LIBRO NIKKA. 2. copia

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LIBRO NIKKA. 2. copia
Bases
de
Datos
Química
bio
química
Jesús Olivero Verbel Ph. D.
Nikka Montoya Rodríguez Ing. Sistemas
www.reactivos.com
adÍstica
est
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UNIVERSIDAD DE
CARTAGENA
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Bases
DE DATOS
Bases DE
DATOS
GenBank
Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html
Entidad administradora: Base de Datos Internacional de Secuencias de Nucleótidos.
Descripción: Base de datos de secuencias genéticas. Proporciona reciente y detallada información sobre secuencias de ADN. Incluye una descripción concisa de la secuencia, el nombre
científico y taxonomía del organismo, fuente, y una tabla de características que identifican las regiones de codificación y otros sitios de significancia biológica, tales como unidades de transcripción, sitios de mutaciones, y repeticiones.
MedBioWorld
Link: http://www.medbioworld.com/
Entidad administradora: Healthnostics, Inc.
Descripción: Directorio médico y de biociencias más grande en Internet. Posee actualmente 8200
revistas dentro de 80 especialidades médicas y 101 campos de biociencias, 7000 asociaciones
médicas y de biociencias, 30000 nuevos artículos de Salud e Industria Reuters, 3100 bases de
datos médicas y de biociencias y más de 2000 empresas de biociencias asociadas.
Biological & Environmental Research Abstracts Database
Link: http://www.osti.gov/oberabstracts/
2
Bases
de
Datos
Entidad administradora: Oficina de Investigaciones Biológicas y Ambientales. Departamento de
Energía de los Estados Unidos.
Descripción: Esta base de datos contiene resúmenes de proyectos de investigación en cuatro
áreas específicas: ciencias biológicas, investigación de cambios climáticos, remediación ambiental y ciencias médicas. Los proyectos son apoyados por el programa de Investigaciones Biológicas y Ambientales.
The BIOTOOLKIT
Link: http://www.biosupplynet.com/biotoolkit/
Entidad administradora: BioSupplyNet.
Descripción: Base de datos con más de 900 recursos en línea de interés para biólogos y neurobiólogos moleculares. Está dividida en cinco secciones: Análisis del ácido nucleico, Recursos sobre genómica, Proyección de imagen y Análisis estructural de la proteína, y Neuroinformática.
Metalloprotein Database and Browser (MDB)
Link: http://metallo.scripps.edu/
Entidad administradora: Instituto de Investigación Scripps.
Descripción: Base de datos y Navegador (MDB) de Metaloproteínas del Instituto de Investigación
Scripps. Contiene información geométrica y molecular que permite la clasificación y búsqueda de
combinaciones particulares de las características del sitio, su visualización y manipulación. Hace
parte de un proyecto para el diseño de metaloproteínas, permitiendo la visualización interactiva de
su información geométrica y funcional.
Bases DE
DATOS
3
Protein Data Bank
Link: www.rcsb.org/pdb/
Entidades administradoras: Fundación Nacional de Ciencias, Instituto Nacional de Ciencias
Médicas Generales, Departamento de Ciencia, Departamento de Energía, Biblioteca Nacional de
Medicina, Instituto Nacional de Cáncer, Centro Nacional para Recursos de Investigación, Instituto
Nacional de Desórdenes y Enfermedades Neurológicas y el Instituto Nacional de Visualización y
Bioingeniería Biomédica.
Descripción: Base de datos en 3-D sobre estructuras de proteínas y ácidos nucleicos. Cada
descripción experimental de la estructura es un archivo de texto con las coordenadas atómicas de
la molécula en formato PDB. Los datos encontrados en PDB generalmente obtenidos por
Cristalografía de rayos X o Resonancia Magnética Nuclear, son enviados por biólogos y
bioquímicos de todo el mundo.
ChemFinder
Link: http://chemfinder.cambridgesoft.com/
Entidad administradora: Corporación CambridgeSoft.
Descripción: Esta base de datos incluye información sobre componentes químicos, estructuras
químicas (estructuras 2D y modelos 3D) y propiedades físicas (MP, BP, CAS RN). De igual forma,
permite realizar búsquedas referenciadas por nombre químico, fórmula, peso molecular y número
de registro CAS. La visualización de estructuras químicas es posible a través de los programas
ChemDraw o Chem3D.
4
Bases
de
Datos
Organic Syntheses
Link: http://www.orgsyn.org/
Entidades administradoras: Rick Danheiser, Dennis Curran, Scott Denmark, Jonathan Ellman,
Alois Fürstner, Mark Lautens, David Mathre, Marvin Millar, John Ragan, Masakatsu Shibasaki,
Peter Wipf y Charles Zercher.
Descripción: Base de datos de libre acceso sobre procedimientos detallados para la síntesis de
compuestos orgánicos. Algunos describen métodos prácticos para la preparación de compuestos
químicos de interés, mientras que otros ilustran métodos sintéticos importantes de utilidad
general.
Agency for Toxic Substances & Disease Registry
Link: http://www.atsdr.cdc.gov/search.html
Entidad administradora: Agencia para Sustancias Tóxicas y Registro de Enfermedades (ATSDR).
Descripción: Base de datos sobre contaminación con sustancias peligrosas en el medio y sus
efectos en la salud de poblaciones humanas. Facilita información sobre las características del
lugar afectado, contaminantes encontrados, niveles de concentración del contaminante, impacto
en la población, recomendaciones de la ATSDR, consecuencias en el ambiente y formas de
exposición, entre otras.
ChemBank
Bases DE
DATOS
5
Link: http://chembank.broad.harvard.edu/compounds/?realm=bioactives
Entidades administradoras: Jeremy Muhlich, Jason McIntosh, Erik Brauner, Jim Conley y
Caroline Shamu.
Descripción: Colección de datos de libre acceso sobre moléculas pequeñas y recursos para el
estudio de sus propiedades. Además, proporciona datos sobre químicos potencialmente peligrosos: registro de efectos tóxicos, aceites y materiales peligrosos, sistemas de información y
respuesta, control de sustancias tóxicas, sistemas integrados de información sobre riesgos, guías
de respuesta de emergencia y para componentes químicos peligrosos.
iPROCLASS
Link: http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/iproclass.shtml
Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico
Universitario de Georgetown (GUMC).
Descripción: Proporciona enlaces a más de 90 bases de datos biológicas, incluyendo bases de
datos para familias de proteínas, funciones, interacciones, estructuras y clasificaciones estructurales, genes y genomas, literatura y taxonomía. iProClass puede ser utilizado para soportar
anotaciones de secuencias de proteínas, investigaciones sobre genómica o proteómica y
adicionalmente, identificación de proteínas.
PIRSF
Link: http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pirsf.shtml
6
Bases
de
Datos
Entidades administradoras: Recurso de Información de Proteínas (PIR) y Centro Médico
Universitario de Georgetown (GUMC)
.
Descripción: El sistema de clasificación PIRSF está basado en proteínas completas, por lo tanto,
permite la anotación de bioquímicos genéricos y funciones biológicas específicas, así como la clasificación de proteínas sin dominios bien definidos. La estructura de PIRSF es formalmente una
red.
PIR-PSD
Link: http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/pir_psd.shtml
Entidades administradoras: Recursos de Información de Proteínas, Centro de Información de
Munich para Secuencias de Proteínas y Base de Datos Internacional de Proteínas de Japón.
Descripción: Primera base de datos de secuencias de proteínas clasificadas. Las secuencias y
anotaciones de PIR-PSD han sido integradas a la base de conocimiento UniProt, con referencias
bidireccionales entre ellas para permitir el rastreo sencillo de las entradas formadas en PIR-PSD.
Las secuencias únicas de PIR-PSD, citaciones de referencia, y datos verificados experimentalmente pueden ser encontrados en los registros de UniProt.
Swiss-Prot
Link: http://www.expasy.ch/sprot/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss (SIB) y el Instituto de Bioinformática Europeo (EBI).
Bases DE
DATOS
7
Descripción: Base de datos de secuencias de proteínas. Genera información detallada acerca de
la secuencia, mutaciones, número de clasificación de enzima (E.C.) requerimiento de cofactores,
modificaciones postraduccionales y bibliografía, entre otros. Proporciona enlaces directos con
múltiples herramientas utilizadas para estimar la masa molecular y el punto isoeléctrico, o para
realizar predicciones estructurales.
Prosite
Link: http://www.expasy.org/prosite/
Entidad administradora: Instituto de Bioinformática Swiss en Geneva y Lausanne.
Descripción: Colección de descriptores de motivos dedicada a la identificación de familias de
proteínas y dominios. Con herramientas computacionales apropiadas, resulta rápida y factible la
identificación de la familia conocida de proteínas a la cual pertenece una nueva secuencia.
Swiss-2Dpage
Link: http://www.expasy.ch/ch2d/
Entidades administradoras: Grupo de Investigación en Proteómica Biomédica (BPRG) del
Hospital Universitario de Geneva y el Instituto de Bioinformática Swiss (SIB).
Descripción: Contiene datos sobre identificación de proteínas en varios mapas de referencia.
