el espectrómetro de masas - Instituto de Biotecnología

Transcripción

Espectrometría de Masas
Instituto de Biotecnología
UNIVERSIDAD
MAESTRÍA
NACIONAL
EN
AUTÓNOMA
CIENCIAS
DE
MÉXICO
BIOQUÍMICAS
CURSO DE MÉTODOS
ESPECTROMETRÍA DE MASAS
PRESENTA:
GERMÁN PLASCENCIA VILLA
JUNIO DE 2003
CUERNAVACA, MORELOS
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INDICE
INDICE
INTRODUCCIÓN
HISTORIA DE LA ESPECTROMETRIA DE MASAS
EL ESPECTRÓMETRO DE MASAS
ENTRADA DE LA MUESTRA
MÉTODOS DE IONIZACIÓN
Impacto Electrónico (Electron Impact EI)
Ionización Química (Chemical Ionization CI)
Ionización de Campo (Field Ionization FI)
Desorción de Campo (Field Desorption FD)
Bombardeo con Átomos Rápidos (Fast Atom Bombardment FAB)
Ionización por Electrospray (Electrospray Ionization ESI)
Matrix-Assited Laser Desorption/Ionization (MALDI)
ANALIZADORES DE MASAS
Efecto de campos magnéticos sobre los iones
Principios de los analizadores de masas
Espectrómetro de masas de sector magnético (Magnetic Sector Mass Spectrometer)
Espectrómetros de masas de cuadrupolo (quadrupole)
Analizador de Tiempo de Vuelo (Time-of-flight TOF)
Analizadores de trampa de iones (Ion-Trap)
Analizador FT-ICR (Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance)
DETECTORES DE IONES
Copa Faraday
Multiplicador de Electrones (Electron Multiplier)
Detector Daly
Detector de Microcanales
ADQUISICIÓN Y PROCESAMIENTO DE DATOS
Procesamiento de Datos
APLICACIONES
Análisis de estructura y masa
Sistemas acoplados
Análisis cuantitativos
Análisis de péptidos
Iones de péptidos
Secuenciación de péptidos
Identificación de proteínas
HERRAMIENTAS PARA ANÁLISIS DE PROTEÍNAS POR ESPECTROMETRÍA DE MASAS
DEFINICIÓN DE TÉRMINOS
REFERENCIAS
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INTRODUCCIÓN
La Espectrometría de Masas es una poderosa técnica microanalítica usada para identificar compuestos
desconocidos, para cuantificar compuestos conocidos, y para elucidar la estructura y propiedades químicas de
moléculas. La detección de compuestos puede ser llevada a cabo con cantidades realmente pequeñas (algunos
pmoles) de muestra y obtener información característica como el peso y algunas veces la estructura del analito.
En todos los casos, alguna forma de energía es transferida a las moléculas a analizar para afectar la ionización.
En la técnica clásica de impacto electrónico (electron ionization EI), algunas de las moléculas ionizadas del
analito “explotan” en una variedad de fragmentos ionizados, el patrón de fragmentación resultante así como los
iones residuales constituyen el espectro de masas. En principio, el espectro de masas de cada compuesto es
único y puede ser usado como se “huella química” para caracterizar el analito.
El proceso de análisis por espectrometría de masas comienza en llevar el compuesto a analizar a fase gaseosa,
-2
la muestra debe tener una presión de vapor de que 10 mmHg, debido a que las moléculas deben migrar por
difusión desde el sistema de entrada hacia la cámara de ionización. Las muestras pueden ser introducidas al
espectrómetro de masas usando una sonda directa o por entrada en lote (batch) para sólidos puros o líquidos
volátiles. Analitos purificados por diferentes técnicas de separación (cromatografía de gases, cromatografía de
líquidos, electroforesis capilar, etc.) pueden entrar al espectrómetro de masas tan pronto como vayan saliendo.
Ya que las moléculas neutras difunden en forma aleatoria por la fuente de ionización, solo una porción es
ionizada.
El proceso de ionización más común en análisis en fase gaseosa es el de ionización electrónica (EI), en el cual
se transfiere energía a la molécula neutra en estado de vapor, dándole suficiente energía para expulsar uno de
sus electrones y de ese modo tener una carga residual positiva. Este proceso produce un ion con carga positiva
y un electrón suelto. La molécula ionizada puede tener energía excesiva que puede ser disipada a través de la
fragmentación de ciertos enlaces químicos. El rompimiento de varios enlaces químicos permite la producción de
fragmentos de ion cuya masa es igual a la suma de las masas atómicas de un grupo de átomos que retienen la
carga positiva durante el proceso de fragmentación.
Para compuestos no volátiles, iones de la molécula intacta son producidos al pasar la solución por un campo
eléctrico (electrospray ionization) o por bombardeo de partículas (fast atom bombardment) o por interacción con
especies fotoexcitadas (matrix-assisted laser desorption).
Después de producir los iones, el siguiente paso es su análisis en el analizador de iones de acuerdo a su
relación masa/carga (m/z). Los iones tienen una carga eléctrica que les permite ser controlados por campos
eléctricos; son separados por su valor m/z en el analizador de masas. Existen diferentes tipos de analizadores
de masas: magnéticos, de cuadrupolo, trampa de iones cuadrupolo, trampa de iones magnética, o tiempo de
vuelo (time-of-flight). Los iones son analizados de acuerdo a su abundancia a lo largo de la escala m/z. Durante
el proceso de adquisición de datos provenientes del detector, los datos pueden ser organizados en forma
tabular o en formato de gráfica de barras para dar finalmente el espectro de masas de la muestra analizada.
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HISTORIA DE LA ESPECTROMETRÍA DE MASAS
La espectrometría de masas tiene su origen en los experimentos desarrollados en el Cavendish Laboratory de
la Universidad de Cambridge en Inglaterra en 1897 por Joseph John Thomson, él descubrió que descargas
eléctricas en gases producían iones y que estos rayos de iones podían adoptar diferentes trayectorias
parabólicas de acuerdo a su masa cuando pasaban a través de campos electromagnéticos. Thomson realizó la
construcción del primer espectrómetro de masas, llamado parábola espectrográfica (Figura 1), para la
determinación de la relación masa/carga de iones.
Figura 1. Parábola espectrográfica construida por J.J. Thomson
Uno de los estudiantes de Thomson, Francis William Aston fue quien diseño varios espectrómetros de masas
en los cuales los iones eran dispersados por sus masas y enfocados de acuerdo a su velocidad. Esto permitió
mejorar el poder de resolución de masas y el posterior descubrimiento de isótopos de diferentes elementos que
están presentes en la naturaleza. Thomson recibió el Premio Nobel de Física en 1906 y Aston el Premio Nobel
de Química en 1922.
En la década de los 20´s, Arthur J. Dempster de la Universidad de Chicago, desarrolló un analizador magnético
que enfocaba iones formados por impacto electrónico (electron impact) sobre un colector eléctrico. Este diseño
fue adaptado por Josef Mattauch, Richard Herzog, Kenneth Bainbridge, Alfred Nier y otros, permitiendo
importantes descubrimientos en física atómica y nuclear en los 30´s. Pero fue hasta la década de los 40´s que
los primeros espectrómetros de masas comerciales aparecieron. Durante los 30´s y 40´s, Nier y algunos otros
incorporaron las tecnologías de vacío y electrónica para mejorar el desempeño de los primeros diseños de
espectrómetros. Instrumentos de doble enfoque, que combinan analizadores magnéticos y electrostáticos
fueron introducidos permitiendo incrementar la precisión. Estos instrumentos fueron originalmente desarrollados
con el propósito de determinar en forma precisa los pesos atómicos de los elementos y sus isótopos.
En la década de los 40´s se construyeron los primeros espectrómetros de masas disponibles comercialmente
por medio de diferentes compañías de Europa y Estados Unidos. En esta década también se desarrolló el
espectrómetro de masas de tiempo de vuelo (time-of-flight, TOF), un concepto propuesto como un analizador
mas barato y simple en el cual los iones son separados en base a sus diferencias en velocidad cuando son
acelerados en un tubo de vuelo lineal.
A principios de los 50´s, los patrones de fragmentación de los iones comenzaron a ser entendidos, aunque los
aparatos disponibles estaban limitados en el rango de masas. Otro tipo de instrumento desarrollado para el
propósito de acoplar el espectrómetro de masas a un cromatógrafo de gases fue el filtro de masas cuadrupolo,
el cual usa un campo eléctrico cuadrupolar conteniendo componentes de radiofrecuencia y corriente directa
para separar iones. En 1953 el analizador de masas cuadrupolo fue patentado. Este analizador fue reportado
por Wolfgang Paul de la Universidad de Bonn, quien después ganó el Premio Nobel de Física en 1989 por su
trabajo de trampa de iones (ion trapping). En 1956 las primeras muestras biológicas (esteroides) fueron
exitosamente analizadas.
En los 60´s la espectrometría de masas se estableció como una técnica para caracterizar compuestos
orgánicos. Este fue asistido con la introducción de una fuente de ionización química. Otros métodos de
ionización surgieron incluyendo desorción de campo, ionización secundaria (secondary ionization MS o SIMS),
desorción de plasma y desorción láser. Aparecieron las primeras publicaciones científicas especializadas
incluyendo Organic Mass Spectrometry. La espectrometría de masas en tándem (MS/MS) surgió con el
desarrollo de procedimientos de disociación por inducción de colisión, permitiendo obtener información
estructural de componente de una mezcla usando dos etapas de análisis de masas.
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En 1974 se desarrollo la espectrometría de masas Fourier ICR (FT-ICR MS). Una importante ventaja de este
sistema es que permite detectar simultáneamente varios iones y estos espectrómetros de masas también logran
tener muy alta resolución de masas. En los 80´s se desarrollaron las técnicas de ionización capaces de ionizar
eficientemente moléculas biológicas. Michael Barber en Manchester desarrollo la técnica FAB (Fast Atom
Bombardment) la cual utiliza una fuente de átomos pesados neutrales para ionizar compuestos de una
superficie de una matriz líquida. John Fenn de la Universidad Yale refinó la fuente de iones originalmente
reportada por Malcolm Dole de la Universidad Northwertern casi dos décadas antes de la técnica de ionización
de electrospray (ESI).
Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) fue también desarrollada en los 80´s por Franz Hillenkamp y
Michael Karas. En esta técnica, las moléculas son desorbidas por un láser de una superficie sólida o líquida
conteniendo una matriz de compuesto orgánico. Las técnicas ESI y MALDI han permitido la introducción de
moléculas biológicas de más de 1 millón de Daltons en los espectrómetros de masas como iones estables en
fase gaseosa.
Actualmente, los espectrómetros de masas son utilizados para el estudio de un amplio rango de sustancias y
materiales con alta precisión y sensibilidad. Los campos de aplicación son desde estudios astronómicos del
sistema solar, geofísica y geoquímica, hasta análisis químicos y en forma fundamental en investigaciones de
química, toxicología, ciencias ambientales, y en forma creciente en ciencias biológicas y biomédicas.
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EL ESPECTRÓMETRO DE MASAS
Un Espectrómetro de Masas es un instrumento que mide las masas de moléculas individuales que han sido
convertidas en iones. Un espectrómetro de masas no mide la masa molecular directamente, pero mide la
relación masa/carga de los iones formados de las moléculas. Los espectrómetros de masas tienen siete
componentes mayores: un sistema de entrada, una fuente de iones, un analizador de masas, un detector, un
sistema de vacío, un sistema de control y un sistema de datos. El sistema de entrada, junto con la fuente de
iones y el tipo de analizador de masas definen el tipo de espectrómetro y las capacidades del sistema.
