor de escala (F) = 0.5 176 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x La estrategia elegida pertenece al grupo RAND/DIR. Siguiendo la nomenclatura de [13], la estrategia propuesta ha sido DE/rand/2/bin. Consiste en la elección de cinco individuos aleatorios de la población y operar con ellos como se indica en (4): ݒǡீାଵ ൌ ݔଵǡீ ܨȉ ቈ 7.4.2 Se ൫ݔଶǡீ െ ݔଷǡீ ൯ (4) ൫ݔସǡீ െ ݔହǡீ ൯ Discusión han usado dos aproximaciones diferentes para compararlas con el método aquí presentado: Programación Genética Clásica e Hidrogramas Unitarios. Transformación lluvia-escorrentía (m3/s) 0,0004 0,0002 0 t (s) Escorrentía Real Programación Genética Evolución Diferencial Hidrogramas 177 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 6: Comparativa de las diferentes técnicas utilizadas. Como se puede ver en la figura 6, el método propuesto se ajusta a la señal deseada mejor que las demás aproximaciones analizadas. De hecho, si comparamos el Error Cuadrático Medio obtenido con cada técnica (tabla 1) se puede apreciar que se obtiene menor error con la variante de DE propuesta en este artículo. Método ECM Programación Genética 2.50E-05 HIdrogramas Unitarios 1.79E-05 Evolución Diferencial 1.58E-05 Tabla 1 Los resultados anteriores se han obtenido del siguiento modo: x El ECM correspondiente a los hidrogramas se ha calculado mediante el software HEC-HMS [7]. Éste es un software que permite calcular el hidrograma producido por una cuenca. Si se le facilitan los datos físicos de la cuenca, de las precipitaciones, etc., proporciona el hidrograma de salida de la cuenca tanto en tabla como gráficamente. 178 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x Los resultados correspondientes a los algoritmos de programación genética se han obtenido mediante el algoritmo propuesto en [12] para determinar el hidrograma unitario de una cuenca urbana. La siguiente ecuación (5) ha sido obtenida como resultado de aplicar el algoritmo propuesto a los datos descritos previamente y que produce los resultados obtenidos en la tabla 1 y la figura 6: ݕ௧ ൌ ͳǤͲʹͷ ȉ ࣟ௧ ͲǤͶ͵ ȉ ࣟ௧ିଵ ͲǤͷͻ ȉ ݕ௧ିଵ ͲǤͳͳͻ ȉ ݕ௧ିଶ (5) 7.5 CONCLUSIONES El objetivo de este capítulo es mostrar la aplicación de uno de los pilares NBIC (Tecnologías de la Información) en hidrología, ligando así la temática a la del capítulo X. Con este objetivo, se ha comenzado con una breve introducción a la hidrología y el problema del cálculo de la transformación lluviaescorrentía. Tras un recorrido por los métodos más usuales de cálculo, el capítulo se ha centrado en una reciente técnica de computación basada en computación evolutiva: Evolución Diferencial. Se ha usado en la construcción de un laboratorio virtual que permite calcular la transformación 179 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). lluvia-escorrentía sin necesidad de construir un modelo físico que la represente. Los resultados se han comparado con dos de las técnicas de mejor funcionamiento en predicción de trasformaciones lluviaescorrentía, y se ha obtenido que la aproximación aquí presentada ofrece buenos resultados. AGRADECIMIENTOS Este trabajo fue parcialmente financiado por la “Dirección Xeral de Investigación, Desenvolvemento e Innovación” de la Xunta de Galicia (Ref. 08MDS003CT). El trabajo de Ana Freire ha sido financiado por una beca FPI del Ministerio de Ciencia e Innovación (Proyecto TIN2009-14203). 180 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Cea L., Garrido M., Puertas J., Urban flood computations from direct precipitation data using a two-dimensional shallow water model. The 8th International Conference on Urban Drainage Modelling. 7-12 Septiembre 2009. Japón. [2] Dorado J., Rabuñal J. R., Pazos A., Rivero D. and Santos A., “Prediction and modeling of the rainfall-runoff transformation of a typical urban basin using ANN and GP” Applied Artificial Intelligence, 2003, vol. 17, pp.329-343. [3] Drecourt J. P., “Application of Neural Networks and Genetic Programming to Rainfall-Runoff Modelling”. D2K Technical Report, vol. 0699-1-1, Danish Hydraulic Institute, Denmark, 1999. [4] Feoktistov V., Differential Evolution. In search of solutions. Springer, 2006. [5] Freire A., Aguiar-Pulido V., Rabuñal J.R., Garrido M., “Genetic Algorithm based on Differential Evolution with variable length. Runoff prediction on an artificial basin”, Proceedings of the International Conference on Evolutionary Computation (ICEC), pp. 207-212. Valencia, 2010. [6] Hydroworks. User Manual. Wallingford, 1995. 181 Hydraulic Research Ltd: Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [7] HEC_HMS, http://www.hec.usace.army.mil/software/hec- hms/, Accedida por última vez: Abril 2010. [8] Koza J. R., Genetic Programming. On the Programming of Computers by means of Natural Selection. Cambrige, MA: The MIT Press. 1992. [9] Mayer D. G., Kinghorn B. P. and Archer A. A., “Differential evolution – an easy and efficient evolutionary algorithm for model optimization”, Agricultural Systems, vol. 83, pp. 315328, 2004. [10] Puertas J., Miguélez M., Sistemas de predicción en hidrología mediante inteligencia artificial. Tecnologías de la Información y las Comunicaciones en la Ingeniería Civil, pp. 215-241. Ed. Fundación Alfredo Brañas. [11] Qin A. K., Huang V. L. and Suganthan P. N., “Differential Evolution Algorithm with strategy adaptation for global numerical optimization”, IEEE Trans. On Evolutionary Computation, vol. 13, no. 2, April 2009, pp. 398-417. [12] Rabuñal J.R., Puertas J., Suárez J., Rivero D., Determination of the unit hydrograph of a typical urban basin using genetic programming and artificial neural networks. Hydrological Processes, vol. 21, pp. 476-485, 2007. [13] Storn R. and Price K. V., “Differential evolution-A simple and efficient heuristic for 182 global optimization over Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). continuous Spaces”, J. Global Optim., vol. 11, pp. 341-359, 1997. [14] Viessmann W., Lewis G. L. and Knapp J. W., Introduction to Hydrology. New York: Harper Collins, 1989. 183 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). INTEGRAÇÃO DE DADOS BIOMÉDICOS Joel P. Arrais, Sérgio Matos e José Luís Oliveira E-mail: [email protected] Departamento de Electrónica, Telecomunicações e Informática (DETI), Instituto de Electrónica e Engenharia Telemática de Aveiro (IEETA), Universidade de Aveiro, 3810-193 Aveiro, Portugal 8.1 INTRODUÇÃO Nos últimos anos assistiu-se a um aumento exponencial da quantidade de dados disponível na área da biologia molecular. Este crescimento manifesta-se não só pelo contínuo incremento da informação armazenada por bases de dados estabelecidas, como o UniProt [1] e o GenBank [2], mas também pelo aparecimento de bases de dados focalizadas em novos domínios. O principal motor de criação de todo este conjunto de dados consistiu no desenvolvimento de novas técnicas de sequenciação e de monitorização da expressão génica em larga escala. disponibilizados O facto dos publicamente resultados em obtidos bases de serem dados estruturadas veio criar novas oportunidades, permitindo a 185 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). aplicação de métodos estatísticos e computacionais para inferir novas relações entre as entidades armazenadas, o que, consequentemente contribuiu para o aumento dos dados. Um exemplo recorrente é o conjunto de bases de dados de interacção entre proteínas, como o InterPro [3], obtidas através da aplicação de modelos computacionais a dados pré-existentes. Na realidade, os dados disponíveis, sejam eles originais ou derivados, possuem um elevado interesse para responder a novas questões biológicas. Estas questões requerem que dados de várias fontes sejam relacionados de forma a extrair relações até então desconhecidas. Por exemplo, um geneticista interessado no estudo da obesidade em humanos restringe o seu objecto de estudo a uma região de 5Mb do cromossoma 1. No intuito de dar resposta a este problema, e em alternativa a realizar experiências que analisem de uma forma cega toda a região, recorre a uma base de dados sobre a qual formula a seguinte pergunta: Existem genes nesta região homólogos aos de alguns dos organismos modelo e que estejam envolvidos na regulação do metabolismo de lípidos? Encontrar uma resposta coloca um desafio técnico nos domínios de acesso e da relação entre dados proveniêntes de várias bases de dados geograficamente dispersas e que possuem diferentes modelos de acesso e de 186 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). partilha (questão adaptada de [4]). A integração de dados caracterizados pela sua heterogeneidade constitui mesmo um dos maiores desafios ao desenvolvimento de ferramentas capazes de extrair relações de dados biológicos. No caso concreto dos microarrays, após a obtenção dos dados de expressão e do cluster de genes de interesse, é imperativo perceber o contexto biológico adjacente, pelo que o acesso a estas bases de dados é essencial [5, 6]. Neste capítulo é realizado um levantamento das principais bases de dados biológicas, das políticas de disponibilização dos dados, assim como das condicionantes existentes. De forma a facilitar a tarefa de aceder a fontes dispersas e, consequentemente, o desenvolvimento destas aplicações, é ainda proposta uma plataforma de integração de dados biológicos (Gens). 8.2 MOTIVAÇÃO À INTEGRAÇÃO DE DADOS BIOLÓGICOS As primeiras bases de dados em biologia molecular eram constituídas por repositórios de reduzidas dimensões que continham informação relativa a um determinado tópico de estudo. A difusão de técnicas laboratoriais em larga escala, tais como microarrays, levaram ao crescimento, tanto em 187 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). dimensão como em número, destes arquivos, o que originou uma enorme dispersão e fragmentação dos dados representativos do conhecimento biológico. De forma a colmatar esta lacuna foram propostos vários repositórios a nível mundial com o objectivo de servirem de ponto integrador. São exemplos o Ensembl [7], o UniProt [1], o Entrez [8] e o KEGG [9]. Porém, a constante criação de novas áreas de estudo e o aumento de dados derivados, obtidos através do processamento dos dados originais, fez com que o número total de bases de dados biológicas continuasse em crescimento. Actualmente existem mais de 1170 bases de dados disponíveis [10]. São dois os propósitos que justificam a integração de dados biológicos. Primeiro, porque os dados relativos a uma entidade biológica podem-se encontrar dispersos em várias bases de dados. Por exemplo, para um gene a informação relativa à sequência do nucleótido encontra-se armazenada no GenBank, às vias metabólicas no KEGG Pathway e aos dados de expressão no ArrayExpress [11]. A capacidade de obter uma vista unificada destes dados é crucial para compreender o papel desempenhado pelos genes. Uma segunda razão reside no facto de bases de dados, sobre o mesmo tópico de estudo, conterem dados incompletos, 188 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). redundantes ou sobrepostos. A integração destas bases de dados permite a complementaridade da informação e a detecção de incongruências através da comparação directa dos dados armazenados. Se, de início, o facto das bases de dados se encontrarem dispersas não ter representado grande problema, visto cada investigador se centrar num determinado domínio de estudo, actualmente, cada vez mais se pretende uma visão holística dos dados e, consequentemente, maior é a necessidade de os integrar [12]. Microarrays O resultado típico de uma experiência de microarrays é um conjunto de ficheiros tabulares com os valores de expressão de cada gene. Destes, e tendo em consideração o desenho experimental, é obtida uma ou mais listas com os genes de interesse. Estas podem ser provir da análise dos genes diferencialmente expressos, ou da detecção de clusters de genes. Em ambos os casos, a obtenção destas listas não representa a finalização do estudo. É necessário, através do recurso a informação