Guia de Generacion de un Modelo Digital - Real Reefs

Transcripción

Guia de Generacion de un Modelo Digital - Real Reefs
Generación de un Modelo
Digital Batimétrico
Guía de Campo y Laboratorio
Proyecto PAPIME, DGAPA-UNAM.
“RealReefs: Plataforma digital de entrenamiento para evaluación de arrecifes coralinos.” Clave
PE100910
Responsable: Dr. Joaquín Rodrigo Garza Pérez • email: [email protected]
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
1
Reconocimiento
La presente Guía es un producto derivado directamente del Proyecto “RealReefs: Plataforma digital de entrenamiento para evaluación de arrecifes coralinos.” Financiado por la Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA), en su Programa de Apoyo a Proyectos para la
Innovación y Mejoramiento de la Enseñanza (PAPIME), en su Convocatoria 2009. Clave
PE100910, primera etapa.
!
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
2
Índice
Como Usar Esta Guía!
4
Introducción!
5
Consideraciones Preliminares!
6
Materiales Necesarios
6
Métodos
7
Caso de Estudio: Akumal!
11
Modelo Batimétrico Digital
11
Materiales y Software Utilizados
11
Planeación
13
Relevamiento batimétrico y generación de base de datos.
14
Modelo Digital Batimétrico
17
Bibliografía!
18
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
3
Como Usar Esta Guía
!
El presente documento está dirigido al apoyo a la enseñanza en niveles superiores para
estudiantes de programas de licenciatura y posgrado en áreas afines a las ciencias ambientales.
Complementa específicamente los siguientes cursos obligatorios de la Licenciatura en Manejo
Sustentable de la Zona Costera de la UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias:
• Métodos de Campo y Laboratorio.
• Estancia de Investigación I,II y III.
Y los siguientes cursos optativos, tanto de la Licenciatura en Manejo Sustentable de la Zona Costera de la UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, como del Programa de Posgrado del Instituto de
Ciencias del Mar y Limnología, UNAM:
•Sistemas de Información Geográfica.
•Percepción Remota.
!
En primera instancia se presenta una procedimiento generalizado para la generación de
modelos digitales batimétricos y a continuación se expone un caso de estudio con sus características metodológicas particulares.
Importante:
!
Para implementar las actividades en esta guía se requieren conocimientos y habilidades
previas, tales como manejo básico de datos tabulares, conocimiento básico en modelación matemática y conocimientos básicos de cartografía. Asimismo, el software necesario para generar un
modelo digital batimétrico, no se encuentra instalado comúnmente en computadoras personales.
Esta guía no sustituye el aprendizaje presencial, ni la supervisión directa por parte de un profesor.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
4
Introducción
!
Las arrecifes coralinos y sus ecosistemas asociados son notablemente complejos. Las ca-
racterizaciones geomorfológicas y batimétricas precisas son productos de información escenciales para la comprensión de estos importantes ecosistemas, en particular como información base
para estudios de modelización que involucren elementos espaciales.
La profundidad del agua está asociada directamente con variables tales como la temperatura, el
oxígeno disuelto, la intensidad de la luz, entre otros (Goreau 1959, Glynn 1973, Done 1983), y de
la modo la profundidad es un factor indirecto de regulación que controla la distribución y abundancia de los componentes bióticos del arrecife. Adicionalmente la geomorfología arrecifal posee
una influencia directa en el intercambio de materia y energía del arrecife por su influencia en la
circulación del agua en el sistema, que a su vez esta asociada con los procesos de conectividad,
dispersión y asentamiento larvario. La complejidad topográfica o rugosidad es también un indicador ecológico de la estructura espacial del hábitat y puede ser estimada y representada conjuntamente con la estructura geomorfológica por medio de un Modelo Digital Batimétrico.
