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Estudie cuidadosamente esta guía previamente a la clase y
COLEGIO SANTIAGO PEREZ “SER CULTOS PARA SER LIBRES” GUÍA TALLER PROTEINAS. AURA REYES G. Estudie cuidadosamente esta guía previamente a la clase y desarrolle cada una de las actividades propuestas en sus respectivos cuadernos. Se realizará Quiz de control de estudio. PROPIEDADES QUÍMICAS. FORMACIÓN DE PEPTIDOS En 1902 Emil Fischer propuso que las proteínas son largas cadenas de aminoácidos unidos entre sí por enlaces amida el α-carbonilo de un aminoácido y el grupo α-amino de otro. Fischer propuso el nombre de enlace peptídico para esta unión o enlace. Al formarse un enlace peptídico se libera una molécula de agua. Una cadena que contiene dos o más residuos de aminoácidos es un péptido. Hasta diez residuos se la llama oligopéptidos y por encima de diez residuos, polipéptido. Una proteína es un polipéptido de alto peso molecular, pero el límite entre ambos es arbitrario y varía según los autores. Los péptidos presentan dos extremos distintos: el Nterminal y el C-terminal. El N-terminal es el que tiene un residuo de aminoácido con grupo amino libre; este residuo es considerado el primero de la cadena. El extremo Cterminal es el que tiene un residuo de aminoácido con el grupo carboxilo libre; éste es considerado el último residuo de la cadena. LAS PROTEÍNAS La palabra proteína viene del griego protos que significa "lo más antiguo, lo primero”. Las proteínas son biopolímeros (macromoléculas orgánicas) de elevado peso molecular; compuestos químicos muy complejos que se encuentran en todas las células vivas. Hay ciertos elementos químicos que todas ellas poseen, pero los diversos tipos de proteínas los contienen en diferentes cantidades. Están constituidas básicamente por carbono (C), hidrógeno (H), oxígeno (O) y nitrógeno (N); aunque pueden contener también azufre (S) y fósforo (P) y, en menor proporción, hierro (Fe), cobre (Cu), magnesio (Mg), yodo (Y). Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en las células; constituyen alrededor del 50% de su peso seco o más en algunos casos. Una bacteria puede tener cerca de 1000 proteínas diferentes, pero en una célula humana puede haber 10.000 clases de proteínas distintas. Químicamente, las proteínas están formadas por la unión de muchas moléculas relativamente sencillas y no hidrolizables, denominadas Aminoácidos (Aa). Los aminoácidos se unen entre sí originando péptidos. Según su tamaño molecular, pueden ser oligopéptidos, formados por no más de 10 Aa y polipéptidos, constituidos por más de 10 Aa. Cuando el número de Aa supera los 50 y el polipéptido tiene una estructura tridimensional específica, entonces se habla propiamente de proteínas. NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTEÍNAS Todas las proteínas son cadenas de alto peso molecular formadas por residuos de aminoácidos. ¿En qué se diferencia una proteína de otra? Las proteínas se diferencian, en primer lugar, por el número, tipo y orden de los aminoácidos que constituyen su cadena. La secuencia de aminoácidos que presenta una proteína particular se denomina estructura primaria. En algunas proteínas hay más de un residuo del aminoácido cisteína, que lleva un grupo sulfhidrilo en su radical. Dos residuos de cisteína pueden establecer una unión covalente entre los átomos de azufre, el puente disulfuro. La posición de los puentes disulfuro, cuando están presentes, forma parte de la estructura primaria. Además de una secuencia particular de aminoácidos, las proteínas se pliegan sobre sí mismas, adoptando una estructura espacial determinada, o conformación nativa. Cada proteína adopta siempre la misma conformación nativa, si las condiciones del medio lo permiten. Esto indica que la forma de una proteína depende de su estructura primaria. El primer nivel de plegamiento de una proteína es su estructura secundaria. La estructura secundaria puede ser regular, como la alfa hélice o la hoja plegada beta, o no seguir un patrón regular, en