Puede localizar proteínas en mapas 2-D PAGE o mostrar la región de un mapa 2-D PAGE donde
espera encontrar una proteína de Swiss-Prot. Incluye datos textuales sobre la proteína, tales como
procedimientos de mapeo, información fisiológica y patológica, datos experimentales (punto
isoeléctrico, peso molecular) y referencias bibliográficas.
8
Bases
de
Datos
Enzyme
Link: http://www.expasy.ch/enzyme/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática Swiss y Recursos de Bioinformática
Canadiense.
Descripción: Base de datos con información sobre nomenclatura de enzimas, basada en el Comité
de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB). Incluye
sobre cada enzima catalogada el número EC, nombre recomendado, nombres alternativos (si
existen), actividad catalítica, cofactores, enlace a la secuencia de proteína obtenido en Swiss-Prot
correspondiente a la enzima y enlace a las enfermedades humanas asociadas con una deficiencia
de la enzima.
Hazardous Substances Data Bank (HSDB®)
LLink: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?HSDB
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina (NLM).
Descripción: Archivo de datos centrado en la toxicología de químicos potencialmente peligrosos.
Posee información sobre exposición humana, higiene industrial, procedimientos de manejo de
emergencias, consecuencias ambientales, requerimientos regulatorios, y áreas relacionadas.
Todos los datos son referenciados y derivados de una serie de libros, documentos gubernamentales, reportes técnicos y literatura seleccionada.
ChemIDplus
Bases DE
DATOS
9
Link: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CHEM
Entidad administradora: Biblioteca Nacional de Medicina (NLM).
Descripción: Base de datos de libre acceso sobre archivos de estructura y nomenclatura para la
identificación de sustancias químicas citadas en las bases de datos de la Biblioteca Nacional de
Medicina (NLM), incluyendo el sistema TOXNET. También proporciona búsquedas de estructuras y
enlaces directos a muchos recursos biomédicos en la NLM y en Internet.
Toxline®
Link: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?TOXLINE
Entidades administradoras: Biblioteca Nacional de Medicina y el Instituto Nacional de Salud.
Descripción: Proporciona información derivada de 16 fuentes secundarias sobre toxicología,
farmacología, y efectos bioquímicos y fisiológicos de drogas y otros químicos. Toxline Core,
comprende la mayoría de la literatura estándar en toxicología y Toxline Special, complementa a
Toxline Core con referencias de una variedad de revistas especializadas y otras fuentes.
Chemical Carcinogenesis Research Information System (CCRIS®)
Link: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?CCRIS
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina.
Descripción: Banco de datos científicamente evaluado y referenciado. Contiene más de 8000
registros químicos sobre carcinogenicidad, mutagenicidad y resultados de pruebas de inhibición
de tumores. Los datos son derivados de estudios citados en revistas, herramientas de conocimiento actuales, informes del NCI y otras fuentes monitoreadas por expertos en carcinogénesis y
mutagénesis.
10
Bases
de
Datos
Developmental and Reproductive Toxicology/Environmental
Teratology Information Center (DART®/ETIC) Database
Link: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?DARTETIC
Entidades administradoras: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®), Agencia de Protección
Ambiental de los Estados Unidos, el Instituto Nacional de Ciencias Ambientales de la Salud y el
Centro Nacional para la Investigación Toxicológica de la Administración de Alimentos y Drogas.
Descripción: Base de datos sobre información en el área de teratología y otros aspectos de la
toxicología de desarrollo y reproductiva. Posee más de 100.000 referencias de literatura publicada
desde 1965.
Gene-Tox
Link: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?GENETOX
Entidad administradora: Red de Datos de Toxicología (TOXNET®). Biblioteca Nacional de
Medicina.
Descripción: Contiene datos de pruebas genéticas de toxicología (mutagenicidad) obtenidos de la
revisión experta de literatura científica abierta en más de 3.000 químicos. Gene-Tox fue establecido para seleccionar sistemas de ensayo para evaluación, revisión de datos en literatura científica, recomendación de protocolos de prueba apropiados y evaluación de procedimientos
adecuados para estos sistemas.
EMBL-Nucleotide Sequence Database
Link: http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-page+query+-libList+EMBL
Bases DE
DATOS
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Entidades administradoras: GenBank, Base de Datos de ADN de Japón (DDBJ) y el Instituto de
Bioinformática Europeo.
Descripción: Base de datos constituida por secuencias de nucleótidos. Las principales fuentes de
secuencias de DNA y RNA son obtenidas de investigadores, proyectos de secuenciación genómica y aplicación de patentes. Es una de las bases de datos más importantes en Europa.
NIST Atomic Spectra Database
Link: http://physics.nist.gov/PhysRefData/ASD/index.html
Entidades administradoras: Administración Nacional Aeronáutica y Espacial, Oficina de Ciencias
de Fusión de Energía de Estados Unidos, Departamento de Energía, Programa de Referencia de
Datos Estándar y el Programa de Integración de Sistemas para Manufacturación de Aplicaciones
de NIST.
Descripción: Base de datos con información sobre transiciones radiactivas y niveles de energía
en átomos e iones atómicos. Los datos son incluidos para las transiciones observadas en 99
elementos y niveles de energía de 56 elementos. ASD contiene datos de cerca de 950 espectros de
aproximadamente 1 Å (Ångströms) a 200 µm (micrometros), con cerca de 72000 niveles de
energía y 102000 líneas, 40000 de las cuales tienen probabilidades de transición listada.
Enzyme Structures Database
Link: http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/enzymes/
Entidades administradoras: Roman Laskowski, Gail Hutchinson, Alex Michie, Andrew
Wallace, Martin Jones, Andrew Martin, Nick Luscombe, Duncan Milburn, Atsushi Kasuya y
Janet Thornton. Colegio Universitario London.
12
Bases
de
Datos
Descripción: Base de datos sobre estructuras de enzimas conocidas depositadas en el Protein
Data Bank (PDB). Ofrece una imagen de cada estructura macromolecular depositada en el PDB y
proporciona diagramas esquemáticos de las moléculas en cada estructura y de las interacciones
entre ellas. Las estructuras de las enzimas son clasificadas por su número E.C.
Medline
Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed
Entidad administradora: Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos.
Descripción: Base de datos bibliográfica más importante de la NLM en las áreas de medicina,
enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. Representa la versión
automatizada de tres índices impresos: Index Medicus, Index to Dental Literature e International
Nursing Index, y reúne referencias bibliográficas de artículos publicados en más de 4.500 revistas
médicas.
REBASE The Restriction Enzyme Database
Link: http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html
Entidades administradoras: Richard Roberts y Dana Macelis.
Descripción: Colección de información sobre enzimas de restricción, metilasas, microorganismos
de los cuales han sido aisladas, secuencias de reconocimiento, sitios de reconocimiento, especificidad de metilación, disponibilidad comercial de las enzimas y proteínas relacionadas. Incluye
referencias publicadas y no publicadas, datos de secuencias, entre otros.
Bases DE
DATOS
13
BodyMap
Link: http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/
Entidades administradoras: T. Yamada, H. Nikaidou, J. Sese, A. Nakaya y S. Morishita.
Descripción: Banco de datos sobre información de expresión genética humana y en ratones,
reciente o conocida, en varios tipos de tejidos o de células. La primera generación del mapa fue
creada por una secuencia aleatoria de clones en 3 bibliotecas dirigidas de cDNA.
Computer Retrieval of Information on Scientific Projects
Link: http://crisp.cit.nih.gov/
Entidad administradora: Instituto Nacional de Salud.
Descripción: Base de datos cuya interfaz de usuario permite el acceso a resúmenes de conceptos
científicos, tendencias y técnicas emergentes, proyectos y/o investigadores específicos.
Scientific Publications
Link: http://www.affymetrix.com/community/publications/index.affx
Entidad administradora: Affymetrix.
14
Bases
de
Datos
Descripción: Base de datos con acceso a 4207 resúmenes de publicaciones científicas que
utilizan la tecnología GeneChip® (microarreglos y herramientas de alta densidad para ayudar a
procesar y analizar pequeños fragmentos de ADN) y publicaciones relevantes de acuerdo al interés
investigativo.
Bases DE
DATOS
15
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Química
Periodic Table of the Elements
Link: http://periodic.lanl.gov/
Entidad administradora: División de Química. Laboratorio Nacional de Los Alamos.
An Online, Interactive Periodic Table of the Elements
Link: http://www.chemicalelements.com/
Entidad administradora: Yinon Bentor.
Tabla Periódica Lenntech
Link: http://www.lenntech.com/espanol/tabla-periodica.htm
Entidad administradora: Lenntech.
Tabla Periódica De Los Elementos (Behude)
Link: http://www.prodigyweb.net.mx/degcorp/Quimica/Tabla_Periodica.htm
Entidades administradoras: Humberto Brambila, Bernardo Maya y Derek Estrada.
17
Química
A Visual Interpretation of the Table of Elements
Link: http://www.Chemsoc.Org/Viselements/
Entidad administradora: David Watson. Universidad de Strathclyde.
Webelements™ Periodic Table
Link: http://www.webelements.com/
Entidad administradora: Mark Winter. Universidad de Sheffield.
The Pictorial Periodic Table
Link: http://chemlab.pc.maricopa.edu/periodic/periodic.html
Entidad administradora: Chris Heilman.
