Diversidad genética y dinámica de Campylobacter
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Diversidad genética y dinámica de Campylobacter
COM-08 Diversidad genética y dinámica de Campylobacter termófilos en granjas de pollos de engorde en Cataluña G. CANTERO*y M. CERDÀ-CUÉLLAR Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), IRTA, Campus UAB, 08193-Bellatera, Barcelona, España; *email: [email protected] La campilobacteriosis es una infección gastrointestinal aguda causada por Campylobacter termófilos. La principal fuente de infección es la carne de ave contaminada y la mayoría de granjas de aves de engorde (broilers) son positivas a Campylobacter. Con el objetivo de determinar la dinámica y diversidad de cepas de Campylobacter en granjas de broilers, se llevó a cabo el genotipado de una selección de los aislados obtenidos en todos los lotes positivos criados a lo largo de dos años en dos granjas (granja A y E) de Cataluña, distantes entre sí. En la granja A se analizaron un total de 55 aislados (27 C. jejuni y 28 C. coli) provenientes de 7 lotes positivos. En la granja E se analizaron 85 aislados (74 C. jejuni y 11 C. coli) provenientes de 10 lotes positivos. El genotipado se llevó a cabo mediante electroforesis en campo pulsado (PFGE) utilizando los enzimas SmaI y KpnI. En la granja A, se detectó una elevada diversidad genética, identificándose un total de 15 perfiles diferentes de macroresctrición con una similitud superior al 90%. Se detectaron entre 1 y 6 perfiles diferentes por lote; únicamente se observó un mismo perfil en dos lotes consecutivos. En la granja E, se identificaron un total de 24 perfiles diferentes, detectándose entre 1 y 5 cepas diferentes por lote; se detectó un mismo perfil en 4 lotes diferentes no consecutivos y otro común a dos lotes consecutivos. No se detectó ninguna cepa común a las dos granjas estudiadas. La colonización de diversos lotes con una misma cepa apunta a una insuficiente bioseguridad en la granja, especialmente a nivel de nave, donde algunas cepas que se mantienen en el ambiente exterior de las naves a lo largo de diversas crianzas son introducidas a las naves de forma sucesiva. Así mismo, la diversidad genética detectada en ambas granjas puede ser un reflejo de una diversidad de fuentes de Campylobacter en el medio ambiente exterior de las naves, que directa o indirectamente, pueden introducir dicho agente en las naves de pollos. Campylobacteriosis is an acute gastrointestinal infection caused by thermophilic Campylobacter bacteria. The major source of infection is contaminated poultry meat and most broiler chicken farms are positive for Campylobacter. With the aim to determine the dynamics and genetic diversity of Campylobacter strains in broiler farms, genotyping of isolates obtained from all positive flocks reared throughout two years in two distant broiler farms (farm A and E) from Catalonia was performed. Overall, 55 isolates from 7 positive flocks were analysed from farm A (27 C. jejuni and 28 C. coli) and 85 isolates (74 C. jejuni and 28 C. coli) from 10 positive flocks were analysed from farm E. Genotyping was conducted using pulsed field gel electrophoresis (PFGE) using SmaI and KpnI enzymes. A high genetic diversity was detected in farm A, with an 191 overall 15 different macrorestriction profiles with a similarity over 90%. Between 1 and 6 different profiles per flock were detected; only one profile was detected in two consecutive flocks. Overall, 24 different profiles were identified in farm E, with 1 to 5 strains per flock. The same profile was detected in 4 non-consecutive flocks, while one profile was found in 2 consecutive flocks. No common strain to the two studied farms was detected. The colonization of different flocks with a common strain points out to an inadequate biosecurity at the farm, especially at the house level. Thus, some strains that survive in the external environment of the farm during the downtime, are introduced into broiler