Figura 2. Componentes básicos de un espectrómetro de masas
Los instrumentos usados están compuestos de una combinación de sistemas de entrada, fuentes de iones, y
analizadores de masas (Tabla 1).
Tabla 1. Variantes de componentes del sistema de espectrometría de masas
COMPONENTE
VARIANTES
Sistema de entrada
1. Directo.
2. Columna capilar cromatografía líquida.
Fuente de iones
1. Impacto electrónico.
2. Ionización Química.
3. Ionización de campo.
4. Deserción de campo.
5. Bombardeo con Átomos Rápidos.
6. Electrospray, incluyendo nanospray y
microspray.
7. Matrix-assisted laser desorption (MALDI)
Analizador de masas 1. Cuadrupolo.
2. Trampa de iones (Ion-trap).
3. Tiempo de vuelo (Time-of-flight TOF).
4. Analizador FT-ICR
Los procesos básicos asociados con la espectrometría de masas abarcan desde la generación de iones en fase
gaseosa de un analito, y la medición de las relaciones masa/carga (m/z) de estos iones. La formación de iones
de la muestra en fase gaseosa es un prerequisito esencial en el proceso del espectrómetro de masas en el
proceso de verificación de masas moleculares o análisis. Aunque los primeros espectrómetros de masas
requerían que la muestra estuviera en forma gaseosa, nuevos desarrollos han permitido incluir muestras en
soluciones líquidas o en una matriz sólida. Dependiendo del tipo de entrada y técnica de ionización usada, la
muestra puede ya estar en forma de iones en solución, o puede ser ionizada en conjunto con su volatilización
por otros métodos en la fuente de iones.
El estudiar el analito como un ion en fase gaseosa le dan dos características fundamentales. La primera
característica fundamental es que el movimiento de los iones en fase gaseosa puede ser controlado en forma
precisa en campos electromagnéticos que contienen los iones a estudiar y pueden ser manipulados para probar
el movimiento del ion en el campo. Debido a que el movimiento de los iones es proporcional a la relación m/z
del ion, esto justifica la medición de la m/z y por lo tanto la masa del analito. Los detalles concernientes a
diferentes tipos de técnicas de análisis de masas y técnicas de ionización utilizadas determinan factores tales
que la precisión y exactitud de la medición de m/z, la resolución, y el rango de m/z del analizador. La segunda
6
característica fundamental es que el uso de iones en fase gaseosa incrementa la sensibilidad del espectrómetro
de masas. El movimiento preciso de iones en campos electromagnéticos que permiten medir m/z también les
provee contención y enfoque.
Durante el proceso de medida de m/z, los iones son transmitidos con gran eficiencia a los detectores de
partículas que registran la llegada de estos iones. Estas llegadas son detectadas con gran sensibilidad debido a
una combinación de señales de bajo fondo y la eficiente generación de electrones secundarios que pueden
5
subsecuentemente ser multiplicados por factores de 10 o mayores. El mantenimiento de la precisión y
exactitud de estos movimientos y por lo tanto de la sensibilidad del análisis requiere operación experta del
sistema de espectrometría de masas.
Algunas desventajas del uso de iones en fase gaseosa es la dificultad de generación de los iones y colocarlos
en la fase gaseosa, además de la complejidad de los instrumentos utilizados en este tipo de experimentos. El
desarrollo de la ionización por electrospray y MALDI han aportado dos importantes métodos para la producción
de iones de péptidos y proteínas en fase gaseosa. Otra consecuencia de la complejidad de los instrumentos es
el alto precio de tales instrumentos en términos su adquisición y costos de mantenimiento. Sin embargo, en
general y considerando la sofisticación, productividad y reproducibilidad de los experimentos desarrollados, se
puede justificar que el costo de la espectrometría de masas es proporcional con los costos asociados con otros
componentes en los proyectos de investigación que requieren este tipo de análisis.
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ENTRADA DE LA MUESTRA
Para sólidos razonablemente puros, la muestra es colocada sobre la punta de una barra que es introducida
dentro del espectrómetro a través de un sistema de vacío. La muestra es entonces evaporada o sublimada en
una fase gaseosa, usualmente por medio de calor. Gases y líquidos pueden ser introducidos a través de
sistemas de entrada diseñados especialmente con un control de flujo, llamados sondas directas (direct probes),
estos dispositivos transfieren la muestra desde el exterior a través de un sistema de vacío hacia la fuente de
ionización que esta a alta presión (Figura 3). Estas sondas pueden ser diseñadas para soportar muestras para
ser ionizadas por distintos métodos. Una vez que la muestra está es fase gaseosa es ionizada y
frecuentemente acompañado de fragmentación para proceder al análisis de masas. En algunas técnicas
especializadas, la volatilización y la ionización de la muestra ocurren al mismo tiempo.
Figura 3. Sondas directas (direct probes)
Para obtener el espectro de masas de un compuesto simple de una mezcla, los componentes individuales
deben ser separados antes del análisis de espectrometría de masas. La separación de los compuestos es
necesaria para tener certeza de la identificación, ya que dos o más compuestos presentes en la muestra
pueden crear espectros que se sobrelapen o mezclen ya que los iones generan fragmentos simples que
dificultarían el análisis de los datos obtenidos.
Desde que en la década de los 60´s se acopló la cromatografía de gases (GC) a la espectrometría de masas,
esta conexión permite separar compuestos ya en fase gaseosa para su entrada al espectrómetro al entrar las
diferentes fracciones en diferentes tiempos en forma continua permite un análisis secuencial de las muestras.
Recientemente, equipos de cromatografía de líquidos (LC), cromatografía de fluidos supercríticos, HPLC y
electroforesis capilar, utilizados para separar compuestos, se pueden acoplar a espectrómetros de masas para
análisis de muestras complejas.
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MÉTODOS DE IONIZACIÓN
Un reto fundamental en la espectrometría de masas de cualquier tipo de analitos es la producción de iones en
fase gaseosa de estas especies, y dificultades en la producción de estos iones en fase gaseosa pueden impedir
el análisis por espectrometría de masas de ciertas clases de moléculas. Esta situación fue el caso de proteínas
y péptidos. Las primeras técnicas que fueron aplicadas, ionización electrónica (electron ionization EI) e
ionización química (chemical ionization CI), son procesos de dos etapas en los cuales los analitos son
vaporizados con calor y la ionización ocurre una vez que el analito esta en fase gaseosa. Esta etapa de
vaporización limitó los experimentos de análisis por espectrometría de pequeños péptidos, usualmente a
máximo 4 o 5 aminoácidos. Adicionalmente, estos péptidos tenían que ser derivatizados para minimizar su
polaridad y darles suficiente volatilidad. El análisis de proteínas no era simplemente posible, y problemas
similares se encontraban en otras clases de moléculas polares. La ionización por bombardeo con átomos
rápidos (fast atom bombardment FAB) fue el primer método de ionización que hizo posible analizar
rutinariamente por espectrometría de masas a moléculas polares, también fue fundamentalmente diferente de
otros métodos de ionización tal como ionización electrónica (IE) debido a que los iones en fase gaseosa fueron
generados directamente de una solución del analito en fase líquida. Como resultado, las diferentes formas de
vaporización y de ionización del analito se convirtieron en una etapa estrechamente ligada en el proceso total
de análisis por espectrometría de masas.
Impacto Electrónico (Electron Impact EI)
El Impacto Electrónico (Electron Impact EI) o comúnmente llamado Ionización Electrónica (Electron Ionization
EI) es un método clásico de generación de iones en espectrometría de masas utilizado aún en muchas
-6
aplicaciones. El analito es introducido dentro de la fuente de ionización que esta al vacío (<10 mbar) y
sebsecuentemente ionizado por colisiones con un flujo de electrones (a 70 eV).
-
+.
M+e _M +2e
-
Los electrones para este proceso son generados por emisión térmica de un filamento caliente. El filamento esta
típicamente hecho de tungsteno o de renio. Los electrones son subsecuentemente acelerados al aplicar un
potencial entre el filamento y la muestra. El rayo de electrones cruza la fuente de iones, afectando las moléculas
-4
neutras que provienen de la muestra (Figura 4). La corriente típica del filamento es de 1x10 Amp.
Figura 4. Ionización por Impacto Electrónico (EI)
La muestra es introducida por medio de una sonda directa (direct probe) operada de 20 a 500°C o por medio de
un cromatógrafo de gases. Las muestras deben ser de polaridad baja o media y con cierta estabilidad térmica,
además de que deben ser evaporadas antes de su ionización. El proceso de EI causa mucha fragmentación de
las moléculas lo cual puede tener ventajas en la deducción de su estructura.
El mecanismo de formación de iones para la especie AB es el siguiente:
-*
+
1. AB + e _ A + B + e
-*
+
°
2. AB + e _ A + B + 2e
-*
+°*
+°*
+°
3. AB + e _ [AB ] + 2e seguido de [AB ] _ AB
-*
2+*
2+*
+
+
4. AB + e _ [AB ]" + 3e seguido de [AB ]" _ A + B - (muy baja abundancia)
-*
+
5. AH + e _ AH* + e seguido de AH* + AH _ [AH+H] + A
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Donde:
* = Especies de alta energía.
° = Radicales.
" = Intermediarios de vida corta.
En 1 y 2 se indican las especias de mayor abundancia las cuales sufren de fragmentación instantánea.
En 3 indica especias de abundancia media.
En 4 indica especies de abundancia muy baja.
En 5 son especies que pueden formarse a altas presiones
Ionización Química (Chemical Ionization CI)
La Ionización Química (Chemical Ionization CI) es un método de ionización relativamente suave, y es el primer
método de ionización suave introducido a la espectrometría de masas. La ionización es afectada por reacciones
sobre la molécula con iones de un reactivo gaseoso generados por medio de ionización de impacto electrónico
(EI) con moléculas del analito neutras.
3
4
El reactivo gaseoso es empleado con un exceso de 10 -10 veces la molaridad del. Esto puede ser logrado al
usar volumen de iones bastante pequeño en comparación a las condiciones de EI. El volumen de reactivo
gaseoso se controla por medio de una válvula.
Figura 5. Ionización Química (CI)
+
Entre los agentes gaseosos utilizados se incluyen el metano, el isobutano y al amoniaco, formando iones CH5 ,
+
+
C4H9 , y NH4 respectivamente como especies predominantes. En caso del metano, el siguiente proceso es el
que permite la formación de iones reactivos:
-
+.
1. CH4 + e _ CH4 Y fragmentos tales como CH3
+.
+
.
2. CH4 + CH4 _ CH5 + CH3 (autoprotonación)
+
+
3. CH3 + CH4 _ C2H5 + H2
+
La protonación de un analito es dependiente de la diferencia de afinidades por protones en las bases
+
+
correspondientes. Por ejemplo, el CH5 protona la mayoría de los analitos, mientras que el NH4 es más
selectivo debido a que necesita un sitio ligeramente básico en las moléculas del analito.
+
+
M + CH5 _ [M+H] + CH4
+
Los iones [M+H] son llamados iones cuasi-molecular.
