Diseño de Fármacos (CEU)

Universidades de Alcalá, Complutense y S. Pablo-CEU
Doctorado en Química Médica
DISEÑO DE FÁRMACOS
Beatriz de Pascual-Teresa
Programa de Doctorado: Química Médica
USP-CEU
Programa de doctorado verificado por la ANECA conforme al RD
1393/2007 y resuelto favorablemente por el consejo de coordinación
universitaria en su sesión de 6 de Julio de 2009.
Denominación de las materias (todas de 6 ECTS):
Química Médica Avanzada (UCM)
Diseño de Fármacos (CEU)
Metodologías químicas en el descubrimiento de nuevos fármacos (UA)
Metodologías para la determinación estructural de fármacos y el estudio
de fenómenos de reconocimiento molecular (CEU-CIB)
Estrategias en síntesis de fármacos (UA-IQO)
Síntesis de fármacos heterocíclicos (UCM)
Aspectos químicos y tecnológicos del desarrollo de los fármacos (UA-CEU)
Programa adherido al Paul Ehrlich European PhD in Medicinal Chemistry
Label to PhD Graduates in Medicinal Chemistry.
www.MedChem Euro-PhD.net
Objetivos: Diseño de Fármacos
USP-CEU
Suministrar al alumno las bases químicas para el diseño racional de fármacos mediante la utilización de
técnicas computacionales.
DEL DESCUBRIMIENTO
CASUAL
AL DISEÑO RACIONAL DE
FÁRMACOS
Química Computacional, Diseño de Fármacos:
USP-CEU
Molecular Modeling, Modelado molecular,
Modelización molecular.
CADD (Computer Aided Drug Design)
[Quimioinformatica, Bioinformática]
Teoría
Prácticas
Competencias
USP-CEU
•
Conocer las bases químicas teóricas para el diseño racional de fármacos
mediante la utilización de técnicas computacionales.
•
Ser capaz de poner en práctica algunos de los conocimientos adquiridos
a través de la realización de talleres.
•
Ser capaz de seleccionar las diferentes técnicas y metodologías
empleadas más frecuentemente en el diseño de fármacos, dependiendo
del sistema objeto de estudio.
Programa de Clases Teóricas y Prácticas
USP-CEU
Teoría Aula 103 A
Hora
Lunes, 9 de Mayo
Prácticas Aula 101, 014, 011 y Aulas A y B
Martes, 10 de Mayo
9:00
B. Pascual-Teresa
(USP-CEU)
Introducción
10:00
B. Pascual-Teresa
Diseño de Fármacos
11:00
S. Martín-Santamaría
(USP-CEU)
Modelado de Proteínas
(I)
B. Pascual-Teresa
Prácticas (PDB,
PoseView DrugBank,
Molinspiration)
12:00
Pausa
Pausa
12:30
S. Martín-Santamaría
Modelado de Proteínas
(II)
A. Ramos (USP-CEU)
REA
S. Martín-Santamaría
Prácticas (formatos xyz,
mol, smiles y PDB)
A. Ramos
“MMP-2 y el Receptor
de Estrógenos: dos
dianas para el diseño
de nuevos agentes
antitumorales”
13:30
B. Pascual-Teresa
Diseño de Fármacos
B. Pascual-Teresa
Diseño de Fármacos
Miércoles, 11 de
Mayo
Jueves, 12 de Mayo
Viernes, 13 de Mayo
S. MartínSantamaría
QM/MM
F. J. González (U. Oviedo)
Química Cuántica
Aula 014
F. J. González (U. Oviedo)
Química Cuántica
Aula 011
Pausa
Pausa
Pausa
Danièle Altschuh
(CNRS)
“The binding
modes of
sequence-based
peptido-mimetics:
real or imaginary
mimicry?“
F. J. González (U. Oviedo)
Prácticas Gaussian
Aula A
F. J. González (U. Oviedo)
Prácticas Gaussian
Aula A
F. J. González (U. Oviedo)
Química Cuántica
Aula 011
F. J. González (U. Oviedo)
Prácticas Gaussian
Aula A
Programa de Clases Teóricas y Prácticas
USP-CEU
Teoría Aula 103 A
Hora
Lunes, 16 de
Mayo
10:00
Conferencia
Glaxo
(Tres Cantos)
11:00
12:30
a
14:30
Miércoles, 18 de Mayo
Jueves, 19 de Mayo
Viernes, 20 de Mayo
Case Study
Janssen
(Toledo)
10:30-12:30- M. Pastor
(UPF)
ADME-Tox
Pausa
Pausa
Pausa
Visita Janssen
(Toledo)
12:45-14:45C. Pérez Martínez (Lilly)
Docking
12:30-14:00- A.
Morreale (CBM-CSIC)
Virtual Screening
(taller)
Aula B
9:30-11:00- M.