armazenada em bases de dados públicas, compreender como estes genes se relacionam, isto 189 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). é, quais os processos em que estão envolvidos e qual a sua influência nesses mesmos processos. Uma das técnicas utilizada apoia-se na realização de uma análise funcional dos genes através do uso de uma ou mais terminologias. Este procedimento, comummente aplicado através do uso da Gene Ontology [5], tem sido expandido a outros conceitos, tais como a KEGG Orthology, vias metabólicas [6] ou classes de homologias. Todavia, esta metodologia depende directamente do acesso às bases de dados que originalmente armazenam a informação e, dependendo da questão biológica a endereçar, outras fontes de dados podem necessitar de ser acedidas. Biologia de sistemas A biologia de sistemas tem por objectivo a compreensão do comportamento de um determinado sistema biológico como um todo. Para tal, é essencial o acesso a um vasto conjunto de dados heterogéneos e de modelos matemáticos que possibilitam a modelação e posterior simulação de sistemas biológicos complexos. Em alguns projectos em que se simulou o comportamento de organismos eucariontes foram usados dados de enzimas, factores de transcrição, vias metabólicas, redes de genes e dados de expressão génica [13]. Como 190 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). suporte a toda esta área está então a necessidade de aceder de forma facilitada aos dados que originalmente se encontram armazenados em bases de dados públicas. Medicina genómica Outra área em que a integração de dados é fundamental é a medicina genómica. Nesta área trabalham geneticistas humanos que procuram genes responsáveis por doenças genéticas, fármaco-geneticistas interessados em perceber como genes, ou grupos de genes, estão envolvidos na resposta diferencial, após sujeição a um determinado fármaco, ou que procurem reunir dados biológicos, clínicos e conhecimento químico no desenvolvimento de novos fármacos; e ainda clínicos que pretendam, em tempo real, obter informação para tratamento dos pacientes. Apesar da aparente multiplicidade de sub-disciplinas na área da medicina genómica, existe um desafio comum que consiste no estabelecimento de associações entre o genótipo e o fenótipo. O genótipo é definido como a variação genética individual determinada pela sequência de ADN, sendo o fenótipo as características visíveis de um organismo obtidas através da interacção entre o genótipo e o ambiente. Neste contexto, faz sentido estudar as ligações entre 191 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). polimorfismos num genótipo e ou diferentes respostas de um genótipo a um tratamento de uma determinada doença. É então essencial integrar num esquema único a informação relativa a toda a cascata de relações que, sobre determinadas pressões ambientais, impelem um determinado genótipo, a manifestar-se como fenótipo [14, 15]. 8.3 POLÍTICAS DE DISPONIBILIZAÇÃO DE DADOS As primeiras bases de dados biológicas consistiam em simples páginas web, cujo conteúdo era adicionado através da edição directa do código HTML. Estas tinham como propósito a partilha dos dados de um estudo, ou projecto, com a restante comunidade científica. No entanto, com o aumento da complexidade das questões biológicas a endereçar a necessidade de aceder programaticamente aos dados foi-se tornando mais relevante. Para ultrapassar este problema, foram inicialmente desenvolvidos parsers que, através da análise do código HTML, extraíam a informação pretendida. Contudo, rapidamente se tornaram evidentes as limitações destes métodos. Primeiro, porque a mais pequena alteração na formatação da página poderia invalidar o parser desenvolvido. Segundo, porque nem todas as páginas possuíam URL acrescentar a explícito, estes invalidando problemas, 192 os a abordagem. intensivos A acessos Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). programáticos causavam degradação do desempenho para os utilizadores do sistema. Uma primeira solução consistiu na disponibilização de todo o conteúdo da base de dados em ficheiros XML ou tabulares num servidor FTP. Apesar da disponibilização dos dados para processamento local ter representado um avanço significativo, estes métodos tornam-se limitados quando apenas se pretende uma fracção dos dados totais. De forma a colmatar esta lacuna foram propostas várias soluções das quais as mais interessantes se baseiam no uso de web services. Um web service é uma interface de programação distribuída sobre a web que possibilita a execução de operações em servidores remotos. Esta tecnologia faz uso do protocolo http, para troca de mensagens, e da linguagem XML para descrever o formato da transmissão. Uma vantagem desta abordagem resulta do facto de não ser dependente de nenhum sistema operativo ou linguagem de programação. No desenvolvimento de web services podem identificar-se duas metodologias distintas: uma tradicional, designada de SOAP (Simple Object Access Protocol), e outra, conceptualmente mais simples mas que tem tido bastante 193 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). receptividade, denominada por REST (Representative State Transfer). Na área da biologia molecular, ambas as aproximações têm sido usadas podendo-se, todavia, afirmar que a baseada em SOAP continua a ser a mais representativa. Um dos exemplos mais conhecidos do uso da tecnologia SOAP é o sistema BioMoby [16]. O BioMoby define um padrão de troca de mensagens baseado numa ontologia que possibilita aos clientes a descoberta e a interacção com os fornecedores do serviço sem a necessidade de uma manipulação directa dos formatos ou dos fluxos dos dados. Já se encontram disponíveis várias aplicações cliente do BioMoby, sendo a mais carismática o Taverna [17], que possibilita a criação e execução de fluxos de tarefas sobre as fontes de informação disponibilizadas. Relativamente à tecnologia REST o sistema DAS (Distributed Annotation System) [18] é o mais relevante. Este sistema possibilita a disponibilização de dados de anotação genómica. As anotações fornecidas possuem para cada sequência, notas, observações e predições tais como a identificação de exões (zonas codificantes dos genes), intrões (zonas não codificantes dos genes) e a categorização de repetições no genoma. 194 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Uma comparação entre as duas tecnologias permite inferir que a interface REST é mais indicada para realizar pedidos de dados já pré-calculados enquanto os SOAP são mais indicados para o processamento remoto de dados. Uma revisão da evolução dos serviços biológicos actualmente disponibilizados através de web services pode ser encontrada em [19] e uma listagem completa no BioCatalogue 1. Não obstante a importância dos web services, existem outras estratégias de disponibilização programática de dados. O Ensembl permite o acesso aos seus dados através de uma API implementada em Perl e Java. Esta consiste na instanciação de classes locais que mascaram uma interface de acesso à base de dados remota do Ensembl. Apesar de funcionalmente semelhante aos web services, do ponto de vista da arquitectura, a estratégia adoptada pelo Ensembl diverge visto utilizar o acesso directo à base de dados. Porém, esta estratégia pode apresentar problemas quando se acede através de uma firewall. 1 http://beta.biocatalogue.org 195 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 8.4 LIMITAÇÕES NO ACESSO AOS DADOS Se bem que essencial, a integração de dados apresenta ainda vários desafios. A maioria dos dados armazenados está publicamente disponível como ficheiros de texto semiestruturado ou através de interfaces web, e para os obter tem que se aceder a cada base de dados, fazer download, parsing e, finalmente, agregá-los num repositório único e não redundante. Esta tarefa, para além de morosa, pode ser surpreendentemente difícil devido a várias limitações encontradas. Mapeamento de identificadores Um dos maiores problemas na área da biologia molecular decorre do facto de cada uma das bases de dados existentes utilizar referências através de “accession numbers” ou através do uso de terminologias próprias. A principal questão é que cada base de dados possui a sua própria estratégia de identificação. Apesar de várias bases de dados já possuírem informação relativa a referências cruzadas, esta continua incompleta. 196 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Dimensão dos datasets a integrar Com a actual dimensão dos conjuntos de dados biológicos é inevitável surgirem problemas de consistência, sincronização e actualização. No entanto, os maiores desafios apresentam-se não pelo efectivo tamanho dos dados mas mais pela quantidade de elementos individuais a integrar e pelo número de inter-relações existentes. Heterogeneidade das bases de dados Um dos obstáculos à integração advám da heterogeneidade existente entre as bases de dados. Com isto pretende-se referir que cada base de dados possui uma interface distinta para acesso e obtenção dos dados dificultando, deste modo, a tarefa de explorar e adquirir os dados pretendidos. Entretanto, um maior impedimento reside na heterogeneidade ao nível da semântica pois, apesar dos esforços de unificação já realizados, diferentes terminologias continuam a ser empregues por bases de dados distintas. Gestão de versões O acesso a fontes de dados distintas é ainda frequentemente dificultado pelo desconhecimento da versão da base de dados em utilização. Na realidade, devido à constante 197 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). mutação da informação armazenada, o resultado de um estudo realizado hoje pode diferir do resultado alcançado alguns meses depois. Esta dificuldade pode ser ultrapassada através do registo de todos os dados intermédios obtidos da análise. Isto é especialmente relevante quando se realizam pesquisas complexas que abrangem múltiplos tipos de dados e bases de dados distintas. 8.5 ABORDAGENS À INTEGRAÇÃO DE DADOS Pese o consenso existente quanto à necessidade de integrar dados biológicos, o mesmo não acontece no que se refere ao método para proceder à integração. Nesta secção são revistos os três principais métodos de integração: hiperligação, mediador e warehouse. A integração baseada em hiperligações foi a primeira e continua a ser a mais bem sucedida aproximação à integração de dados biológicos [4]. O motivo deste sucesso radica na sua semelhança com a própria web. No contexto da biologia molecular a questão coloca-se no facto de existir um incremento no número de bases de dados com informação de interesse. Para obter esta informação o investigador necessita de individualmente aceder a cada base de dados e de manualmente pesquisar a informação 198 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). pretendida. Para além disso, uma vez que cada base de dados possui a sua própria interface, o utilizador tem que “aprender” a navegar em cada uma das bases de dados. De forma a resolver este problema e simplificar a tarefa do investigador, foram desenvolvidos sistemas que agregam hiperligações de acesso directo às bases de dados biológicas. Deste modo, o utilizador apenas necessita de aceder a um sítio web e de fornecer o critério de pesquisa uma única vez, devolvendo o sistema a informação disponível em todas as bases de dados integradas. Algumas implementações não armazenam quaisquer dados localmente, sendo os identificadores, necessários à construção do url, obtidos, aquando da execução, através de um mecanismo de crawling. No entanto, noutras implementações desta técnica, uma base de dados local é usada para o armazenamento dos identificadores previamente obtidos. Exemplos desta metodologia são DiscoveryLink [20] e DiseaseCard [21]. Na integração baseada em mediadores é criada sobre as fontes de dados uma vista unificada que é fornecida ao utilizador. Através do uso deste método, o motor do mediador reformula durante a execução, a questão solicitada numa ou em várias questões que são colocadas sobre as respectivas bases de dados. Os resultados são então agregados e processados de forma a alcançar um resultado final que é 199 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). devolvido ao utilizador. Exemplos da utilização deste método são o BioMediator [22] e o SEMEDA [23]. Por fim, a integração de dados baseada na metodologia warehouse consiste na integração física de múltiplas fontes numa base de dados local, de forma a possibilitar a execução de questões directamente nesta base de dados e não nas fontes originais. A utilização de warehouses implica o desenvolvimento de um modelo unificador que possibilite acomodar toda a informação já armazenada nas bases de dados originais. Adicionalmente, é também necessária a existência de scripts que acedam às fontes de dados no intuito de obter e processar os dados, fazendo com que estes correspondam ao esquema unificador local. Após este passo inicial de configuração, a warehouse pode ser usada para responder a questões suportadas pelas fontes de dados originais, assim como a questões que necessitem da relação de conceitos armazenados em múltiplas bases de dados. 