Periodic Table
Link: http://www.chemicool.com/
Entidad administradora: David Hsu. Instituto de Tecnología de Massachusetts.
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The Wooden Periodic Table
Link: http://www.theodoregray.com/PeriodicTable/
Entidad administradora: Theodore Gray.
Genesis education: modeling the periodic table interactive simulation
Link: http://www.genesismission.org/educate/scimodule/cosmic/ptable.html
Entidad administradora: Instituto de Tecnología de California.
Periodic Library
Link: http://www.orbit.org/perlib/
Entidad administradora: Bolean Dream Inc.
Journal of the American Chemical Society
Link: http://pubs.acs.org/journals/jacsat/index.html
Entidad administradora: Sociedad Americana de Química.
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Química
Descripción: Esta revista realiza publicaciones de artículos, comunicaciones al editor, revisiones
de libros, y revisiones de software en todos los campos de la química. Facilita acceso a resúmenes y textos completos de artículos y publicaciones.
The Journal of Organic Chemistry
Link: http://pubs.acs.org/journals/joceah/
Entidad administradora: Sociedad Americana de Química.
Descripción: Posee contribuciones originales de investigación fundamental en todas las áreas de
la teoría y práctica de la química orgánica y bio-orgánica. JOC ofrece artículos completos y notas,
así como mini-revisiones y contribuciones.
Chemistry Magazine
Link: http://www.chemistry.org/portal/a/c/s/1/acsdisplay.html?DOC=Chemistry%5cindex.html
Entidad administradora: Sociedad Americana de Química.
Descripción: Chemistry es un diario en línea creado para todo público interesado en las ciencias
químicas y la Sociedad Americana de Química. Proporciona acceso a los artículos publicados en
un archivo PDF.
Kinetics Database
Link: http://kinetics.nist.gov/
Entidad administradora: Instituto Nacional de Estándares y Tecnología.
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Descripción: Incluye esencialmente todos los resultados sobre cinética reportados para las
reacciones químicas. Está diseñada para realizar búsquedas sobre datos de cinética basada en los
reactivos específicos involucrados, datos de reacciones resultantes de productos especificados,
información de todas las reacciones de una especie particular, o una combinación de éstas.
Compendium of Pesticide Common Names
Link: http://www.hclrss.demon.co.uk/
Entidad administradora: Alan Word.
Descripción: Este compendio contiene todos los nombres estándar aprobados por la ISO para los
pesticidas químicos, así como aquellos nombres aprobados por entidades nacionales e internacionales para pesticidas sin nombres estándar. Más de 1000 de estos nombres oficiales de
pesticidas han sido asignados por la Organización Internacional de Estandarización (ISO), en
acuerdo con un sistema establecido de nomenclatura.
Molecular Logic
Link: http://molo.concord.org/database/
Entidad administradora: Fundación Nacional de Ciencia (NSF).
Descripción: Facilita acceso a las actividades basadas en sus modelos computacionales atómicos y moleculares. Estas actividades son parcialmente derivadas de proyectos del Concord
Consortium patrocinados por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF). Los modelos son principalmente de interacciones de átomos y moléculas, o basados en reglas genéticas.
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Química
Honors Chemistry Experiments
Link: http://www.chemtopics.com/hlarchiv.htm
Entidad administradora: Steve Marsden.
Descripción: Contiene información sobre distintos experimentos en el área de química, incluyendo procedimientos y explicación detallada de cada actividad.
Virtual Experiments
Link: http://neon.chem.ox.ac.uk/vrchemistry/
Entidad administradora: Departamento de Química. Universidad de Oxford.
Descripción: Laboratorio de simulación tridimensional para la enseñanza de química. Este
laboratorio es modelado utilizando técnicas de realidad virtual para la enseñanza de la química y
contiene experimentos interactivos en multimedia.
The Chemistry Collective
Link: http://www.chemcollective.org/applets/vlab.php
Entidad administradora: David Yaron. Departamento de Química. Universidad Carnegie Mellon.
Descripción: Chemistry Collective inicia con el proyecto de Laboratorio Virtual IrYdium cuyo
objetivo principal es la simulación flexible con fines educativos. El proyecto evoluciona para crear
un escenario de enseñanza de actividades para proveer interactividad, incluyendo materiales con
enlaces a conceptos químicos.
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The Reactor Lab
Link: http://reactorlab.net/
Entidad administradora: Richard Herz. Universidad de California.
Descripción: Este software proporciona simulaciones de una gran variedad de reactivos químicos. Permite aprender activamente acerca de los reactivos y reacciones químicas a través del
desarrollo de experimentos y análisis de datos.
Chemsketch
Link: http://www.acdlabs.com/products/chem_dsn_lab/chemsketch/
Entidad administradora: Advanced Chemistry Development, Inc. (ACD/Labs).
Descripción: Permite dibujar moléculas en dos dimensiones y transformarlas en 3D, construir
ecuaciones químicas, estructuras moleculares y diagramas de laboratorio. Adecuado para poder
crear moléculas de compuestos orgánicos, experimentar con algunos instrumentos de laboratorio,
resolver ejercicios, visualizar u ocultar enlaces y manipular estructuras de Newman escalonadas
y eclipsadas.
RasMol
Link: http://openrasmol.org/
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Química
Entidad administradora: Roger Sayle.
Descripción: Permite visualizar imágenes difíciles de dibujar por ser muy complejas, tales como
estructuras de ADN y de proteínas. Proporciona diversos diseños de presentación de moléculas
(barras de enlace, barras y esferas, modelo compacto) y permite ver, rotar y animar moléculas y
cristales. Admite los formatos moleculares más extendidos: pdb, mol, mdl y xyz, con objeto de
ampliar las posibilidades de obtener moléculas listas para visualizar disponibles en Internet.
Chime
Link: http://www.mdlchime.com/downloads/downloadable/index.jsp
Entidad administradora: MDL ISIS (Sistema de Información Científico Integrado).
Descripción: Este módulo de programa (plug-in) ofrece la posibilidad de manipular representaciones tridimensionales en los navegadores Internet Explorer y Netscape. Su instalación habilita
el navegador para trabajar con archivos de moléculas en formato PDB y permite realizar cambios
en la forma de visualización de la molécula, color, activar o desactivar la rotación y rotular los
átomos.
Protein Explorer
Link: http://proteinexplorer.org/
Entidades administradoras: Fundación Nacional de Ciencia y la Universidad de Massachusetts.
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Descripción: Programa derivado de RasMol y basado en el plug-in Chime para Netscape. Permite
investigar la estructura de macromoléculas y su relación con la función que cumplen, visualizar en
tres dimensiones estructuras de proteínas, ADN y macromoléculas, y visualizar interacciones y
enlaces.
3-D Angles
Links: http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html
Entidad administradora: Stephen Schimpf.
Descripción: Visualizador de estructuras tridimensionales muy fácil de utilizar; ideal para exponer
temas como la hibridación debido a la fácil representación de moléculas tridimensionales de
compuestos orgánicos.
Crystalline Solids
Link: http://www.molsci.ucla.edu/pub/explorations.html
Entidad administradora: Stephen Schimpf.
Descripción: Proporciona modelos tridimensionales de estructuras cristalinas fundamentales
fácilmente manejables. Es posible dar vuelta o rotar las células de la unidad de cualquiera de las
catorce estructuras de las redes de Bravis.
25
Química
The Molecule of the Month
Link: http://www.chm.bris.ac.uk/motm/motm.htm
Entidad administradora: Paul May. Universidad de Bristol.
Descripción: Cada mes una nueva molécula es agregada a la página, en la cual son encontrados
varios enlaces que conducen al sitio Web del Departamento de Química de la Universidad o a sitios
comerciales en cualquier lugar del mundo, donde pueda ser hallada información sobre la molécula
agregada.
ArgusLab
Link: http://www.planaria-software.com/
Entidad administradora: Mark Thompson. Planaria Software LLC.
Descripción: ArgusLab es un programa de modelación molecular. Consiste en una interfaz de
usuario con soporte para visualización de gráficas OpenGL de estructuras de moléculas y realización de cálculos de mecánica cuántica utilizando el servidor Argus.
Yasara (Yet Another Scientific Artificial Reality Application)
Link: http://www.yasara.org/
Entidades administradoras: Gregor Högenauer, Günther Koraimann, Andreas Kungl y Gert Vriend.
Universidad de Graz, Universidad de Nijmegen.
26
Descripción: Programa de modelación y simulación interactiva en tiempo real con campos de
fuerza sumamente exactos de gráficas moleculares, interfaz de usuario intuitiva, gráficas fotorealísticas, visualizaciones y dispositivos de entrada con nuevos niveles de interacción de “realidad
artificial”. Puede interactuar con las moléculas y trabajar con modelos dinámicos en vez de imágenes estáticas. Requiere licencia para garantizar nuevos desarrollos, actualizaciones y soporte.
Tinker (Software Tools for Molecular Design)
Link: http://dasher.wustl.edu/tinker/
Entidades administradoras: Fundación Nacional de Ciencia y el Instituto Nacional de Salud.
