ANALISIS FILOGENÉTICO DE INSECTA (ARTHROPODA
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ANALISIS FILOGENÉTICO DE INSECTA (ARTHROPODA
ANALISIS FILOGENÉTICO DE INSECTA (ARTHROPODA: HEXAPODA) BASADO EN DATOS DE MORFOLOGÍA Y ADN Carlos Andrés Hernández Jaimes Código 2061290 INTRODUCCIÓN La Clase Insecta se encuentra compuesta por 32 órdenes de hexápodos que comprenden quizá, el más diverso grupo de animales sobre la tierra (Wheeler et al., 2001), por esta razón, diversos autores han dedicado sus esfuerzos en comprender las relaciones filogenéticas que subyacen esta gran diversidad, en este sentido existen numerosos aportes desde un punto de vista molecular (Carapelli et al., 2005; Kjer, 2004; Misof et al., 2007; Whiting, 2001) y otros pocos que enfatizan en caracteres morfológicos (Bitsch y Bitsch, 2004), no obstante, una reciente publicación de Wiens (2004), destaca la importancia de continuar trabajando con morfología, a pesar de ello, se ha encontrado que los datos morfológicos contradicen los datos moleculares en el estudio filogenético de los hexápodos (Bitsch et al., 2004). Adicionalmente, recientes trabajos emplean análisis de evidencia total (Whiting et al., 1997; Giribet et al., 2001; Edgecomb, 2010), los cuales proveen mayor solidez a las hipótesis filogenéticas. MATERIALES Y MÉTODOS Se realizó un análisis filogenético con 25 ingroups de insectos pertenecientes a 13 órdenes dentro de la Clase Insecta procurando abarcar entre ellos, grupos que, de acuerdo con la literatura, se consideren problemáticos (Coleoptera, Strepsiptera), se trabajó con 3 outgroups dentro de los órdenes Collembola, Campodeina y Japygina; el análisis se llevó a cabo utilizando una matriz de datos de anatomía interna con 47 caracteres, los cuales fueron tomados de la matriz original de Wheeler et al. (2001) quien modificó los caracteres de la matriz de forma tal que reflejaran los estados generales dentro de cada orden; los datos moleculares corresponden con secuencias del gen nuclear 18S y del gen mitocondrial 16S (Tabla 1), las cuales fueron obtenidas de la bibliografía (Whiting et al. 1997; Wheeler et al. 2001; misof et al. 2007) y de la base de datos del GenBank. A partir de la matriz de datos morfológicos, se llevó a cabo una búsqueda heurística en WinClada 2.0 (Nixon, 1999) y se le aplicó el soporte de Bootstrap con 1850 réplicas. Se realizó un alineamiento múltiple de las secuencias de ADN mediante el programa Muscle 3.8.31 (Robert C, 2004), dichos alineamientos fueron empleados para hallar el modelo evolutivo utilizando jModelTest 0.1.1 (Posada D, 2008), el modelo seleccionado para ambos genes corresponde con el criterio de selección de AKAIKE; con base en este modelo se ejecutó un análisis de máxima verosimilitud (ML) de las secuencias génicas en estudio empleando el programa PhyML 3.0 (Guidon y Gascuel, 2003) y se halló el soporte de Bootstrap con 100 réplicas. Se realizó un análisis de evidencia total (ADN + Morfología), empleando distintas matrices de costos de transformación de caracteres mediante el programa POY 4.1.2 (Varón et al., 2007); posteriormente se hallo el índice de incongruencia de Farris ILD (Farris, 1985) (Tabla 2) el cual se halló empleando la ecuación 1, con base en los resultados obtenidos del análisis de sensibilidad en POY y se empleó como criterio para elegir la matriz de costos adecuada, con la cual se hallaron los soportes de Bremer y Bootstrap utilizando el programa TNT (Goloboff et al.2007). Finalmente, por medio del programa MrBayes 3.1.2 (Huelsenbeck y Ronquis, 2001) se llevó a cabo un análisis de inferencia filogenética Bayesiana (BIP), con 6 millones de generaciones, utilizando los datos de evidencia total y los modelos evolutivos hallados con jModelTest. Ecuación 1. RESULTADOS El análisis de los datos morfológicos con WinClada dio como resultado 8 árboles igualmente parsimoniosos, en la Figura 1 se presenta, un