Curriculum vitae - Simon Uribe

Simon Uribe-Convers
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http://www.simonuribe.com
Moscow, Idaho, USA
Educación
2009-Presente
2001-2008
2004-2005
Candidato a Doctorado, Dept. de Ciencias Biológicas, Universidad de Idaho, Moscow, ID, USA
Director: Dr. David Tank
Biología, Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia
Director: Dr. Santiago Madriñán
Estudiante de Intercambio, Johannes Gutenberg Universität, Mainz, Alemania
Director: Prof. Dr. Joachim Kadereit
Entrenamiento Adicional
2012
2011
2010
Curso en Estimación de Árboles de Especies, Universidad de Ohio, Columbus, OH, USA.
Curso en R, Universidad de Idaho, Moscow, Idaho, USA.
Curso de Filogenética Aplicada en Bodega Bay, Universidad de California Davis, CA, USA.
Publicaciones (§ Denota coautor de pregrado)
Uribe-Convers S, Duke JR§, Moore JM, Tank DC. 2014. A long-PCR based method for chloroplast genome
enrichment and phylogenomics in angiosperms. Applications in Plant Sciences 2: 1300063. Destacado en
EurekAlert!: http://goo.gl/C4rAeh y en ScienceDaily: http://goo.gl/zdFuZ4.
Goldberg CS, Tank DC, Uribe-Convers S, Bosworth WR, Marx HH, Waits LP. 2012. Species designation of the
Bruneau Dune tiger beetle (Cicindela waynei) is supported by phylogenetic analysis of mitochondrial DNA
sequence data. Conservation Genetics 13: 373-380.
Uribe-Convers S. 2008. Molecular Phylogeny for the Colombian species of páramo, for the genera Bartsia and
Castilleja (Orobanchaceae). Thesis B.Sc. Biology, Universidad de los Andes, Bogota, Colombia.
Kadereit JW, Uribe-Convers S, Westberg E, Comes HP. 2006. Reciprocal hybridization at different times between
S. flavus and S. glaucus gave rise to two polyploid species in North Africa and Southwest Asia. New Phytologist
169: 431 - 441.
En preparación
Uribe-Convers S, Settles ML, Tank DC. En preparación. A targeted subgenomic approach for phylogenomics
based on microfluidic PCR and high throughput sequencing. A ser sometido a Systematic Biology.
Uribe-Convers S and Tank D.C. En preparación. Phylogenetic Recircumscription of the genus Bartsia
(Orobanchaceae) and Closely Related Genera. A ser sometido a Systematic Botany.
Uribe-Convers S and Tank D.C. En preparación. Shifts in diversification rates linked to biogeographic movement
into new areas: an example of disparate continental distributions and a recent radiation in the Andes. A ser
sometido a Systematic Biology.
Nürk NM, Uribe-Convers S, Tank DC, Madriñán S, Blattner F. En preparación. Out of the tropics? Historical
biogeography of the temperate genus Hypericum. A ser sometido a PNAS.
Jacobs S, Kristofferson C§, Uribe-Convers S, Tank DC. “Evaluating the Taxonomic Status of Two Narrowly
Endemic Owl's Clovers (Castilleja: Orobanchaceae)” A ser sometido a Systematic Botany.
Becas (Valores en dólares americanos)
2013
2013
Beca para expedición botánica (Colombia), Herbario Stillinger Universidad de Idaho ($10750)
Beca de viaje Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad de Idaho ($700)
Curriculum Vitae
Simon Uribe-Convers
2009-2012
2012
2012
2012
2012
2011
2011
2011
2010
2010
2010
2010
Beca de investigación para estudiantes de postgrado Herbario Stillinger, Universidad de Idaho
($50000 por año como beca y matrícula)
Beca para expedición botánica (Perú y Bolivia), Herbario Stillinger Universidad de Idaho ($10965)
Beca para el mejoramiento de la tesis doctoral, Fundación Nacional para la Ciencia (NSF) ($14980)
Beca de viaje Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad de Idaho ($792)
Beca de viaje Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad de Idaho ($490)
Beca para expedición botánica (Ecuador y Perú), Herbario Stillinger Universidad de Idaho ($6496)
Programa de becas para estudiantes de postgrado, Universidad de Idaho ($4914)
Beca de investigación para estudiantes de postgrado Sociedad Americana de Botánica ($500)
Beca de viaje Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad de Idaho ($490)
Beca de viaje Sociedad Americana de Taxónomos de Plantas – Congreso “Botany 2010” ($335)
Beca de investigación para estudiantes de postgrado Sociedad de Biólogos Sistemáticos ($1800)
Beca de investigación para estudiantes de postgrado Sociedad Americana de Taxónomos de Plantas
($750)
Liderazgo y Premios
2012-Presente
2013-2014
2012, 2013
2011-2013
2010-2012
1999/2001
Presidente, Capítulo estudiantil de la Sociedad Americana de Botánica, Universidad de Idaho.