Descripción: Software de modelación molecular para mecánicas y dinámicas moleculares, con
algunas características especiales para biopolímeros. Posee la habilidad de utilizar cualquiera de
varios grupos de parámetros comunes, como Amber (ff94, ff96, ff98 y ff99), CHARMM (19 y 27),
Allinger MM (MM2-1991 y MM3-2000), OPLS (OPLS-UA, OPLS-AA y OPLS-AA/L), potenciales
polarizables de Liam Dang y su propio campo de fuerza atómico polarizable multipolo AMOEBA.
Oscail X - Software for Crystallography and Molecular Modelling
Link: http://www.nuigalway.ie/cryst/software.htm
Entidad administradora: Universidad Nacional de Ireland.
Descripción: Este software proporciona un sistema integrado de alta calidad para la construcción
y modelación de moléculas, maneja PC GAMESS y Tinker, y puede resolver, refinar y examinar
pequeñas estructuras de moléculas de cristal. Las películas son efectivas y fáciles de hacer
utilizando RASMOV. El software para la simulación de la pauta de Powder y la detección y
visualización de vacíos también está disponible.
27
Química
JMOL
Link: http://jmol.sourceforge.net/
Entidad administradora: Warren DeLano.
Descripción: Proporciona un conjunto de aplicaciones y visores moleculares. Jmol es un visor de
moléculas multiplataforma. JmolApplet es una miniaplicación para el navegador que puede integrarse en páginas Web. La aplicación Jmol es un programa autónomo en Java que funciona localmente en el ordenador, fuera del navegador. JmolViewer es un conjunto de herramientas de desarrollo que se puede integrar en otros programas Java.
Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com
Link: http://www.3dchem.com/index.asp#
Entidad administradora: Karl Harrison. Universidad de Oxford.
Descripción: Base de datos de estructuras 3D de más de 400 moléculas activas. Permite
visualizar las estructuras de pequeñas moléculas, medicamentos, enzimas biológicas, proteínas,
ADN, virus en ilustraciones 3D interactivas. Utiliza la tecnología Java de JMOL para mostrar los
modelos.
JME Molecular Editor
Link: http://www.molinspiration.com/jme/index.html
28
Entidad administradora: Peter Ertl.
Descripción: JME Molecular Editor proporciona herramientas para dibujar o editar moléculas y
reacciones y para representar moléculas directamente dentro de una página HTML. El applet
puede ser obtenido libremente directamente de su autor a través del correo electrónico.
3D Analysis :: Mage Display Software
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/mage.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Programa de vectores 3D para visualización de gráficas tipo "kinemage" utilizado en
diversas aplicaciones como evaluaciones de calidad de modelos cristalográficos de rayos X. Mage
visualiza de forma 3D las relaciones entre los datos en un ambiente interactivo permitiendo la
exploración abierta y presentación estructurada.
JavaMage
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/javamage.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Herramienta en Java disponible para visualizar gráficas de tipo “kinemage” a través
de Internet.
29
Química
King
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/king.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: King es un sistema interactivo para gráficas de vector tridimensionales. Soporta un
grupo primitivo para muchos tipos de gráficos, diagramas, y otras ilustraciones; además su primer
uso era mostrar estructuras macromoleculares para investigación biofísica.
Prekin
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/prekin.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Prekin prepara kinemages moleculares (archivos de entrada para Mage y King) de
archivos en formato PDB coordinados, utilizando opciones de scripts de construcción o
especificaciones flexibles del usuario.
Reduce
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/reduce.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
30
Descripción: Reduce es un programa para agregar hidrógenos a un archivo de estructura de proteína del Protein DataBank (PDB). Tanto proteínas como ácidos nucleicos pueden ser procesados,
al igual que los grupos HET mientras la conectividad del átomo sea proporcionada.
Probe
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Permite la evaluación de paquetes atómicos, dentro o entre las moléculas. Genera
“puntos de contacto” donde los átomos están en contacto cercano. Probe lee las coordenadas
atómicas de los archivos del Protein Databank (PDB) y escribe una lista de puntos para inclusión en
un archivo de tipo kinemage. Alternativamente, la información almacenada puede ser cuantificada
y visualizada en una tabla para interacciones de van der Waals, H-bonds y superposiciones
atómicas ("choques").
Contouring Programs
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/kincon.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Kin2Dcont y Kin3Dcont lee listas de valores o coordenadas para producir planos
acotados en formato kinemage. Tanto los datos dispersos como los datos uniformes pueden ser
acotados. Kin2Dcont puede incluso ser usado para producir acotaciones en formato PostScript.
31
Química
Dang
Link: http://kinemage.biochem.duke.edu/software/dang.php
Entidad administradora: Richardson Lab.
Descripción: Dang lee coordenadas de archivos de estructuras moleculares del Protein DataBank
(PDB) y genera una tabla de varias medidas geométricas útiles para cada residuo o base. En su
forma básica, genera ángulos diedrales (phi, psi, chi) de ahí su nombre.
Swiss-PdbViewer
Link: http://www.expasy.ch/spdbv/mainpage.html
Entidades administradoras: GlaxoSmithKline R&D y el Instituto de Bioinformática Swiss.
Descripción: Esta aplicación permite analizar varias proteínas al mismo tiempo. Estas pueden ser
superpuestas con el objeto de deducir alineamientos estructurales y comparar sus sitios activos y
otras partes relevantes. Mutaciones de aminoácidos, enlaces H, ángulos y distancias entre los
átomos son fáciles de obtener gracias a la interfaz de menú y gráficas intuitiva.
Cells Alive!
Link: http://www.cellsalive.com/
Entidad administradora: James Sullivan. Quill Graphics.
32
Analytical Abstracts
Link: http://www.rsc.org/Publishing/CurrentAwareness/AA/index.asp
Entidad administradora: Sociedad Real de Química.
Descripción: Cerca de 1.400 resúmenes son incluidos mensualmente. Incluye las áreas de
cromatografía, electroforesis, espectrometría y métodos radioquímicos; análisis inorgánico, orgánico y organometálico; análisis clínico y bioquímico, incluyendo genómica y proteómica; análisis
farmacéutico, incluyendo medicamentos y fluidos biológicos; y análisis ambiental, agrícola y de
alimentos.
Spectral Database for Organic Compounds SDBS
Link: http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/cgi-bin/direct_frame_top.cgi?lang=eng
Entidad administradora: Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada de Japón.
Descripción: Compendio de datos de caracterización comunes para más de 10000 compuestos.
La estructura del compuesto, el espectro 1H NMR (resonancia magnética nuclear), 13C NMR y el
espectro de masas pueden ser visualizados al especificar el nombre del compuesto, fórmula
molecular o número de registro CAS.
ThermoDex
Link: http://www.lib.utexas.edu/thermodex/
33
Química
Entidad administradora: Universidad de Texas.
Descripción: Registro de datos termoquímicos y termofísicos para compuestos químicos y otras
sustancias. ThermoDex proporciona una lista de manuales con información sobre los compuestos
y propiedades seleccionadas en la página principal.
Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Structure Index
Link: http://ois.nist.gov/pah/
Entidad administradora: Instituto Nacional de Estándar y Tecnología.
Descripción: Herramienta de ayuda en la identificación de las estructuras químicas y nomenclatura de 660 hidrocarburos aromáticos policíclicos comunes (PAH). La búsqueda puede realizarse por nombre y/o peso molecular del compuesto. Las estructuras pueden ser descargadas en
formatos metafile o molfile.
Abinit
Link: http://www.abinit.org/
Entidad administradora: Grupo ABINIT.
Descripción: Permite encontrar la energía total, densidad de carga y estructura electrónica de
sistemas compuestos de electrones dentro de la Teoría Funcional de Densidad (DFT). Permite
optimizar la geometría de acuerdo con las fuerzas DFT, desarrollar simulaciones moleculares
dinámicas utilizando estas fuerzas, o generar matrices dinámicas, cargas efectivas de Born y
tensores dieléctricos, entre otros cálculos.
34
Cafun
Link: http://www.cafun.de/
Entidad administradora: André Homeyer.
Descripción: Cafun permite crear simulaciones de sistemas complejos de una forma sencilla.
Cafun es utilizado por estudiantes e investigadores en procesos de prueba de teorías o visualización de sistemas complejos para una mejor comprensión.
ChemCraft
Link: http://www.chemcraftprog.com/
Entidades administradoras: Grigoriy Zhurko y Denis Zhurko.
Descripción: ChemCraft es un software gráfico para desarrollos computacionales en química
cuántica y una interfaz gráfica de usuario para los paquetes de software Gamess y Gaussian,
permitiendo importar/exportar coordenadas de los átomos en formato texto. Software comercial
con limitaciones en versión libre.
Program DynaFit
Link: http://www.biokin.com/dynafit/
Entidad administradora: BioKin Ltd.
Descripción: El propósito principal del programa DynaFit es desarrollar regresiones no lineales de
cinética química, cinética enzimática y datos de enlace ligando receptor. Los datos experimentales
pueden ser velocidades iniciales de reacción o curvas de progreso de reacciones.
35
Química
Modeller
Link: http://salilab.org/modeller/modeller.html
Entidad administradora: Ben Webb. Universidad de California.