El método tradicional (y mas barato) para obtener modelos batimétricos y geomorfológicos digitales en 3-D, en ecosistemas arrecifales es por medio de relevamientos batimétricos directos en
campo utilizando ecosondas comerciales/recreativas, y combinar la información obtenida de esta
manera con modelación por métodos geoestadísticos (Kvernevik et al. 2002, Ecochard et al.
2003, Garza-Pérez et al. 2004, Hogrefe et al. 2008entre otros).
Esta aproximación requiere comúnmente de trabajo de campo intensivo y proporciona modelos
en 3-D con una resolución espacial horizontal media.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
5
Consideraciones Preliminares
Materiales Necesarios
1. Ecosonda con GPS integrado, de preferencia con transductor de frecuencia doble
200/50 kHz
★ Se debe de considerar la capacidad del aparato para archivar los datos de profundidad y posición geográfica. En caso de que la ecosonda no presente esta funcionalidad se debe de utilizar además un dispositivo externo para registro continuo de datos (p.ej. Datalogger, Netbook).
★ Dependiendo de la embarcación que se utilice se podría necesitar una batería
(12 v, ciclado profundo) para proporcionar energía a la ecosonda y el dispositivo
de registro de datos. Considerar la necesidad de adaptadores de voltaje y conexiones eléctricas necesarias.
2. Cables de datos y software necesarios para transferir la información a una computadora. Considerar la necesidad de adaptadores para diferentes cables a diferentes puertos de
comunicación de la computadora (p.ej. adaptador de puerto serial a puerto USB, lector
de tarjetas de memoria).
3. Software
★ Para importación de datos a partir de la ecosonda o el dispositivo externo de
registro.
★ Para el procesamiento de datos tabulares (hoja de cálculo o de bases de datos).
★ Para geoestadística.
★ Google Earth (versión gratuita, http://www.google.com).
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
6
4. Computadora personal con sistema operativo y hardware adecuado para operar los
softwares antes mencionados, de preferencia con conexión a internet.
Métodos
1. Planeación.
!
Se debe de considerar el tipo de ambiente que se va relevar batimétricamente (arrecife
coralino, laguna costera, zona sublitoral, etc.), y de ser posible se debe de recopilar información
previa de la zona (cartas náuticas). Para planear adecuadamente la mejora de la información existente o la generación de información base.
La utilización del software gratuito Google Earth para la visualización del área de estudio nos
puede ser muy útil si nuestra zona de interés se encuentra cercana a la costa y si existe cobertura
de imágenes de alta resolución del área. La utilidad principal será para establecer la extensión del
área de interés, trazar rutas de navegación para el relevamiento batimétrico y recopilar las coordenadas geográficas de los vértices de nuestras rutas de navegación.
Estas coordenadas se deben de introducir a la ecosonda como rutas de navegación que puedan ser
seguidas en tiempo real por la embarcación.
Antes de salir a campo siempre se debe realizar una revisión del pronóstico del tiempo en el área
de interés, particularmente para este tipo de actividades de relevamiento batimétrico. En primer
lugar por la seguridad de los participantes y en segundo lugar porque una superficie en calma y
con poco viento, mejorará las posibilidades de una navegación precisa y un registro de datos con
menos errores.
2. Relevamiento Batimétrico.
!
En primer lugar se deben de seguir las instrucciones de montaje del sensor de la ecoson-
da en la embarcación, de conexión al sistema eléctrico de la embarcación y se debe de probar el
correcto funcionamiento de la ecosonda, el sensor y en su caso del dispositivo externo de registro. De preferencia estas pruebas se deben de realizar en una zona somera y cercana al punto de
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
7
partida de la embarcación (embarcadero, muelle, marina, etc.) para, en caso necesario, se pueda
regresar a tierra a efectuar ajustes o reparaciones.
Una vez confirmado el correcto funcionamiento de todo el conjunto de aparatos, cables y sensores, se iniciará el registro de los datos de posición y profundidad y se seguirán las rutas preestablecidas de navegación a una velocidad moderada, vigilando en todo momento la continuidad del
registro del dato de profundidad.
