Descargue la Presentación

Ciencia centrada en datos:
aplicaciones de física A&M
C. Mendoza (IVIC/CeCalCULA)
Día Virtual de e-Infraestructura
RedCLARA
8 Mayo 2012
1
Las nebulosas planetarias prácticamente se
convierten en laboratorios de física atómica
2
El modelo del interior del Sol concuerda
con las observaciones heliosismológicas
Modelo del interior del Sol
Observaciones heliosismológicas
3
Existe interés en estudiar formación
estelar en las galaxias
4
Fuente: Hubble Space Institute
La validez del modelo astrofísico depende
de la completitud y precisión de la DB
OPserver at OSC
From Bailey (2008)
5
Los códigos de modelado espectral
leen una base de datos atómicos
6
El Proyecto de la Opacidad (1985-1997) fue
pionero en la ciencia intensiva en datos
The Opacity Project Team
The Queen's University of Belfast, Belfast, UK
K.A. Berrington, P.G. Burke, V.M. Burke, W.E. Eissner, A.H. Hibbert, A.E. Kingston, P.M.J. Sawey, M.P. Scott, J.F. Thornbury
Royal Holloway and Bedford New College, Unversity of London, London, UK
K.T. Taylor
University College London, University of London, London, UK
J.A. Fernley, G. Peach, H.E. Saraph, M.J. Seaton, P.J. Storey
University of Illinois, Urbana-Champaign, Illinois, USA
D. Mihalas, Yu Yan
Institut für Astronomie und Astrophysik, Munich, Germany
K. Butler, D.G. Hummer, D.J. Lennon
IBM Venezuela, Caracas, Venezuela
W. Cunto, C. Mendoza (until 1993)
University of Oxford, Oxford, UK
A.E. Lynas-Gray
Ohio State University, Columbus, Ohio, USA
F. Delahaye, S.N. Nahar, A.K. Pradhan
Observatoire de Paris, Meudon, France
M. Le Dourneuf, C.J. Zeippen
Observatoire de la Côte d'Azur, Nice, France
J.A. Tully
Joint Institute for Laboratory Astrophysics, Boulder, Colorado, USA
D. Luo
High Altitude Observatory, Boulder, Colorado, USA
W. Däppen
Strathclyde University, Glasgow, UK
N.R. Badnell
Venezuelan Institute for Scientific Research (IVIC), Caracas, Venezuela
M.A. Bautista, C. Mendoza (as from 1993)
NASA Goddard Space Flight Center, Greenbelt, Maryland, USA
P. Palmeri
7
TOPbase was one of the first
online atomic databases
Source: Cunto & Mendoza (1992)
The OPserver is a good example of
database-centric computing
OPserver at OSC
From Mendoza et al. (2007)
9
Outstanding problems in existing A&M databases
are interoperability and data interfaces
10
• VAMDC tiene como objetivo la construcción de una einfraestructura inter-operable para el intercambio de datos
atómicos y moleculares. Involucra 15 socios administrativos
que representan 24 grupos de investigación de 6 países de
la Unión Europea (UE), Serbia, la Federación Rusa y
Venezuela.
• VAMDC está patrocinado por la UE en el marco de la
iniciativa FP7 "Research Infrastructures - INFRA-2008-1.2.2 Scientific Data Infrastructures". Comenzó el 01 de Julio 2009
con una duración de 42 meses.
11
VAMDC intends to deploy an interoperable eenvironment for distributed A&M databases
database2
database1
database3
database4
12
Users will navigate seamlessly and
retrieve data from 21 A&M databases
VALD
NIST
CHIANTI
CDMS
HITRAN
OPserver
BASECOL
STSP
XSTAR
UMIST
TIPbase
VAMDC
KIDA
TOPbase
PAH
W@DIS
LASP
SPECTRA
OZONE
BELDATA
CDSD
SpecW3
13
A&M data are used in a wide variety of
research and industrial fields
Astrophysics
Fusion plasmas
Lighting
14
VAMDC se concibe como una warehouse
de datos A&M virtual distribuida
15
XSAMS es un esquema XML para
intercambio de datos A&M
16
XSAMS tree
Solids
Particles
Atoms
Molecules
Collisions
Functions
Radiative
Methods
Data
sources
Objects
XSAMS
VO-PDC Forum, Paris, November 2011
Processes
Nonrad.
<XSAMSData xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
xsi:noNamespaceSchemaLocation="http://www-amdis.iaea.org/xsams/schema/xsams-0.1.xsd">
<Sources>
<Source sourceID="B.Mendoza_etal_2010">
<Category>preprint</Category>
<SourceName></SourceName>
<Year>2010</Year>
<Authors>
<Author>
<Name>Claudio Mendoza</Name>
</Author>
<Author>
<Name>Juan Gonzalez</Name>
</Author>
</Authors>
</Source>
</Sources>
<Methods>
<Method methodID="M.MCDF">
<Category>theory</Category>
<Description></Description>
</Method>
</Methods>
18
<ChemicalElement>
<NuclearCharge> 1</NuclearCharge>
<ElementSymbol>H </ElementSymbol>
</ChemicalElement>
<Isotope>
<IonState>
<IonCharge> 0</IonCharge>
<IsoelectronicSequence> H </IsoelectronicSequence>
19
Storage of XML in a database
Source: Freire & Benedict, 2004, Comp. Sc. Eng., 6, 12
20
IBM propone una BD híbrida de
SQL/XML
Fuente - “XML: changing the data warehouse”
IBM Software Group White Paper
21
En eCiencia se introduce un nuevo modelo
del proceso de curación de datos
Original image from Lord et al (2004)
22
Conclusiones
La producción y el consumo de datos científicos
está evolucionando de una industria casera a
grandes consorcios multinacionales
En el contexto de la eCiencia, la computación de
alto rendimiento está centrada en bases de datos
La integración de las bases de datos involucra
laboratorios virtuales
El intercambio de datos va a estar basado en
esquemas de XML
El proceso de curación de datos se convierte en
23
una nueva profesión