La muestra es introducida por medio de una sonda directa (direct probe) a una temperatura de operación de 20
a 500°C (para sólidos y líquidos de baja volatilidad, así como líquidos y gases) o por medio de un cromatógrafo
de gases (mezclas). Los analitos deben tener polaridad baja o media, así como estabilidad térmica. La
ionización química genera iones de energía interna relativamente baja, exhibiendo un bajo nivel de
fragmentación, la evaporación del analito antes de su ionización es el paso crítico.
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Tipo de analito
Polaridad baja
Polaridad media
Polaridad alta
+ Iones K A
Tabla 2. Iones producidos por CI
Iones positivos
Iones negativos
dominante // raramente detectado
+
-.
[M+H]
M // [M-H]
+
+
+
-.
[M+H] // [M+R] [2M+H]
M [M-H]
+
+
+
-.
[M+H] [M+R] // [2M+H]
[M-H] // [M+R] M
descomposición
descomposición
Ionización de Campo (Field Ionization FI)
La Ionización de Campo (Field Ionization FI) es un método de ionización suave. La muestra es introducida por
las mismas técnicas que en EI y CI. La ionización de campo lleva el riesgo de descomposición térmica de la
muestra.
Las moléculas son ionizadas por medio de ionización de campo (FI) en los bordes del campo del ánodo emisor.
El emisor consiste de un alambre de tungsteno de 10-13mm de diámetro que es activado por un procedimiento
especial creando miles de microagujas en su superficie. Un voltaje alto de 10-12 kV es aplicado al emisor
causando polarización y finalmente ionización de las moléculas que están cerca de las puntas de las
microagujas donde el campo eléctrico alcanza una gran fuerza. Este proceso tiene una eficiencia de ionización
+.
+
muy baja y por lo tanto, FI produce una corriente de iones muy baja. FI produce iones del tipo M y/o [M+H] ,
dependiendo del analito. Aunque los iones generados pueden estar casi libres de fragmentación, se prefiere la
ionización CI en lugar de FI no puede ser utilizada debido a la volatilidad del analito.
La muestra es introducida por medio de una sonda directa (direct probe) a una temperatura de operación de 20
a 500°C (para sólidos y líquidos de baja volatilidad, así como líquidos y gases), el uso de un cromatógrafo de
gases acoplado al espectrómetro de masas es complicado ya que las condiciones son difíciles de estabilizar en
las corridas de las muestras. Mientras que F I genera iones con muy baja energía interna y casi nula
fragmentación, la evaporación del analito antes de su ionización es la etapa crítica.
Tipo de analito
Polaridad baja
Polaridad media
Polaridad alta
Tabla 3. Iones producidos por FI
Iones positivos
Iones negativos
dominante // raramente detectado Dominante // raramente detectado
+.
+
M // [M+H]
+.
+
M [M+H]
+
+.
[M+H] // M
-
Desorción de Campo (Field Desorption FD)
La Desorción de Campo (Field Desorption FD) es un método de ionización muy suave utilizado en
espectrometría de masas. Este método esta basado en el de Ionización de Campo (Field Ionization FI), FD ha
sido desarrollado al combinar la desorción y la ionización del analito, pero no hay necesidad de evaporación
antes de la ionización, generando iones con muy baja energía interna y casi nula fragmentación. En la Figura 6
se muestra un equipo de espectrometría de masas con una fuente de FD.
Figura 6. Fuente de FD
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Moléculas neutras son ionizadas principalmente por FI en el borde del campo del ánodo emisor, los cationes
son desorbidos tal cual. Un alto voltaje de 10-12 kV es aplicado al emisor causando polarización y finalmente
ionización de las moléculas que están cerca de las puntas de las microagujas donde el campo eléctrico alcanza
una enorme fuerza (Figura 7). Un ligero calentamiento de la muestra ayuda a mantener el equipo limpio al evitar
su acumulación.
Figura 7. Esquema general de ionización por FD
Usualmente, se pasa una corriente de 50 mA sobre el emisor (un alambre de 10mm) o incluso hasta 80-100 mA
en emisores de 13mm. Esto incrementa la movilidad de las moléculas sobre la superficie del emisor, ayudando a
la migración hacia las puntas de las agujas. El emisor puede resistir hasta 800°C.
La muestra es introducida dentro de la fuente de iones por medio de una sonda directa que lleva el emisor de
campo en su punta (Figura 8), el alambre activado entre las dos puntas de acero inoxidable es de 5mm de
longitud. Este par de alfileres de acero están aislados eléctricamente mutuamente por medio de una pieza de
cerámica. La sonda transfiere el emisor F D dentro de la muestra y se suministra un alto voltaje para la
desorción/ionización y ocurre el calentamiento del emisor.
Figura 8. Sonda y emisor de FD
El emisor FD consiste de un alambre central de tungsteno de 10-13mm de diámetro. La activación a alta
temperatura esta basada en una descomposición térmica de la superficie del alambre de tungsteno caliente al
vacío. La activación crea miles de microagujas en la superficie del emisor (Figura 9).
Figura 9. Supericie del emisor (80x80mm)
La muestra es introducida como una solución (1 a 2 ml a 0.1-1.0 mg/ml en solventes volátiles) hacia el emisor.
Durante este proceso una solo gota colgante en la punta de una jeringa de un microlitro puede tocar la
superficie del emisor, de otra manera se rompería el emisor (Figura 10).
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Figura 10. Proceso de montaje de una gota de 1.5ml sobre el emisor activado. La gota
permanece en el alambre donde el solvente se avaporará para permitir tener solo una delgada
capa de muestra.
Es preferible que la muestra sea soluble en solventes volátiles, se pueden analizar compuestos de baja o alta
polaridad, inclusive es posible analizar mezclas de compuestos, aunque solo se pueden cuantificar compuestos
puros. Si la muestra esta contaminada con sales inorgánicas puede ocurrir daño en los componentes del
sistema. Se pueden analizar muestras de 1-5000 amu.
Tabla 4. Iones producidos por FD
Iones positivos
Iones negativos
Tipo de analito
+.
+
2+
+.
Polaridad baja
M // [M+H] M [2M]
+.
+
+
2+
+
+
Polaridad media
M [M+H] // [M+Cat] M [2M+H] [2M+Cat]
+
+
+
+
+.
2+
Polaridad alta
[M+H] [M+Cat] [2M+H] [2M+Cat] // M M
[M-H] // [M+An]
+ +
+
+.
Iones K A
K [Kn+An-1] // [KA]
A [An+Kn-1]
+
+
+
Cat: cationización por Li , Na , K , y otros iones metálicos.
- An: anionización por Cl , Br , I , HSO4-, y otros aniones.
Bombardeo con Átomos Rápidos (Fast-Atom Bombardment FAB)
Los métodos de desorción de partículas fueron desarrollados en los 70´s y 80´s, y a diferencia del método de
desorción de campo (field desorption), evito complicaciones en diseño de equipo y preparación de la muestra.
FAB es un método de ionización suave, resulta de la combinación de desorción del analito desde una fase
condensada (mezcla de analito sólido+matriz) con su subsecuente ionización. La matriz esta formada de
moléculas orgánicas (glicerol o 3-nitrobencil alcohol) que mantienen una superficie homogénea para el
+
bombardeo. Ocurre el bombardeo de la muestra con átomos rápidos (Ar o Xe de 3-10 keV) o iones rápidos (Cs
arriba de 35 keV) (Figura 11). Si se utilizan iones rápidos la técnica se conoce también como liquid secondary
ion mass spectrometry (LSIMS o liquidSIMS). En la práctica, no hay una diferencia significativa entre los
espectros obtenidos por FAB o LSIMS.
Figura 11. Sistema general de FAB
El rayo primario de átomos rápidos es librado por una pistola de átomos rápidos (FAB gun) (Figura 12) o por
+
+
una pistola de iones Cs que utiliza un horno conteniendo CsI como fuente de Cs . La pistola FAB esta
localizada fuera de la fuente de iones, a través de ella pasa un flujo de Xe neutro, los iones Xe son generados
13
por EI. Los iones son acelerados, enfocados y neutralizados por intercambio de cargas con Xe neutro al haber
colisión. El rayo de átomos pega con una gota de muestra y debido a colisiones y disrupciones se forman iones
secundarios que son expulsados de la superficie de la muestra, los iones generados son acelerados y
enfocados al analizador.
Figura 12. FAB gun
La muestra es introducida por medio de una sonda directa. Básicamente la sonda FAB consiste de una simple
barra con un contenedor para la muestra donde se dirigen los átomos rápidos que soporta la gota de la solución
de analito contenida en una matriz. Este contenedor de la muestra esta aislado eléctricamente.
La función de la matriz es absorber energía de las partículas primarias que la impactan, actuar como solvente
para el analito, refrescar la superficie de la gota y ayudar en el proceso de ionización, ya que puede ser
aceptor/donador de protones o electrones. Para que una matriz lleve a cabo todas sus funciones es necesario
que la muestra sea 100% soluble en ella, solo aquellos solventes con baja presión de vapor pueden ser usados
fácilmente, el solvente debe tener una viscosidad suficientemente baja que permita la difusión de los solutos a
la superficie, ser químicamente inerte.
Las muestra que pueden ser analizadas por FAB deben ser altamente solubles, e incluso altamente polares
(péptidos, oligosacáridos), ionicos (sales), o apolares (compuestos neutros, oligomeros sintéticos). FAB puede
ser utilizado para detección directa de iones positivos o negativos. El rango de masa es desde 300 amu hasta
5000 amu, en compuestos de menor masa resultan algunas complicaciones en la detección de los picos del
espectro y en moléculas mayores se presentan problemas en la desorción. Los iones secundarios generados
pueden permanecer estables por varios minutos, ya que poseen baja energía interna y exhiben un bajo nivel de
fragmentación.
Tabla 5. Iones producidos por FAB
Iones positivos
Iones negativos
Tipo de analito
dominante // raramente detectado dominante // raramente detectado
+.
+
-.
Polaridad baja
M // [M+H]
M // [M-H]
+.
+
+
-.
Polaridad media
M [M+H] // [M+Cat]
M [M-H]
+
+
+.
-.
Polaridad alta
[M+H] [M+Cat] // M
[M-H] // [M+An] M
+ +
+
+.
-.
Iones K A
K [Kn+An-1] // [KA]
A [An+Kn-1] // [KA]
+
+
+
Ionización por Electrospray (Electrospray Ionization ESI).
La Ionización por Electrospray (ESI) es uno de los métodos de ionización mas recientemente desarrollados en
espectrometría de masas. El diseño y operación de fuentes de ionización por electrospray usadas comúnmente
en los espectrómetros de masas están basados en diseños descritos por Fenn y colaboradores en 1985. Este
método es llevado a cabo a presión atmosférica a diferencia de otros métodos, por lo que se le conoce también
como un método de ionización a temperatura ambiente (atmospheric pressure ionization API). ESI es
14
ampliamente utilizado en aplicaciones de ciencias bioquímicas y biomédicas debido a su capacidad de analizar
moléculas altamente polares tales como péptidos, oligonucleótidos y oligosacáridos.
