Antecedentes
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Antecedentes
TÍTULO: Caracterización de marcadores moleculares mitocondriales de ADN para el estudio de la diversidad genética de las 3 especies del género Anadara (A. similis, A. tuberculosa, A. grandis) en los manglares de Ecuador. Antecedentes 1.- Taxonomía 2.- Problemática especie y poblaciones naturales 3.- Trabajos de genética: Incluir relación de trabajos y marcadores utilizados en trabajos para diferentes especies del género Anadara. Anadara tuberculosa isolate tuber91 cytochrome c oxidase subunit I gene, partial cds; mitochondrial gene for mitochondrial product Anadara grandis isolate 97 cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene, partial cds; mitochondrial gene for mitochondrial product Anadara nux isolate nux116 cytochrome c oxidase subunit I gene, partial cds; mitochondrial gene for mitochondrial product Anadara similis isolate simil35 cytochrome c oxidase subunit I gene, partial cds; mitochondrial gene for mitochondrial product La falta de datos genéticos en las especies de este género en Ecuador, requiere una previa caracterización genética para abordar los diferentes estudios basados en las técnicas moleculares. El estudio de marcadores moleculares permite responder a preguntas sobre la diversidad genética, la estructura y la conectividad de las poblaciones y el flujo génico, que dependen de la capacidad de dispersión y de la “historia” de las especies. En ecosistemas marinos, los estudios de diversidad y flujo genéticos son todavía poco frecuentes, especialmente en el caso de los invertebrados. Es, por lo tanto, especialmente interesante ir ampliando el banco de datos genéticos (poblacionales) del mayor número posible de especies. Ello es además muy recomendable en aquellas que resultan ser clave, bien por su vulnerabilidad frente a presiones antropogénicas o bien por su papel determinante en el funcionamiento y en la estructura de los ecosistemas, en este caso las especies presentes en los manglares de Ecuador. Los marcadores moleculares constituyen unas herramientas indispensables para determinar la variación genética y la biodiversidad con un alto grado de precisión y reproductibilidad. Dichos marcadores se clasifican principalmente en dos tipos: marcadores mitocondriales y nucleares. Los marcadores de DNA mitocondrial, que se utilizan mucho, son en orden decreciente de secuencias conservadas ADNr 12S > ADNr 16S > citocromo b > región de control (RC); así pues, el ADNr 12S es muy estable y el RC es muy variable. El estado actual de desarrollo de las técnicas de marcaje molecular permite un análisis más exacto del estado de “salud” de las poblaciones, así como de su capacidad de asimilar cambios potenciales introducidos en sus hábitats. Objetivo general Caracterizar los marcadores moleculares mitocondriales para las especies de Anadara presentes en los mangalres de Ecuador Objetivos específicos - - - Validar y evaluar la metodología más efectiva y económica para la extracción del ADN: E.Z.N.A. Mollusc DNA Kit (Omega Bio-tek) , método salino (Aljanabi y Martinez, 1997), método urea-SDS-proteinasa K (Aranishi, 2005); método fenol cloroformo (Bardakci y Skibinski, 1994). Caracterización de la secuencia parcial nucleotídica de los genes mitocondriales (Cox1, Cyt b, 16S, 12S) de las 3 especies de manglar Anadara similis, A. tuberculosa y A grandis. Determinar un marcador molecular mitocondrial para la detección específica de las 3 especies del género Anadara (D-Loop), usando PCR a tiempo final. HIPOTESIS - - Ho. Los marcadores moleculares mitocondriales NO aportan información válida para los estudios de diversidad genética en las especies del género Anadara presentes en los manglares de Ecuador. H1 Los marcadores moleculares mitocondriales SI aportan información válida para los estudios de diversidad genética en las especies del género Anadara presentes en los manglares de Ecuador.