NOTAS IMPORTANTES:
✓ Mantener una velocidad de navegación moderada es importante por dos motivos: A
mayor velocidad se obtienen menos puntos de registro por unidad de distancia recorrida,
y para nuestro propósito, mientras mas puntos se registren, mejor va a a ser la resolución
espacial de nuestro producto final. A altas velocidades el sensor puede perder la señal de
regreso y esto ocasionará retrasos en los recorridos y vacíos de información en la base de
datos.
✓ El área sondeada por el haz generado por la ecosonda se incrementa proporcionalmente a la profundidad a la que esté el fondo y la señal de regreso no necesariamente refleja
la porción mas profunda en esa área, sino que podrá ser el registro de profundidad de
cualquier objeto o superficie que se encuentre en esa área. Por esta razón, una vez más, la
navegación a una velocidad moderada ayudará a reducir el error en los registros de profundidad.
3. Generación de Base de Datos.
!
La captura diaria de los datos de relevamiento batimétrico en un medio de respaldo adi-
cional (medios magnéticos -disco duro externo, memoria USB-, otra computadora, medios ópticos -CD’s, DVD’s- ) es esencial para evitar pérdidas. Una vez completadas todas las rutas de navegación pre-establecidas y de haber respaldado los registros originales, se procederá a importar
los archivos a bases de datos tabulares que deberán ser filtradas para eliminar registros nulos (con
datos faltantes de posición y/o profundidad) y registros repetidos, así como columnas de información no necesaria.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
8
La importación de los registros originales de campo puede ser por dos vías, la primera puede ser
utilizando el software provisto por los fabricantes de la ecosonda, que permita importar los archivos de registro y exportarlos a archivos tabulares. O, utilizando la consola de comunicación del
puerto serial de la computadora conectado al dispositivo externo de registro, que generará un
archivo de texto delimitado que puede ser importado a su vez a software de hoja de cálculo o de
bases de datos.
Los archivos de registro originales están ordenados en tablas, por columnas de tipos de datos y
renglones que corresponden a registros individuales. Generalmente en estos archivos existen columnas que indican la validez de cada tipo de dato registrado. en este caso eliminaremos todos los
registros que contengan el código “F” (false) en la validación tanto de la posición geográfica (indicando que no se tenía una posición verdadera) como en la profundidad (indicando que el valor
de profundidad no es correcto). Asimismo los casos en que existan celdas vacías o códigos
“NULL” tanto en las columnas de las coordenadas geográficas como en las de profundidad.
Las tablas filtradas finales deben de presentar de preferencia, únicamente cuatro columnas, dos
de coordenadas geográficas, una de profundidad y otra de identificación del registro. Los registros filtrados de todas las tablas se deberán copiar a un solo archivo de texto delimitado, en un
formato legible por el software de geoestadística (delimitado por comas, delimitado por tabulaciones, etc). Este archivo final de registros filtrados debe de respaldarse también, como los archivos originales.
4. Pre-procesamiento.
!
En el caso de que nuestra área de interés se encuentre cerca de la costa (p.ej. arrecifes
frontales, lagunas costeras y arrecifales), será necesario digitalizar la línea de costa presente a todo lo ancho (o largo) de nuestros barridos y digitalizar asimismo una porción de tierra firme inmediata a la costa. Esto responde a la necesidad de proporcionar datos reales al análisis para delimitar la zona marina de tierra y que éste no se genere automáticamente datos en zonas en donde
no existen datos. Las técnicas de geoestadística (p.ej. kriging) funcionan trazando limites espaciales en los extremos de los registros de la matriz de datos, generalmente formando superficies rectangulares o cuadradas y rellenando los espacios vacíos con datos generados por el análisis artificialmente. Si no se tiene especial cuidado en añadir los datos correspondientes a la línea de costa
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
9
(profundidad 0) y de una porción de tierra, el análisis generará una superficie con las mismas tendencias a los registros existentes de profundidad mas cercanos a la costa.