En el proceso general de electrospray, que ocurre en la punta del emisor (capilar o aguja), una solución acuosa
-4
-5
ácida o básica (dependiendo del la muestra) diluida del analito (10 -10 molar) es rociada desde la punta del
emisor en el cual se aplica un potencial de 3-4 kV, la solución debe proveer conductividad eléctrica que puede
ser obtenida por el uso de analitos iónicos o aditivos iónicos tales como buffers o por algún grado de disociación
electrolítica del solvente. El líquido comienza a salir de la aguja, incrementa su carga y asume una forma
cónica, llamada cono de Taylor, en honor a G.I. Taylor quien describió este fenómeno en 1964 (Figura 13). El
líquido asume esta forma cuando incrementa su carga ya que una forma cilíndrica puede retener mas carga que
una esfera. En la punta del cono, el líquido cambia de forma a una línea fina, que se vuelve inestable ya que es
forzado a retener mas y más carga, y finalmente llega a un punto crítico donde no puede soportar mas carga
eléctrica y la solución entonces se dispersa en forma de niebla de pequeñas gotas (de menos de 10 mm de
diámetro) altamente cargadas que vuelan buscando una superficie de carga opuesta. Debido a que las gotas
están altamente cargadas con la misma carga eléctrica se repelen fuertemente, las gotas vuelan y se dispersan
cubriendo un área cada vez mayor y se van reduciendo de tamaño ya que las moléculas de solvente se
evaporan en su superficie, y la distancia entre las moléculas cargadas disminuye dramáticamente. Si la gota no
encuentra donde disipar su carga, las cargas eléctricas llegan a un estado crítico y la gota explota
violentamente (Figura 14). Este proceso fue originalmente observado por el físico John Zelany en 1914.
Figura 14. Reducción de tamaño de gota en ESI
Figura 13. Cono de Taylor
Aún no existe una explicación 100% aceptada de lo que le sucede a las gotas, pero algunas de las teorías son:
1. Modelo de Residuo Cargado (charged residue model) de Dole. Las gotas sufren repentinamente de
explosiones coulombicas produciendo gotas más pequeñas y más pequeñas que finalmente contendrán
solo una molécula cargada y quizá algunas moléculas de solvente.
2. Modelo de Evaporación Iónica (ion evaporation model) de Iribarne y Thomson. Ocurre la expulsión de
moléculas cargadas para reducir la densidad de carga de la superficie.
3. La gota original sobrevive después de haber expulsado algunas micro gotas cargadas.
De cualquier forma, el proceso termina con moléculas cargadas que pueden todavía llevar moléculas de
solvente. El proceso de evaporación y rompimiento de gotas se repite hasta que el tamaño y carga de las gotas
desorba moléculas protonadas dentro de la fase gaseosa, donde pueden ser dirigidas en el espectrómetro de
masas por medio de campos eléctricos apropiados (Figura 15). El proceso de evaporación puede ser
suplementado con un flujo de gas (típicamente nitrógeno) y calor.
Figura 15. Proceso general de Ionización por Electrospray (ESI)
Una característica de ESI es que debido a las condiciones ácidas usadas para producir las gotas cargadas
positivamente se tienden a protonar todos los sitios básicos en las moléculas de analito. Una segunda
característica de ESI es la eficiencia del proceso de ionización y, como resultado, la sensibilidad de los
experimentos basados en esta forma de ionización, la eficiencia en la protonación de estos sitios básicos en
15
ambientes ácidos parece contribuir a la sensibilidad. Una tercera característica es su compatibilidad con los
solventes de HPLC de fase reversa (reverse-phase high-performance liquid chromatography), ya que las
mezclas agua/solvente tienen excelentes propiedades compatibles con ESI.
Figura 17. Rociador (sprayer) de ESI y el orificio del capilar (0.4mm de ancho).
La señal observada en el proceso ESI es proporcional a la concentración del analito en la solución que esta
siendo rociada pero no a su velocidad de flujo. Esto es debido a que un incremento en la velocidad de flujo
simplemente provoca tener que eliminar un mayor porcentaje de solvente, debido a que en muchas ocasiones
se tienen muestras biológicas en un volumen pequeño y en poca cantidad, es preferible poder rociar un
volumen extremadamente pequeño, por lo que a partir de ESI que maneja flujos de 5-1000ml/min se han
derivado el micro ESI que maneja una velocidad de flujo de 0.5-5ml/min y el nano ESI 0.02-0.5ml/min (Figura
17).
Figura 17. ESI, microESI y nanoESI
En dirección contraria, se han diseñado ESI asistidos neumáticamente, llamados Ion Spray (ISP) donde una
corriente de gas inerte es aplicada en conjunto con un alto voltaje para ayudar al proceso de rociado de
volúmenes grandes.
Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI)
Esta técnica de ionización, comúnmente llamada MALDI, fue descrita por Karas y Hillenkamp en 1988. En este
método de ionización los analitos son disueltos en una solución de un compuesto que absorbe UV, llamado
matriz (matrix), y colocado dentro del espectrómetro de masas. Debido a que los solventes se van secando, los
compuestos de la matriz cristalizan y los analitos quedan contenidos dentro de la matriz de cristales (Figura 18).
Figura 18. Proceso de Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI)
16
7
2
Pulsos de láser de luz UV (3-5 ns, 337 nm, 10 W/cm ) son utilizados para vaporizar pequeñas cantidades de la
matriz donde se incluyen los iones del analito y llevados a fase gaseosa en el proceso (Figura 19). La ionización
ocurre por protonación en el ambiente ácido producido por los compuestos de la matriz y por la adición de ácido
diluido en la muestra. La protonación de péptidos es particularmente eficiente en ambientes ácidos, haciendo de
MALDI, un método efectivo para producir péptidos protonados. Debido a que con la desorción por láser la
producción de iones es discreta y es pequeños paquetes, el MALDI esta comúnmente combinado con un
analizador de tipo time-of-flight (TOF) dando un sistema de alta sensibilidad.
Figura 19. Laser UV
Mientras que ESI es afectado por especies contaminantes, MALDI puede tolerar niveles variables de algunos
contaminantes.
Cada pulso láser genera una pequeña cantidad de plasma que se expande en vacío, del cual se extraen los
iones (positivos o negativos) del analito que son acelerados por un potencial de 10-30 kV y controlados por
medio de campos electromagnéticos. Debido a diferencias de velocidades que resultan de sus diferencias en
masas los iones llegan al detector en diferentes tiempos. Los tiempos de vuelo son del rango de 10-100 ms.
Una muestra de 1 ml de la solución del analito o de la solución analito/matriz es aplicada en un contenedor y se
seca, formando una capa delgada y cristalina. Los contenedores son de acero pulido, plata o cromo plateado
(Figuras 20 y 21).
Figura 20. Contenedor de plata para
10 muestras, cada pozo mide 23 mm
de diámetro.
Figura 21. Detalle del pozo 10 del contenedor.
El rectángulo muestra el lugar donde impactará
el láser. La línea blanca es un rasguño. La
muestra aplicada es una solución en acetona
que formo una capa cristalina. Se necesitan
entre 10-100 disparos del láser para evaporar la
capa completamente.
La función de la matriz es en primer lugar absorber la energía del láser. Por lo que las matrices para MALDI
están formadas de compuestos aromáticos (Figura). La ionización del analito puede ser afectada por
deprotonación, al aceptar o ceder un electrón, por unión de cationes o fotoionización, por lo que los iones
generados por MALDI son de una amplia variedad de moléculas, ya que dependiendo de la combinación entre
el analito y la matriz será el tipo de iones predominantes en el espectro obtenido.
17
Figura 22. Compuestos utilizados en las matrices MALDI
Tabla 6. Iones producidos por MALDI
Iones positivos
Iones negativos
Tipo de analito
+.
+
-.
Polaridad baja
M // [M+H]
M // [M-H]
+.
+
+
+
-.
M [M+H] // [M+Cat] [2M+H]
M [M-H] // [2M-H]
Polaridad media
n+
nMW > 3000: [M+nH] , n = 2, 3
MW > 3000: [M-nH] , n = 2, 3
+
+
+
+
-.
[M+H] [M+Cat] // [2M+H] [2M+Cat] [M-H] // M [2M-H]
Polaridad alta
n+
nMW > 3000: [M+nH] , n = 2, 3
MW > 3000: [M-nH] , n = 2, 3
+ +
+
+.
-.
Iones K A
K // [Kn+An-1] [KA]
A // [An+Kn-1] [KA]
+
+
+
+
Residuos de la matriz pueden formarse con todos los analitos dando: [M+H+matriz] .
18
ANALIZADORES DE MASAS
Todos los espectrómetros de masas combinan la formación de iones, el análisis de masas, y la detección de
iones. Los analizadores de masas llevan a cabo la separación de los iones producidos por diferentes métodos
en una fuente de iones, de acuerdo a su relación masa/carga (m/z) para que puedan llegar al detector. La
unidad para m/z es el Thomson (Th).
En los experimentos de espectrometría de masas aparecen dos clases principales de iones, el ion molecular,
que es la molécula completa del analito, y fragmentos iónicos, los cuales contienen solo una parte de la
estructura. El peso molecular de una molécula puede ser calculado de la m/z del ion molecular, si la carga (z) es
conocida, la información estructural se obtiene a partir de las m/z de los fragmentos del ion. Una variedad de
analizadores de masas están disponibles para realizar estas mediciones, incluyendo cuadrupolo (quadrupole),
trampa de iones (ion-trap), tiempo de vuelo (time-of-flight), sector magnético (magnetic sector), ciclotrón (ion
cyclotron resonance) y otros.
Cada tipo de analizador posee características y aplicaciones especiales, así como beneficios y limitaciones. La
selección del tipo de analizador a utilizar es en base a que aplicación se le dará, el costo y el rendimiento
deseado, ya que el analizador determina varias características del resultado del experimento, entre estas la
resolución y el rango de m/z de los iones que pueden ser medidos.
Efecto de campos magnéticos sobre los iones
Todos los analizadores de masas comúnmente usados utilizan campos eléctricos y magnéticos para aplicar una
fuerza a partículas cargadas (iones). La relación entre fuerza, masa y los campos aplicados puede verse a
través de la segunda ley de Newton y la ley de Lorentz.
Segunda ley de Newton
Ley de Lorentz
F=ma
F=e(E+vB)
Donde,
F= fuerza aplicada al ion,
M= masa del ion,
a= aceleración,
e= carga iónica,
E= campo eléctrico,
vB= producto de la velocidad del ion y el campo magnético aplicado.
De la segunda ley de Newton se observa que la fuerza aplicada causa una aceleración que es dependiente de
la masa del ion, y la Ley de Lorentz indica que la fuerza aplicada es también dependiente de la carga del ion.
Por lo tanto, los espectrómetros de masas separan los iones de acuerdo a su relación masa/carga (m/z) y no
solo a partir de la masa únicamente.
Principios de los analizadores de masas
Un analizador de masas es análogo al equipo utilizado en espectroscopia óptica para el análisis del contenido
de color de luz visible. En espectroscopia óptica, se inicia con luz visible que esta compuesta de colores
individuales (a diferentes longitudes de onda) que están presentes en diferentes intensidades. Un prisma
separa la luz es sus diferentes longitudes de onda, y pequeña salida es usada para seleccionar cual longitud
alcanza el detector. Las diferentes longitudes de onda son barridas o escaneadas al otro lado de la salida del
detector y la intensidad de luz es registrada como una función del tiempo (longitud de onda) (Figura 23).
En espectrometría de masas, se inicia con una mezcla de iones que tienen diferentes relaciones masa/carga y
diferentes abundancias relativas. Campos electromagnéticos separan los iones de acuerdo a sus relaciones
masa/carga, y una hendidura es usada para seleccionar cuales iones llegan al detector. Las diferentes
relaciones masa/carga son entonces analizadas en la salida del detector y las corrientes de iones son
registradas como una función del tiempo (figura 23).