8.6 GENS: PLATAFORMA DE INTEGRAÇÃO DE DADOS BIOLÓGICOS O acesso integrado a fontes de dados dispersas constitui um elemento basilar no desenvolvimento de aplicações bioinformáticas. O modelo proposto, designado de Gens 200 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). (Genomic Name Server), tem por objectivo facilitar o desenvolvimento de novas aplicações que necessitem de aceder a dados, sem terem que se preocupar com a camada de acesso, obtenção e processamento. As escolhas efectuadas ao nível do modelo de armazenamento tiveram como principal propósito responder a uma série de requisitos, tais como eficiência, flexibilidade e escalabilidade do sistema. Como resultado, não se chegou a um modelo único mas sim a um conjunto de dois. Um de base, designado modelo físico, responsável pelo armazenamento efectivo dos dados independentemente do seu formato ou da sua origem, e um de topo, conceptual designado de meta-modelo, responsável pela definição dos dados a integrar e a armazenar. Sobre este último assentam os mecanismos de obtenção de dados e a ele acedem as aplicações externas, tais como GeneBrowser e Quext, que usam como fonte integradora de dados uma implementação do modelo proposto ( Figura 2). Bases de dados integradas O primeiro passo na construção do sistema de dados visa a selecção das bases de dados e na identificação 201 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). dos métodos mais adequados para os extrair. O esquema da Figura 3 ilustra as bases de dados e os respectivos métodos de acesso empregues. Sistematizando, as bases de dados usadas foram: - ArrayExpress2: Esta base de dados possui dados de experiências de expressão genética e foi acedida através do uso da interface SOAP [11]; - BioMart3: Esta base de dados, que corresponde a uma interface alternativa aos ao Ensembl, foi seleccionada 2 http://www.ebi.ac.uk/microarray-as/ae/ 3 http://www.biomart.org/ 202 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). pelas facilidades oferecidas na selecção personalizada dos dados pretendidos [7, 24]. Os dados são obtidos por meio da interface SOAP; - NCBI4: O NCBI (National Center for Biotechnology Information) [25] possui uma vasta colecção de bases de dados (Entrez Gene, Taxonomy, Pubmed, ReSeq, GenBank e OMIM), que foram integradas com recurso à importação dos dados disponibilizados em formato tabular; - ExPASy5: A base de dados ExPASy (Expert Protein Analysis System) [26] do SIB (Swiss Institute of Bioinformatics), focalizada na análise da sequência e estrutura de proteínas, foi integrada através de ficheiros tabulares; - UniProt6: A base de dados UniProt [1], constituída pela versão curada (SwissProt) e pela versão não curada (TrEMBL), foi integrada pela obtenção dos dados no formato XML; - PharmGKB7: Esta base de dados armazena informação relativa ao impacto que variações genéticas possuem 4 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 5 http://www.expasy.ch 6 http://www.uniprot.org 7 http://www.pharmgkb.org 203 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). na resposta a fármacos e foi integrada recorrendo-se ao download de ficheiros tabulares [27]; Figura 2. Modelo de integração constituído pelo modelo físico e pelo modelo conceptual. - KEGG8: O KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) [9] possui uma representação completa da célula, do organismo e da envolvência que permite a predição computacional de processos celulares e de informação molecular. Apesar de o KEGG possibilitar a 8 http://www.genome.jp/kegg 204 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). obtenção de dados por meio de vários métodos foi seleccionado o uso de ficheiros tabulares; - Gene Ontology9: O GO (Gene Ontology) [28] consta de um vocabulário controlado que possibilita a descrição de genes e de produtos de genes em qualquer organismo. Os dados foram obtidos através do parsing do ficheiro de texto disponibilizado no formato OBO (The Open Biomedical Ontologies) [29]; - InterPro10: A base de dados InterPro [3] consiste num repositório de famílias de proteínas, domínios, regiões e repetições já identificadas em proteínas conhecidas que possam ser usadas no processo de descoberta de novas. A obtenção dos dados desta base de dados foi realizada pela análise dos mesmos no formato XML. 9 http://www.geneontology.org 10 http://www.ebi.ac.uk/interpro 205 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 3. Bases de dados integradas no Gens. Não obstante as bases de dados apresentadas apenas representarem uma pequena porção das existentes, algumas delas são, já por si, hubs integradores, pelo que o resultado final redunda num conjunto alargado de conceito e relações biológicas. Deste modo, ao integrar estes dados numa instância única, foram obtidos mais de 500.000 genes únicos, cerca de 50 milhões de identificadores e 50 milhões de relações entre entidades biológicas, o que perfaz um total de 100 milhões de entidades biológicas sobre um único esquema. 206 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Meta-modelo de integração de dados As bases de dados apresentadas cobrem um vasto conjunto de áreas de estudo, podendo ser usadas na resolução de questões biológicas complexas que necessitem de relacionar vários conceitos [30]. No entanto, é necessário construir um modelo que integre os conceitos biológicos de cada base de dados, assim como as relações existentes entre estes. O meta-modelo obtido,, teve como especial foco a análise de estudos de expressão génica, pelo que a selecção das classes de dados a integrar e as relações apresentadas reflectem isso mesmo. Este apresenta-se como uma rede de conceitos centrados na proteína visto a maioria das relações derivarem desta unidade. Optou-se pelo uso da proteína e não do gene, enquanto conceito central, pelo facto de um gene poder dar origem a mais do que uma proteína. Directamente associados com cada proteína estão outros conceitos: o organismo a que a proteína pertence, a sua sequência, a sua localização genómica e os seus nomes alternativos. Estão também relacionadas diversas entidades, tais como doenças genéticas, informação de fármacos e seus respectivos genes alvo. As vias de sinalização possuem uma relação múltipla com o gene, visto um gene poder encontrar- 207 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). se em várias vias de sinalização e, de igual modo, uma via de sinalização possuir vários genes. Modelo físico O meta-modelo apresentado contém informação relativa às classes de dados a considerar e às respectivas relações. Numa aproximação comum, este modelo poderia mesmo ser convertido em modelo relacional e ser usado na base de dados para o armazenamento dos dados a integrar. Esta estratégia, embora mais directa, apresenta várias limitações, na medida em que a adição de uma classe implica alterações no modelo físico de armazenamento. A opção seguida passou pelo estabelecimento de um modelo físico de armazenamento, suficientemente genérico, de forma a suportar o meta-modelo anterior, assim como futuras evoluções do mesmo. Requisitos do modelo físico Foram estabelecidos os seguintes requisitos na implementação do modelo físico: - De modo a que a implementação do modelo seja usável, o seu esquema tem que ser fácil de compreender e de manter. Para tal, vários esforços 208 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). foram colocados no desenvolvimento de um esquema com um limitado número de tabelas; - É fundamental que o sistema seja escalável em dimensão, de forma a conter vários gigabytes de dados e centenas de milhões de entidades biológicas; - O sistema deve também ser escalável em termos do número de bases de dados armazenadas, o que deve ser obtido sem necessitar de alterar o esquema da base de dados; - Quanto aos dados armazenados, é necessário que sejam acessíveis através do uso de vários métodos. Para tal, é possível pesquisar no sistema através do uso de web services e uso directo de sql; - Mesmo contendo uma elevada quantidade de dados, o sistema está obrigado a ser eficiente de modo a possuir tempos de resposta baixos para as pesquisas mais frequentes. Este aspecto é de especial importância, pois esta ferramenta serve para responder a perguntas definidas pelo utilizador, assim como de plataforma ser usada como fonte de dados por outras ferramentas. De modo a atingir este objectivo, os identificadores dos genes são armazenados numa tabela distinta dos dados referentes a entidades biológicas, assim como são adicionados índices nas colunas associadas com os critérios de pesquisa mais comuns; - O sistema deve ainda incluir a possibilidade de guardar várias versões da mesma base de dados. Justificação para o uso de warehouse 209 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Tendo em consideração os requisitos impostos e atendendo às características específicas de cada um dos métodos de integração, optou-se pelo uso de warehouse. Uma descrição mais detalhada dos argumentos, que justificam o uso de warehouse e que são apresentados de seguida, pode ser encontrada em [31]. - Desempenho: A warehouse é o único método em que o tempo de obtenção dos resultados depende unicamente de factores locais (processador, memória, disco), ao contrário dos restantes que estão dependentes do atraso da comunicação dos dados e do tempo de processamento de servidores remotos. Este aspecto é especialmente relevante para a execução de questões complexas, que requerem a decomposição da questão original em várias subquestões; - Restrições de acesso: Ao contrário da warehouse, algumas das fontes de dados não disponibilizam mecanismos de pesquisa sobre as suas bases de dados (web services, url directo), e outras incluem mecanismos nas suas interfaces (tais como variáveis de sessão, cookies, etc) que dificultam o uso de métodos de acesso remoto. - Disponibilidade: As restantes metodologias, por oposição à warehouse, não permitem garantir a qualidade do serviço devido à incontornável dependência da disponibilidade de fontes de dados externas. Assim, o serviço prestado pode ficar 210 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). compremetido no decurso de uma avaria no servidor; porque os métodos de acesso aos dados foram alterados; ou, por exemplo, se a construção de um url se alterar, um procedimento não invulgar numa web sempre em constante evolução. Em qualquer dos casos o acesso à base de dados torna-se indisponível, e com agravamento destes serem usualmente resolvidos com intervenção humana; - Processamento dos dados: Outro problema apresentado pelas restantes metodologias que não a warehouse consiste na dificuldade em manipular e processar o conjunto de dados como um todo. No caso da integração baseada em links, a unidade atómica é a própria página web, pelo que não é possível distinguir