Vicepresidente, Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad de Idaho.
Nominado para el premio “Enseñanza Excepcional - Estudiantes de Postgrado” (segundo puesto),
Universidad de Idaho.
Director del Comité de Becas de Viaje, Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales,
Universidad de Idaho.
Senador del Departamento, Asociación de Estudiantes de Postgrado y Profesionales, Universidad
de Idaho.
Completé satisfactoriamente el Sprach Diplom Erste und Zweite Stuffe (Niveles Avanzado y
Superior). Estos son exámenes internacionales necesarios para el estudio en Alemania.
Experiencia en Investigación
2009-2012
Verano 2008
Verano 2008
2008
2004-2005
Asistente de investigación, Herbario Stillinger, Universidad de Idaho, Moscow, ID, USA.
Investigador invitado, Mathews Lab, The Arnold Arboretum de la Universidad de Harvard,
Cambridge, MA, USA.
Pasantía investigativa, Litt Lab, Pfizer Plant Research Laboratory, Jardín Botánico de Nueva
York, Nueva York, NY, USA.
Tesis de pregrado, Laboratorio de Botánica y Sistemática, Departamento de Ciencias Biológicas,
Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia.
Asistente de investigación, Institut für Spezielle Botanik und Botanischer Garten, Johannes
Gutenberg Universität, Mainz, Alemania.
Presentaciones Invitadas
Septiembre 2013
Marzo 2013
Noviembre 2012
Noviembre 2011
Febrero 2011
“Una corta historia acerca de Bartsia (Orobanchaceae): nuevos métodos genómicos”. Universidad
de Los Andes, Bogotá, Colombia.
“Análisis filogenético del género Bartsia L. (Orobanchaceae) - Nuevas herramientas genómicas”,
Universidad Mayor de San Andrés (UMSA), La Paz, Bolivia.
“Investigando la Acumulación de Evidencia en la Especiación”. Instituto para Estudios
Bioinformáticos y Evolutivos (IBEST), Universidad de Idaho, Moscow, ID, USA.
“Páramo: Un Ecosistema Alpino suramericano”. Seminario de Praderas Globales, Universidad de
Idaho, Moscow, ID, USA.
“El Uso de Filogenias para Entender la Biodiversidad”. Capítulo Estudiantil – Sociedad
Americana Forestal. Universidad de Idaho, Moscow, ID, USA.
Curriculum Vitae
Simon Uribe-Convers
Presentaciones en Conferencias Profesionales (*Denota presentador)
2013
2013
2013
2013
2010
2010
Uribe-Convers S*, Tank DC. “Chloroplast phylogenomics in Bartsia (Orobanchaceae) a
subgenomic approach using microfluidic PCR”. Botany 2013, New Orleans, LA, USA.
Uribe-Convers S*, Duke J, Moore JM, Tank DC. “Got Genome: A long-PCR based method for
chloroplast genome enrichment and a subgenomic approach for phylogenomics”. Botany 2013,
New Orleans, LA, USA.
Jacobs S*, Kristofferson C, Uribe-Convers S, Tank DC. “Evaluating the Taxonomic Status of
Two Narrowly Endemic Owl's Clovers (Castilleja: Orobanchaceae)”. Botany 2013, New
Orleans, LA, USA.
Uribe-Convers S*, Duke J, Moore JM, Tank DC. “Got Genome: A long-PCR based method for
chloroplast genome enrichment and a subgenomic approach for phylogenomics”. Poster en el
Simposio para la Investigación en Genómica en el Noroccidente Interior (INWGRS por sus
siglas en inglés), Moscow, ID, USA.
Uribe-Conver S*, Tank D. “Phylogenetic analysis of the genus Bartsia L. (Orobanchaceae): a
mostly South American genus wrapped in a European Clade”. Botany 2010, Providence, RI,
USA.
Tank D*., Duke J, Uribe-Convers S. “Phylogeny and diversification of the species-rich perennial
Castilleja (Orobanchaceae) clade: parallel radiations in western North America and montane
Latin America”. Botany 2010, Providence, RI, USA.