19
Figura 23. Comparación entre espectrofotómetro y espectrómetro de masas
Espectrómetro de masas de sector magnético (Magnetic Sector Mass
Spectrometer)
En un espectrómetro de masas de deflección magnética, los iones que llegan de la fuente de iones son
acelerados a una gran velocidad. Los iones entonces pasan a través de un sector magnético (magnetic sector)
en el cual se aplica un campo magnético en una dirección perpendicular al movimiento de los iones. Cuando se
aplica aceleración perpendicular al movimiento de los iones, su velocidad permanece constante, pero se
mueven en dirección circular, es por esto que el sector magnético tiene forma de arco, el radio y el ángulo del
arco varían de acuerdo a diferentes diseños.
Un sector magnético por si mismo es capaz de separar iones de acuerdo a su relación masa/carga, pero su
resolución se ve limitada ya que no todos los iones que llegan de la fuente de iones tienen la misma energía ni
la misma velocidad. Para tener una mejor resolución se añade un sector eléctrico (electric sector) que enfoca
los iones de acuerdo a su energía cinética, esto se realiza aplicando una fuerza perpendicular a la dirección del
movimiento de los iones, también en forma de arco.
Figura 24. Espectrómetro de masas de sector magnético.
La configuración de este aparato es también llamada de geometría reversa, ya que el sector magnético esta
antes del sector eléctrico.
La operación del espectrómetro de masas se logra manteniendo constantes el potencial de aceleración y el
potencial del sector eléctrico y variando su campo magnético. Los iones que tienen una energía cinética
constante, pero una relación m/z diferente son captados por el detector a diferentes fuerzas de campo
magnético.
La dependencia de la relación m/z sobre los campos eléctrico y magnético es deducida a partir de que todos los
iones formados en la fuente de iones son acelerados a una energía cinética (T) de acuerdo a:
20
Despejando velocidad (v) tenemos:
2
De la Ley de Lorentz, el campo magnético aplicado a una fuerza evB debe ser igual a la fuerza centrípeta mv /r
ya que los iones se mueven en un arco a través del sector:
Substituyendo velocidad (v), se llega a la ecuación de trabajo aplicable al espectrómetro de masas de sector
magnético:
El sector magnético se mantiene constante usualmente a un valor en el cual pasen solo los iones que tengan
una energía cinética específica, por lo que el parámetro que es variable es B, la fuerza del campo magnético. El
campo magnético es generalmente analizado exponencialmente o linealmente para obtener el espectro de
masas. El análisis de campo magnético puede ser usado para cubrir un amplio rango de m/z con una
sensibilidad que es independiente de la relación masa/carga.
Una alternativa es mantener B constante y analizar V. El potencial del sector eléctrico rastrea el voltaje, esto
tiene la ventaja de que la relación m/z y el voltaje tienen una relación linear, pero una desventaja al analizar el
voltaje es que la sensibilidad es proporcional a la relación m/z.
El analizador de masas de sector magnético es un modelo clásico que posee varias ventajas: alta
reproducibilidad, alto desempeño en análisis cuantitativos, alta resolución, sensibilidad y rango dinámico.
Algunas limitaciones son que no pueden adaptarse a algunos métodos de ionización (por ejemplo: MALDI),
costos mayores que otros analizadores. Son ampliamente usados en análisis de compuestos orgánicos,
realizan mediciones exactas de masas, en cuantificación y en mediciones de isótopos.
Espectrómetros de masas de cuadrupolo (quadrupole)
El analizador de masas de cuadrupolo (quadrupole) es probablemente el analizador de masas mas utilizado, ya
que además de su alto desempeño analítico combina facilidad de uso. Este tipo de analizador esta compuesto
de cuatro barras organizadas paralelamente como dos grupos de dos barras conectadas eléctricamente (Figura
25). Una combinación de voltajes de radiofrecuencia (rf) y corriente directa (dc) son aplicados a cada par de
barras, este arreglo simétrico permite producir campos hiperbólicos. Superficies diagonalmente opuestas están
conectadas juntas a fuentes de voltajes rf y dc. Los iones se extraen de la fuente de iones y son acelerados (515 V) dentro del espacio central formado por el cuadrupolo a lo largo del eje longitudinal hacia el detector. Miller
y Denton describieron el concepto de filtro de masas cuadrupolo como la combinación o superposición de filtros
de pase bajo y pase alto. Al menos para iones relativamente ligeros (<300 Da), el análisis m/z no es afectado
por la estructura del ion.
Figura 25. Analizador cuadrupolo (quadrupole)
El filtro cuadrupolo m/z es examinado al modificar la magnitud de la amplitud de voltaje de rf y manteniendo dc
a una proporción fija. El poder de resolución es establecido por la relación de los voltajes rf y d c . Las
trayectorias de los iones a través del espacio central de las barras es complicado, y para cada par de voltajes dc
y rf solo iones de un valor m/z específico evitaran colisionar con las barras y pasaran el filtro cuadrupolo a
través del eje Z hasta alcanzar el detector, todos los demás iones chocarán con las superficies del cuadrupolo a
21
estos valores de rf y dc. El espectro de masas completo puede ser examinado ya que se hace un barrido desde
un valor de voltaje mínimo preestablecido hasta un máximo, pero manteniendo la relación dc/rf constante.
Una exploración rigurosa de la trayectoria de los iones a través del filtro cuadrupolo incluye un gran número de
variables físicas que afectan los campos eléctricos instantáneos que afectan los iones. Para un filtro de masas
hiperbólico clásico, el potencial de distribución (F) a cualquier tiempo (t) es descrito por la siguiente ecuación:
2
F = [U+Vcos(wt)] x - y
2
2r0
2
2
donde x y y son las distancias a lo largo de ejes de coordenadas, r0 es la distancia desde el eje z a cualquiera
de las superficies del cuadrupolo, w es la frecuencia angular (2p¶) de la corriente alterna aplicada (AC), V es la
magnitud de la señal rf aplicada, y U es la magnitud del potencial dc aplicado a las superficies.
El campo eléctrico instantáneo a lo largo de cualquiera de los tres ejes (x-y-z) puede ser calculado al derivar
parcialmente la ecuación anterior en función de un eje particular, al realizar esto, se observa que los potenciales
dc y AC aplicados a las superficies no afecta la aceleración de los iones en la dirección Z, es decir a través del
eje entre la fuente de iones y el detector, ya que la formula no tiene dependencia de Z.
Desde un punto de inicio del espectrómetro de masas de cuadrupolo, una solución frontera para la ecuación de
Mathieu corresponde a un desplazamiento finito de los iones a lo largo de los ejes x y y, esto es que los iones
siguen una trayectoria para evitar colisiones con las superficies y llegar al detector. Otro tipo de solución
describe el desplazamiento radial de los iones que chocan con las superficies del cuadrupolo para excluir
transmisión al detector. Definición de los términos a y q de la ecuación de Mathieu, en la cual a se relaciona con
dc y q con rf.
2
2
2
2
ax = -ay = 4zeU/m r0
qx = -qy = 2zeV/m r0
Los valores a (proporcional a U/m) y q (proporcional a V/m) corresponden a trayectorias estables de los iones
en el filtro cuadrupolar. Estas trayectorias le permiten a los iones llegar a la superficie del detector sin chocar o
colisionar con las superficies del cuadrupolo. Estas transformaciones matemáticas permiten crear un diagrama
a-q que simplifica los parámetros que afectan el movimiento de los iones en el cuadrupolo, estos diagramas son
bidireccionales (en a y en q) pero incluyen seis variables (e, w , r 0, m, U, y V), este diagrama de estabilidad
(Figura 26) relaciona el potencial dc aplicado (U) y el potencial rf aplicado (V).
Figura 26. Diagrama de estabilidad a-q
El analizador cuadrupolo ofrece alta reproducibilidad, además de costos relativamente bajos de manejo y
mantenimiento del sistema, pero puede llegar a tener una resolución limitada, puede no adaptarse a algunos
métodos de ionización. Este analizador esta frecuentemente acoplado a sistemas de cromatografía de
gases/espectrómetro de masas (GC/MS) y cromatografía líquida/espectrómetro de masas (LC/MS).
Analizador de Tiempo de Vuelo (Time-of-flight TOF)
El principio de operación del analizador de tiempo de vuelo (time-of-flight TOF) involucra la medición del tiempo
requerido por un ion para viajar desde la fuente de iones hasta el detector localizado a 1-2m de la fuente. Todos
los iones reciben la misma energía cinética durante la aceleración instantánea (3000 eV), pero debido a que
22
tienen diferentes valores de m/z, se separan en grupos de acuerdo a su velocidad (por lo tanto m/z) como van
recorriendo la región libre de campo entre la fuente de iones y el detector. Los iones chocan secuencialmente
en el detector en forma de un incremento de m/z. Los iones de baja m/z llegan al detector antes que aquellos
con m/z alta debido a que entre mas m/z tengan los iones tendrán una velocidad menor (Figura 27).
Figura 27. Analizador TOF
La energía cinética de un ion se define por:
T = eV = mv
2
2
La velocidad del ion:
v = 2zeV
m
1/2
Debido a que es impráctico medir directamente la velocidad del ion, el tiempo de vuelo (time-of-flight tof) desde
la fuente de iones hasta el detector (separados por una distancia L) provee la información necesaria:
[
]
tof = L =
m
v
2zeV
_
El valor de m/z para un ion es determinado por su tof al detector calibrado con los tof de al menos dos iones de
m/z conocida. El tiempo de tránsito de un ion de 3000 eV de 800 m/z es aproximadamente 70 mseg a través de
un tubo de 1m de vuelo, el ciclo de producción de iones, aceleración y detección es completado en un periodo
de aproximadamente 100mseg para un rango mayor de 1000 m/z.
Los iones que parten de la fuente de iones en un espectrómetro de masas TOF no tienen los mismos tiempos
de partida ni exactamente la misma energía cinética, por lo que estos aparatos han sido diseñados para
compensar estas diferencias. Un reflectron es un aparato óptico en el cual los iones en un espectrómetro TOF
pasan a través de un espejo o reflectron y su vuelo es invertido (Figura 28). Un campo de reflección linear
permite a los iones con mayores energías cinéticas penetrar más profundamente dentro del reflectron en
comparación con iones de energías cinéticas menores. Los iones que estén más dentro del reflectron tardarán
más en llegar al detector. Si un paquete de iones de una m/z dada contiene iones con diferentes energías
cinéticas, el reflectron disminuirá la dispersión de los tiempos de vuelo de los iones, mejorando la resolución del
espectrómetro.
Figura 28. Reflectron
El analizador TOF es el analizador de masas más rápido, puede adaptarse a los métodos de ionización por
pulsos (MALDI), tiene alta transmisión de iones y el rango de masas más grande de todos los analizadores de
masas. Algunas limitantes son que en muchas ocasiones requieren exclusivamente de un método de ionización
por pulsos y que la selectividad de los iones puede limitarse en algunos experimentos. Casi todos los sistemas
23
MALDI están en conjunto con un analizador de TOF, los sistemas GC/MS con TOF poseen una alta velocidad
de análisis.
Analizador de trampa de iones (Ion-Trap)
El espectrómetro de masas de trampa de iones cuadrupolo (quadrupole ion-trap), así como el filtro cuadrupolo,
utilizan campos eléctricos oscilantes para atrapar los iones en forma controlada. En la trampa de iones
cuadrupolo, los iones son atrapados en un espacio tridimensional, mientras que en el filtro de masas cuadrupolo
solo es en un espacio bidimensional.
