La heredabilidad oculta del genoma
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La heredabilidad oculta del genoma
AGAGTTCTGCTC G AGAGTTCTGCTC G AG G GTTAT G C G C G AG G GTTAT G C G C G Variación genética en el genoma AGAGTTCTGCTC G AGAGTTCTGCTC G AG G GTTAT G C G C G AG G GTTAT G C G C G 1 1. 2. 3. 500 568 SNPs Controles •1500 individuos 1958 British Birth Cohort •1500 voluntarios (UK Blood services) 2 3 15 variantes con información previa de evidencia de asociación 4 25 señales que superan el umbral de p = 10-7 12 se habían detectado previamente 58 señales que superan el umbral de p = 10-5 5 6 7 8 •Validación de la aproximación GWA: los hallazgos son comparables a todos los estudios previos por genes candidatos o clonación posicional •Importancia control de calidad •Beneficios logísticos y económicos de esta aproximación respecto a otras •Variantes alélicas detectadas con efecto moderado OR entre 1,2 y 1,5 •Preponderancia de variantes susceptibles de efecto pequeño •Tamaños de muestras de 2000 casos y 3000 controles son necesarios •Primer paso para la disección de enfermedades comunes y su traslación a la mejora de la salud humana Estudios de asociación: efectos fenotípicos de los SNPs 9 La heredabilidad oculta del genoma 1. LIMITACIONES DE LOS GWA (Variantes raras) 2. ‘OUT OF SIGHT’ (Baja penetrancia) Brendan Maher 5 November 2008 | Nature 456, 18-21 (2008) 3. ARQUITECTURA DEL GENOMA (Variación estructural) 4. REDES ENTRE GENES (Epistasis) 5. ESTIMAS HEREDABILIDAD EN DUDA (Epigenética) 6. PERDIDOS EN EL DIAGNÓSTICO (Diferentes enfermedades) La heredabilidad oculta del genoma 10 La heredabilidad oculta del genoma La heredabilidad oculta del genoma 11 12