Descripción: Modeller es usado para homología o modelación comparativa de estructuras tridimensionales de proteínas. El usuario proporciona un alineamiento de una secuencia para ser
modelado con las estructuras relacionadas conocidas y Modeller calcula automáticamente un
modelo que contenga todos los átomos no hidrogenados.
PLATON
Link: http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/
Entidad administradora: Ton Spek.
Descripción: Platon es una herramienta cristalográfica versátil que implementa una gran variedad
de cálculos geométricos estándar, pruebas, utilidades, gráficas y varios filtros, y la opción
SQUEEZE para manejo de solventes.
PyMOL
Link: http://pymol.sourceforge.net/
Entidad administradora: DeLano Scientific LLC.
Descripción: PyMOL es un sistema gráfico molecular diseñado para la visualización en tiempo real
de generación de gráficas moleculares y animaciones de alta calidad. También puede desarrollar
muchas otras tareas como la edición de archivos PDB, con fines de apoyo en los procesos de
investigación.
36
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
American Chemical Society Publications: Biochemistry Home Page
Link: http://pubs.acs.org/journals/bichaw/
Entidad administradora: Sociedad Americana de Química.
Descripción: Proporciona los últimos progresos y avances en las áreas de química, bioquímica y
biología molecular y celular. Incluye estructura, función y regulación de moléculas biológicamente
activas; estructura y expresión del gen; mecanismos bioquímicos; biosíntesis de proteínas; plegamiento de proteínas; relaciones estructura-función de la membrana; bioenergética; e inmunoquímica.
The Journal of Biological Chemistry
Link: http://www.jbc.org/
Entidad administradora: Sociedad Americana para la Bioquímica y Biología Molecular.
Descripción: Es publicado semanalmente para un total de 55000 páginas por año de reportes
investigativos originales en bioquímica y biología molecular. Proporciona acceso a resúmenes y
textos completos de publicaciones.
Journal of Lipid Research
Link: http://www.jlr.org/
Entidad administradora: Sociedad Americana para la Bioquímica y Biología Molecular.
38
bio
química
Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto completo) con el objeto de promover la investigación básica en el campo de los lípidos. JLR publica
artículos originales y revisiones en toda el área de lípidos biológicos, incluyendo aquellos relacionados con bioquímica, biología molecular, biología estructural, biología celular, medicina molecular, y metabolismo.
Kegg Ligand Database
Link: http://www.genome.ad.jp/dbget/ligand.html
Entidad administradora: Kanehisa Laboratorio de Kyoto. Universidad Centro de Bioinformática.
Descripción: Contiene información sobre las sustancias químicas y sus reacciones. Es un banco
de datos resultante de la unión de las bases de datos Compound, Drug, Glycan, Reaction, Rpair y
Enzyme. Una copia de sólo lectura de la base de datos relacional es públicamente accesible.
AARS DataBase
Link: http://rose.man.poznan.pl/aars/
Entidades administradoras: Maciej Szymanski y Jan Barciszewski de Poznañ. Centro de
Supercomputación y Redes en Polonia.
Descripción: Base de datos de secuencias de aminoacil-tRNA sintetasa. Las entradas obtenidas
están basadas en el formato EMBL/Swiss-Prot. En adición a las secuencias de aminoácidos,
incluyen el nombre y número de acceso de la secuencia Swiss-Prot, una corta descripción de la
secuencia, nombre del organismo y su clasificación taxonómica, así como la información
bibliográfica básica.
39
Brenda
Link: http://brenda.bc.uni-koeln.de/
Entidad administradora: Instituto de Bioquímica. Universidad de Cologne.
Descripción: Colección de datos sobre enzimas disponible para la comunidad científica. Permite
hacer búsquedas por número EC, nombre de la enzima, organismo, o combinación de éstos. Ha
sido desarrollada en una red de sistemas de información metabólicos con enlaces a la expresión de
enzimas e información de regulación. Disponible libremente para académicos; el uso comercial
requiere licencia.
Catalytic Site Atlas
Link: http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/
Entidad administradora: Instituto de Bioinformática Europeo (EBI).
Descripción: Base de datos de sitios activos de enzimas y residuos catalíticos en enzimas de
estructura 3D. El acceso a CSA es utilizando códigos PDB, entradas SWISS-PROT o número EC.
Cada entrada lista los residuos catalíticos encontrados, utilizando la numeración PDB de residuos,
y cada sitio activo puede ser visualizado utilizando RasMol.
Genome Atlas Database
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/GenomeAtlas/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
40
bio
química
Descripción: Atlas de estructuras de ADN para cromosomas y genomas completos. Representa
un almacenamiento dinámico para resultados de bioinformática y datos de secuencia.
EasyGene 1.0 Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/EasyGene/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Proporciona una lista de genes predichos dada una secuencia de ADN procariótica.
El usuario sólo necesita especificar el organismo que recibe la secuencia buscada.
HMMgene (v. 1.1)
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/
Entidad administradora: Centro para el Análisis de Secuencias Biológicas.
Descripción: Puede predecir varios genes completos o parciales en una secuencia y sitios de
acoplamiento. Si algunas de las características de una secuencia son conocidas, tales como
proteínas o elementos repetidos, el programa encontrará la mejor estructura génica bajo estas
limitaciones.
NetGene2 Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/NetGene2/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Este servidor genera predicciones a través de redes neuronales de los sitios de
acoplamiento de ADN en humanos, C. elegans y A. thaliana.
41
NetPlantGene Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPGene/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Servidor de predicciones mediante redes neuronales de los sitios de acoplamiento
en el ADN de Arabidopsis thaliana.
NetStart 1.0
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/NetStart/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Genera predicciones en redes neuronales del comienzo de la traducción de las
secuencias de nucleótidos en vertebrados y Arabidopsis thaliana. NetStart ha sido entrenado en
secuencias de cDNA y por lo tanto, tiene mejor desempeño para cDNA y EST.
Promoter 2.0 Prediction Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predice los sitios de inicio de transcripción de promotores de vertebrados PoIII en
secuencias de ADN. Ha sido desarrollado como una evolución de factores de transcripción
simulados que interactúan con secuencias en regiones de promotores. Está construido sobre principios comunes a las redes neuronales y algoritmos genéticos.
GenePublisher 1.03 Serverr
42
bio
química
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/GenePublisher/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Desempeña análisis de datos automatizado de expresiones génicas en un número
diferente de plataformas. Este servidor acepta tablas de genes o archivos Affymetrix CEL como
entrada, desarrolla análisis numérico y estadístico, enlaces de los resultados a varias bases de
datos, y genera un reporte de los resultados.
OligoWiz 2 Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/OligoWiz2/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Este servidor realiza un diseño inteligente de oligonucleótidos para microarreglos de
ADN. Es implementado como una solución cliente-servidor, lo cual consiste en un fácil uso de la
Interfaz Gráfica de Usuario (escrita en Java) que delega las operaciones computacionales intensivas a poderosos servidores Multi-CPU ubicados en el Centro para Análisis de Secuencias
Biológicas. Es necesario descargar la interfaz.
SecretomeP 2.0 Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/SecretomeP/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predicción de secreciones de proteínas no clásicas. SecretomeP 2.0 produce
predicciones ab initio. El método busca un largo número de otros servidores de predicción característicos para obtener información en varios aspectos de la proteína, los cuales están integrados
en la predicción final de secreción.
43
TargetP 1.1 Server
Link: http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/
Entidades administradoras: Fundación de Investigación y Centro para Computación Científica
Danés.
Descripción: Predice la localización subcelular de proteínas eucarióticas. La asignación de la
localización es basada en la predicción de la presencia de cualquiera de las pre-secuencias Nterminales: (cTP), (mTP) o (SP).
AbCheck - Antibody Sequence Test
Link: http://www.bioinf.org.uk/abs/seqtest.html
Entidad administradora: Andrew Martin. Universidad College London.
Descripción: Esta página permite poner a prueba una secuencia de anticuerpo contra la base de
datos de secuencias Kabat. Esto facilita la identificación de potenciales tecnologías de clonación y
errores de secuenciación.
123Genomics
Link: http://www.123genomics.com/
Entidad administradora: Grupo 123Genomics.
Descripción: Este sitio posee enlaces a muchos recursos disponibles en Internet gratuitamente
relacionados con genómica y bioinformática. Dentro de las categorías encontradas están Análisis
de Secuencias, Bases de Datos de Secuencias, Genes y Proteínas, Revistas y Publicaciones, entre
otras.
CATH
44
bio
química
Link: http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/cath.html
Entidad administradora: Universidad College London.
Descripción: Esta base de datos proporciona clasificación jerárquica de dominios de estructuras
de proteínas en el banco de datos de proteínas Brookhaven. CATH es una nueva clasificación
jerárquica de dominios de estructuras de proteínas, con cuatro niveles principales, Class (C),
Architecture (A), Topology (T) y Homologous superfamily (H).
ProDom
Link: http://protein.toulouse.inra.fr/prodom/current/html/form.php
Entidad administradora: INRA y CNRS.
Descripción: Completo grupo de dominios de familias de proteínas automáticamente generados
de una comparación global de todas las bases de datos de secuencias de proteínas disponibles.
Gepasi
Link: http://www.gepasi.org/
Entidades administradoras: Instituto de Bioinformática de Virginia y el Grupo de Biología
Cuantitativa y Biotecnología Analítica Aberystwyth.