La trampa de iones cuadrupolo atrapa los iones en un pequeño volumen entre tres electrodos, uno circular (ring
electrode) y dos electrodos hiperbólicos en los extremos (end-cap electrodes), por medio de campos eléctricos
oscilantes (Figura 29).
Figura 29. Analizador de trampa de iones (ion-trap)
La trampa de iones es operada al aplicar un potencial sinusoidal (rf a una frecuencia determinada) al electrodo
circular, mientras que los de los extremos se mantienen constantes (frecuentemente en cero), o mantenidos a
un potencial oscilante. La variedad de potenciales posibles que pueden aplicarse a los electrodos de los
extremos permite atrapar los iones dentro de un rango m/z específico, es decir atrapar iones por encima de un
valor m/z específico, atrapar iones solo de un valor m/z seleccionado, o expulsar iones de un valor m/z
específico.
Como fue originalmente concebido, la trampa de iones puede ser ajustada para almacenar iones de un valor
m/z dado. Al cambiar las condiciones de operación, iones de un valor m/z especificado podrán salir o ser
expulsados de la trampa. Stafford y colaboradores establecieron el modo de operación de la trampa de iones,
en el cual los iones los iones que tienen un valor m/z por encima de un valor predeterminado son almacenados,
pero eventualmente son expulsados de acuerdo a valores secuenciales de m/z al cambiar los parámetros de
operación para permitir un examen analítico.
El movimiento dentro de la trampa de iones, al igual que en el filtro cuadrupolo, puede ser descrito por las
ecuaciones de Mathieu. Debido a que potenciales dc pueden ser aplicados a la trampa, puedes usarse
diagramas de estabilidad basados en a y q para indicar cuales iones de acuerdo a su valor m/z permanecen
estables dentro de la trampa de iones y cuales serán expulsados bajo unas condiciones específicas.
Las condiciones para estabilidad de iones dentro de la trampa de iones pueden ser graficadas en función de a-q
de Mathieu. Los valores de a y q de la ecuación de Mathieu dependen de las dimensiones de la trampa de
acuerdo a las ecuaciones:
az = -2ar = -16
eU
2 2
mr0 w RF
.
qz = -2qr = -8
eV
2 2
mr0 w RF
.
Los subíndices z y r representan el movimiento axial y radial entre los electrodos de los extremos, U es el
potencial dc aplicado a cualquiera de los electrodos de los extremos, V es potencial rf aplicado al electrodo
24
2
central, r0 es el radio del electrodo central, y w RF es la frecuencia angular. Iones cuyos valores a y q caen
dentro de la gráfica tendrán trayectorias estables en la trampa de iones (Figura 30).
Figura 30. Diagrama de estabilidad a-q
Durante la operación del espectrómetro de trampa de iones, las oscilaciones de los iones atrapados son
-3
reducidas por colisiones con helio a alta presión (10 torr). Durante el proceso de detección, los potenciales de
los electrodos son alterados para producir una rampa de amplitud de radio frecuencia en las trayectorias de los
iones y así expulsar los iones en dirección axial. Los iones son expulsados en orden de decrementos de m/z,
enfocados a la salida de la trampa y detectados por el sistema de detección de iones.
Algunos investigadores han demostrado gran resolución y rango de masas en sistemas de trampas de iones
diseñadas especialmente. Sin embargo, estas características no son aplicables a todos los sistemas de trampa
de iones disponibles comercialmente. Este sistema posee alta sensibilidad además de ser equipos
relativamente compactos, pero ofrecen poca capacidad en análisis cuantitativos, pueden sufrir de efectos por
cargas y reacciones de los iones, muchos parámetros influyen la calidad del espectro obtenido por este método
(excitación, atrapado y detección de los iones) por lo que debe contarse con sistemas de control sumamente
precisos. Puede acoplarse a sistemas cromatográficos.
Analizador FT-ICR (Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance)
El analizador FT-ICR (Fourier-Transform Ion Cyclotron Resonance) es probablemente el método más complejo
de análisis de masas. Esta técnica fue desarrollada en los 50´s, es altamente sensible, pero tiene limitaciones
de resolución de masas (>106 Da). Este tipo de espectrómetros consisten principalmente de tres secciones, la
primera es la fuente de iones (ESI y MALDI son las más comunes), después la región de transferencia de iones
donde los iones producidos son captados, enfocados y transferidos a una región de alto vacío antes de entrar al
analizador, y finalmente el analizador.
El arreglo estándar para el analizador FT-ICR, es una trampa de iones localizada dentro de un campo
magnético especialmente uniforma de una fuerza B0. El efecto del campo magnético es obligar a los iones
incidentes a circular en una órbita (Figura 31), la frecuencia es determinada por la masa (m), la carga (z) y
velocidad (v) del ion, por acción de la ley de Lorentz, ecuación. El ion es llevado a una trayectoria circular en un
plano perpendicular al campo magnético. La frecuencia angular de los iones (wc) se define por la ecuación 2. El
sentido contrario de rotación es experimentado por iones de carga opuesta.
Ecuación 1.
Ecuación 2.
F = zivB0
wc = ziB0
2pmi
Ecuación 3.
mi = B0 .
2zipwc
25
Donde,
F = fuerza de lorentz
B0 = campo magnético
mi = masa del ion
zi = carga del ion
v = velocidad incidente del ion
wc = frecuencia rotacional inducida (ciclotrón)
Figura 31. Analizador FT-ICR
La presencia de iones entre el par de electrodos (en trampa) no producirá ninguna señal medible, por lo que es
necesario excitar los iones de una m/z dada como un paquete a un radio orbital mayor al aplicar barrido de
potencial rf de milisegundos. Una frecuencia excitará una m/z particular (la transformación de Fourier permite
medir simultáneamente todas las frecuencias). La medición de la frecuencia angular (wc) lleva a valores de m/z
y al espectro de masas. Debido a que la frecuencia puede ser medida más exactamente que otras propiedades
físicas, esta técnica de análisis tiene una gran resolución. Después de la excitación, los iones regresan a su
estado normal.
Este tipo de analizadores poseen la resolución de masas mas alta, alta capacidad, y acoplamiento a métodos
de ionización por pulsos (MALDI), es un método no destructivo, pero posee un rango de masa limitado, puede
sufrir de efectos por cargas y por reacciones entre los iones, se deben cuidar muchos parámetros para tener
buenas mediciones. Se acopla bien a MALDI y ESI.
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DETECTORES DE IONES
Sensibilidad, precisión, y tiempo de respuesta son criterios importantes que distinguen los diferentes sistemas
de detección de iones. Alta precisión y rápido tiempo de respuesta son características mutuamente excluyentes.
Idealmente, la sensibilidad debe definir explícitamente la corriente de ion recibida por el detector. La definición
debe incluir: (1) el nombre del compuesto de calibración, (2) el valor m/z del ion medido, (3) el poder de
resolución del instrumento, (4) la cantidad de compuesto de calibración consumido por minuto, (5) la intensidad
de la corriente de electrones y presión de la fuente de iones (para CI), (6) la corriente del ion que llego al
detector. Estas unidades de sensibilidad permiten comparar instrumentos, que en ocasiones es difícil ya que las
diferentes compañías usan diferentes criterios.
Copa Faraday
Este es un detector eléctrico convencional, iones positivos que impactan sobre el colector son neutralizados por
electrones después de pasar a través de una resistencia. La caída de voltaje en la resistencia de acuerdo a un
estándar es la medición de la corriente del ion. La señal del voltaje de la resistencia es entonces amplificada por
un amplificador DC o por unn electrómetro. El pequeño electrodo de metal que intercepta los iones positivos
esta montado en una jaula de Faraday (Figura 32).
La corriente del ion medida y amplificada es directamente proporcional al número de iones y al número de
cargas de los iones. La respuesta de la copa faraday es independiente de la energía, la masa, o la naturaleza
química de los iones. Este tipo de detector es simple, barato, resistente y fiable. Posee alta precisión,
sensibilidad y produce poco ruido de salida. La principal desventaja es que tiene un gran retraso inherente a la
simplificación del sistema. Por esto es que se utiliza para mediciones precisas o de corrientes de iones poco
cargados y no debe ser usado para realizar examinaciones rápidas (por ejemplo en sistemas GC/MS).
Figura 32. Copa Faraday
Multiplicador de Electrones (Electron Multiplier)
El multiplicador de electrones (electron multiplier) utiliza el principio de emisión secundaria de electrones para
afectar la amplificación. En el dinodo discreto (discrete-dynode) los iones provenientes del analizador de masas
son enfocados sobre un dinodo que emite electrones en proporción directa al número de iones bombardeados
hacia él. Los electrones secundarios del dinodo (iones en electrones) son acelerados y enfocados hacia un
segundo dinodo, el cual también emite electrones secundarios (electrones en electrones). De este modo, la
amplificación es llevada a cabo a través de un “efecto cascada” de electrones secundarios de dinodo a dinodo,
ya que el número de electrones que llegan a un dinodo es menos al que sale del mismo (Figura 33). Cada
etapa es un dinodo de cobre-berilio conectado a un potencial sucesivamente mayor por un divisor de voltaje.
7
Pueden llegar a tener de 10 a 20 etapas amplificando la señal en un orden de hasta 10 .
27
Figura 33. Multiplicador de electrones de dinodo discreto (discrete-dynodo)
Este tipo de detectores son de amplio uso, ya que además de ser sistemas confiables, baratos y que pueden
captar casi todos los electrones poseen sistemas electrónicos y mecánicos simples, aunque pueden no ser tan
sensibles (al no tener amplificación de señal) y un tiempo de respuesta lento debido a alta impedancia en el
amplificador.
Un diseño alternativo de multiplicador de electrones utiliza un dinodo continuo en forma de cuerno hecho de
vidrio cubierto con plomo. Este vidrio cubierto es eléctricamente resistente y provee un gradiente eléctrico que
esta conectado a una fuente de poder. Hacia el final del cuerno se ajusta el ángulo para poder captar todos los
iones y convertirlos en electrones secundarios. Estos electrones secundarios son atraídos a lo largo de un
gradiente eléctrico positivo en el cuerno, estos electrones chocan con la pared y más electrones secundarios
son expulsados, provocando amplificación (Figura 34). La forma de dinodo continuo (frecuentemente llamado
channeltron) es curva para prevenir que iones positivos causen señales de ruido debido a ionización secundaria
de moléculas residuales de gas.
Figura 34. Principio general y entrada de muestra de un dinodo continuo (channeltron)
6
La rápida respuesta y alta sensibilidad, con una ganancia de 10 hacen que el detector multiplicador de
electrones sea indispensable en sistemas como el GC/MS.
Detector Daly
Una corriente de iones positivos pasan por la hendidura del detector y son atraídos hacia un cátodo de aluminio
(el botón Daly) teniendo un gran potencial negativo (-15000 V). Ocurre el impacto con el botón Daly, el cual
esencialmente sirve como un dinodo de conversion que produce más de ocho veces electrones secundarios
que son atraídos hacia un aparato centelleante, los electrones secundarios generan fotones que son
amplificados en un fotomultiplicador (Figura 35).
Figura 35. Detector Daly
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El detector Daly tiene la ventaja de que no opera bajo vacío, puede detectar iones de masas grandes, y puede
detectar iones estables y metaestables, pero solo es capaz de detectar iones de alguna m/z específica ya es un
detector de canal simple.