elementos. Mesmo os mediadores que oferecem uma maior granularidade, ao permitirem a manipulação directa de elementos, têm dificuldade em aceder a todos os detalhes. - Gestão de versões: a warehouse é a única abordagem que possibilita a monitorização da versão de cada uma das bases de dados usadas, funcionalidade não muito relevante em pequenos projectos mas essencial em projectos de maior dimensão. Descrição do modelo físico O modelo implementado no Gens é baseado num modelo hierárquico centrado na proteína, no qual todas as relações 211 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). são construídas tendo por base os identificadores de proteínas associados. A motivação para centrar o modelo na proteína, e não no gene, reside no facto deste último se apresentar como um conceito mais geral, na medida em que cada gene, devido a vários mecanismos biológicos, poder dar origem a várias proteínas. Deste modo, se o modelo estivesse centrado no gene, estar-se-ia a perder informação relativa a associações únicas entre proteínas e outras entidades biológicas. O esquema da base de dados do Gens encontra-se na Figura 3. Figura 4. Esquema da base de dados do Gens 212 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). De seguida são descritos em pormenor os conceitos aplicados no desenho da base de dados: - Organism: Armazena a informação taxonómica, sendo que cada entrada corresponde ao organismo. Esta tabela pode ser considerada como a raiz do modelo, pois dela dependem todas as proteínas. É registado para cada organismo informação detalhada como o seu nome científico e a sequência de referência; - Protein: Guarda a informação de cada proteína. Esta informação inclui a localização no cromossoma, a sequência do gene e da proteína, assim como as relações para a tabela Identifier e BioEntity; - Identifier: Contém informação relativa a nomes e identificadores alternativos para a proteína em questão; - BioEntity: Armazena informação relativa a todas as entidades biológicas associadas com a proteína. Apesar de não existir uma lista fechada de elementos que podem constituir esta lista, esta inclui entradas em ontologias, vias metabólicas e doenças; - DataType: Define, cada entrada uma classe à qual um conjunto de identificadores de entidades biológicas ou de genes pertence. Este conceito é distinto do de base de dados, na medida em que tanto uma base de dados, pode possuir mais de um tipo de dados (por exemplo, o KEGG possui o KO, para ortologias, e o KEGG Pathway, para vias metabólicas), como o mesmo tipo de dados pode ser usado em várias bases 213 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de dados (por exemplo, o geneid é usado para identificar um gene humano no Entrez e no KEGG). - BioEntityDescription: Recolhe-se nesta tabela a informação relativa à descrição dos elementos armazenados na BioEntity. A organização hierárquica não se limita a simplificar o esquema da base de dados (tornando o sistema mais fácil de perceber e de manter), como também permite um melhoramento no desempenho do sistema. O sistema obtido é bastante flexível devido à forma como os elementos são mapeados. A adição de um novo tipo de elemento biológico, como uma via metabólica, por exemplo, apenas requer a criação de um novo tipo de dados, o estabelecimento da correspondente descrição por BioEntityDescription e, finalmente, a inserção de relações entre vias metabólicas e proteínas por ProteinBioEntity. Este esquema está ainda preparado para acomodar dados derivados. Mapeamento entre o modelo conceptual e o modelo físico A estratificação do modelo em dois níveis, físico e conceptual, foi concretizada possibilidade de tendo a com adição de principal fontes argumento de dados a sem necessidade de alterar o esquema físico de armazenamento dos dados. Exemplefica-se de seguida como o conjunto de 214 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). base de dados apresentado é mapeado no modelo conceptual e como estes dados são armazenados no modelo físico. O primeiro passo consiste em, para cada base de dados através do uso do método de parsing adequado, analisar e extrair as relações pretendidas. A título de exemplo, para o UniProt é necessário analisar o ficheiro XML, sendo depois, para cada elemento, correspondente a uma proteína extraídas as relações de acordo com o modelo conceptual. Deste modo, para cada proteína, elemento central do modelo, o parser extrai as relações associadas, tais como os identificadores de genes alternativos, a sequência, as vias de sinalização ou os fármacos associados. É desta forma que o modelo conceptual é iterativamente construído. Após a análise e extracção das relações de todas as fontes de dados, procede-se à persistência dos dados através do modelo físico. Cada entrada de proteína no modelo conceptual é registada na tabela Protein, que armazena ainda a sequência genética e genómica. A cada entrada de proteína organismo encontra-se associada correspondente. No uma modelo entrada com conceptual, o as associações relativas a alternative ids são guardado na tabela Identifier, sendo estabelecida uma associação com a tabela 215 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). DataType, que define univocamente qual o tipo de identificador usado. De seguida, as restantes associações são recolhidas na tabela BioEntity. Por exemplo, o elemento Pathway, no modelo conceptual, é armazenado na tabela BioEntity, sendo a associação com a proteína estabelecida pela tabela ProteinBioEntity. A indicação de que uma entrada na tabela BioEntity corresponde a um determinado elemento do modelo conceptual é definida pela tabela DataType. Ainda, caso o elemento em questão possua uma ou mais descrições, estas podem ser conservadas na tabela BioEntityDescritpion. A adição de uma classe biológica ao meta-modelo, situação bastante comum, não implica alterações no esquema da base de dados. São, portanto, evidentes as vantagens que esta aproximação apresenta quando comparada com a tradicional. Exemplo de utilização O seguinte exemplo demonstra um de vários cenários de utilização do Gens: um investigador pretende obter a rede de conceitos relacionada com o gene ‘sce:Q0085’. Começa por se determinar o identificador interno da proteína através da tabela Identifier. Com este identificador pode 216 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). então, chegar-se à lista dos identificadores de genes alternativos. Seguidamente e através do acesso à tabela Protein, é possível conseguir informação genérica tal como a sua sequência ou a sua localização cromossomal. Dando sequência a este processo e por meio da consulta da tabela BioEntity são encontradas todas as entidades biológicas directamente relacionadas como o gene em questão, tais como homologia, bibliografia, dados de expressão, ontologias, vias de sinalização ou enzimas. Por fim, informação mais detalhada sobre cada uma destas entidades pode ser encontrada na tabela BioEntityDescription. Seguindo este procedimento de navegação, é agora possível saber, por exemplo, para a via metabólica ‘sce00190’, identificada como contendo o gene ‘sce:Q0085’, todos os genes directamente associados. Para tal é necessário perceber todas as relações inversas entre a tabela BioEntity e Protein. 217 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Figura 5. Exemplo que ilustra o uso do Gens para obter a rede de conceitos associados com o gene ‘sce:Q0085’. Utilização pública O acesso ao Gens encontra-se disponível através de dois métodos: queries SQL efectuadas directamente sobre a base de dados e uma interface de web services. O recurso a queries SQL é aconselhado para acessos intensivos e para questões que necessitem de relacionar simultaneamente um número 218 elevado de entidades Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). biológicas. Neste caso, é necessária a instalação de uma instância local com uma dimensão aproximada de 10 GB. O download da base de dados, assim como informação detalhada sobre a instalação encontra-se disponível em http://bioinformatics.ua.pt/applications/gens. Em alternativa, é possível pesquisar na base de dados através da interface de web services, http://bioinformatics.ua.pt/GeNS/WS/. disponível Os em métodos implementados fazem uso da flexibilidade do esquema do Gens para, através de um número limitado de métodos, conseguir expressar um conjunto abrangente de questões. Estes permitem a listagem dos tipos de dados e proteínas armazenados, a pesquisa por organismos e proteínas e a dupla conversão entre entidades biológicas e identificadores. 8.7 CONCLUSÃO Neste capítulo foi apresentada uma revisão das principais bases de dados biológicas, dos métodos de acesso aos dados e das estratégias de disponibilização. É ainda proposta uma plataforma de integração de dados biológicos, que possibilita o acesso centralizado a fontes de dados dispersas. O modelo proposto, designado de Gens (Genomic Name Server), tem por objectivo facilitar o desenvolvimento de novas aplicações 219 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). que necessitem de aceder a dados, sem terem que se preocupar com a camada de acesso, obtenção e processamento. O problema da integração de dados biológicos apresenta-se como um dos mais relevantes problemas da bioinformática. O principal factor diferenciador da plataforma proposta consiste no estabelecimento de dois níveis de armazenamento: um de base, designado modelo físico, responsável pelo armazenamento efectivo dos dados independentemente do seu formato ou da sua origem; e um modelo de topo, designado de meta-modelo, responsável pela definição dos dados a integrar e a armazenar. A solução proposta, para além de simples, permite garantir a eficiência, flexibilidade e escalabilidade do sistema. A instância actual do Gens integra 9 bases de dados que totalizam 500.000 de genes únicos com cerca de 100 milhões de entidades biológicas. O Gens já foi usado como base no desenvolvimento das aplicações bioinformáticas GeneBrowser [32] (http://bioinformatics.ua.pt/gb2) que permite realizar uma análise funcional a um conjunto de genes e Quext [33] (Query Expansion Tool – http://bioinformatics.ua.pt/quext) que usa expansão de termos para optimizar pesquisas sobre o PubMed. 220 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERÊNCIAS [1] "The Universal Protein Resource (UniProt) 2009," Nucleic Acids Res, vol. 37, pp. D169-74, Jan 2009. [2] D. A. Benson, I. Karsch-Mizrachi, et al., "GenBank: update," Nucleic Acids Research, vol. 32, p. 23, 2004. [3] S. Hunter, R. Apweiler, et al., "InterPro: the integrative protein signature database," Nucleic Acids Res, vol. 37, pp. D211-5, Jan 2009. [4] L. D. Stein, "Integrating biological databases," Nat Rev Genet, vol. 4, pp. 337-45, May 2003. [5] F. Al-Shahrour, P. Minguez, et al., "FatiGO +: a functional profiling tool for genomic data. Integration of functional annotation, regulatory motifs and interaction data with microarray experiments," Nucleic Acids Res, vol. 35, pp. W91-6, Jul 2007. [6] S. Draghici, P. Khatri, et al., "A systems biology approach for pathway level analysis," Genome Res, vol. 17, pp. 1537-45, Oct 2007. [7] T. J. Hubbard, B. L. Aken, et al., "Ensembl 2009," Nucleic Acids Res, vol. 37, pp. D690-7, Jan 2009. [8] D. Maglott, J. Ostell, et al., "Entrez Gene: genecentered information at NCBI," Nucleic Acids Res, vol. 35, pp. D26-31, Jan 2007. [9] M. Kanehisa and S. Goto, "KEGG: kyoto encyclopedia of genes and genomes," Nucleic Acids Res, vol. 28, pp. 27-30, Jan 1 2000. [10] M. Y. Galperin and G. R. Cochrane, "Nucleic Acids Research annual Database Issue and the NAR online Molecular Biology Database Collection in 2009," Nucleic Acids Res, vol. 37, pp. D1-4, Jan 2009. 