Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas

Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas

Cursos y Tópicos
Semestre 2016-2
1. Título del curso o tópico
Genómica y genómica funcional de microsimbiontes
2. Tutor responsable
Nombre del Tutor MARTINEZ ROMERO ESPERANZA
Entidad
Centro de Ciencias Genómicas
Teléfono
Correo electrónico [email protected]
3. Integrantes
Integrante
Rol
MARTINEZ ROMERO ESPERANZA
Horas
Tutor responsable
MÓNICA TERESA ROSENBLUETH LAGUETTE Profesor invitado (Externo)
VIOLETA MATUS ACUÑA
Profesor invitado (Externo)
4. Observaciones del Coordinador del curso o tópico
Es recomendable que los estudiantes tengan conocimiento de biología molecular y genética.
5. Características para impartir el curso o tópico
Lugar en donde se realizará el tópico
Cuernavaca, Morelos
Horario en que se realizará el tópico
viernes 11:00-14:00
Número de sesiones
16
Máximo de alumnos que puede aceptar 12
6. Métodos de evaluación
Método
Participación en clase
Porcentaje Cantidad
32 %
16
7. Introducción / justificación del curso o tópico
Las interacciones simbióticas predominan en la naturaleza. La simbiosis transforma a los organismos y constituye un
motor en su evolución. Los avances en los estudios genómicos han llevado a analizar con un nuevo enfoque a los
simbiontes. La secuenciación masiva de ARN (RNA-Seq) de endosimbiontes dentro de sus hospederos permite
generar hipótesis sólidas para elucidar el funcionamiento y papel que juega el microsimbionte en el hospedero.
Revisaremos las generalidades de distintos microsimbiontes y los avances en sus estudios genómicos y
transcriptómicos. Se dará énfasis a los conocimientos biológicos generados con éstos enfoques y no a los aspectos
metodológicos. Para algunos microsimbiontes aún no se cuenta con estudios transcriptómicos, sólo genómicos.
8. Objetivos
1. Revisar criticamente la información genómica y transcriptómica de microsimbiontes de interés agrícola y
biotecnológico.
2. Identificar las funciones microsimbiontes en sus hospederos, derivadas de estudios transcriptómicos.
9. Temario del curso o tópico
1. Generalidades, genómica y transcriptómica de endófitos, ¿Qué son, de dónde se aíslan? Ejemplo de Kebsiella
como endófito.
2. Burkholderia, multireplicones y genomas diversos.
3. Bacterias de los nódulos de leguminosas: Alpha y beta rhizobia, arquitectura genómica.
4. Wolbachia, spiroplasmas y Cardium.
5. Metilobacterias y sphingobacterias.
6. Actinobacterias y micoplasmas.
7. Bacillus, lactobacillus y paenibacillus.
8. ARN pequeños en bacteria y elementos de regulación genética.
9. Análisis estadísticos.
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