houses in consecutive flocks. Also, the genetic diversity detected in both farms may reflect diverse Campylobacter sources of infection from the external environment that directly or indirectly can introduce the pathogen into the broiler houses. Palabras clave: Campylobacter; genotipado; PFGE; granjas de broilers Keywords: Campylobacter; genotyping; PFGE; broilers farms Introducción La campilobacteriosis es actualmente la principal infección zoonótica entérica bacteriana en la UE y en el resto de países industrializados (EFSA and ECDC, 2015; WHO, 2012). La principal fuente de infección es la carne de ave contaminada y la mayoría de granjas de aves de engorde son positivas a Campylobacter (EFSA and ECDC, 2015). Con el objetivo de determinar la dinámica y diversidad de cepas de Campylobacter en granjas de broilers, se llevó a cabo el genotipado de una selección de los aislados obtenidos en todos los lotes positivos criados a lo largo de dos años en dos granjas (granja A y E) de Cataluña. Material y métodos Las dos granjas estudiadas (granja A y granja E), distantes entre sí, poseían ventilación natural y una capacidad máxima por nave de 15.500 y 28.500 pollos (granja A y E, respectivamente). Los aislados objeto de estudio proceden de un estudio longitudinal previo, en el que se identificaron y conservaron 5 aislados por muestreo de cada lote positivo del total de lotes criados a lo largo de dos años (Urdaneta et al., 2013). En la granja A se analizaron un total de 55 aislados (27 C. jejuni y 28 C. coli) provenientes de 7 lotes positivos del total de 12 lotes criados. En la granja E se analizaron 85 aislados (74 C. jejuni y 11 C. coli) provenientes de 10 lotes positivos de un total de 12 lotes. El genotipado se llevó a cabo mediante electroforesis en campo pulsado (PFGE) utilizando los enzimas SmaI y KpnI. Resultados y discusión En la granja A, se detectó una elevada diversidad genética, identificándose un total de 15 perfiles diferentes de macroresctrición (Figura 1). Se detectaron entre 1 y 6 cepas diferentes (perfiles 192 diferentes) por lote; únicamente se observó un mismo perfil de macroresctrición en dos lotes consecutivos (lotes 6 y 7). PFGEPFGE SmaI+PFGE KpnI KpnI KpnI SmaI+PFGE PFGE SmaI+PFGE SmaI&KpnI SmaI&KpnI SmaI&KpnI PFGE SmaI PFGE PFGE SmaI SmaI PFGE KpnI PFGE PFGE KpnI KpnI 100 95 KpnI Aislado Especie Edad/Lote 100 90 85 95 95 90 100 85 80 90 75 70 80 80 75 85 65 60 70 70 65 75 55 50 60 60 55 65 50 50 55 SmaI . A11 .A11 jejuni C. jejuni . L7L728d, . L7 .A11 C.C. jejuni . 28d, 28d, . .A2A2 .A2C.C. jejuni C. jejuni . L2L226d, . L2 jejuni . 26d, 26d, . .A3A3 .A3C.C. jejuni C. jejuni . L2L226d, . L2 jejuni . 26d, 26d, . .A1A1 .A1C.C. . L1L137d, . L1 colicoli C. coli . 37d, 37d, . .A4A4 .A4C.C. jejuni C. jejuni . L2L226d, . L2 jejuni . 26d, 26d, . A14 .A14 jejuni C. jejuni . L12 L12 . 19d, L12 .A14 C.C. jejuni . 19d, 19d, . A15 .A15 jejuni C. jejuni . L12 L12 . 19d, L12 .A15 C.C. jejuni . 19d, 19d, . .A9A9 .A9C.C. jejuni C. jejuni . L7L728d, . L7 jejuni . 28d, 28d, . .A7A7 .A7C.C. . L6L630d, . L6 colicoli C. coli . 30d, 30d, . .A8A8 .A8C.C. . L6L630d, . L6 colicoli C. coli . 30d, 30d, . A16 .A16 . L7L728d, . L7 .A16 C.C. colicoli C. coli . 28d, 28d, . A10 .A10 jejuni C. jejuni . L7L728d, . L7 .A10 C.C. jejuni . 28d, 28d, . A13 .A13 jejuni C. jejuni . L7L732d, . L7 .A13 C.C. jejuni . 32d, 32d, . A12 .A12 . L7L732d, . L7 .A12 C.C. colicoli C. coli . 32d, 32d, . .A6A6 .A6C.C. . L4L414d, . L4 colicoli C. coli . 14d, 14d, . .A5A5 .A5C.C. . L3L335d, . L3 colicoli C. coli . 35d, 35d, Figura 1. Dendrograma de PFGE de los aislados de C. jejuni y C.coli de la granja A. La similitud entre aislados se evaluó mediante el coeficiente de Dice (tolerancia 1%, optimización 1%) y el método UPGMA. Los recuadros señalan los clusters que agrupan aislados con un nivel de similitud ≥ 90%. En la granja E se identificaron un total de 24 perfiles diferentes de macroresctrición (Figura 2), detectándose entre 1 y 5 cepas diferentes por lote; se detectó un mismo perfil en 4 lotes diferentes no consecutivos (lotes 2, 4, 7 y 9) y otro común a dos lotes consecutivos (lotes 11 y 12). No se detectó ninguna cepa común a las dos granjas estudiadas. PFGE SmaI+PFGE KpnI PFGE SmaI+PFGE KpnI SmaI&KpnI SmaI&KpnI PFGE SmaI PFGE SmaI PFGE KpnI PFGE KpnI KpnI SmaI&KpnI SmaI&KpnI Aislado Especie . ES12 C. . jejuni ES12 C. . jejuni 22d, L4 . 