221 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [11] H. Parkinson, U. Sarkans, et al., "ArrayExpress - a public repository for microarray gene expression data at the EBI," Nucleic Acids Res, vol. 33, pp. D553-5, Jan 1 2005. [12] B. Louie, P. Mork, et al., "Data integration and genomic medicine," J Biomed Inform, vol. 40, pp. 5-16, Feb 2007. [13] T. Ideker, V. Thorsson, et al., "Integrated genomic and proteomic analyses of a systematically perturbed metabolic network," Science, vol. 292, pp. 929-34, May 4 2001. [14] T. E. Klein, J. T. Chang, et al., "Integrating genotype and phenotype information: an overview of the PharmGKB project. Pharmacogenetics Research Network and Knowledge Base," Pharmacogenomics J, vol. 1, pp. 167-70, 2001. [15] E. E. Schadt, S. A. Monks, et al., "A new paradigm for drug discovery: integrating clinical, genetic, genomic and molecular phenotype data to identify drug targets," Biochem Soc Trans, vol. 31, pp. 437-43, Apr 2003. [16] M. D. Wilkinson and M. Links, "BioMOBY: an open source biological web services proposal," Brief Bioinform, vol. 3, pp. 331-41, Dec 2002. [17] T. Oinn, M. Addis, et al., "Taverna: a tool for the composition and enactment of bioinformatics workflows," Bioinformatics, vol. 20, pp. 3045-54, Nov 22 2004. [18] R. D. Dowell, R. M. Jokerst, et al., "The distributed annotation system," BMC Bioinformatics, vol. 2, p. 7, 2001. [19] P. B. Neerincx and J. A. Leunissen, "Evolution of web services in bioinformatics," Brief Bioinform, vol. 6, pp. 178-88, Jun 2005. 222 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). [20] L. Haas, P. Schwarz, et al., "DiscoveryLink: A system for integrated access to life sciences data sources," IBM Systems Journal, pp. 489-511, 2001. [21] J. L. Oliveira, G. Dias, et al., "DiseaseCard: A Web-Based Tool for the Collaborative Integration of Genetic and Medical Information," in Biological And Medical Data Analysis: 5th International Symposium, Springer, Ed., ed, 2004, pp. 409-417. [22] E. Cadag, B. Louie, et al., "Biomediator data integration and inference for functional annotation of anonymous sequences," Pac Symp Biocomput, pp. 343-54, 2007. [23] J. Kohler, S. Philippi, et al., "SEMEDA: ontology based semantic integration of biological databases," Bioinformatics, vol. 19, pp. 2420-7, Dec 12 2003. [24] D. Smedley, S. Haider, et al., "BioMart - biological queries made easy," BMC Genomics, vol. 10, p. 22, 2009. [25] D. L. Wheeler, D. M. Church, et al., "Database resources of the National Center for Biotechnology Information: update," Nucleic Acids Res, vol. 32, pp. D35-40, Jan 1 2004. [26] M. R. Wilkins, E. Gasteiger, et al., "Protein identification and analysis tools in the ExPASy server," Methods Mol Biol, vol. 112, pp. 531-52, 1999. [27] C. F. Thorn, T. E. Klein, et al., "PharmGKB: the pharmacogenetics and pharmacogenomics knowledge base," Methods Mol Biol, vol. 311, pp. 17991, 2005. [28] M. Ashburner, C. A. Ball, et al., "Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium," Nat Genet, vol. 25, pp. 25-9, May 2000. [29] B. Smith, M. Ashburner, et al., "The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support 223 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). biomedical data integration," Nat Biotechnol, vol. 25, pp. 1251-5, Nov 2007. [30] R. Stevens, C. A. Goble, et al., "Ontology-based knowledge representation for bioinformatics," Brief Bioinform, vol. 1, pp. 398-414, Nov 2000. [31] L. Wong, "Technologies for integrating biological data," Brief Bioinform, vol. 3, pp. 389-404, Dec 2002. [32] J. P. Arrais, J. Fernandes, et al., "GeneBrowser 2: an application to explore and identify common biological traits in a set of genes," BMC Bioinformatics, vol. 11, p. 389, 2010. [33] S. Matos, J. P. Arrais, et al., "Concept-based query expansion for retrieving gene related publications from MEDLINE," BMC Bioinformatics, vol. 11, p. 212, 2010. 224 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). PROYECTOS DE INTEGRACIÓN DE INFORMACIÓN MOLECULAR EN UN HOSPITAL ACADÉMICO Sonia Benítez, Daniel Luna, Paula Otero y Fernán Quirós E-mail: [email protected] Depto. de Informática en Salud – Hospital Italiano de Buenos Aires 9.1 INTRODUCCIÓN Con los avances de la Medicina Genómica, más pacientes tendrán enfermedades reconocible que con deberían un componente poder ser genético manejados apropiadamente[1]. Los profesionales de la salud que hoy por hoy son competentes para tener en cuenta las necesidades de la genética médica estarán preparados para hacer frente a los avances en la medicina genómica a medida que aparezcan, mientras que los profesionales de la salud que desconocieran conceptos básicos de la genética médica pondrían a sus pacientes en riesgo de no recibir el mejor cuidado disponible. El mejoramiento del acceso a internet en la práctica asistencial también provee oportunidades en la actualización 225 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de la información genética como guía. Diversas organizaciones están desarrollando sistemas de soporte a la toma de decisiones en el punto de atención para los profesionales de atención primaria. Estos sistemas incorporan materiales de educación básicos, a veces combinados con guías clínicas, incluyendo recomendaciones para la derivación a especialistas cuando fuera necesario. Un número de factores convergen para promover la educación continua y en la integración de la genética en la práctica. El creciente interés de los profesionales y los administradores de salud en los sistemas electrónicos de manejo de datos puede ayudar a llevar el contenido genético al punto de atención, especialmente con la Historia Clínica Electrónica (HCE). Esto tiene implicancias importantes para el mejoramiento de las aplicaciones de la historia familiar, el cual es central en la atención médica basada en la genética[2]. El objetivo de este artículo es describir algunos de los proyectos de integración de información molecular y genética, tales como los Programas de Farmacogenómica y el de Cáncer Hereditario, en el ámbito de un Hospital Universitario de alta complejidad información en salud. 226 con un Sistema de Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 9.2 HOSPITAL ITALIANO DE BUENOS AIRES El Hospital Italiano de Buenos Aires es un hospital universitario de alta complejidad fundado en 1853, cuyos pilares han sido desde sus comienzos la asistencia, la docencia y la investigación. Pertenece a una red sanitaria sin fines de lucro junto con un segundo hospital con 25 centros ambulatorios y 150 consultorios particulares, mas de 150 mil afiliados y con una cobertura de 1,5 millones de pacientes. 227 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). En la red trabajan 6300 personas (2300 médicos asistenciales, 2500 agentes del equipo de salud, 1500 administrativos) que asisten a 2.500.000 de consultas ambulatorias y 50.000 egresos anuales que se distribuyen en sus 750 camas (200 de cuidado críticos). Es pionero en procedimientos que requieren la más alta complejidad, tanto en el ámbito de Argentina como en el de Latinoamérica. Se realizan más de 240 trasplantes por año. Además cuenta con Sistema de información Clínico, con Servicios terminológicos, la Historia Clínica electrónica (HCE), sistema de PACS y el Portal Personal de Salud (Personal Health record) 228 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La HCE, es el sistema web con toda la información médica del paciente orientada a problemas, tanto clínica, de prescripción de fármacos, como de estudios por imágenes. Esta herramienta profesionales del se encuentra Hospital en a todo disposición momento de y los lugar, permitiendo un acceso inmediato a la información, y brindando gran seguridad a los pacientes. A su vez, en Docencia cuenta con más de 40 especialidades médicas, más de 30 programas de residencias médicas y 34 programas de fellowships. Para cubrir las 70 plazas del programa de residencias del último año, se presentaron 1.400 aspirantes. Además cuenta con una Universidad con carreras de Medicina, Enfermería, Farmacia y Bioquímica, brindando a la comunidad más de 60 cursos de posgrado, con modalidad presencial o a distancia, a través de su Campus Virtual. En el campo de investigación, como parte de la institución, se encuentra el Instituto de Ciencias Básicas y Medicina Experimental (ICBME) centro de investigaciones básicas y aplicadas que desarrolla tecnologías y conocimientos para luego ser transferidos a la medicina asistencial. 229 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Además de profundizar los estudios que se refieren a medicina regenerativa, a trasplante celular y a células madre, el Instituto ha creado la Unidad de Medicina Molecular y Genómica, destinado a mejorar el diagnóstico de enfermedades y establecer tratamientos diferenciales para cada paciente. Se encuentran, a su vez el Comité de Ética de Protocolos de Investigación (CEPI) que tiene a su cargo la función de evaluar la viabilidad de los protocolos de investigación tanto desde el punto de vista técnico como ético, así como el Comité de Investigación Clínica (CIC), cuyo objetivo es estimular y promover el desarrollo de la investigación clínica dentro de la Institución. 9.2.1 Centro de Excelencia de Informática Médica para la Región Latinoamericana El recientemente creado Centro de Investigación y Educación en Tecnologías e Informática para la Salud (CIETIS), parte integrante del Departamento de Informática en Salud, se encarga de los proyectos de investigación en Informática en Salud. La Beca Fogarty del año 2009, que tiene financiación del NIH para crear un Centro de Excelencia de Informática Medica para la Región Latinoamericana, fue concedida, entre otras 230 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). instituciones, a la Oregon Health and Science University (OHSU) para combinar su programa de Informática y Epidemiologia con la del HIBA y desarrollar un programa focalizado en Clinical and Translational Research Informatics (CTR). El programa Fogarty de entrenamiento en Informática para la Salud Global tiene como objetivo incrementar la expertise en Informática en Salud en los países en desarrollo, a través del entrenamiento de científicos en el diseño de sistemas de información y gestionen y realicen análisis sobre investigación biomédica mediado por computadoras. 231 la Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 9.3 PROGRAMA DE FARMACOGENÓMICA Un tratamiento aplicado a dos personas con la misma enfermedad puede producir resultados secundarios distintos. Además de los y/o efectos condicionantes ambientales, uno de los factores determinantes ante la efectividad y toxicidad de un fármaco son los genes[3]. El estudio de las variaciones genéticas a la respuesta al fármaco se llama farmacogenética en el estudio de un gen individual, o farmacogenómica en el estudio de todos los genes[4]. La variabilidad en los genes que codifican para las proteínas y otras dianas de los medicamentos está relacionada con la eficacia y toxicidad de los fármacos. Un mayor conocimiento científico de estas moléculas permitirá optimizar la terapia farmacológica. De hecho ya existen Tests comerciales que están disponibles y la FDA ha sugerido que se incluya la información genética al iniciar el uso de la warfarina. De esa manera la farmacogenómica se encargará de estudiar cómo diferentes individuos, con características genéticas distintas, responden de manera distinta a los medicamentos[3, 4]. 