Detector de Microcanales
Un arreglo de capilares de vidrio huecos (de 10-25mm de diámetro), unidos a un material emisor de electrones,
formando un microcanales. Manteniendo estos microcanales a un alto voltaje permite a los iones golpear el
material y expulsar electrones, esto causa una avalancha, creando electrones secundarios con una ganancia de
3
4
10 -10 (Figura 36). Estos detectores son útiles en señales de baja intensidad.
Figura 36. Principio del detector de microcanales
Los microcanales pueden también emitir electrones a través de pantallas fosforescentes. Un detector de arreglo
de fotodiodo es usado para convertir los fotones liberados en señales eléctricas (Figura).
Figura 37. Detector de arreglo de fotodiodo.
29
ADQUISICIÓN Y PROCESAMIENTO DE DATOS
En los 60´s y 70´s el oscilógrafo de rayo de luz fue el primer aparato de registro con suficiente respuesta de alta
frecuencia para registrar en forma precisa los espectros de masas. Hasta el desarrollo de la minicomputadora
fue posible hacer procesamiento de datos al tener algoritmos para su proceso e interpretación.
Figura 37. Componentes esenciales de un sistema de adquisición de datos
La salida análoga del detector es típicamente una señal de voltaje que varía en función del tiempo, esta es
convertida a una señal digital por medio de un convertidor análogo-digital. Los datos digitales son procesados y
almacenados en el CPU de una computadora. El sistema de datos almacena solo la información de los picos
del espectro de masas (valor de m/z y la intensidad) para cada análisis. Estos datos son entonces procesados
para producir diferentes representaciones al interpretar y procesar los datos por medio de la computadora. Los
datos procesados son entonces desplegados ya sea en el monitor o impresos en formato de gráfica de barras.
Figura 38. Diagrama de procesamiento de datos. ARRIBA: Señal analoga.
EN MEDIO: Señal procesada. ABAJO: Datos procesados mediante software
y produciendo el espectro de masas.
La calibración del espectrómetro de masas, en el eje de masa es llevado a cabo al introducir una muestra de un
compuesto cuyo espectro de masas es bien conocido. Dependiendo del tipo de algoritmo utilizado, el operador
puede ingresar los valores conocidos de m/z a los picos en el espectro de masas del compuesto de calibración,
la computadora realizará los ajustes necesarios en la escala de masa. En otros casos, el operador puede
ajustar los parámetros de la escala de masa hasta que en la computadora se indiquen los valores apropiados
de m/z de los picos conocidos en el espectro de masas del compuesto de calibración.
30
Procesamiento de datos
Debido a las grandes cantidades de información que son generadas y la gran cantidad de parámetros que
cambian en un periodo de tiempo, las computadoras son una herramienta esencial en espectrometría de
masas, tanto para control del equipo, adquisición, almacenamiento y presentación de datos. Los sistemas de
procesamiento de datos generalmente incluyen programas útiles en cuantificación, interpretación de los
espectros de masas y comparación de compuestos a través de consulta de bases de datos vía internet.
La estrategia es utilizar un sistema de procesamiento datos que permita adquirir datos constantemente, y
obtener los datos tan rápido como sea posible teniendo una buena relación señal-ruido sin abusar de los
principios de operación del espectrómetro de masas. Esto usualmente es completado en un ciclo de examen
del orden de 1 segundo, adquiriendo un nuevo espectro de masas cada segundo, esto tiene la ventaja de no
perder datos importantes pero tiene la desventaja de que se deben adquirir grandes cantidades de datos. El
análisis será realizado con el problema de tener que determinar cuales datos son útiles y necesarios para tener
el resultado final.
Los sistemas de procesamiento de datos emplean procedimientos de búsqueda hacia adelante o de búsqueda
reversa. En la búsqueda hacia adelante, un espectro no definido es comparado con cada miembro de una
biblioteca de espectros de referencia. Un resultado siempre será alcanzado, al calificar son cierta clase de
parecido respecto a las referencias, esto tiene la ventaja de sugerir el tipo de compuestos presentes en la
muestra si el grado de parecido no es aceptable o suficiente. En la búsqueda reversa, un banco de datos es
comparado con el espectro no definido para determinar si algunos picos de referencia están presentes en el
espectro analizado. Un resultado puede lograrse si el espectro no definido tiene algunos picos “extras” que
pueden ser comparables a los espectros de referencia. No se podrá identificar un compuesto si no se tiene un
espectro de referencia que corresponda en la base de datos.
Las computadoras pueden realizar búsquedas en bases de datos de espectros de masas, para ello se basan en
algoritmos de probabilidad, llamados algoritmos PBM (probability-based-matching) y variantes del algoritmo
INCOS, el cual busca parecido entre los picos más intensos del espectro (utiliza los 16 picos más intensos)
contra una base de datos.
31
APLICACIONES
Análisis de estructura y masa
En el análisis de estructura por medio de espectrometría de masas de la acetona (C3H6O) se observan
diferentes fragmentos de iones y el ion molecular en m/z=58 (Figura 39).
Figura 39. Espectro de masas de la acetona (C3H6O)
Los iones más intensos han sido marcados con su m/z. Los fragmentos de ion son usados por los
espectrometristas de masas para deducir las estructuras moleculares. Algunas veces los símbolos [+·] y [-·] son
usados para indicar los iones radicales, esta información es útil para determinar los patrones de fragmentación.
Se observa que la pérdida de 15 Da del ion molecular de la acetona da un ion de m/z=43 indicando la presencia
de un grupo metil (CH3) en la molécula original, la pérdida de 28 Da da un ion con m/z= 15 sugiriendo la
presencia de CO. Al analizar estas pérdidas y organizando las posibles estructuras a partir de los iones
obtenidos, se puede deducir la estructura del compuesto original. Algunas pérdidas comúnmente observadas
son de agua (H2O 18 Da), amonio (NH3 17 Da) y grupo fenil (C6H5 77 Da).
Otra aplicación de la espectrometría de masas es la determinación de masas. Cada isótopo de cada elemento
(excepto para carbono al cual se le asigno un valor de 12.00000 Da) tiene una masa no entera única. La
determinación de mediciones de masa permite determinar composición química. En el espectro de masas
(Figura 40) es posible distinguir entre monóxido de carbono (CO, m/z=27.995) y nitrógeno (N2 m/z=28.006) por
mediciones exactas de sus masas
Figura 40. Espectro de masas CO y N2.
32
Sistemas Acoplados
La espectrometría de masas es un sistema de detección útil en técnicas de separación tales como
cromatografía de gases (G C), cromatografía líquida (LC), electroforesis capilar y otras, debido a que es
altamente sensible y es capaz de identificar compuestos químicos en forma precisa. El reto al acoplar el
espectrómetro de masas a un sistema de separación es el mantener el vacío necesario al introducir la muestra
desde el cromatógrafo. Interfaces que restringen o reducen el flujo de gas de entrada al espectrómetro permiten
acoplar el cromatógrafo de masas y el espectrómetro de masas (GC/MS) (Figura 41).
Figura 41. Sistema GC/MS
Al vaporizar el solvente de una cromatografía líquida este representaría un volumen de 100-100 veces más
grande que el gas usado en cromatografía de gases. Se han desarrollado interfaces que resuelven este
problema al eliminar este exceso de gas usando calor y vacío, en algunos casos con ayuda de una corriente de
gas que ayuda a secar. Los sistemas acoplados LC/MS utilizan ionización química (CI) o electrospray (ESI)
como métodos de ionización.
Tabla 7. Compuestos aptos para análisis LC/MS
Bajo peso molecular
Peso molecular medio
Peso molecular alto
< 1 kDa
1 -10 kDa
> 10 kDa
Drogas, compuestos endógenos,
vitaminas, pesticidas, toxinas,
Polipéptidos sintéticos y
Polipéptidos, proteínas,
conjugados (glucoronidos, SO4) polisacáridos.
oligonucleótidos, polisacáridos.
de compuestos con m/z > 50.
Figura 42. Sistema LC/MS
En GC/MS y LC/MS, los datos obtenidos consisten en una serie de espectros de masas que son adquiridos
secuencialmente en tiempo. Para generar esta información, el espectrómetro de masas examina un rango de
masas (por ejemplo m/z de 30 a 500) repetitivamente durante la corrida cromatográfica. Si se realiza un examen
cada segundo y se hace una corrida de 30 minutos, se obtendrán 1800 espectros.
La información obtenida puede ser analizada en diferentes formas. En primer lugar, las intensidades de todos
los iones en cada espectro son sumadas, y esta suma graficada como función del tiempo de retención
cromatográfico (TIC) cuya apariencia es similar a los datos de salida de un detector cromatográfico
convencional (Figura 43 parte superior). Otra forma es desplegar cualquiera de los espectros obtenidos (Figura
43 parte central), cada pico en TIC representa un compuesto eluido que puede ser identificado al analizar su
espectro de masas obtenido es ese punto. La intensidad a una m/z específica en el transcurso de la corrida
33
cromatográfica puede ser desplegada para producir un perfil de corrientes de iones seleccionados o un
cromatograma de masas (Figura 43 parte inferior). Esta técnica puede ser usada para encontrar componentes
en una mezcla compleja sin tener que examinar cada espectro en forma individual.
Figura 43. Análisis de espectros en sistemas acoplados.
Acoplando dos etapas de
análisis
de
masas
(MS/MS) puede ser muy útil en la identificación de compuestos en mezclas complejas y en la determinación de
sustancias no conocidas. El examen de iones producidos es el modo MS/MS mas frecuentemente usado, se
generan los espectros de masas de iones producidos de un valor m/z específico. De una mezcla de iones
generados o colectados, se seleccionan aquellos iones que tengan un valor m/z particular, esta es la primera
parte del análisis. Estos iones son fragmentados y los productos de la fragmentación de estos iones son
analizados es una segunda etapa del análisis de masas (Figura). Si la muestra es un compuesto puro y se
realiza fragmentación de los iones producidos, los espectros producidos de esta fragmentación proveerán
información adicional respecto la estructura del analito. Si la muestra original es una mezcla y se usa ionización
suave, la segunda etapa de MS puede usarse para obtener un espectro de masas para cada componente en la
mezcla. MS/MS puede también usarse para eliminar interferencias en experimentos SIM donde se producen
varias señales de iones de una m/z específica.
Análisis cuantitativos
Cuando ya se conoce el espectro de masas de un compuesto específico, se puede confirmar la presencia de
sustancias específicas o medir la cantidad presente en la muestra. Este tipo de análisis son rutinarios en
mediciones de contaminantes ambientales y estudios farmocinéticos donde se requiere cuantificar analitos en
concentraciones muy bajas y además en mezclas complejas. El espectrómetro de masas se ajusta para
monitorear solo valores específicos de m/z representativos de las moléculas a analizar. El tipo de ionización
utilizado puede favorecer la producción de ciertos tipos de iones, incrementando la sensibilidad y manteniendo
la señal de ion en su valor de m/z.
Figura 44. Sistema MS/MS
En la Figura 45, se muestra un espectro en el cual se monitorearon solo los valores de m/z=158 y m/z=160
durante una corrida cromatográfica. Este proceso se conoce como monitoreo selectivo de iones (SIM).