cuyo caso es de tipo aleatoria. Las estructuras secundarias se originan porque se establecen uniones puentes de hidrógeno entre los restos amino y carboxilo de aminoácidos que están relativamente distantes en la estructura primaria, produciendo así un acercamiento entre ellos. La estructura terciaria es la disposición global que adoptan en el espacio las distintas regiones de una proteína, después de haber adquirido su estructura secundaria. Esta disposición depende de interacciones que se establecen entre radicales, en general bastante alejados en la estructura primaria. Entre dichas interacciones se cuentan: uniones iónicas, puentes de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas (todas ellas uniones no covalentes) y puentes disulfuro. Algunas proteínas tienen estructura cuaternaria. Esta estructura se alcanza cuando la proteína está formada por dos o más cadenas polipeptídicas unidas entre sí por uniones no covalentes entre los radicales. A cada una de las cadenas que constituyen la proteína se le da el nombre de protómero o subunidad. Las proteínas de estructura cuaternaria también se conocen como proteínas oligoméricas. Solubilidad Las proteínas globulares poseen un elevado tamaño molecular, por lo que al disolverse, dan lugar a disoluciones coloidales. La solubilidad de estas moléculas se debe a los radicales R que, al ionizarse, establecen puentes de hidrógeno con las moléculas de agua. Así, la proteína queda recubierta de una capa de moléculas de agua que impide que se pueda unir a otras proteínas, lo que provocaría su precipitación. La solubilidad depende del pH, temperatura, concentración iónica... A pesar de ser solubles, la mayoría de las membranas biológicas son impermeables al paso de proteínas. Desnaturalización La desnaturalización es la destrucción de la conformación nativa de una proteína, sin que se vea afectada su estructura primaria. La proteína conserva la cadena, pero no su estructura espacial. Cuando una proteína se desnaturaliza, la función biológica se pierde, ya que ésta se halla estrechamente ligada a la forma. Consecuencias inmediatas son: - Disminución drástica de la solubilidad de la proteína, acompañada frecuentemente de precipitación - Pérdida de todas sus funciones biológicas - Alteración de sus propiedades hidrodinámicas Agentes desnaturalizantes I. Físicos 1. Calor. La mayor parte de las proteínas experimentan desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60 ºC; otras se desnaturalizan también cuando se enfrían por debajo de los 10 a 15 ºC. 2. Radiaciones II. Químicos: todos los agentes que rompen interacciones o enlaces presentes en la estructura nativa de la proteína: 1. Detergentes 2. Urea y guanidina a altas concentraciones 3. Altas concentraciones de sal y extremos de pH 4. Reactivos de grupos –SH Especificidad La especificidad es doble: de especie de función. Especificidad de especie: En su secuencia de aminoácidos, las proteínas presentan dos tipos de sectores: Sectores estables Sectores variables: Algunos aminoácidos pueden ser sustituidos por otros distintos sin que se altere la funcionalidad de la molécula. Ello ha dado lugar, durante la evolución, a una gran variabilidad de proteínas, lo que permite que cada especie tenga sus proteínas específicas y que, incluso, aparezcan diferencias entre individuos de la misma especie (rechazo en trasplantes de tejidos). Las diferencias entre proteínas homologas, es decir, con la misma función, son grandes entre especies alejadas evolutivamente y escasas entre especies emparentadas. Especificidad de función. La especificidad también se refiere a la función. Cada proteína realiza una determinada función exclusivamente, por ejemplo, catalizar cierta reacción química sobre cierto substrato y no sobre otro. La especificidad se debe a que su actuación se realiza mediante interacciones selectivas con otras moléculas, para lo que necesitan una determinada secuencia de aa y una conformación concreta. Un cambio en la secuencia o conformación puede impedir la unión