232 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 9.3.1 Experiencia en el HIBA El Programa de Farmacogenómica en el HIBA comprende el desarrollo de proyectos de investigación, tendientes a generar evidencia que sustente recomendaciones para el uso de los distintos análisis farmacogenómicos y de las prácticas específicas en aquellos casos en que ya exista suficiente justificación científica. El programa está liderado por la Sección Farmacología Clínica del Servicio de Clínica Médica y la Unidad de Medicina Molecular y Genómica del ICBME. El objetivo del programa, en esta primera etapa es promover la utilización de los análisis farmacogenómicos en la actividad asistencial, para luego poder establecer de alertas y recordatorios en la HCE. Para ello se encargara de : la identificación de los principales genes polimórficos que codifican isoenzimas biotransformadoras, transportadoras o sitios de acción de drogas específica; la jerarquización de las isoenzimas con mayor aplicabilidad práctica con el objeto de establecer una secuencia de desarrollo; el desarrollo de las técnicas más apropiadas para la identificación de las variantes genéticas seleccionadas; la puesta a punto de las técnicas específicas; la determinación de la frecuencia de 233 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). cada polimorfismo en la población argentina a partir de muestras del banco de ADN del HIBA, la comparación de las frecuencias de los polimorfismos entre la población general y población de pacientes con patologías que justifican el uso de drogas afectadas por estos polimorfismos; el análisis de polimorfismos entre pacientes con respuestas exageradas, insuficientes o con efectos adversos a determinados fármacos; los estudios de predicción de la concentración plasmática y resultado terapéutico para casos seleccionados. En la primera Fase, que se ejecuto entre de Marzo y Septiembre de 2009, se redactó el documento final, se presento y se empezó a trabajar sobre algunas prácticas (HLAB*5701, CYP3A5, CYP2C9 / VKORC, CYP2D6 y CYP2C19). Entre Octubre de 2009 y Junio de 2010 se siguió con otras prácticas (UGT1A1, CYP2C8, TMPT, CYP2B6, CYP1A2, NAT2, CYP2E1 y DPD). En la actualidad se sigue trabajando para incorporar mas practicas. En la siguiente figura se ve el modulo de Solicitud de prácticas de la HCE donde se ven la prácticas farmacogenómicas solicitadas: 234 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Solicitud de prácticas farmacogenómicas desde la HCE Las Prácticas que en la actualidad ya están disponibles en la HCE son: el test de hipersensibilidad al abacavir, la tipificación de K-RAS y sensibilidad farmacogenómico de al cetuximab, CYP2C9 y el VKORC1, estudio para medicamentos anticoagulantes orales (CYP2C9 y VKORC1), antidepresivos (CYP2D6, SLC6A4 y CYP2C19); Psicofármacos, transportadores: ABCB1; la tipificación molecular de UGT1A1 y relación con la toxicidad por irinotecan; el CYP3A5, para tacrolimus; la farmacogenómica de CYP2B6. 235 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Se encuentra en desarrollo la armonización del resultado que se entrega al paciente, lo cual implica la codificación y control del vocabulario utilizado. Esto permitirá la creación de reglas que serán el sustento de las alertas y recordatorios. 9.4 PROGRAMA DE SEGUIMIENTO (PCCR) COLORRECTAL DE PROGRAMA Y CÁNCER DE CÁNCER HEREDITARIO (PRO.CAN. HE) 9.4.1 Programa de Seguimiento de Cáncer colorrectal (PCCR) El Programa de seguimiento de Cáncer colorrectal, se encuentra en proceso. El desarrollo del Programa está a cargo de la Sección de Coloproctología, del Servicio Cirugía General, de la Unidad de Medicina Molecular y Genómica, del ICBME; Anatomía Gastroenterología, del Patológica, Servicio de la Clínica Sección de Médica e Informática Medica y Bioestadística y Epidemiologia del DIS Los objetivos de este programa son el seguimiento de la población afectada de Cáncer colorrectal, de Cáncer Hereditario y la Creación de reportes para realizar intervenciones y seguimiento. En la siguiente figura se resume el flujo de trabajo e información. 236 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Flujo de información del PCCR De diferentes sistemas (HCE, sistema de gestión de pacientes – Sistema ADT -) se creara un padrón o listado de pacientes que tengan diagnostico de Cáncer colorrectal o similar. Este listado se auditara y según los resultados se hará la intervención seguimiento de pacientes y registro del mismo. 9.4.2 Programa de Cáncer Hereditario (Pro.Can.He) Desde fines del año 1996 la Sección de Coloproctología del Servicio de Cirugía General del HIBA, comenzó a trabajar en un programa dirigido a pacientes y familiares afectados por tumores hereditarios. 237 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La iniciativa nació luego de reconocer las primeras nueve familias tratadas por Síndrome de Lynch (Cáncer colorrectal No Asociado a Poliposis-CCNAP) y se inspiró en los diferentes programas que funcionan en los principales centros del mundo. El programa tiene su espacio tanto en la Página web del HIBA [4] como en el Campus Virtual, donde además de la información propia del grupo se promueve la capacitación interna de los profesionales, tal como se puede ver en las siguientes figuras. Página web de acceso al Pro.Can.He 238 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Espacio de Capacitación interna del Pro.Can.He en el Campus Virtual Entre las actividades más importantes es la de brindar a los pacientes la disponibilidad de realizar estudios genéticos, permitiendo así detectar precozmente grupos familiares de riesgos. El objetivo fundamental del PROCANHE es lograr un adecuado manejo de los cánceres hereditarios. Los pilares para lograr este objetivo son: 1. Educación, al paciente, familia y comunidad. 239 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). 2. Pautas enfocadas en la prevención y tratamiento del cáncer colorrectal. 3. Centralización de los datos para facilitar la colaboración y realización en los estudios de investigación. Este Registro se haya reconocido en la Internacional Society for Gastrointestinal Hereditary Tumors (InSIGHT), y su director es actual integrante del consejo del Internacional Collaborative Group of the Americas. Como parte de esta tarea en el año 2008 se creó en la HCE un registro estructurado específico del Pro.Can.HE que permite el ingreso preciso de datos en cada consulta médica, que luego permite el seguimiento de pacientes. A continuación se pueden apreciar algunos módulos de la misma: 240 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Registro estructurado del Pro.Can.He en la HCE: modulo de datos generales 241 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Registro estructurado del Pro.Can.He en la HCE: modulo de estudios genéticos previos 242 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). PORTAL PERSONAL DE SALUD DE SALUD: I-TALIANO Existe acuerdo sobre recomendar la promoción de la educación sobre genética médica a los profesionales, pero también se deben establecer métodos más efectivos y eficientes para obtener y actualizar la historia familiar del paciente. También se debe dar poder al paciente para que tome responsabilidad sobre estas tareas, para lo cual diversas propuestas informáticas o basadas en la web han sido desarrolladas[5]. Dentro de estas propuestas podríamos incluir a los Personal health record. El Portal Personal de salud del HIBA es el Personal health record o HCE del paciente y es una herramienta que el HIBA puso al servicio de su comunidad en el año 2007. El proyecto se inicio en Octubre 2007 y en la actualidad ya hay 33.521 personas registradas, de las cuales el 87% son del Plan de Salud, el 75% ingresaron más de 1 vez, la edad promedio de los pacientes es de 47 años y el 20% son mayores de 65 años. Aquí el paciente puede tener un rol activo, ya que le permite conocer al instante información sobre su salud, comunicarse con su médico y acceder a los servicios del Hospital. El sistema 243 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). promueve la participación activa de las personas en el cuidado de su salud, incentivando la prevención y la toma de decisiones responsables. En la actualidad hay 33.521 personas registradas x 87% son del Plan de Salud x 75% ingresaron más de 1 vez x Edad promedio 47 años x 20% son mayores de 65 años Los ingresos por año han ido aumentando desde su lanzamiento como lo muestra la figura a continuación: Ingresos al Portal Personal por año Toda la información está personalizada de acuerdo a: x Información Demográfica 244 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x Información/opciones que el paciente elige x Problemas de Salud / Diagnósticos x Programas Médicos x Médicos tratantes que envían información directamente al Portal Personal de Salud del Paciente A esta herramienta web se puede acceder desde la página principal del HIBA como se puede observar en la siguiente figura: Acceso al Portal Personal de Salud a través de la página principal del HIBA 245 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Luego de ingresar el usuario y contraseña correspondiente se accede al Portal Personal de salud, propiamente dicho. Página Principal del Portal Personal de Salud y acceso a las funcionalidades Desde este portal el paciente puede a través del menú que presenta: buscar a los profesionales, centros médicos y especialidades; solicitar online atención tanto con el médico de cabecera, como especialistas; ver las derivaciones, interconsultas y los turnos que el paciente tomó y la posibilidad de cancelar turnos tomados; ver los medicamentos prescriptos 246 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). en la HCE , vigentes y el stock disponible en las farmacias de Plan de Salud; solicitar el envío de Medicamentos directamente desde el Portal a la dirección y en el horario que el paciente indique; actualizar sus datos personales; imprimir documentación para realizar los pagos del Plan de Salud; enviar un mensaje a su médico de cabecera y ver resultados de los laboratorios e imprimirlos desde su casa. Se resumen esas funcionalidades en las siguientes figuras. Visualización de resultados de laboratorio desde la Página Principal del Portal Personal 247 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Visualización de medicación desde la Página Principal del Portal Personal El uso de este portal tiene el gran potencial de actualizar la información del paciente en la HCE lo que plantea la posibilidad que el mismo paciente pueda poner al día su información familiar en la HCE, así como otra información de interés. 248 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). AGRADECIMIENTOS Y CONTACTOS Proyecto de Informática en Salud del HIBA x Dr. Fernán Quirós, Vicedirector Medico de Planeamiento Estratégico o x [email protected] Dr. Daniel Luna, Jefe del Departamento de Informática en salud o x [email protected] Dra. Paula Otero, Gerente de Productos y Staff de Informática medica o x [email protected] Dra. Sonia Benítez, Residente de Informática Medica o [email protected] Comunicación Institucional x Marisa Kapucian o [email protected] Proyecto de Farmacogenómica x Lic. María Ana Redal. Jefa de la Unidad de Medicina Molecular y Genómica. Jefa de Farmacogenómica. x Dr. Waldo H Belloso. Jefe Farmacología Clínica del HIBA. 249 de la Sección de Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). x Dra. Paula Scibona. Becaria de Perfeccionamiento de la Sección de Farmacología Clínica del HIBA o [email protected] Proyecto de seguimiento de Cáncer colorrectal/Pro.can.he x Dr. Carlos Vaccaro. Jefe de la Sección de Coloproctología o [email protected] Proyecto de Portal Personal de Salud x Ing. Marcela Martínez. Jefa de Desarrollos para el Plan de salud o x [email protected] Dr. Carlos Otero. Jefe de la Sección de Terminología y Documentación Clínica o [email protected] 250 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] Feero WG, Guttmacher AE, Collins FS. Genomic medicine--an updated primer. N Engl J Med May 27;362(21):2001-11. [2] Guttmacher AE, Porteous, Mary E , McInerney, Joseph D. Educating health-care professionals about genetics and genomics. Nature2007;8:152-7. [3] Torrades S. Farmacogenética: la medicina a la carta. Ambito Farmaceutico - OFFARM2002;21. [4] Flockhart DA, Skaar T, Berlin DS, Klein TE, Nguyen AT. Clinically available pharmacogenomics tests. Clin Pharmacol Ther2009 Jul;86(1):10913. [5] Greendale K, Pyeritz, R. Empowering Primary Care Health Professionals in Medical Genetics: How Soon? How Fast? How Far? American Journal of Medical Genetics (Semin Med Genet) 2001;106:223±32. 