Descripción: Gepasi es un paquete de software para la modelación de sistemas bioquímicos.
Realizar simulación de cinética de sistemas de reacciones bioquímicas y proporciona un número
de herramientas para colocar los modelos en datos, optimizar cualquier función del modelo,
desarrollar análisis de control metabólico y análisis de estabilidad lineal.
45
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
adÍstica
est
Dataplot
Link: http://www.itl.nist.gov/div898/software/dataplot/
Entidades administradoras: James Filliben y Alan Heckert. Instituto Nacional de Estándares y
Tecnología.
Descripción: Software para visualización científica, análisis estadístico, y modelación no lineal.
Permite dibujar gráficos 2D, 3D, histogramas, símbolos geométricos y eléctricos, diagramas
lógicos, análisis de series de tiempo, cálculos estadísticos y de probabilidad, generación aleatoria
de números y simulación, entre otros.
EpiInfo
Link: http://www.cdc.gov/epiinfo/index.htm
Entidades administradoras: Epi Info™ Helpdesk y el Centro para Control de Enfermedades y
Prevención de Atlanta.
Descripción: Software de dominio público diseñado para la comunidad mundial de científicos del
área de la salud, epidemiología y medicina. Permite desarrollar rápidamente cuestionarios o
formas, modificar procesos e ingreso de datos, e incorporar y analizar datos con estadísticas epidemiológicas, mapas y gráficos.
AM Statistical Software
47
adÍstica
est
Link: http://am.air.org/default.asp
Entidad administradora: Instituto Americano para la Investigación.
Descripción: Software estadístico que permite analizar datos de muestras complejas,
especialmente de mediciones a gran escala. AM proporciona automáticamente errores estándar
para las muestras utilizando series de Taylor como método de aproximación, gráficos de barras y
líneas, y diagramas de densidad diseñados para comparar distribuciones, entre otros.
ADE4 2004 Assessment
Link: http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4.html
Entidades administradoras: Jean Thioulouse, Daniel Chessel y Sylvain Dolédec. Ministerio de
Ambiente Francés y CNRS.
Descripción: Software estadístico para análisis multivariable y generación de gráficas. Incluye
métodos de análisis espacial de datos, análisis de discriminación y de grupos, métodos de regresión lineal incluyendo regresión polinomial, múltiple y regresión ortogonal, métodos de proyección, entre otros.
Engineering Statistics
Link: http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/
Entidad administradora: NIST / SEMATECH.
48
Descripción: Este libro proporciona ayuda a científicos e ingenieros en el proceso de incorporar
métodos estadísticos en su trabajo de la forma más eficiente posible.
MicrOsiris Statistical and Data Management Software
Link: http://www.microsiris.com/MicrOsiris.htm
Entidad administradora: Van Eck Computer Consulting.
Descripción: Paquete para el manejo de datos y estadísticas. Incluye análisis multivariable de
datos nominales, genera distribuciones de frecuencia univariadas y bivariadas y estadísticas
relacionadas (incluyendo lambdas, gammas, kappa, taus, chi-cuadrado, y coeficientes Gini), estadísticas no paramétricas, análisis de varianza, y análisis de clasificación múltiple (regresión
múltiple utilizando predoctores categóricos).
The Decision Tree for Statistics
Link: http://www.microsiris.com/Statistical%20Decision%20Tree/
Entidad administradora: Van Eck Computer Consulting.
Descripción: Herramienta de ayuda para seleccionar técnicas estadísticas apropiadas para los
propósitos y condiciones de un análisis particular. Es una colección interactiva de páginas Web, la
cual realiza una serie de preguntas simples acerca de los datos (número de variables, escala de
medida, entre otros) y luego presenta recomendaciones sobre la mejor técnica de aplicación.
Selecting Statistics
49
adÍstica
est
Link: http://www.socialresearchmethods.net/selstat/ssstart.htm
Entidad administradora: William Trochim. Universidad Cornell.
Descripción: Colección de páginas Web interactivas de ayuda para seleccionar el mejor método
analítico sobre los datos. El resultado obtenido de una búsqueda es un examen estadístico o una
medida estadística para la situación descrita, proporcionando notas cuando es relevante, y usualmente sugiere un programa estadístico que puede ser utilizado para realizar el análisis.
A Collection of Javascript E-Labs Learning Objects
Link: http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/scientificCal.htm#rmenu
Entidad administradora: Hossein Arsham.
Descripción: Este sitio es una parte de los objetos de aprendizaje del JavaScript E-labs para la
toma de decisiones. En el menú principal son presentadas varias áreas de aplicación: Herramientas de decisión en Economía & Finanzas, Modelación Probabilística y Estadística.
Electronic Textbook Statsoft
Link: http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html
Entidad administradora: StatSoft R&D.
Descripción: Ofrece entrenamiento en la comprensión y aplicación de la estadística, incluyendo
investigación de laboratorio (biomédica, agricultura, entre otros), estadística de negocios, estadística para ciencias sociales, minería de datos, ingeniería y control de calidad de aplicaciones, y
muchas otras. Presenta una introducción a los elementos conceptuales relevantes y continúa con
una exploración más profunda de áreas específicas de estadística y organizadas por módulos.
50
Interstat
Link: http://interstat.statjournals.net/
Entidad administradora: Richard Krutchkoff. Instituto Politécnico de Virginia.
Descripción: InterStat es una fuente libre de artículos sobre estadísticas. Pueden ser publicados
artículos referentes a cualquier aspecto de investigación estadística o métodos innovadores.
[B/D] The Bayes Linear Programming Language
Link: http://fourier.dur.ac.uk:8000/stats/bd/
Entidades administradoras: David Wooff y Michael Goldstein. Universidad de Dirham.
Descripción: [B/D] es un lenguaje de programación interactivo. Permite realizar un completo
análisis diagnóstico y a priori de problemas de estadística lineal de Bayes.
Macanova (A Program for Statistical Analysis and Matrix Algebra)
Link: http://www.stat.umn.edu/macanova/
Entidades administradoras: Gary Oehlert y Christopher Bingham. Universidad de Minnesota.
Descripción: MacAnova es un programa libre para realizar análisis estadístico interactivo. Es
particularmente fuerte en (M) ANOVA y modelos lineales e incluye por lo menos ocho archivos de
macros para realizar análisis multivariable, análisis de series de tiempo para dominios de tiempo y
frecuencia, y diseño de experimentos factoriales, entre muchas otras cosas.
Statistical Calculators
Link: http://calculators.stat.ucla.edu/
Entidad administradora: Departamento de Estadística. Universidad de California.
51
adÍstica
est
Descripción: Contiene herramientas para realizar cálculos para gran cantidad de funciones de
distribución de probabilidad, incluyendo Normal, Bivariada, t Student, Chi-cuadrado, Fisher F,
Poisson, Log-normal, Exponencial, Beta, Gamma, Binomial, Multinomial, Cauchy, Gumbel, Laplace, Pareto, Weibull, Triangular y Geométrica, entre otras.
Probability Distribution Functions
Link: http://members.aol.com/johnp71/pdfs.html
Entidades administradoras: John Pezzullo.
Descripción: Esta herramienta permite calcular las funciones de distribución de probabilidad y sus
inversas para cuatro de las distribuciones estadísticas más comunes.
The P-Values for the popular distributions
Link: http://home.ubalt.edu/ntsbarsh/Business-stat/otherapplets/pvalues.htm#rbetaden
Entidad administradora: Hossein Arsham.
Descripción: Presenta programas en JavaScript que calculan los valores P para las distribuciones
más ampliamente utilizadas. Entre las funciones evaluadas encontramos: Función de Densidad,
Función Total Binomial, Densidad de Chi-cuadrado, Densidad Exponencial, Densidad F de Fisher, KS: Dos Muestras, Función Total de Poisson, Densidad Estándar Normal, Densidad t de Student y
Densidad Uniforme.
Journal of Statistical Software
Link: http://www.jstatsoft.org/
Entidad administradora: Jan de Leeuw. Asociación Americana de Estadística.
52
Descripción: Esta revista publica manuales, guías de usuario y otras formas de descripción de
software estadístico, ediciones especiales en asuntos de estadística computacional (editores
invitados), una edición especial anual documentando el progreso de mayores proyectos de
software estadístico, revisiones de libros en software y estadística computacional y revisiones y
comparaciones de software estadístico.
UCLA Statistics
Link: http://www.socr.ucla.edu/Applets.dir/OnlineResources.html
Entidad administradora: Ivo Dinov. Universidad de California.
Descripción: Recursos en línea de Probabilidad y Estadísticas: Calculadoras de Distribución de
Alta Precisión: Exponencial, Normal, Chi-Cuadrado, Distribución Poisson, Binomial, Normal, T de
Student y F, tablas, herramientas para procesamiento de funciones y gráficos, demostraciones
conceptuales (Applets), análisis de datos estadísticos de Tiempo Real en línea: WebStat (paquete
de software estadístico en línea para análisis de datos) y ANOVA.
INSTAT An Interactive Statistical Package
Link: http://www.rdg.ac.uk/ssc/software/instat/instat.html
Entidad administradora: Escuela de Estadística Aplicada. Universidad de Reading.