La digitalización de la línea de costa y la porción terrestre se puede realizar directamente en el
software de geoestadística exportando los datos de posición a un formato de texto fácilmente editable, o en el software Google Earth, exportando los archivos .kmz, los cuales habrán de ser traducidos y exportados a archivos vectoriales o de texto delimitado.
5. Análisis Geoestadístico.
!
Para el análisis geoestadístico se utilizará la base de datos final que incluirá todos los re-
gistros de profundidad filtrados, y en su caso los datos de línea de costa y porción terrestre. Típicamente se realizan análisis espaciales exploratorios antes de hacer la interpolación, para observar
y describir las tendencias batimétricas, así se puede escoger el mejor modelo basando la decisión
en los resultados de las validaciones estadísticas. El resultado del análisis geoestadistico es una
matriz de valores interpolados, esta matriz puede ser exportada como capa raster a un sistema de
información geográfica, o puede ser visualizada en forma de superficie continua en 3-D, superficie de malla, mapa de relieve con sobras o un mapa de isolíneas.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
10
Caso de Estudio: Akumal
Arrecife Akumal, Quintana Roo, México
MODELO BATIMÉTRICO DIGITAL
Materiales y Software Utilizados
1. Ecosonda Garmin GPSMap 170 Sounder, con transductor 50/200 kHz, de montaje en espejo
de popa. (Figura 1)
2. Unidad manual GPS Garmin modelo GPS 76, con cable de comunicación a PC (puerto serial).
3. Datalogger Brookhuse, con cable de datos de especificación NMEA (Figura 2)
4. Batería de 12 v, de ciclado profundo.
5. Soporte removible para transductor.
6. Cable serial (RS-232) con convertidor a USB (Figura 2).
7. Computadora personal con sistema operativo Windows XP Profesional (Figura 3).
8. Hielera grande 45.4 L.
9. Hyperterminal, (Herramienta de comunicación para puerto serial incluida en Windows XP).
10. Driver para reconocimiento de adaptador de cable serial a USB.
11. Sistema de Mapeo de Superficies, Surfer v. 8.0 (Golden Software Inc.)
12. Hoja de cálculo, Microsoft Excel 2003 (Microsoft Corp.)
13. Editor de texto, Microsoft Notepad v. 5.1 (Microsoft Corp.)
14. Software de sistemas de información geográfica, ArcView v. 3.2a (ESRI Inc.), con extension
Spatial Analyst v. 2.0 (ESRI Inc.), extensión DNR Garmin v. 5.0.4 (Minnesota Dept. of Natural
Resources), y extensión Surfer v. 2.5 (Johannes Weigel).
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
11
Figura 1. A) Ecosonda GPSMap 178 Sounder de Garmin, con antena integrada, B) Transductor de frecuencia dual 50/200 kHz, para montaje en espejo de popa.
Figura 2. A) Datalogger Brookhouse con conexión de entrada a cables de datos NMEA y de
salida a puerto serial y conexión de salida a puerto serial (B), C) Pinzas para conexión a batería de 12v, D) Cable de corriente y datos para ecosonda, E) Cable de conexión a transductor, F) Cable USB con adatador a puerto serial y CD de instalación de driver.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
12
Figura 3. Computadora personal con sistema operativo Windows XP y software necesario para la generación del modelo digital batimétrico.
Planeación
!
Se realizó la planeación del relevamiento batimétrico en campo con ayuda del software
ArcView v3.2a, sobre una imágen satelital de alta definición de la zona de Akumal en Quintana
Roo, México. Se seleccionó un área de 580 hectáreas correspondiente a la zona de laguna arrecifal, frente y pendiente. Por medio de líneas en zig-zag para se cubrió el área de interés para efectuar los barridos con la ecosonda (Figura 4). Estas líneas fueron exportadas a una ruta de navegación en la unidad manual de GPS utilizando la extensión DNR Garmin v. 5.0.4. (Figura 5).
