La heredabilidad oculta del genoma

Transcripción

La heredabilidad oculta del genoma
AGAGTTCTGCTC G AGAGTTCTGCTC G
AG G GTTAT G C G C G AG G GTTAT G C G C G
Variación genética
en el genoma
AGAGTTCTGCTC G AGAGTTCTGCTC G
AG G GTTAT G C G C G AG G GTTAT G C G C G
1
1.
2.
3.
500 568 SNPs
Controles
•1500 individuos 1958 British Birth
Cohort
•1500 voluntarios (UK Blood services)
2
3
15 variantes con información previa de evidencia de asociación
4
25 señales que
superan el umbral de
p = 10-7
12 se habían
detectado
previamente
58 señales que
superan el umbral de
p = 10-5
5
6
7
8
•Validación de la aproximación GWA: los hallazgos son comparables a
todos los estudios previos por genes candidatos o clonación posicional
•Importancia control de calidad
•Beneficios logísticos y económicos de esta aproximación respecto a
otras
•Variantes alélicas detectadas con efecto moderado OR entre 1,2 y 1,5
•Preponderancia de variantes susceptibles de efecto pequeño
•Tamaños de muestras de 2000 casos y 3000 controles son necesarios
•Primer paso para la disección de enfermedades comunes y su
traslación a la mejora de la salud humana
Estudios de asociación:
efectos fenotípicos de los SNPs
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La heredabilidad oculta del genoma
1. LIMITACIONES DE LOS
GWA (Variantes raras)
2. ‘OUT OF SIGHT’ (Baja
penetrancia)
Brendan Maher
5 November 2008 | Nature 456, 18-21 (2008)
3. ARQUITECTURA DEL
GENOMA (Variación
estructural)
4. REDES ENTRE GENES
(Epistasis)
5. ESTIMAS
HEREDABILIDAD EN DUDA
(Epigenética)
6. PERDIDOS EN EL
DIAGNÓSTICO (Diferentes
enfermedades)
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