Descripción: Paquete general de estadística útil en la enseñanza de conceptos estadísticos,
además de complementar la investigación en cualquier disciplina que requiera el análisis de datos.
Incluye características que ayudan a explicar conceptos claves como intervalos de confianza
(normalmente confuso entre los usuarios).
53
adÍstica
est
LISP-STAT Information
Link: http://www.stat.uiowa.edu/~luke/xls/xlsinfo/xlsinfo.html
Entidad administradora: Luke Tierney. Universidad de Minnesota.
Descripción: Lisp-Stat es un ambiente de estadística computacional para análisis de datos,
instrucción estadística e investigación, con énfasis en uso de métodos gráficos dinámicos. Un
sistema de programación orientado a objetos es usado para implementar el sistema gráfico y
también en las representaciones básicas para los modelos estadísticos, como los modelos de
regresión lineal y no lineal y modelos lineales generalizados.
The R Project for Statistical Computing
Link: http://www.r-project.org/
Entidad administradora: John Chambers. Laboratorios Bell.
Descripción: R es un lenguaje y ambiente para computación estadística y gráfica. R proporciona
una amplia variedad de técnicas estadísticas (modelación lineal y no lineal, examen estadístico
clásico, análisis de series de tiempo, clasificación, entre otros) y gráficas. Posee gran calidad de
publicación en los diagramas generados, incluyendo símbolos matemáticos y fórmulas.
WinIDAMS
Link: http://portal.unesco.org/ci/en/ev.phpURL_ID=2070&URL_DO=DO_TOPIC&URL_SECTION
=201.html
Entidades administradoras: UNESCO en cooperación con expertos de varios países.
54
Descripción: Paquete de software para la validación, manipulación y análisis estadístico de datos.
Ofrece un amplio rango de técnicas de análisis de datos como análisis de regresión, análisis
discriminante, análisis clúster, análisis de correspondencias, tipología de segmentación e
iterativa, entre otras, componentes interactivos para la construcción de tablas multidimensionales
y su presentación gráfica, para la exploración gráfica de datos y para análisis de series de tiempo.
IRRISTAT
Link: http://www.irri.org/science/software/irristat.asp
Entidad administradora: Instituto Internacional de Investigación Rice (IRRI).
Descripción: Software para el manejo de datos y análisis estadístico básico de datos
experimentales. IRRISTAT ha sido desarrollado primariamente para el análisis de datos de campos
agrícolas, pero muchos de sus atributos pueden ser usados para el análisis de datos de otras
fuentes. Los módulos principales y facilidades son manejo de datos con hojas de cálculo, editor de
texto, análisis de varianza y Regresión y Correlación.
VISTA The Visual Statistics System
Link: http://forrest.psych.unc.edu/research/
Entidad administradora: Forrest Young. Universidad de Carolina del Norte.
Descripción: Vista proporciona visualizaciones estadísticas altamente dinámicas e interactivas.
La visualización intuitiva de Vista y el acercamiento computacional intensivo en el análisis de los
datos estadísticos son diseñados para clarificar su significado, de modo que pueda verse la
información contenida en estos datos. Posee interfaz gráfica estructurada y permite visualización
55
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est
estadística univariada y multivariada y análisis de datos.
Gretl
Link: http://gretl.sourceforge.net/
Entidades administradoras: Allin Cottrell y Riccardo Lucchetti. Universidad Wake Forest y
Universidad de Ancona.
Descripción: Es un paquete de software para análisis econométrico. Posee instrucciones
sencillas para realizar contraste de Dickey-Fuller aumentado, contraste de estabilidad estructural
de Chow, auto regresiones vectoriales o estimación de modelos ARMA. Estructura de bucles de
instrucciones para simulaciones de Monte Carlo y procedimientos de estimación iterativos.
Salstat Statistics
Link: http://salstat.sourceforge.net/index.php?index
Entidad administradora: Alan James Salmoni.
Descripción: Rápido análisis estadístico de datos científicos bajo GPL. SalStat es una aplicación
diseñada para el análisis de datos científicos: el tipo de datos comúnmente vistos en psicología,
por ejemplo. Puede realizar un rango de pruebas, desde estadística descriptiva hasta análisis de
varianza y sus equivalentes no paramétricos.
ZELIG: Everyone's Statistical Software
56
Link: http://gking.harvard.edu/zelig/
Entidades administradoras: Kosuke Imai, Gary King y Olivia Lau.
Descripción: Zelig un programa fácil de usar que puede estimar, ayudar a interpretar, y presentar
los resultados de un largo rango de métodos estadísticos.
Biostatistics
Link: http://biostatistics.oxfordjournals.org/
Entidad administradora: Universidad de Oxford.
Descripción: El objetivo de Biostatistic es el avance en las ciencias estadísticas y su aplicación en
problemas de salud humana y enfermedades. Biostatistics publica artículos que desarrollan
métodos estadísticos innovadores con aplicaciones en la comprensión de salud humana y enfermedades, incluyendo ciencias biomédicas básicas.
QuickCalcs
Link: http://www.graphpad.com/quickcalcs/index.cfm
Entidad administradora: GraphPad Software.
Descripción: Este sitio contiene libre acceso a calculadoras en líneas para cálculos de radioactividad, pruebas t, ANOVA, entre otros.
GraphPad Library
Link: http://www.graphpad.com/index.cfm?cmd=library.index
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est
Entidad administradora: GraphPad Software.
Descripción: Contiene información de ayuda sobre el análisis de datos dirigido a biólogos (y otros
científicos). Esta “biblioteca” contiene artículos y manuales escritos por GraphPad, así como enlaces a otros sitios web.
MIX
Link: http://tigger.uic.edu/~hedeker/mix.html
Entidades administradoras: Donald Hedeker y Robert Gibbons. Universidad de Illinois.
Descripción: Incluye programas para realizar regresión lineal, regresión logística para resultados
nominales u ordinales, regresión de Poisson, entre otros.
VassarStats
Link: http://faculty.vassar.edu/lowry/VassarStats.html
Entidad administradora: Richard Lowry. Vassar College.
Descripción: Contiene útiles herramientas para el desarrollo de computación estadística. Incluye
calculadoras estadísticas, herramientas para el desarrollo de regresiones múltiples, correlación
parcial, probabilidades binomiales, entre otras.
B-Course
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Link: http://b-course.cs.helsinki.fi/
Entidad administradora: Grupo de Sistemas de Computación Complejos. Universidad de Helsinki.
Descripción: B-Course es una herramienta en línea para el análisis de datos para modelación
Bayesiana, en particular dependencia y modelación de clasificación. B-Course puede ser utilizada
como una herramienta de análisis para cualquier investigación. Es de libre acceso para propósitos
educacionales.
BUGS
Link: http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/welcome.shtml
Entidades administradoras: Imperial College School of Medicine at St Mary's y University of
Helsinki.
Descripción: BUGS es un software flexible para desarrollar análisis Bayesiano de modelos
estadísticos complejos utilizando cadenas de Markov y métodos de Monte Carlo. Es necesario un
conocimiento previo de estadística Bayesiana.
GeoR
Link: http://www.est.ufpr.br/geoR/
Entidades administradoras: Paulo Ribeiro y Peter Diggle.
Descripción: Este es un paquete para análisis geoestadístico de datos utilizando el software
estadístico de libre acceso R.
59
adÍstica
est
STARS
Link: http://stars-py.sourceforge.net/
Entidad administradora: Sergio Rey. Grupo STARS.
Descripción: STARS es un paquete de libre acceso diseñado para el análisis de datos reales
tomados en un intervalo de tiempo. Une varios métodos recientes de desarrollo de análisis de espacio-tiempo en un ambiente gráfico. Es útil como herramienta para análisis exploratorio de datos.
SciGraphica
Link: http://scigraphica.sourceforge.net/
Entidad administradora: Adrian Feiguin.
Descripción: Aplicación científica para el análisis de datos y gráficas técnicas. Es algo similar a
Sigmaplot y pretende ser un clon de la aplicación comercial Microcal Origin. Es de libre acceso y
código abierto. Está disponible para plataformas Linux.
60
RECURSOS DE INTERNET
PARA CIENTÍFICOS DEL
ÁREA DE LAS CIENCIAS
QUÍMICAS Y BIOLÓGICAS
Buscadores
Entrez Pubmed
Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed
Descripción: PubMed es un servicio de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos
que incluye más de 16 millones de citaciones de artículos biomédicos de MEDLINE y otras revistas
de ciencias biológicas. PubMed incluye enlaces al resumen y texto completo de los artículos y
otros recursos relacionados.
ScienceDirect
Link: http://www.sciencedirect.com/
Descripción: Science Direct permite el acceso a resúmenes de artículos (texto completo para
usuarios registrados) de más de 1400 revistas sobre ciencia, tecnología y medicina mundial de la
editorial Elsevier Science, así como de editores asociados, y a los índices de las revistas no
suscritas. Además posee acceso a bases de datos bibliográficas y obras integradas en Science
Direct.