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
13
Figura 5. Area de estudio en la zona de Akumal, Quintana Roo México. El área delimitada en
rojo (580 ha.) corresponde a la zona de desarrollo arrecifal. Las líneas verdes corresponden
a la propuesta del relevamiento batimétrico previa a campo.
Relevamiento batimétrico y generación de base de datos.
Se realizaron los barridos con ecosonda en el frente y pendiente arrecifal y en una porción de la
laguna arrecifal, y se obtuvieron 3,050 puntos con registro de coordenadas y profundidad (x,y,z),
después de filtrar los registros con datos de posición o profundidad faltantes (Figura 6). Además
se añadieron 1,260 puntos delimitando la línea de costa y añadiendo información de elevación en
la porción terrestre. La información en la porción terrestre se manejo como “cero” para los puntos de línea de costa y “uno” para los puntos representando elevación en tierra (Figura 7). Esta
información de elevación es completamente artificial, únicamente se incluye en el análisis para
evitar tendencias erróneas de profundidad en la zona terrestre, producida automáticamente por el
kriging.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
14
La totalidad de los 4,310 puntos se incluyeron en un archivo de texto, con columnas separadas por
tabuladores, con la información de las coordenadas (Easting y Northing, WGS-84, UTM Z16Q ) y
la profundidad expresada en metros negativos.
Figura 6. Representación visual de los barridos con ecosonda para el relevamiento batimétrico
del arrecife de Akumal (en rosa). En azul se delimita el área de estudio.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
15
Figura 7. Area de estudio en la zona de Akumal, Quintana Roo México. El área delimitada en
rojo (580 ha.) corresponde a la zona de desarrollo arrecifal. Las líneas verdes corresponden
a la propuesta del relevamiento batimétrico previa a campo.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
16
Modelo Digital Batimétrico
Se realizó un filtro preliminar de registros en la base de datos y se eliminaron 67 , quedando 4,243
registros válidos en la base de datos. Se corrió una rutina de kriging de tipo puntual con un variograma lineal. El resultado fué una rejilla de 1,296 líneas por 1,133 columnas, para generar una superficie en 3-D representando la morfología del arrecife Akumal y su batimetría a una resolución
de 4 m x píxel (Figura 8).
Figura 8. Modelo Batimétrico Digital del Arrecife de Akumal, Quintana Roo.
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
17
Bibliografía
๏DONE, T., 1983, Coral zonation: its nature and significance. In Perspectives in Coral Reefs,
D.J. Barnes (Ed). pp.107-147 (Hong Kong: AIMS).
๏ECOCHARD, J.L.B., HEYMAN, W.D., REQUENA, N. AND CUEVAS, E., 2003, Adptive
Bathymetric System (ABS). Available online at:
http://conserveonline.org/docs/2004/08/Adaptive_Bathymetric_System_Final.pdf (accesado
17 Feb. 2009).
๏GARZA-PÉREZ, J.R., LEHMANN, A. and ARIAS-GONZÁLEZ, J.E., 2004, Spatial Prediction
of Coral Reef Habitats: Integrating Ecology with Spatial Modeling and Remote Sensing. Marine
Ecology Progress Series, 269, pp. 141-152.
๏GLYNN, P.W., 1973, Aspects of the ecology of coral reefs in he Western Atlantic Region. In
Biology and Geology of Coral Reefs II, Jones and Endean (Eds.), pp. 273-324 pag. (Chicago:
Academic Press)
๏GOREAU, T.F., 1959, The ecology of Jamaican coral reefs. 1. Species composition and zonation, Ecology, 40, pp. 67–89.
๏HOGREFE, K.R., WRIGHT, D.J. and HOCHNBERG, E.J., 2008, Derivation and integration
of shallow-water bathymetry: Implications for coastal terrain modelling and subsequent analyses,
Marine Geodesy, 31, pp.299-317
PIESACOM • UMDI-Sisal, Facultad de Ciencias, UNAM
18

Documentos relacionados