árbol consenso con una longitud de 63 (CI=85, RI=89), en el que se puede apreciar en general, un buen soporte de Bootstrap de las ramas, a excepción de algunos grupos con valores de Bootstrap de 3 y 1, de igual forma se aprecia una buena separación entre los grupos internos y externos. Se encontró que el ILD óptimo, de acuerdo con el test de incongruencia de Farris, fue de 0,1234; el peso de la morfología fue de 4, mientras que los costos de transición/transversión/indel para el gen 18S fueron de 124 y para el gen 16S de 111 (Tabla 2). El análisis de evidencia total con máxima parsimonia arrojó una topología con una longitud de 17446, donde es posible apreciar un soporte de Bootstrap de 100 para todas las ramas del árbol, no obstante, el outgroup Japygina aparece ubicado dentro del grupo interno; por otro lado, la topología con soporte de Bremer (Figura 2) arroja valores de soporte entre 64-100 y al igual que la topología anterior, Japygina se encuentra ubicada dentro del grupo interno. El modelo evolutivo obtenido por jModelTest según el criterio de AKAIKE fue el de GTR + G para ambos genes; las topologías filogenéticas obtenidas con base en estos modelos mediante el análisis de ML en PhyML arrojaron evidencia que permite ver que, para cada gen, las ramas de los grupos más internos no se encuentran bien soportadas de acuerdo con los valores de Bootstrap obtenidos. El análisis de inferencia bayesiana indica valores de soporte de Bremer entre 0.5 y 1.0, adicionalmente, se observa una parafilia en el nodo con valor de Bremer de 0,67 al cual denominaré para el propósito de este trabajo como Grupo 1, el cual está compuesto por cinco subgrupos. DISCUSIÓN Los distintos análisis llevados a cabo (BIP, ML y Parsimonia) proveen distintas topologías, distintas hipótesis sobre la relación entre los órdenes dentro de Insecta tomados en cuenta en el análisis, por lo cual es posible inferir que las secuencias 16S, 18S y los datos de morfología por sí solos no proveen evidencia contundente para la separación de los grupos, adicionalmente las conclusiones respecto de la monofilia o parafilia de los grupos dependerá del tipo de análisis. Especial atención requieren los órdenes Coleoptera, Strepsiptera, Psocoptera, Hymenoptera, Grylloblattodea y Blattaria, los cuales se ubican en distintos clados en los diferentes análisis, y no permiten tener una idea clara sobre las relaciones con los otros órdenes, dificultando el análisis, en todo caso, esto puede deberse a que los terminales elegidos dentro de cada orden contaminen el análisis probablemente por tratarse de especies que, en grupos muy grandes como Coleoptera pudieran estar alejadas unas de otras, generando ruido en el análisis. Por otro lado, en general, se apoya la monofilia de los órdenes Mecoptera, Dermaptera, Diptera, Neuroptera y Mantodea a lo largo de todos los análisis realizados. Con el objetivo de obtener resultados más contundentes e informativos, es necesario llevar a cabo futuros análisis de evidencia total que tomen en cuenta un mayor número de caracteres morfológicos, tanto internos como externos, así como secuencias de genes completas y un mayor número de órdenes dentro de la Clase Insecta. Así mismo es aconsejable trabajar con especies pertenecientes a una misma familia dentro de cada orden con el objetivo de disminuir el ruido en los análisis filogenéticos. Bitsch, J., Bitsch, C., Bourgoin, T., and D’haese, C. 2004. The Phylogenetic Position of Early Hexapod Lineages: Morphological Data Contradict Molecular Data. Systematic Entomology 29, 433–440. Bitsch, C., & Bitsch, J. 2004. Phylogenetic Relationships of Basal Hexapods Among the Mandibulate Arthropods: A Cladistic Analysis Based on Comparative Morphological Characters. Zoologica Scripta, 33, 6, pp511–550. Carapelli, A., Nardi, F., Dallai, R., Boore, J., Pietro, L., & Frati, F. 2005. 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