Estudio in silico de la interacción entre el anti

Estudio in silico de la interacción entre el anti

ESTUDIO IN SILICO DE LA INTERACCIÓN ENTRE EL ANTI-ACTIVADOR TRAM CON
EL ACTIVADOR TRANSCRIPCIONAL TRAR DE AGROBACTERIUM TUMEFACIENS.
Leonardo Mokarzel Falcón,1,2 Juan Alexander Padrón García,2 Marcia Rojas Badía.1
1. Departamento de Microbiología y Virología, Facultad de Biología, Universidad de La
Habana, 10400, Habana, Cuba, [email protected].
2. Laboratorio de Química Computacional y Teórica, Facultad de Química, Universidad de
La Habana, 10400, Habana, Cuba, [email protected].
RESUMEN
La transferencia del plásmido inductor de tumores (Ti) en Agrobacterium tumefaciens
constituye un proceso regulado estrictamente por un sistema quorum-sensing del tipo
LuxRI, cuyos componentes principales son el activador transcripcional TraR y su autoinductor. Este sistema le permite a la bacteria sincronizar la infección de la planta cuando
se ha alcanzado una concentración celular crítica (quorum). TraM es una proteína de A.
tumefaciens relacionada con la regulación de este sistema. Esta se une con una elevada
afinidad al complejo TraR-inductor, impidiendo de esta forma su unión a la secuencia
reguladora en el ADN bacteriano. Existen varias hipótesis contradictorias sobre la
geometría del complejo formado entre estas proteínas, todas basadas en el conocimiento
de las estructuras cristalográficas del activador y el anti-activador por separado. Nuestro
estudio propone modelos computacionales para el complejo TraR/ TraM, mediante el
empleo de metodologías de docking macromolecular, y además profundiza en el
conocimiento del número de moléculas de cada proteína involucradas en la interacción.