y por lo tanto dificultar la función. Capacidad amortiguadora Las proteínas, al estar constituidas por aminoácidos, tienen un comportamiento anfótero. Tienden a neutralizar las variaciones de pH del medio, ya que pueden comportarse como un ácido o una base y, por tanto, liberar o retirar protones (H+) del medio 1. ACTIVIDAD PARA REALIZAR EXTRACLASE: Conteste las siguientes preguntas: 1. Las proteínas son macromoléculas biológicas constituidas básicamente por: a. C, H, O, P. b. C, H, O, N. c. C, H, O, Fe d. C,N, Fe, S 2. Los α -L-aminoácidos se caracterizan por: a. b. La disposición del grupo carboxilo (-COOH) a la izquierda del carbono α. c. La disposición del grupo amino (-NH2) a la derecha del carbono α. d. La disposición del grupo amino (-NH2) a la izquierda del carbono α. 3. El comportamiento anfótero de los aminoácidos se refiere a que: a. El pH que exista en una disolución acuosa determina su ionización. b. El pH que exista en una disolución acuosa determina su actividad óptica. c. El pH impide que se solubilicen en una disolución acuosa. 4. La configuración β o de lámina plegada de una proteína, se refiere a: a. su estructura primaria. b. su estructura secundaria. c. su estructura terciaria. 5. Cuando una proteína se desnaturaliza, ¿quedan libres sus aminoácidos? a. si b. nunca c. a veces CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS Según su composición, las proteínas se pueden clasificar en dos tipos que son proteínas simples o proteínas conjugadas. Por un lado tenemos las proteínas que son proteínas simples y son aquellas que, por hidrolisis, producen solamente α-aminoácidos. Un ejemplo de proteína que es una proteína simple es la ubiquitina. Por otro lado, están proteínas que son proteínas conjugadas. Estas proteínas contienen además de su cadena polipeptídica un componente que no es un aminoácido, denominado grupo prostético. Este componente puede ser un ácido nucleico, un lípido, un azucar o simplemente un ión inorgánico. Ejemplos de proteínas que son proteínas conjugadas son la mioglobina, la hemoglobina y los citocromos. Se clasifican en: Holoproteínas: Formadas solamente por aminoácidos. Heteroproteínas: Formadas por una fracción proteínica y por un grupo no proteínico, que se denomina "grupo prostético. Se clasifican según la naturaleza del grupo prostético. HOLOPROTEÍNAS Globulares: Más complejas que las fibrosas. Forman estructuras compactas, casi esféricas, solubles en agua o disolventes polares. Son responsables de la actividad celular 1. Prolaminas: Zeína (maíza),gliadina (trigo), hordeína (cebada) 2. Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz). 3. Albúminas: Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo), lactoalbúmina (leche) 4. Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina, tirotropina 5. Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas. HOLOPROTEÍNAS Fibrosas: Más simples que las globulares. Forman estructuras alargadas, ordenadas en una sola dimensión, formando haces paralelos. Son responsables de funciones estructurales y protectoras Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas, cuernos. Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos) HETEROPROTEÍNAS Glucoproteínas: ribonucleasa mucoproteínas, anticuerpos, hormona luteinizante Lipoproteínas: De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lípidos en la sangre. Nucleoproteínas: Nucleosomas de la cromatina, ribosomas, histonas y protaminas de eucariotas. Cromoproteínas: Pueden ser de dos tipos: a. Porfirínicas. Hemoglobina, mioglobina que transportan oxígeno, citocromos, que transportan electrones b. No Porfirínicas como la hemocianina (pigmento respiratorio de crustáceos y moluscos, de color azul y que contiene cobre) Fosfoproteínas: Tienen H3PO4 en el grupo prostético. La caseína de la leche. FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEÍNAS Las proteínas desempeñan infinidad de funciones: hormonal, de sostén, contráctil, de transporte, de defensa, regulación genética, recepción de señales, enzimática