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Guía del Curso 2008-2009 de Botánica Farmacéutica Impartido por la Prof. Ana Crespo Catedrática de Botánica de la Facultad de Farmacia UCM (i) Generalidades BOTÁNICA FARMACÉUTICA Estudia la diversidad biológica (= biodiversidad) de los hongos, y vegetales (algas y plantas) que viven en el planeta desde una perspectiva filogenética (= sistemática) y desde su interés práctico (farmacéutico y ambiental) La magnitud actual de la diversidad de los seres vivos se estima en 14. especies (Nature, vol 405 11 Mayo 2000 Nature insight Biodiversity) 106 300.000 especies 10.000.000 especies 300.000 especies 1.500.000 especies 1.000.000 especies VIDA 3500.106 FOTOSÍNTESIS 3400.106 EUCARIOSIS 1500.106 EUCARIOSIS FOTOSÍNTESIS VIDA http://www.scotese.com/future2.htm HADEANA / ARQUEANA Gases volcánicos: Nitrógeno gaseoso, dióxido de carbono y vapor de agua. C, H, O, N, S Radiación Sulfuro de hidrógeno, solar no amoníaco y filtrada metano VIDA PRIMITIVA ANAEROBIA: Vida primitiva (primeras células). El O2 gaseoso es consecuencia de la fotosíntesis. Reproducción experimental Amoníaco Metano Vapor de agua “efecto tormenta” Y luego ...mucho tiempo para evolucionar CUÁNTO TIEMPO?? Experimento de Stanley Miller 50’ EUCARIOSIS 1500.106 + 1900. 106 FOTOSÍNTESIS 3400.106 + 100. 106 VIDA 3500.106 Se necesita mucho tiempo para que los seres vivos hayan acumulado el alto número de cambios evolutivos para alcanzar la actual biodiversidad. Demasiado? Hipótesis para resolver el problema del TIEMPO Astrobiología ??? Endosimbiosis Ambos procesos y otros (relacionados con expresión génica) Astrobiología Astrobiología En la nave Soyuz Foton M1 LICHENS L.G.Sancho & al 2007 Astrobiology ENDOSIMBIOSIS: el origen de la célula eucariótica (L. Margulis 70’) Un procariota procariotaingiere ingiere una bacteria aerobia.Las Asi bacterias aerobias. los areobios quedan bacterias quedarían protegidos protegidasyy proporcionan energía producirían energía A lo largo del tiempo las bacterias aerobias se transforman en mitocondrias y ya son incapaces de vivir libremente ENTRE 3400 Y 1500 ENTRE 3400 Y 1500 MILLONES DE AÑOS MILLONES DE AÑOS Un procariota primitivo ingiere una cianobacteria que contiene pigmentos fotosintéticos Las cianobacterias se transforman en cloroplastos y ya son incapaces de vivir libremente ENDOSIMBIOSIS: el origen de la célula eucariótica (L. Margulis 70’) La magnitud actual de la diversidad de los seres vivos se estima en 14. 106 especies (Nature, vol 405 11 Mayo 2000 Nature insight Biodiversity) 300.000 especies 10.000.000 especies 300.000 especies 1.500.000 especies 1.000.000 especies E A 1 2 3 4 5 6 Eucariosis 2. Opisthokonta 1. Amebozoa 3. Rhizaria 6. Excavata 4. Archaeplastida (=Arqueoplástidos) 5. E. EUBACTERIAS A. ARQUEBACTERIAS Chromalveolata Sistemática Taxonomía Filogenia SISTEMÁTICA Y/O TAXONOMÍA FILOGENIA Caracteres: 1. Morfológicos: macromorfológicos y micromorfológicos 2. Químicos 3. Moleculares (obviamente filogenéticos) Para construir una sistemática se comparan los caracteres de los individuos sujeto de estudio. Los que tienen en común mayor número de caracteres se situarán mas cerca en la clasificación sistemática. REPRESENTACIÓN DE SEMEJANZAS EN ÁRBOL (CLADÍSTICA*) Carácter a Carácter b Carácter c Carácter d Carácter e Planta 1 + + _ + + Planta 2 + _ + _ _ Planta 3 + + + _ + *clado significa rama REPRESENTACIÓN DE SEMEJANZAS EN ÁRBOL (CLADÍSTICA) 1 3 2 Planta Planta Planta 1 2 3 Planta 5 1 3 1 1 Planta 2 1 5 2 Planta 3 3 2 5 3 2 Arboles no-enraizados (Unrooted) E D F A H B C J I No enraizado G Arboles no-enraizados (Unrooted) y enraizados (Rooted) A B C D E H I Enraizado J F G E D RAIZ F A ENRAIZADO CLADOGRAMA RECTANGULAR (rectangular cladogram) H B C J G A B C D E F G H I I No enraizado ENRAIZADO CLADOGRAMA EN V (slanted cladogram) J Árbol filogenético Elementos terminales Ramas terminales A B nodo 1 C D E F nodo 2 G H I J politomía ramas interiores (SLANTED) CLADOGRAMA V Raiz Grados de confianza: probabilidades Bacterium 1 Bacterium 2 Bacterium 3 Eukaryote 1 Eukaryote 2 Eukaryote 3 Eukaryote 4 98 100 100 Bacterium 1 Bacterium 2 Bacterium 3 Eukaryote 1 95 Eukaryote 2 Eukaryote 3 Eukaryote 4 Grados de confianza: probabilidades Bacterium 1 Bacterium 2 Bacterium 3 Eukaryote 1 Eukaryote 2 Eukaryote 3 Eukaryote 4 Árboles de distancia y árboles filogenéticos Bacterium 1 Bacterium 2 Bacterium 3 Eukaryote 1 Eukaryote 2 Eukaryote 3 Eukaryote 4 Grupo hermano En taxonomía, un grupo es monofilético si todos los organismos incluidos en él han evolucionado a partir de un ancestro común, y todos los descendientes de ese ancestro están incluidos en el grupo. En taxonomía un grupo es parafilético cuando incluye al ancestro común de sus miembros, pero no a todos los descendientes de éste. Un grupo se constituye como parafilético cuando a un clado (rama evolutiva) se le sustraen uno o más grupos holofiléticos (monofiléticos). un grupo taxonómico que contiene organismos pero carece de un ancestro común se llama polífilético Grupos hermanos Relaciones filogenéticas: monofilético, parafilético y polifilético Para discusión Seleccionar grupos: Monofiléticos Polifiléticos Parafiléticos Comentar grupos: Bien respaldados Mal respaldados Para discusión Seleccionar grupos: Monofiléticos Polifiléticos Parafiléticos Comentar grupos: Bien respaldados Mal respaldados Relaciones filogenéticas: monofilético, parafilético y polifilético Ninfa de agua Anís estrellado Amapola Rosa Girasol Dicotiledoneas Tomate Magnolio Peperomia Alisma Orquídea lirio Monocotiledoneas jengibre maíz SISTEMÁTICA Y/O TAXONOMÍA FILOGENIA Caracteres: 1. Morfológicos: macromorfológicos y micromorfológicos 2. Químicos 3. Moleculares (obviamente filogenéticos) LAS CLASIFICACIONES Aristóteles: Plantas y Animales Linneo Clasificación plantas por órganos reproducción sexual. Nomenclatura binomial Darwin Nace 12 Febrero 1809 en 1859 publica el origen de las especies por selección natural Evolución: Clasificaciones Filogenéticas Filogenia Caracteres Moleculares a le Son vari b s Son genéticos y no adaptativos Son numerosos (centenares) CARACTERES MOLECULARES: CARÁCTER Y ESTADO DEL CARÁCTER Cada posición es un carácter y cada posibilidad (A, C, T, G) es un estado CARACTERES MOLECULARES: DATOS PARA INFERIR LA FILOGENIA (O PARENTESCO EVOLUTIVO) Los cambios o variables entre los organismos se producen por las mutaciones que ocurren en el genoma. M. de sustitución: AAT ACTACG AAC - CATCG AACACATCG Transiciones: entre purinas (A, G) y entre pirimidinas (T y C) Transversiones: de purinas a pirimidinas INDEL M. de posición CARACTERES MOLECULARES: VARIABILIDAD ADN Intrones de diversos tipos Exones de los genes de proteinas y Separadores ITS Microsatelites NO CODIFI CANTE CODIFI CANTE gran parte de las subunidades ribosómicas CARACTERES MOLECULARES: SELECCIÓN Microsatellites El marcador molecular se selecciona según el tipo de análisis que se quiera realizar Categorías Reino División Subdivisión Clase Sufijos castellano, latín (hongos) -fitos, -phyta (-micota, -mycota) -fitina, -phytina (-micotina, -mycotina) -ópsidos, -fíceas, opsida, -phyceae (-micetes, -mycetes) Ejemplos Planta, Fungi Magnoliophyta Eumycota Magnoliophytina Pezizomycotina Magnoliopsida Phaeophyceae Lecanoromycetes Rosidae Lecanoromycetidae Subclase -idas, idea (-micétidas, -mycetidae) Orden -ales Rosales Lecanorales Familia -áceas, aceae Rosaceae Parmeliaceae Género Especie Malus Parmelia Malus communis Parmelia saxatilis CATEGORÍA SUFIJO (sufijo hongos) EJEMPLOS HONGOS EJEMPLOS (plantas, algas) Parmelia sulcata, Peziza abieticola, Agaricus bisporus, Mucor mucedo, Aspergillus nidulans Pinus pinaster, Quercus suber, Poa annua, Capsella bursa-pastoris, Fucus vesiculosus Reino División -phyta (-mycota) Subdivisión -phytina (-mycotina) Clase - opsida, -phyceae (-micetes, -mycetes) Subclase idea (-mycetidae) Orden -ales Familia -aceae Género Especie