Martín (IQM-CSIC)
“Aminoácidos no
proteinogénicos
como inductores de
giros inversos”
9:00
12:00
Martes,17 de Mayo
Prácticas Aula 004
Pausa
Visita Glaxo
(Tres Cantos)
A. Ramos
“MMP-2 y el
Receptor de
Estrógenos: dos
dianas para el
diseño de nuevos
agentes
antitumorales”
Pausa
A. Gradillas (USP-CEU)
“Caso: Gleevec”
11:00-12:00- A.
Morreale (CBM-CSIC)
Virtual Screening
Aula 011
Contenidos
USP-CEU
Propiedades de los productos drug-like. Relación estructura-actividad.
Química Computacional. Mecánica molecular. Métodos semiempíricos.
Métodos ab initio. Cálculos DFT.
Análisis conformacional. Dinámica molecular.
Diseño de fármacos basado en la estructura.
Diseño de fármacos basado en el ligando.
QSAR-3D. Identificación de farmacóforos.
Modelado de proteínas. Modelado de ácidos nucleicos.
Predicción de estructura.
Docking. Screening virtual. Diseño de novo.
Programa de clases prácticas
USP-CEU
Prácticas 1 y 2. Visualización 3D, manipulación de complejos fármaco-receptor,
construcción y modelado de ligandos y receptores:
PDB, DrugBank, Molinspiration, Rasmol, Chime, Sybyl,
ChemSketch, Corina, Moviemaker, etc.
Práctica 3. Estudio ab initio de un proceso enzimático: Gaussian, Gaussview
Prácticas 4. Diseño de Fármacos Basado en la estructura. Docking
Profesores participantes de la USP-CEU
USP-CEU
Dra. Beatriz de Pascual-Teresa
Catedrática
Departamento de Química.
Diseño de Fármacos, ADME-Tox y practicas
Dra. Sonsoles Martín Santamaría.
Profesora Adjunta.
Departamento de Química.
Modelado de proteínas. QSAR-3D y prácticas
Dra. Ana Ramos González.
Catedrática
Departamento de Química
Relación Estructura Actividad y seminario
Dra. Ana Gradillas Nicolás
Profesora Adjunta
Departamento de Química
Caso
Profesores participantes de otras instituciones
USP-CEU
Dr. Javier González Fernández. Profesor Titular. Departamento de Química. Universidad de Oviedo.
Química Computacional. Prácticas.
Dr. Carlos Pérez Martínez. Computational Drug Discovery (DCRT). Eli Lilly and Company
Docking en el diseño de fármacos (Glide). Prácticas.
Dra. Danièle Altschuh. CNRS(France)
Surface Plasmon Resonance and applications
Dr. Manuel Pastor. Universidad Pompeu Fabra
“ADME-Tox”
Dra. Mercedes Martín. IQM-CSIC
“Aminoácidos no proteinogénicos como inductores de giros inversos”
Dr. A. Morreale. CMB (CSIC)
“Virtual Screening”
Dr. M. Cacho. Glaxo
Visita
Dr. J. Fernández Gadea. Janssen
Visita
Bibliografía general
USP-CEU
Andrew R. Leach, Molecular Modelling, Principles and Applications, 2nd Edition, Pearson,
Prentice Hall, 2001.
Grant, G.H.; Richards, W.G.; Computational Chemistry. Oxford University Press, 1996
U. Burkert and N.L. Allinger, Molecular Mechanics, ACS Monograph 177. Washington D.C.,
American Chemical Society, 1982.
P. R. Schleyer and P. R. Schreiner. Eds. Encyclopedia of Computational Chemistry. Wiley,
1998
Kenny B. Lipkowitz and Donald B. Boyd. Eds. Reviews in Computational Chemistry. Wiley.
1996
Hugo Kubinyi, Gerhard Müller. Chemogenomics In Drug Discovery: A Medicinal Chemistry
Perspective, Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2004
Dr. David C. Young Computational Drug Design Wiley interscience 25 Feb 2009. Print ISBN:
9780470126851
Young Researchers
Searched for the
Second SEQT –
Janssen
Summer School
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Apply to the SEQTsponsored grants before
April7th
http://www.seqt.org/
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1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network
7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences
Promoting education and research training of PhD students in Medicinal Chemistry.
In this congress PhD students are encouraged to present their research and interact
within the multidisciplinary field of Pharmaceutical Sciences, and foster professional
and personal networks throughout Europe.
Deadlines:
- Communications and registration: 22nd April, 2011.
- More information: [email protected]; [email protected]
1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network
7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences
COLEGIO MAYOR SAN PABLO CEU
USP-CEU
“De un doctor bien formado, lo menos importante es el resultado
específico de sus trabajos, lo importante es que la gente así formada:
•ha aprendido el proceso de pensamiento crítico
•sabe que las cosas importantes por pequeñas que sean
requieren un esfuerzo grande y a largo plazo
•sabe reconocer que se ha equivocado y sabe rectificar
•sabe comunicarse y comunicar
•sabe formular ideas
•sabe discutir y defender racionalmente sus posiciones
•sabe extraer lo esencial de problemas complejos”
Pedro Miguel Echenique Landiríbar. “Lo Útil de Conocer” Salamanca 2001