HighWire Press
Link: http://intl.highwire.org/
Descripción: Buscador de publicaciones científicas realizado en colaboración estrecha de
científicos, bibliotecarios y editoriales. Mediante la introducción de enlaces entre autores,
artículos y citas, capacidades de búsqueda avanzada, imágenes de alta resolución, multimedia e
interactividad, las versiones electrónicas ofrecen un notable valor añadido a la información
ofrecida en las revistas impresas.
62
Buscadores
Google Scholar
Link: http://scholar.google.com/
Descripción: Google Scholar proporciona acceso a literatura científica. Puede realizar búsquedas
sobre muchas disciplinas y fuentes: artículos revisados, tesis, libros, resúmenes y artículos académicos, de sociedades profesionales, universidades y otras organizaciones escolares. Google
Scholar identifica la información más relevante en el campo de la investigación científica.
Scirus
Link: http://www.scirus.com/srsapp/
Descripción: Scirus es el más completo buscador de ciencia en Internet. Busca sobre 200
millones de páginas de ciencia en la Web, permitiendo hallar los principales datos científicos,
escolares, técnicos y médicos, encontrar los últimos informes, artículos revisados, patentes, revistas y obtener funcionalidades únicas diseñadas para científicos e investigadores.
Cheminfo
Link: http://www.indiana.edu/~cheminfo/search.html
Descripción: CHEMINFO (Chemical Information Sources) es diseñado para buscar y enseñar
cómo utilizar recursos de información química en Internet y otros lugares. Integra sitios Web de la
Universidad de Indiana con información química significativa.
63
WWW.OJOSE.COM: Online Journals Search Engine
Link: http://www.ojose.com/
Descripción: OJOSE (Online JOurnal Search Engine) es un poderoso buscador científico que
permite hacer exploraciones en diferentes bases de datos utilizando un solo campo de búsqueda.
Es posible encontrar, descargar o comprar publicaciones científicas (revistas, artículos, reportes
de investigación, entre otros) en más de 60 bases de datos diferentes.
Sciseek
Link: http://www.sciseek.com/
Descripción: SciSeek ofrece noticias de carácter científico desde su página principal, e
indudablemente el mayor interés radica en su amplio directorio, que consta de numerosos temas y
subtemas. Los resultados del buscador incluyen la dirección de la página web, el número de votos
que ha conseguido por parte de los usuarios y los comentarios realizados por los mismos
visitantes.
Biology Browser
Link: http://www.biologybrowser.org/
Descripción: BiologyBrowser, es un sitio web desarrollado por BIOSIS. Ofrece recursos de
información sobre ciencias biológicas para la comunidad. BiologyBrowser presenta oportunidades
únicas para los científicos, como la utilización de recursos de información exclusivamente
producidos por BIOSIS y encuentra información relevante de otras fuentes y enlaces.
64
Buscadores
Chmoogle
Link: http://www.chmoogle.com/
Descripción: Chmoogle, un buscador que permite localizar productos químicos, sus propiedades
físicas e incluso su estructura, utilizando java o, en el peor de los casos, de un software específico
disponible sólo para Windows.
Chemedia
Link: http://www.chemedia.com/
Descripción: El índice temático de Chemedia es un directorio jerárquico sobre diferentes temas de
ciencia y tecnología, con aproximadamente 125000 palabras indexadas y 53000 páginas con
información relevante almacenada en la base de datos.
ChemIndustry.com
Link: http://chemindustry.com/
Descripción: ChemIndustry.com es el directorio y buscador más completo para sustancias
químicas y profesionales relacionados con la industria. La base de datos de sitios web incluye más
de 45000 industrias químicas y entidades relacionadas y contiene textos completos de millones
de páginas.
65
The Chemical Database
Link: http://ull.chemistry.uakron.edu/erd/
Descripción: Esta base de datos permite al usuario obtener información de cualquiera de los
23495 químicos peligrosos o entradas 'genéricas' basadas en la búsqueda. Las fórmulas son
presentadas en formato Hill y formato descriptivo para la visualización.
Risctox
Link: http://www.ccoo.es/istas/rs/rsrx.htm
Descripción: Risctox ofrece información toxicológica sobre productos de utilización industrial que
actualmente incluye unos 1.000 productos, para cada uno de los cuales es ofrecida la siguiente
información: descripción de las características del producto, límites de exposición, efectos
agudos y crónicos y datos sobre efectos medioambientales.
Biocrawler
Link: http://www.biocrawler.com/
Descripción: Biocrawler.com es una enciclopedia escrita con varios colaboradores. El propósito
de esta es ofrecer una enciclopedia científica comprendida en todos los niveles científicos.
66
Buscadores
Science
Link: http://www.sciencemag.org/
Descripción: Science es la revista de ciencia líder en la presentación de noticias científicas, e
investigación de vanguardia En línea están disponibles los resúmenes de sus publicaciones (textos
completos requieren suscripción).
ChemSpy.com
Link: http://www.chemspy.com/index.html
Descripción: ChemSpy.com es el primer portal para búsqueda de sustancias químicas y bases de
datos, ofreciendo información de sustancias químicas en la industria a científicos, ingenieros,
estudiantes y cualquier interesado.
Molecular and Cellular Proteomics
Link: http://www.mcponline.org/
Descripción: Publicación con libre acceso a resúmenes (requiere suscripción para texto
completo) de artículos y revisiones cortas sobre las propiedades estructurales y funcionales de las
proteínas y su expresión, particularmente con respecto al desarrollo. Hace énfasis en la
determinación de cómo la presencia o ausencia de proteínas afecta las respuestas biológicas y
cómo la interacción de proteínas con células asociadas permite su funcionamiento.
67
BIOME
Link: http://biome.ac.uk/
Descripción: BIOME es un catálogo de libre acceso de recursos de Internet seleccionados y
evaluados Internet para estudiantes, lectores e investigadores en las áreas de ciencias médicas y
de la salud, enfermería y profesiones de la salud afines, salud animal y ciencias veterinarias, investigación biológica y biomédica, el mundo natural, agricultura y alimentación.
FIZ CHEMIE Berlin Guides
Link: http://www.fiz-chemie.de/guides/
Descripción: ChemGuide y MedPharmGuide son buscadores de información en Internet en el área
de la química, medicina y farmacología. PublishersGuide es un buscador en servidores web de
publicaciones, instituciones, sociedades, etc., en las áreas de ciencia y tecnología.
E-BioSci
Link: http://e-biosci.embo.org:8080/index.jsp
Descripción: Buscador en los campos de biología molecular, y genética, con enfoque en genética
humana. La búsqueda es realizada sobre literatura, patentes, genes y proteínas.
68
Buscadores
INFOMINE
Link: http://infomine.ucr.edu/
Descripción: INFOMINE es una biblioteca virtual de herramientas de Internet relevantes para
estudiantes e investigadores. Contiene recursos de Internet útiles tales como bases de datos,
revistas electrónicas, libros electrónicos, boletines, listas de correo, artículos, directorio de investigadores, entre otros.
BioHunt
Link: http://au.expasy.org/BioHunt/
Descripción: Buscador de Biología Molecular. Permite realizar búsquedas simples y avanzadas es
áreas específicas tales como educación, organizaciones, gobierno, entre otras.
Bioinformatics.Net
Link: http://www.bioinformatics.vg/cgi-bin/odp/index.cgi
Descripción: Bioinformatics.Net es un catálogo en línea de información en ciencias biológicas,
especializado en herramientas de bioinformática. Dirigido a biólogos moleculares y otros científicos biológicos trabajando en investigación científica, incluyendo biotecnología y medicina,
tanto en la industria como el área académica.
69
@Genetics
Link: http://www.atgenetics.com/genetics/
Descripción: Buscador de Internet de información y recursos en las áreas de Genética y Biología
Molecular.
WFCC-MIRCEN
Link: http://wdcm.nig.ac.jp/
Descripción: WFCC-MIRCEN proporciona un completo directorio de bases de datos en las líneas
de microbios y células, y enlaces a proyectos sobre biodiversidad, biología molecular y genómica.
Organic-Chemistry
Link: http://www.organic-chemistry.org/
Descripción: Buscador de Internet para reacciones orgánicas.
YAHOO SEARCH
Link: http://dir.yahoo.com/Science/chemistry/
Descripción: Información sobre química en el Directorio de Yahoo.
70
Buscadores
METACRAWLER
Link: http://www.metacrawler.com
Descripción: MetaCrawler utiliza la tecnología innovadora de búsqueda de los buscadores más
representativos en Internet, incluyendo Google, Yahoo! Search, MSN Search, Ask Jeeves, About,
MIVA, LookSmart y muchos otros. Con un simple click, MetaCrawler busca los mejores resultados
obtenidos de la combinación de los mejores buscadores mundiales.
GALAXY
Link: http://galaxy.einet.net/galaxy/Science.html
Descripción: Galaxy emplea la mejor tecnología y experticia humana para organizar la información de tal forma que sea comprensible y altamente relevante con respecto a las necesidades
de los usuarios. Como parte del proceso, son eliminados sitios con contenido para adultos, sitios
ofensivos y con poca o ninguna información de valor.
ASK JEEVES
Link: http://www.askjeeves.com
Descripción: Ask.com ofrece muchas características y herramientas innovadoras para ayudar a
conseguir información rápida y fácilmente.
71
Diseño, diagramación e ilustración
Angélica Semacarit R.

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