y muchas otras. También pueden ser oxidadas para la producción de energía (rinden 4 Kcal/g) aunque no se reservan con este fin. Todos hemos oído hablar de la información genética y se sabe que esta información, guardada en las moléculas de ADN, es la responsable de las características de un organismo y de las diferencias entre una planta y un perro, o entre dos personas. Lo que no todos saben es que la información que guarda el ADN es la información para fabricar proteínas. No heredamos el color de pelo, o la estatura, heredamos recetas con las instrucciones para elaborar determinadas proteínas. Luego, las proteínas son las encargadas de dotar al organismo de su estructura, su función y sus características propias. Estructural Es una de las funciones más características: Algunas glucoproteínas forman parte de las membranas celulares. Intervienen en el transporte selectivo de iones (bomba de Na-K) Otras proteínas forman el citoesqueleto de las células, las fibras del huso, de los cilios y flagelos. Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas eucariotas. El colágeno, que mantiene unidos los tejidos animales y forma los tendones y la matriz de los huesos y cartílagos. La elastina, en el tejido conjuntivo elástico (ligamentos paredes de vasos sanguíneos). La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte de pelos, uñas, escamas de reptiles, plumas, etc. La fibroína, que forma la seda y las telas de arañas. Es una disolución viscosa que solidifica rápidamente al contacto con el aire. Enzimática Es la función más importante. Las enzimas son las proteínas más numerosas y especializadas y actúan como biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo celular. Se diferencian de los catalizadores no biológicos porque las enzimas son específicas de la reacción que catalizan y de los sustratos que intervienen en ellas. Hormonal Insulina y glucagón Hormona del crecimiento segregada por la hipófisis Calcitonina Defensiva Inmunoglobulina, trombina y fibrinógeno Transporte Además de las proteínas transportadoras de las membranas, existen otras extracelulares que transportan sustancias a lugares diferentes del organismo. Hemoglobina, la hemocianina y la mioglobina del músculo estriado. Los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria (mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosíntesis (cloroplastos). La seroalbúmina transporta ácidos grasos, fármacos y productos tóxicos por la sangre. Las lipoproteínas transportan el colesterol y los triacilglicéridos por la sangre. Reserva En general, las proteínas no se utilizan para la obtención de energía. No obstante, algunas como la ovoalbúmina de la clara de huevo, la caseína de la leche o la gliadina de la semilla de trigo, son utilizadas por el embrión en desarrollo como nutrientes. Función homeostática Las proteínas intracelulares y del medio interno intervienen en el mantenimiento del equilibrio osmótico en coordinación con los tampones. Función contráctil El movimiento y la locomoción en los organismos unicelulares y pluricelulares dependen de las proteínas contráctiles: la dineína, en cilios y flagelos, la actina y miosina, responsables de la contracción muscular. Anticongelante Presentes en el citoplasma de ciertos peces antárticos ACTIVIDAD FINAL. Resuelva el siguiente cuestionario en su cuaderno. 1. Un aminoácido se define como: a. Una molécula orgánica formada principalmente por C, H, O, N y S. b. Una molécula inorgánica formada principalmente por H, O y N. c. Una molécula orgánica formada principalmente por C y N d. Una molécula inorgánica formada principalmente por C, H, O, N y S. e. Una molécula orgánica formada principalmente por C, N, O, y P 2. Los aminoácidos se clasifican de acuerdo a su cadena lateral en: a. Aminoácidos neutros y polares b. Aminoácidos polares y aniónicos c. Aminoácidos neutros, polares neutros, ácidos ó aniónicos y básicos ó catiónicos. d. Aminoácidos polares, ácidos ó aniónicos y básicos o catiónicos. e. Aminoácidos neutros, catiónicos y aniónicos. 