251 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). COMUNIDADES DE PRÁCTICA: ESTRATEGIA PARA LA GENERACIÓN Y DISEMINACIÓN DE CONOCIMIENTO CIENTÍFICO Álvaro Margolis, Antonio López [email protected], [email protected] EviMed 10.1 INTRODUCCIÓN Desde el siglo XVII, la producción de conocimiento científico se aceleró rápidamente año a año [1]; durante los últimos 20 años se han realizado más descubrimientos que en el resto de la historia de la Humanidad. Este escenario de superproducción de conocimiento científico también genera un problema a los grupos de investigación para poder hacer llegar sus resultados a su población objetivo sin que estos pasen desapercibidos entre la inmensidad de información disponible. Desde sus orígenes en 1989, la World Wide Web (WWW) fue concebida por el Consejo Europeo de Investigación Nuclear (CERN) como un medio para el intercambio de información 253 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). científica entre grupos de investigación, rol que cumplió con creces; de hecho, ni el más optimista de sus arquitectos jamás habría pensado que dicha infraestructura iba a evolucionar hasta los niveles que hoy tiene, con tan sólo veinte años de existencia. Pero la infraestructura web y los altísimos niveles de interconexión planetaria que ha alcanzado han permitido la creación de nuevas aplicaciones que faciliten la interacción entre la población, mucho más allá del intercambio de información científica para el cual fue concebida. La popularidad de las redes sociales como Facebook o LinkedIn hoy permiten a las personas interactuar y comunicarse entres sí con extrema facilidad aprovechando una serie de servicios interactivos conocidos como “web 2.0”. Un buen ejemplo de red social aplicada a temas médicos son las agrupaciones de pacientes diabéticos; a través de la plataforma electrónica los mismos comparten experiencias, prácticas, recetas médicas y demás interacciones que cuando son compartidas aportan a la calidad de vida de los integrantes de la red, aunque sin un impacto significativo sobre el conocimiento, comportamiento o estado de salud de sus integrantes [2]. Una red social, cuando está conformada por grupos mas reducidos de personas altamente capacitadas en algún tema 254 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). específico, se convierte en una comunidad de practica. Las comunidades de práctica [3] significan cooperación profesional interdisciplinaria para optimizar el desempeño de los profesionales. Corresponden a “un grupo de personas que comparten una preocupación, un grupo de problemas o una pasión sobre una temática y que profundizan en su conocimiento y experticia a través de la interacción continua entre sus integrantes” [4]. En toda comunidad de práctica se identifican ciertos componentes comunes, que se destacan a continuación [5]: Áre ad a Comunidad de práctica tic Antecedentes ác Pr ec on oc im ien to Liderazgo y patrocinio Interacción Participantes Participación Necesariamente tiene que haber un liderazgo claro, y algún tipo de patrocinio que permita cubrir los costos mínimos de operación; sin estos dos elementos, la comunidad seguramente nunca alcance índices altos de participación, interacción y –en definitiva- valor. Una articulación bien 255 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). diseñada sobre un área de conocimiento definida que facilite la interacción entre los participantes favorece el proceso de “darle sentido” a los datos para transformarlos en información, que en el caso de la investigación es nuevo conocimiento y en el caso de la práctica médica es conocimiento tácito o mindlines (concepto definido más adelante). 10.2 APLICACIONES A LA INVESTIGACIÓN Y DISEMINACIÓN Durante el ciclo de vida de un nuevo conocimiento resultado de una investigación – desde que se inicia la exploración hasta que es aplicado regularmente en la práctica clínica- se pueden identificar dos comunidades de práctica que participan en dicho proceso: 1. Los grupos de investigación: creadores del nuevo conocimiento, muchas veces trabajando en forma distribuida geográficamente e integrando múltiples instituciones y organismos. 2. Los consumidores del nuevo conocimiento: son los grupos de interés que van a aplicar en su práctica diaria los resultados de la investigación. El proceso de 256 diseminación del nuevo Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). conocimiento generado tiene como publico objetivo a estos grupos. Las comunidades de práctica pueden contribuir tanto en el proceso de creación como en el de diseminación del nuevo conocimiento: Investigación Tipo de red: Comunidad de práctica Integrantes: Investigadores Moderadores: Lideres de la investigación Objetivos: Diseminación Comunidad de práctica Profesionales de la salud Lideres de opinión Explotación Red social Población beneficiaria Auto-organizado Facilitar estudio 1. Enterar Compartir información Estimular debate 2. Lograr aceptación Grupos de auto-apoyo Crear espacios de reflexión 3. Convencer de aplicabilidad Espacios de colaboración 4. Capacitar para aplicar Medios de comunicación 5. Comenzar aplicación Repositorios de información 6. Convencer del beneficio Compartir experiencia 7. Recolectar evidencia Obtener feedback ---------------------------Generar nuevo conocimiento Lograr adhesión ------------------------------- Generar conocimiento tácito, aplicable en la practica diaria 257 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La siguiente figura muestra a los actores involucrados en el proceso de investigación y diseminación del nuevo conocimiento, así como también muestra donde podrían aprovecharse las ventajas de las comunidades de práctica y de las redes sociales: Pacientes Medicos Referentes Prensa Sociedades cientificas Equipos Familiares de salud Investigacion Evidencia Organizaciones medicas Universidades Industria Asociaciones El proceso de investigación (concepción de la idea -> pregunta de investigación -> justificación del problema -> análisis de viabilidad -> revisión de literatura -> construcción del marco teórico -> definición de hipótesis, …) es, por definición, un multidisciplinario, trabajo iniciado de a reflexión, través de preferentemente discusiones u observaciones de hechos, investigaciones anteriores u otras fuentes de inspiración. La gran mayoría de las ideas iniciales 258 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). son vagas y requieren un análisis para ser transformadas en planteamientos precisos y estructurados, así como también de una revisión exhaustiva de antecedentes para evitar investigar en un tema que ya ha sido estudiado muy en profundidad. Las comunidades de práctica son ámbitos ideales para este tipo de actividad, la cual puede ser realizada a distancia, entre grupos dispersos geográficamente, involucrando a más expertos y disciplinas. La propia comunidad puede ser utilizada por el grupo de investigación, luego de generado el nuevo conocimiento, para realizar otras actividades de tipo “peer reviews” como ser validación de hipótesis, adquisición de datos de campo, revisión de publicaciones, y demás tareas propias de los grupos de investigación. Luego de generado el nuevo conocimiento, los profesionales de la salud difícilmente utilicen en su practica clínica directamente la nueva evidencia científica que proviene de los grupos de investigación. Más allá de la importancia de los procesos estandarizados basadas en la evidencia científica (como, por ejemplo, las guías clínicas), es sabido que los profesionales cambian su práctica principalmente a través de las llamadas “mindlines” [6], definidas como guías tácitas, internalizadas por el profesional y reforzadas a través de la interacción colectiva. Estas mindlines se generan a partir de lecturas breves, de la 259 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). experiencia personal, de la interacción con los pares y líderes de opinión, representantes de la industria farmacéutica, pacientes y otras fuentes de conocimiento tácito; todas estas interacciones pueden suceder naturalmente en una comunidad de práctica. La alimentación de la comunidad de practica con mindlines puede ser realizada y monitoreada por el propio grupo de investigación. Estas comunidades de práctica orientadas a la diseminación de nuevo conocimiento pueden involucrar a lideres de opinión, representantes de sociedades científicas, instituciones de asistencia médica, industria farmacéutica y estudiantes de posgrado entre otros potenciales interesados. Adicionalmente, las comunidades de práctica ofrecen beneficios a las instituciones donde los profesionales de la salud se desempeñan. Si bien la medicina es una práctica multidisciplinaria, no todos los médicos cuentan con un equipo interdisciplinario en su lugar de trabajo; muchas veces se enfrentan a sus pacientes sin el encuadre institucional que les permita reflexionar y transformar su práctica, en el contexto aislado del consultorio individual. En este sentido, las comunidades de práctica pueden ofrecer a los médicos oportunidades no solamente para su propia formación profesional y –además- enriquece 260 a los grupos de Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). investigación con feedback de campo de una manera costo/efectiva. En este sentido, el uso de comunidades de práctica basadas en las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC) crece notoriamente en todo el mundo como una forma de adecuar las estrategias de investigación y de contribuir al trabajo colaborativo interdisciplinario, así como también ser una herramienta de apoyo eficiente y efectiva para la diseminación del nuevo conocimiento generado. Las TIC posibilitan, entre otros elementos: La cooperación de profesionales dispersos geográficamente. El involucramiento investigadores, de un estudiantes, mayor numero evaluadores, testers de y demás participantes del proceso de investigación. La creación de ámbitos de debate y reflexión entre mayor cantidad de participantes La realización de actividades asincrónicas en la modalidad individual y grupal, acorde al tiempo y horario disponible de cada participante. La elaboración enfoque colectiva de conocimientos con interdisciplinario colaborativas en línea. 261 mediante actividades Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). El concepto de comunidad de práctica no se asocia exclusivamente al ámbito virtual; la comunidad puede tener componentes presenciales que se apoyan en la plataforma virtual principalmente para el establecimiento de la red de contactos y la publicación de conclusiones de las actividades presenciales. Al mismo tiempo, una comunidad de práctica puede apoyarse en medios impresos para distribuir sus principales avances o conclusiones a través de canales existentes con un público objetivo bien definido. Las comunidades de práctica, entonces, pueden utilizarse para facilitar el proceso de investigación a través de la introducción de nuevos medios que permitan a un publico ampliado -pero conocedor profundo del tema- participar en todo el ciclo de vida de la producción científica, desde la concepción inicial por parte del grupo de investigación pasando por el debate, discusión y reflexión necesario, su posterior validación hasta llegar a la etapa de diseminación del nuevo conocimiento que permita su aplicación en la práctica cotidiana. La creación de comunidades de práctica se convierte, de estas maneras, en un elemento estratégico para optimizar la performance de los equipos de investigación y como una 262 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). herramienta vital para permitir una rápida diseminación del nuevo conocimiento generado. 