22d, L4 . ES15 C. . jejuni ES15 C. . jejuni 28d, L4 . 28d, L4 . ES20 C. . jejuni ES20 C. . jejuni 23d, L9 . 23d, L9 . ES14 C. . jejuni ES14 C. . jejuni 28d, L4 . 28d, L4 . ES13 C. . jejuni ES13 C. . jejuni 28d, L4 . 28d, L4 . ES23 C. . coli ES23 C. . coliL10 25d, . 25d, L10 . ES18 C. . jejuni ES18 C. . jejuni 21d, L5 . 21d, L5 . ES7 C. . jejuni ES7 C. . jejuni 28d, L2 . 28d, L2 . ES8 C. . jejuni ES8 C. . jejuni 28d, L2 . 28d, L2 . ES6 C. . jejuni ES6 C. . jejuni 28d, L2 . 28d, L2 . ES16 C. . jejuni ES16 C. . jejuni 28d, L4 . 28d, L4 . ES21 C. . jejuni ES21 C. . jejuni 28d, L9 . 28d, L9 . ES19 C. . jejuni ES19 C. . jejuni 20d, L7 . 20d, L7 . ES17 C. . jejuni ES17 C. . jejuni 21d, L5 . 21d, L5 . ES4 C. . jejuni ES4 C. . jejuni 27d, L1 . 27d, L1 . ES9 C. . jejuni ES9 C. . jejuni 28d, L2 . 28d, L2 . ES10 C. . jejuni ES10 C. . jejuni 33d, L3 . 33d, L3 . ES11 C. . jejuni ES11 C. . jejuni 33d, L3 . 33d, L3 . ES1 C. . jejuni ES1 C. . jejuni 23d, L1 . 23d, L1 . ES3 C. . jejuni ES3 C. . jejuni 27d, L1 . 27d, L1 . ES2 C. . jejuni ES2 C. . jejuni 23d, L1 . 23d, L1 . ES25 C. . jejuni ES25 C. . jejuni 31d, L11 . 31d, L11 . ES26 C. . jejuni ES26 C. . jejuni 25d, L12 . 25d, L12 . ES27 C. . jejuni ES27 C. . jejuni 25d, L12 . 25d, L12 . ES28 C. . jejuni ES28 C. . jejuni 29d, L12 . 29d, L12 . ES22 C. . coli ES22 C. . coliL9 28d, . 28d, L9 . ES24 C. . coli ES24 C. . coliL10 25d, . 25d, L10 . ES23 C. . coli ES23 C. . coliL9 28d, . 28d, L9 . ES5 C. . jejuni ES5 C. . jejuni 27d, L1 . 27d, L1 Edad/Lote 100 90 95 80 95 85 100 85 70 90 75 80 65 70 55 75 60 60 65 50 50 55 SmaI Figura 2. Dendrograma de PFGE de los aislados de C. jejuni y C.coli de la granja E. La similitud entre aislados se evaluó mediante el coeficiente de Dice (tolerancia 1%, optimización 1%) y el método UPGMA. Los recuadros señalan los clusters que agrupan aislados con un nivel de similitud ≥ 90%. 193 La diversidad de cepas detectada en ambas granjas puede ser un reflejo de una diversidad de fuentes de Campylobacter en el medio ambiente exterior de las naves, que directa o indirectamente, pueden introducir dicho agente en las naves de pollos. Por otro lado, la colonización de diversos lotes con una misma cepa es indicativa de una insuficiente bioseguridad en la granja, especialmente a nivel de nave, donde algunas cepas que se mantienen en el medioambiente exterior de las naves a lo largo de diversas crianzas son introducidas a las naves de forma sucesiva. Se descarta la posibilidad de que alguna cepa sobreviva dentro de la nave entre crianzas, puesto que la limpieza y desinfección que se realiza en cada vacío sanitario elimina cualquier Campylobacter presente. Por otro lado, los pollitos de un día procedentes de las incubadoras, que se crían en cada nave están libres de dicho agente zoonótico. Así pues, un primer paso para el control de Campylobacter en granjas de pollos de engorde sería establecer unas sencillas pero estrictas medidas de bioseguridad, tanto a nivel de granja como a nivel de nave. Referencias EFSA (European Food Safety Authority) and ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control) (2015) The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 2013. EFSA Journal 2015; 13(1):3991 URDANETA S., R. DOLZ, S. LÓPEZ-SORIA, M. CERDÀ-CUÉLLAR. (2013) Dynamics of Campylobacter spp. infection in Spanish broiler farms: a longitudinal 18-months study. 17th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms (CHRO 2013). Aberdeen, p. 100. WHO. (2012). The global view of campylobacteriosis. Report of an expert consultation. Utrecht, Netherlands, 9-11 July 2012. 194