3. ¿Cuántos aminoácidos de la naturaleza forman parte de las proteínas humanas? a. 21 aminoácidos b. 20 aminoácidos c. 22 aminoácidos d. 30 aminoácidos e. 19 Aminoácidos 4. ¿Cuáles son los tipos de isómeros que pueden formar los aminoácidos? a. Dextrógiros (D) b. Levógiros (L) c. Dextrógiro y levógiro (D y L) d. Carbono quiral e. Compuestos ópticamente activos 5. Un enlace peptídico se forma: a. Entre el grupo R de un aminoácido y el NH2 del segundo aminoácido b. Entre el grupo COOH de un aminoácido y el NH2 del segundo aa c. Entre el grupo R y el COOH de 2 aminoácidos d. Entre el grupo NH2 del primer aminoácido y el COOH del segundo aminoácido e. Entre el H de un aminoácido y el COOH del segundo aminoácido 6. En la función calorigénica, las proteínas aportan: a. 10 Kcal/g b. 100 Kcal/g c. 4 Kcal/g d. 30 Kcal/g e. 150 Kcal/g 7. Molécula que contiene entre 11 y 100 aminoácidos: a. Proteína b. Péptido c. Dipéptido d. Oligopéptido e. Tetrapéptido 8. Las proteínas humanas están constituidas por: a. Aminoácidos dextrógiros b. Aminoácidos levógiros c. Beta aminoácidos d. Gamma aminoácidos e. Delta aminoácidos 9. El carbono quiral representado por el carbono alfa de los aminoácidos debe poseer: a. Cuatro sustituyentes químicamente diferentes b. Tres sustituyentes químicamente diferentes c. Cuatro sustituyentes químicamente iguales d. Tres sustituyentes químicamente iguales e. Dos sustituyentes químicamente diferentes 10. La estructura terciaria de las proteínas... a. Es el resultado del plegamiento de la hélice alfa b. Se debe a los enlaces peptídicos entre aminoácidos muy voluminosos. c. Sólo está presente en las proteínas con función enzimática d. Está formada por la combinación de alfa-hélices con láminas plegadas. 11. ¿Cuál de estas funciones no realizan las proteínas? a. Hormonal b. Defensiva c. Vitamínica d. Enzimática 12. Las proteínas fibrosas... a. El enlace peptídico que forman los aminoácidos es más rígido, impidiendo la formación de las hélices alfa. b. Suelen presentar estructura secundaria en forma de lámina plegada. c. Pueden presentar estructura globular. d. Están formadas por cadenas de polipeptídicas perpendiculares asociadas por puentes de H. 13. La estructura primaria de una proteína viene determinada por: a. Todas las otras respuestas son correctas. b. Número de aminoácidos c. Tipo de aminoácidos d. Orden de aminoácidos 14. ¿Qué supone la desnaturalización de una proteína? a. Pérdida de todas las estructuras, incluida la rotura del enlace peptídico. b. La pérdida irreversible de sus propiedades. c. El cambio de su naturaleza química. d. La pérdida de las estructuras cuaternaria, terciaria y secundaria, manteniéndose la primaria. 15. En relación a la desnaturalización proteica por variación de la temperatura: a. es reversible si se ha alterado la estructura primaria. b. es reversible por recalentamiento. c. es irreversible si se ha alterado la estructura primaria. d. es reversible por enfriamiento. e. es irreversible siempre. 16. La función de reserva energética está asociada al siguiente tipo de proteínas: a. cromoproteínas b. glucoproteínas c. albúminas d. histonas e. globulinas 17. Identifica la característica que NO es propia de los aminoácidos: a. algunos poseen S. b. siempre tienen una función carboxilo. c. están compuestos por C, H, O y N. d. la carga eléctrica a pH neutro es siempre positiva. 18. Resuelva el siguiente crucigrama Verticales: 1. ¿Cuantos aminoácidos especifica el código genético? 2. ¿Cuáles son los grupos funcionales que contienen los aminoácidos? 8. Escriba un sinónimo de las proteínas. Horizontales 3. ¿Qué estructuras son las que permiten que los aminoácidos se unan entre sí? 4. ¿Que se origina cuando se unen varios aminoácidos? 5. ¿Cuáles son los componentes de las proteínas? 6. ¿Cuáles son los elementos químicos que componentes a las proteínas? 7. De acuerdo a las funciones de las proteínas ¿Qué tipo de proteína es la Hemoglobina? 9. ¿Cómo debe ser el PH de la célula para que el aminoácido adopte su forma catiónica?