10.3 EXPERIENCIAS EN CREACION DE COMUNIDADES DE PRACTICA EviMed cuenta con experiencia internacional en la conformación de comunidades de práctica utilizando TIC [7][8]; lo viene haciendo exitosamente desde 2004 en Uruguay, y desde 2007 en Puerto Rico. La creación de una comunidad de práctica es un proceso delicado que requiere de tres elementos esenciales: x Líderes, expertos en un tema específico, que le den respaldo científico a la comunidad y dirijan el curso de la misma. x Equipos multidisciplinarios con una metodología probada que diseñen un conjunto de productos y servicios que atienda las necesidades del colectivo que se desea abordar, ofrezca un nivel y calidad de servicio superior al esperado y estimule/anime la participación. x Un patrocinio que permita solventar los costos operativos de la comunidad; el pago por 263 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). suscripción de los miembros de la red no ha demostrado ser una forma sustentable de iniciar una comunidad de práctica. Los equipos de trabajo multidisciplinarios del staff permanente de EviMed (comunicadores, médicos, bibliotecólogos, informáticos) se complementa para cada tema a abordar con expertos en dicha área de conocimiento – provenientes de Universidades, sociedades científicas, u otros organismos reconocidos. El aval académico de las actividades realizadas siempre es aportado por una Universidad local (del país donde se desarrolla la actividad). Generalmente en cada área de especialidad donde se desee crear una comunidad de práctica, siempre es posible 264 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). invitar a patrocinadores que deseen invertir en el soporte financiero de la comunidad, ya sea a cambio de publicidad dentro de la plataforma o como forma de apoyo al proyecto de investigación. En el caso de la Educación Medica Continua, la industria farmacéutica dispone de rubros presupuestales para financiar este tipo de actividades de comunidad, ya sea a través de becas para participar en las actividades educativas o a través de publicidad directa. 10.4 IMPORTANCIA DE LA METODOLOGÍAS Lamentablemente, es frecuente encontrar propuestas de elearning para el área de la Salud provenientes de empresas tecnológicas o universidades que enfatizan el potencial de Internet y otras TIC por sí mismas, o bien de los contenidos educativos por sí mismos, cuyos resultados en el aprendizaje son pobres o inexistentes y generan gran insatisfacción en los médicos al reforzar el aislamiento profesional y/o la brecha digital producto de las limitaciones en el manejo de las herramientas informáticas (especialmente en los médicos mayores). Estas propuestas carecen de ningún tipo de diseño metodológico que articule tecnologías y contenidos de acuerdo a las necesidades y expectativas de los médicos y otros profesionales de la Salud. 265 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). A la hora de proponerse crear una comunidad de practica – ya sea para apoyar la investigación o para facilitar la diseminación- es estratégico poner fuerte énfasis en las actividades de interacción; esto es la publicación en una plataforma electrónica de materiales de calidad en conexión con actividades interactivas coordinadas por expertos que permitan a los investigadores o a los médicos poner en juego sus conocimientos previos y problemas de la práctica, en diálogo con sus pares y con los especialistas. Parte de la metodología deberá incluir necesariamente instrumentos de medición, que permitan crear una línea de base, habilitar mediciones constantes y retroalimentar el diseño original para ir adecuando las comunidades a las cambiantes realidades. Esta estrategia sigue la tendencia de las redes sociales que ejemplifican con máxima claridad el impacto de las ofertas de interacción social en la Web y su efecto potencial en los procesos de investigación, enseñanza y aprendizaje. 10.5 OPORTUNIDAD PARA LA RED NBIC La aplicación de este instrumento en el marco de la red NBIC se visualiza como una oportunidad para fortalecer los vínculos entre los participantes de la red existente, montando una plataforma que facilite la comunicación entre los integrantes 266 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). de los equipos y que les provea de una herramienta adicional que facilite el proceso de investigación en si mismo y también la difusión de los resultados obtenidos. Entre los objetivos del proyecto IBERO-NBIC se encuentran: 1 Creación de una comunidad amplia de científicos y tecnólogos 2 Formación (biólogos, médicos, nuevos investigadores) 3 Difusión (transferencia a la industria, divulgación a población, decisores), 4 Gestión de conocimiento, recomendaciones publicas - mantener la confianza de la población 5 Desarrollo de modelos de escenarios y conocer percepción social 6 Aplicación a enfermedades complejas – adhesión al tratamiento 7 Divulgación a comunidad científica y público en general 8 Actividades de formación on-line y presenciales 9 Análisis de impacto (social, económico) 10 Creación de web site del grupo: dinámico vs estático vs red 267 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). La creación de comunidades de práctica que integren a los involucrados en cada grupo de investigación contribuye a todos los objetivos del proyecto IBERO-NBIC: en el fortalecimiento de las propias comunidades (integración), acciones educativas dirigidas a médicos (mejores prácticas), investigadores (formación), pacientes (adhesión al tratamiento) y población en general (mantener la confianza en las NBIC). También en medición de impacto (grupos intervención y control), y en definitiva comunicar todos los conocimientos generados por los propios grupos integrantes de la red NBIC en forma efectiva y de alto impacto. La red IBERO-NBIC es un ámbito donde la introducción de comunidades de practica puede ofrecer altos beneficios tanto en el apoyo al proceso de investigación como a la diseminación de los nuevos conocimientos generados dado que ya se cuenta con los elementos esenciales para una comunidad de práctica exitosa: áreas de conocimiento definidas, referentes internacionales en dichas áreas (líderes), patrocinios, vínculos con la industria, grupos de investigación dispersos geográficamente, reuniones presenciales periódicas y un medio impreso de comunicación hacia el exterior (el libro). En este contexto, el principal aporte de una comunidad de práctica sería facilitar la interacción entre sus miembros 268 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). para estimular el intercambio creando espacios de debate y reflexión. De esta manera, las disciplinas Nano, Bio y Cogno pueden apoyadas en la disciplina Info- ser más eficientes durante el proceso de investigación y además proyectar sus resultados a un público más amplio introduciendo comunidades de práctica específicas para dar soporte a cada investigación y comunidades de práctica particulares para los públicos Investigación Publico masivo objetivo que se quiera abordar. N B C I El hecho de disponer de una plataforma basada en TIC para facilitar la investigación permite realizar mediciones de impacto con mayor precisión y esfuerzos significativamente menores. Las plataformas electrónicas que administran el funcionamiento de la comunidad de práctica recolecta en forma automática información sobre uso y acceso que puede 269 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). ser utilizada con fines estadísticos. Por ejemplo: la realización de encuestas sobre un determinado punto puede escalarse fácilmente a múltiples países donde el representante local del grupo de investigación es el encargado de la captación de la información local, y luego esta puede ser analizada en forma agregada por los investigadores del grupo discriminando, por ejemplo, según país, sexo, edad o formación de los participantes. También habilita la realización de intervenciones masivas, a nivel intercontinental. De esta manera, el grupo de investigación no solo es responsable de la generación de conocimiento, sino también de la diseminación del mismo. Además, facilita la generación de capacidades locales en temas específicos de interés del grupo de investigación; un excelente ejemplo de iniciativa de este tipo son las actividades de formación realizadas a nivel iberoamericano por el Hospital Italiano de Buenos Aires [9] (integrante de la red NBIC). CONCLUSIONES Las comunidades de práctica basadas en TIC permiten hacer más eficiente el trabajo de los grupos de investigación, habilitando un cambio en la forma de investigar y generar 270 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). conocimiento basado en un modelo participativo y de alta interacción; estas instrumentos existentes, durante los herramientas, procesos pueden de complementarias –además- ser diseminación del a los utilizadas nuevo conocimiento. La identificación de líderes científicos, el apoyo de patrocinadores (incluir a la industria), y la aplicación de una metodología probada (comprensión de las necesidades específicas, diseño participativo y realista, involucrando a instituciones locales) son tres elementos esenciales para que la comunidad de practica sea exitosa. Subestimar el esfuerzo que implica la creación de una comunidad de práctica exitosa es un error frecuente que lleva a la existencia de múltiples iniciativas con escasa o nula actividad. El valor agregado de una comunidad de práctica se mide en la calidad de las participaciones que cada integrante hace al colectivo con su contribución personal influenciada por la diversidad de experiencias y perspectivas. La articulación necesaria para que estas dinámicas sucedan no deberían ser responsabilidad directa de los líderes de la comunidad, sino preferentemente de grupos multidisciplinarios (comunicadores, educadores, profesionales de la salud, informáticos, etc.) que, trabajando en forma transversal, crean 271 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). las condiciones para que tanto los líderes como los participantes realicen su mayor aporte sin distraerlos con aspectos operativos propios comunidad. 272 del funcionamiento de la Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). REFERENCIAS [1] SCImago Journal [2] Balsa, Gandelman.The Impact of ICT on Health Promotion: A Randomized Experiment with Diabetic Patients, InterAmerican Development Bank, Department of Research and Chief Economist. IDB WORKING PAPER SERIES No. IDB-WP-221, 2010 [3] Parboosingh JT. Physician communities of practice: where learning and practice are inseparable. J Contin Educ Health Prof. 2002; 22(4): 230-236. [4] Wenger, E. Communities of Practice. Learning, meaning and identity. Cambridge University Press, 1998. [5] John Parboosingh, People tools for knowledge transfer – the role of communities of practice. Health Research Transfer Network of Alberta –RTNA- 2008 [6] Soubbi, Bayliss, Fortin, Hudon, Akker, Thivierge, Posel, Fleiszer. Learning and caring in communities of practice: using relationships and collective learning to improve primary care for patients with multimorbidity. Annals of family medicine, march/april 2010. [7] Martínez E, Margolis A, Joglar F, et al. From Uruguay to Puerto Rico: similarities and differences in continuing medical education 273 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). and the context of health care. Continuing Medical Education Congress, UBC/Alliance/CACHE/SACME/AHME, Vancouver, abril de 2008. [8] Llambí L, Margolis A, Toews J, et al. Distance Education for Physicians: Adaptation of a Canadian Experience to Uruguay. JOURNAL OF CONTINUING EDUCATION IN THE HEALTH PROFESSIONS, 28(2):79–85, 2008. [9] Quirós, Luna, Otero, Benitez, Otero. Manejo de pacientes y formacion de clinicos en el Hospital Italiano de Buenos Aires desde la perspectiva NBIC. Nuevas fronteras tecnologicas, 2010 274 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). APÉNDICE: REPORTAJE FOTOGRÁFICO DEL III WORKSHOP INTERNACIONAL REDES NANOROADMAP E IBERO-NBIC. México, Noviembre 2011. Miembros de la Red Ibero-NBIC en el primer día del Workshop. Reunión conjunta Redes NanoRoadmap e Ibero-NBIC. 275 Nano, Bio, Info y Cogno (Convergencia de Tecnologías NBIC). Reunión de miembros de CYTED en el Foro FIBECYT. FIBECYT Prof. Alejandro Pazos junto al Prof. Mario Molina (Premio Nobel de Química, 1995). 276 9 788415 413004