beca predoctoral fpi2013
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beca predoctoral fpi2013
OFERTA DE BECA PRE-DOCTORAL El Dr. Elia Campo del grupo de “Oncomorfología Funcional Humana y Experimental” de la Unidad de oncología y Hematología del Hospital Clínico de Barcelona, busca un/a licenciado/a para trabajar en un proyecto de investigación sobre las mutaciones somáticas en Neoplasias linfoides. Nuestro laboratorio está interesado en secuenciar a gran cobertura todo el exoma de 16 MCL convencional e indolente seleccionados para identificar mutaciones somáticas y de todo el genoma de 7 tumores para identificar variaciones estructurales. El impacto funcional, patológico y clínico de estas mutaciones somáticas serán validados en líneas celulares y una gran serie de tumores primarios. La investigación combina técnicas de Next Generation Sequencing (NGS), FISH, cultivos celulares primarios y de líneas celulares, biología molecular y bioquímica. Publicaciones recientes representativas: 1. Puente XS, Pinyol M, Quesada V, Conde L, Ordóñez GR, Villamor N, Escaramis G, Jares P, Beà S, González-Díaz M, Bassaganyas L, Baumann T, Juan M, López-Guerra M, Colomer D, Tubío JM, López C, Navarro A, Tornador C, Aymerich M, Rozman M, Hernández JM, Puente DA, Freije JM, Velasco G, Gutiérrez-Fernández A, Costa D, Carrió A, Guijarro S, Enjuanes A, Hernández L, Yagüe J, Nicolás P, Romeo-Casabona CM, Himmelbauer H, Castillo E, Dohm JC, de Sanjosé S, Piris MA, de Alava E, Miguel JS, Royo R, Gelpí JL, Torrents D, Orozco M, Pisano DG, Valencia A, Guigó R, Bayés M, Heath S, Gut M, Klatt P, Marshall J, Raine K, Stebbings LA, Futreal PA, Stratton MR, Campbell PJ, Gut I, López-Guillermo A, Estivill X, Montserrat E, López-Otín C*, Campo E*. Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia. Nature; PMID: 21642962. 2. Quesada V, Conde L, Villamor N, Ordóñez GR, Jares P, Bassaganyas L, Ramsay AJ,Beà S, Pinyol M, Martínez-Trillos A, López-Guerra M, Colomer D, Navarro A, Baumann T, Aymerich M, Rozman M, Delgado J, Giné E, Hernández JM, González-Díaz, M, Puente DA, Velasco G, Freije JM, Tubío JM, Royo R, Gelpí JL, Orozco M, Pisano DG, Zamora J, Vázquez M, Valencia A, Himmelbauer H, Bayés M, Heath S, Gut M, Gut I, Estivill X, López-Guillermo A, Puente XS, Campo E*, López-Otín C*. Exome sequencing identifies recurrent mutations of the splicing factor SF3B1 gene 3. 4. 5. 6. 7. in chronic lymphocytic leukemia. Nat Genet; PMID: 22158541; Royo C, Navarro A, Clot G, Salaverria I, Giné E, Jares P, Colomer D, Wiestner A, Wilson WH, Vegliante MC, Fernandez V, Hartmann EM, Trim N, Erber WN, Swerdlow SH, Klapper W, Dyer MJ, Vargas-Pabón M, Ott G, Rosenwald A, Siebert R, López-Guillermo A, Campo E, Beà S. Non-nodal type of mantle cell lymphoma is a specific biological and clinical subgroup of the disease. Leukemia; PMID: 22425896. Navarro A, Clot G, Royo C, Jares P, Hadzidimitriou A, Agathangelidis A, Bikos V, Darzentas N, Papadaki T, Salaverria I, Pinyol M, Puig X, Palomero J, Vegliante MC, Amador V, Martinez-Trillos A, Stefancikova L, Wiestner A, Wilson W, Pott C, Calasanz M, Trim N, Erber W, Sander B, Ott G, Rosenwald A, Colomer D, Giné E, Siebert R, López-Guillermo A, Stamatopoulos K, Beà S, Campo E. Molecular subsets of mantle cell lymphoma defined by the IGHV mutational status and SOX11 expression have distinct biological and clinical features. Cancer Res; PMID: 22915760. Kulis M, Heath S, Bibikova M, Queirós AC, Navarro A, Clot G, MartínezTrillos A, Castellano G, Brun-Heath I, Pinyol M, Barberán-Soler S, Papasaikas P, Jares P, Beà S, Rico D, Ecker S, Rubio M, Royo R, Ho V, Klotzle B, Hernández L, Conde L, López-Guerra M, Colomer D, Villamor N, Aymerich M, Rozman M, Bayes M, Gut M, Gelpí JL, Orozco M, Fan JB, Quesada V, Puente XS, Pisano DG, Valencia A, López-Guillermo A, Gut I, López-Otín C, Campo E, Martín-Subero JI. Epigenomic analysis detects widespread gene-body DNA hypomethylation in chronic lymphocytic leukemia. Nat Genet; PMID: 23064414. Vegliante MC, Palomero J, Pérez-Galán P, Roué G, Castellano G, Navarro A, ClotG, Moros A, Suárez-Cisneros H, Beà S, Hernández L, Enjuanes A, Jares P, Villamor N, Colomer D, Martín-Subero JI, Campo E, Amador V. SOX11 regulates PAX5expression and blocks terminal B-cell differentiation in aggressive mantle celllymphoma. Blood; PMID: 23321250. Vegliante MC, Royo C, Palomero J, Salaverria I, Balint B, Martín-Guerrero I, Agirre X, Lujambio A, Richter J, Xargay-Torrent S, Bea S, Hernandez L, Enjuanes A, Calasanz MJ, Rosenwald A, Ott G, Roman-Gomez J, Prosper F, Esteller M, Jares P, Siebert R, Campo E, Martín-Subero JI, Amador V. Epigenetic Activation of SOX11 in Lymphoid Neoplasms by Histone Modifications. PLoS One; PMID 21738649. Fernàndez V, Salamero O, Espinet B, Solé F, Royo C, Navarro A, Camacho F, Beà S, Hartmann E, Amador V, Hernández L, Agostinelli C, Sargent RL, Rozman M, Aymerich M, Colomer D, Villamor N, Swerdlow SH, Pileri SA, Bosch F, Piris MA, Montserrat E, Ott G, Rosenwald A, López-Guillermo A, Jares P, Serrano S, Campo E. Genomic and gene expression profiling defines indolent forms of mantle cell lymphoma. Cancer Res; PMID: 20124476. REQUERIMIENTOS Master o Grado de Licenciatura en relación con la Biomedicina (Biología, Bioquímica, Farmacia, etc.) Motivación por la investigación básica. FINANCIACIÓN El candidato solicitará una ayuda predoctoral FPI del Ministerio de Economía Y competitividad (MINECO). CONTACTO Enviar CV con la nota media del expediente académico a la Dra. Virginia Amador ([email protected]) Telf.: 2275400 (ext. 4582). Centro Esther Koplowitz (CEK), 2ª planta, lab. 2.5. C/ Rosselló 153, 08036 Barcelona http://www.idibaps.org/recerca/103/oncomorfologia-funcional-humana-iexperimental Fecha límite: 9 de Septiembre de 2013 Barcelona, 19 de Agosto de 2013 INSTITUT D’INVESTIGACIONS BIOMÈDIQUES DE BARCELONA