34
Figura 45. Monitoreo selectivo de iones (SIM)
Este espectro es un análisis cuantitativo de un derivado de 5-fluorouracil en plasma, la respuesta de la
sustancia de interés es medida relativamente en comparación con un estándar interno añadido a la muestra. En
la parte superior de la Figura se muestra el perfil SIM del ion a una m/z=158, el compuesto de interés produce el
pico central, dos pequeños picos aparecen y corresponden a compuestos que también producen iones a
m/z=158. En la parte inferior de la Figura es el perfil SIM de la misma molécula teniendo el N15 sustituido por
N14 normal en dos posiciones, debido a que ambos nitrógenos están sustituidos, la señal de este ion es a
m/z=160, 2 Da mas pesado. Aunque la muestra y es estándar tienen el mismo tiempo de retención, son
detectados en forma separada ya que tienen masas diferentes. Los estándares pueden ser sustancias
altamente relacionadas o químicamente idénticas pero sintetizadas sustituyendo un isótopo de uno de los
elementos como en este caso.
La medición de isótopos es útil en diferentes áreas tales como estudios metabólicos que utilizan sustancias
marcadas isotópicamente, en estudios climáticos al usar isótopos de oxígeno y carbono que son temperatura
dependientes, en cálculo de edades de materiales (por ejemplo rocas) al medir plomo, neodimio o estroncio. La
relación de isótopos de un elemento puede ser determinada en forma precisa y exacta por medio de
espectrometría de masas, pero es necesario reducir los compuestos a moléculas simples antes de la medición,
los compuestos orgánicos son reducidos a CO2, H2O y N2.
Análisis de péptidos
Para realizar análisis de péptidos, una vez obtenida la proteína o extracto de proteínas, se realiza una digestión
proteolítica para obtener péptidos, esta mezcla de péptidos son separados y purificados por medio de
cromatografía de gases (GC), HPLC u otras técnicas de separación (Figura 45). Los péptidos separados y
purificados son sometidos a espectrometría de masas para obtener los espectros de las diferentes fracciones.
Se analizan los espectros obtenidos, la relación m/z y la intensidad de los iones obtenidos en los diferentes
espectros son usados para identificar los péptidos de las muestras.
Figura 45. Análisis de péptidos por medio de espectrometría de masas.
35
Iones de péptidos
Cuando un péptido es fragmentado por colisión con moléculas un de gas neutro, la fragmentación es inducida
por transferencia de energía cinética de las moléculas del gas al péptido. Cuando un péptido es fragmentado en
un enlace peptídico particular entre carbonilo (-CO-) y nitrógeno (-NH-), se forman dos fragmentos, un
fragmento del péptido retiene la carga positiva en el C terminal del péptido ionizado y es llamado ión-y, el otro
fragmento retiene la carga positiva en el N terminal y es llamado ión-b. Un ión-b generalmente tiene un ión-y
complementario. Cuando un péptido que tiene una sola carga es fragmentado, la carga se mantiene solo en un
fragmento y solo aquel que tenga la carga podrá ser detectado mientras que el otro permanecerá como
fragmento neutro no detectable. Péptidos doblemente cargados producirán dos iones cargados.
Figura 46. Iones formados durante fragmentación de péptidos.
Durante la fragmentación de péptidos pueden formarse otros tipos de iones además de los iones-y y los ionesb. Los iones-a y los iones-x, los iones-c y los iones-z, siendo complementarios entre a-x y c-z. Los iones a-x se
forman por rompimiento entre el péptido y el carbonilo en el extremo N terminal. Los iones c-z se forman al
haber un rompimiento entre el nitrógeno (-NH-) y el resto del péptido. Los iones a, x, c y z se forman en
condiciones de alta energía y los b-y en baja energía.
Secuenciación de péptidos
La secuenciación de novo de péptidos es llevada a cabo al determinar la secuencia directamente del espectro
de masas sin consulta de bases de datos. Las diferencias entre m/z sucesivas se usan para determinar la
secuencia aminoacídica del péptido. Se asume que solo ocurre formación de iones b-y durante el proceso de
fragmentación del péptido, se forman iones-b ascendentes desde el extremo N terminal mientras que se forman
iones-y en forma descendente desde el C terminal. Se determinan las m/z de los fragmentos aminoacídicos. Al
comparar las diferencias entre masas sucesivas de cada serie y comparándolos con las masas conocidas de
residuos de aminoácidos, se puede determinar la secuencia de un péptido. Tanto los iones de la serie b como
de la serie y indican la misma secuencia.
Figura 47. Secuenciación de novo de un péptido AVAGCAGAR
La precisión de la secuencia deducida es limitada por las características del equipo. La calidad de la reacción
de fragmentación, ya que en ocasiones no ocurre el corte y los fragmentos obtenidos diferirán en algún
aminoácido que no podrá deducirse, por ejemplo, en presencia de prolina la fragmentación puede no ocurrir y
causar errores en la secuencia.
36
Identificación de proteínas
Para identificar proteínas se utilizan las huellas de masas de péptidos (peptide mass fingerprinting) o huellas
peptídicas, este método utiliza los péptidos obtenidos de la digestión enzimática de la proteína para obtener sus
espectros de masas. Los péptidos son identificados por comparación contra una base de datos, ya que las
masas de los péptidos forman en conjunto la huella peptídica de la proteína, es posible identificar la proteína de
interés. Factores importantes que deben ser considerados en este procedimiento es la pureza de la proteína y
la precisión de los datos obtenidos, la precisión de los datos disponibles en las bases de datos y el tipo de
algoritmos usados al comparar las masas de los péptidos (Figura 48).
Figura 48. Proceso de identificación de péptidos por medio de huellas peptídicas.
El resultado de este análisis puede sufrir algunos problemas al tener presencia de señales provenientes de
péptidos que no están presentes en la proteína de interés debido a que la purificación dejo algunas proteínas
que contaminaron la muestra o presencia de péptidos contaminantes. Es posible además obtener resultados
falsos positivos al comparar los espectros obtenidos contra las bases de datos, o que la proteína de estudio
tenga modificaciones postraduccionales desconocidas que podrían alterar el análisis, algunas veces es difícil
distinguir entre proteínas que son muy similares o que podrían tener las mismas huellas peptídicas.
Se dispone de tres tipos de herramientas para al análisis de huellas peptídicas:
1. Programas que asignan puntuaciones a las masas de los péptidos obtenidos que coinciden con las masas
de péptidos de las bases de datos. Por ejemplo:
PepSea: http://www.unb.br/cbsp/paginiciais/pepseafingerprint.htm
Peptldent: http://us.expasy.org/tools/peptident.html
2. Programas que asignan puntuaciones basados en la longitud del péptido y la proteína. Por ejemplo:
MOWSE: http://srs.hgmp.mrc.ac.uk/cgi-bin/mowse
MS-Fit: http://prospector.ucsf.edu/ucsfhtml4.0/msfit.htm
3. Programas que asignan puntuaciones probabilisticas para determinar la significancia de los resultados
obtenidos entre las muestras y las bases de datos. Esto es para evitar resultados no significativos. Por
ejemplo:
PROWL: http://prowl.rockefeller.edu/
MASCOT: http://www.matrixscience.com/cgi/index.pl?page=/search_form_select.html
37
HERRAMIENTAS PARA ANÁLISIS DE PROTEÍNAS POR
ESPECTROMETRÍA DE MASAS
Protein Prospector
Colección de herramientas de la UCSF Mass Spectrometric Facility usadas para identificar proteínas usando
datos de espectrometría de masas y bases de datos.
http://prospector.ucsf.edu/
ExPASy Proteomics Tools
Programas del Expert Protein Analysis System (ExPASy) del Swiss Institute of Bioinformatics. Para
identificación y caracterización de proteínas, predicción de modificaciones postraduccionales, topología y
estructura de proteínas.
http://us.expasy.org/tools/
MASCOT
Identificación de proteínas basado en bases de datos de pesos de péptidos, usa métodos probabilisticos para
calcular significancia entre datos.
http://www.matrixscience.com/cgi/index.pl?page=/search_form_select.html
PeptideSearch
Identificación de proteínas en base a sus espectros de masas.
http://www.mann.embl-heidelberg.de/GroupPages/PageLink/peptidesearchpage.html
MOWSE
MOWSE (MOlecular Weight Search). Utiliza pesos moleculares obtenidos por digestión de proteínas con una
proteasa conocida y busca en bases de datos de péptidos para identificar proteínas, de 3 a 4 péptidos son
necesarios para identificar una proteínas entre una base de datos de 50000 proteínas.
http://srs.hgmp.mrc.ac.uk/cgi-bin/mowse
Mass Spec Tools
Herramientas de Scientific Information Services usadas para generar y graficar espectros de masas y calcular
distribución de isótopos.
http://www.chemsw.com/13057.htm
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DEFINICIÓN DE TÉRMINOS
Relación masa/carga
Esta expresión, abreviada m/z, es la relación del número de masa (m) de una partícula dada entre el número (z)
de unidades cargadas electrostáticamente (e) que posee la partícula. Así, m/z es una relación adimensional
que es el parámetro medido por el analizador de masas. La masa de una partícula dada es igual a la suma de
sus masas atómicas (en Daltons) de todos los elementos que componen la partícula. El símbolo para las unidad
12
de masa es u, y corresponde a 1/12 de la masa del C, al que se la ha asignado un valor de 12.000000 por
convención.
Iones doblemente cargados
Es posible para una molécula perder dos electrones durante el proceso de ionización. Estos iones que están
doblemente cargados producirán un pico en el espectro de masas en un valor m/z numéricamente igual a la
mitad de la masa molecular del ion. Los iones doblemente cargados son insignificantes en el espectro de masa
para la mayoría de los compuestos. Sin embargo, para aquellas moléculas que los produzcan en forma estable,
los picos correspondientes en el espectro de masas pueden ser usados en la interpretación de datos.
Ion molecular
El ion molecular resulta de la ionización de la molécula a analizar. Este ion representa la molécula intacta y es
el último precursor de todos los iones fragmentados que componen el espectro de masas. El pico del ion
molecular aparece a un valor m/z numéricamente igual al peso molecular del compuesto.
Pico base
Es el pico más intenso en el espectro de masas. Es usado como base para normalizar las intensidades de los
otros picos. Al pico base se le asigna una intensidad relativa de 100%.
Intensidad relativa
La intensidad relativa de un pico representa su intensidad en comparación con el pico base. Se representa
como % respecto al pico base que es 100%. Por convención, este dato se indica en la izquierda del espectro de
masas.
Porcentaje total de ionización
Este término expresa la abundancia de un ion individual comparado con la suma de las abundancias de todos
los iones en un rango de masa especifico. La escala de porcentaje total de ionización esta representada a la
derecha del espectro de masas con el símbolo (%Sn), este dato puede ser utilizado para comparar diferentes
espectros de masas de diferentes compuestos.
Espectro de masas
Un espectro de masas es una gráfica de intensidad relativa del ion como función de la relación masa/carga
(m/z). El espectro de masas es frecuentemente representado como un histograma simple. Esta forma de
registro de iones y sus intensidades sirven para establecer el peso molecular y estructura del compuesto a ser
analizado. Debido a que ocurre la fragmentación del analito, las fracciones del ion aparecen en el espectro a
valores m/z menores que la molécula completa ionizada (ion molecular) a partir de es tos datos se deduce la
estructura y peso molecular de la molécula completa.
39
REFERENCIAS
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database. Bioinformatics. 2001;17 Suppl 1:S13-21
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