Evaluador Científico/Evaluador por Pares (Peer Review)
2012-2014
Ad hoc
Miembro de la junta editorial para Applications in Plant Sciences (APPS)
Australian Systematic Botany, Botanical Journal of the Linnean Society, Molecular Phylogenetics
and Evolution, Phytotaxa, Plant Systematics and Evolution, University of Idaho Student Grant
Program
Datos Contribuidos
Uribe-Convers S, Duke JR, Moore MJ, Tank DC (2014) Data from: A long PCR based approach for DNA
enrichment prior to next-generation sequencing for systematic studies. Dryad Digital Repository.
doi:10.5061/dryad.kc75n
Experiencia en Trabajo de Campo
He realizado trabajo de campo en Colombia (2008, 2010, 2013), Ecuador (2010), Perú (2010, 2011), Bolivia (2013)
y Estados Unidos (2010), colectando más de 700 especímenes. He trabajado en varios ecosistemas incluyendo el
páramo, la Amazonía, áreas montañosas, zonas áridas y humedales.
Servicios a la Comunidad
2013
2012
BEACON: Center for the Study of Evolution in Action, publicó una entrada en su blog acerca de
mi trabajo en los páramos y en Bartsia! Lea todo acerca de esto acá: http://goo.gl/K5wPgu
Mi grupo de investigación y yo fuimos parte de el segundo episodio de “Las Plantas También son
Chéveres” (Plants Are Cool, Too!). El episodio se llama “Bosques Fosilizados” y puede ser visto
en el siguiente enlace: http://youtu.be/YfRXDbtkEi0. Adicionalmente, escribo los subtítulos en
español para todos los episodios de la serie.
Idiomas
Español (lengua materna), Inglés (fluido) y Alemán (fluido).
Curriculum Vitae
Simon Uribe-Convers
Experiencia en Educación
2010/11/12/13
2011
2010
2008
2005
2002
Asistente graduado, Dendrología. Facultad de Recursos Naturales, Universidad de Idaho,
Moscow, ID, USA.
Profesor invitado, “El uso de Filogenias para Entender la Biodiversidad”, Introducción a la
Ecología y a la Biología de la Conservación, Universidad de Idaho, Moscow, ID, USA.
Profesor invitado, “¿Qué fue de Scrophulariaceae?”, Botánica Sistemática, Universidad de Idaho,
Moscow, ID, USA.
Monitor, Biología de Organismos, Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de los
Andes, Bogotá, Colombia.
Monitor, Botánica, Departamento de Ciencias Biológicas Universidad de los Andes, Bogotá,
Colombia.
Monitor, Biología Celular, Universidad de los Andes, Colombia Bogotá, Colombia.
Experiencia como Mentor
He sido mentor de varios estudiantes de pregrado durante mi doctorado, entrenándolos en técnicas de laboratorio en
biología molecular y en análisis filogenéticos. Algunos de ellos son: Jordin Jacobs (2013), Casey Kristofferson
(2012), Shaylee Martling (2011) y Justin Duke (2009-2010). Justin Duke y Casey Kristofferson son coautores en un
artículo cada uno. Adicionalmente, cada vez que he enseñado la sección del laboratorio de Dendrología en la
Universidad de Idaho, he sido el mentor de cuatro estudiantes en su cargo de monitores. Estos estudiantes
participaron en el curso el año anterior y usan esta oportunidad para repasar el material del curso y obtener
experiencia enseñando. Finalmente, estoy encargado de entrenar a nuevos miembros del laboratorio Tank en
técnicas de laboratorio.
Sociedades Profesionales
American Society of Plant Taxonomists (Sociedad Americana de Taxónomos de Plantas)
Asociación Colombiana de Botánica
Botanical Society of America (Sociedad Americana de Botánica)
Capítulo estudiantil de la Sociedad Americana de Botánica en la Universidad de Idaho.
Red de Biogeografía Neotropical (Network for Neotropical Biogeography)
Red Colombiana de Biología Evolutiva
Society of Systematic Biologists (Sociedad de Biólogos Sistemáticos)
Referencias
David Tank, Ph.D.
University of Idaho
Department of Biological Sciences
875 Perimeter MS 3051
Moscow, ID 83844-3051, USA
Jack Sullivan Ph.D.
University of Idaho
Department of Biological Sciences
875 Perimeter MS 3051
Moscow, ID 83844-3051, USA
Tel: +1) 208 885 7033
[email protected]
http://www.phylodiversity.net/dtank
Tel: +1) 208 885 9049
[email protected]
www.webpages.uidaho.edu/~jacks/
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Simon Uribe-Convers
Luke Harmon Ph.D.
University of Idaho
Department of Biological Sciences
875 Perimeter MS 3051
Moscow, ID 83844-3051, USA
Prof. Joachim Kadereit, Ph.D.
Institut für Spezielle Botanik und
Botanischer Garten
Johannes Gutenberg-Universität Mainz
55099, Mainz, Alemania
Tel: +1) 208 885 0346
[email protected]
http://www.webpages.uidaho.edu/~lukeh/
Tel: +49) 6131 39 23755
[email protected]
http://www.spezbot.fb10.uni-mainz.de/eng/29.php
Curriculum Vitae
Simon Uribe-Convers