Diapositiva 1 - Genética y Biología Molecular
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Diapositiva 1 - Genética y Biología Molecular
Universidad Nacional Autónoma de México Facultad de Química Curso Genética y Biología Molecular (1630) Licenciatura Químico Farmacéutico Biológico Dra. Herminia Loza Tavera Profesora Titular de Carrera Departamento de Bioquímica Lab 105, Edif E 5622-5280 [email protected] VII. CÓDIGO GENÉTICO. TRADUCCIÓN Y PROCESAMIENTO DE PROTEÍNAS. • Objetivo general – El alumno conocerá el proceso de traducción de los mRNAs basado en la universalidad del código genético y comprenderá su importancia dentro del contexto de la expresión genética, dado que la síntesis de proteínas es el paso final requerido para realizar la función del gen correspondiente. Comprenderá las diferencias de este proceso en organismos procariontes y eucariontes y su regulación. Objetivos particulares El alumno... 5. Procesamiento de proteínas y modificación posttraduccional. 5.1. Conocerá los diferentes tipos de modificaciones posttraduccionales y su relevancia para regular la funcionalidad y localización de las proteínas celulares. 5.2. Discutirá la importancia del direccionamiento adecuado de las proteínas desde el mismo momento de su síntesis. 5.3. Definirá las enzimas necesarias para el plegamiento correcto de las proteínas que están siendo sintetizadas por el aparato traduccional. 5.4. Examinará el mecanismo de degradación de proteínas, el papel de la ubiquitinación y la variación del tiempo de vida media de las proteínas. Conoci- Compren- Aplicamiento sión ción X X X X 5. Procesamiento de proteínas y modificaciones post-traduccionales Las proteínas después de sintetizadas en los ribosomas, deben ser procesadas para que logren tener su conformación nativa y ser activas Eventos involucrados: Plegamiento correcto Procesamiento co- y post-traduccional Ubicación subcelular De la proteína sintetizada a la proteína funcional En algunos casos los dominios protéicos se forman desde que las proteínas se sintetizan Plegamiento (folding) de proteínas Desnaturalización y renaturalización de proteínas Desnaturalización de proteínas Etapas para alcanzar el estado nativo Otras proteínas requieren de chaperonas moleculares para adquirir su plegamiento correcto Algunas proteínas que no se pliegan correctamente pueden formar estructuras amiloides El plegamiento de algunas proteínas es asistido por chaperonas Plegamiento en ausencia y en presencia de chaperonas Existen dos sistemas de chaperonas Chaperonas individuales Chaperonas oligoméricas Mecanismo de las chaperonas moleculares HSP70 Algunas proteínas son plegadas con la ayuda de otras proteínas (DnaJ, DnaK) Mecanismo de la chaperona HSP60/HSP10 (GroEL/GroES) Algunas proteínas son plegadas por el sistema GroEL/GroES GroEL/GroES Formación de puentes disulfuro PDI: proteína disulfuro isomerasa Procesamiento Co- y Posttraduccionales de las proteínas Eliminación de residuos N-terminales (f-Met en bacteria; Met en eucariontes) Modificación de aminoácidos • • • • • • • • Acetilación (Lys, Arg en histonas; cambia la función) Fosforilación (Ser, Thr, Tyr; transducción de señales, actividad) Metilación (Lys, Arg en histonas; cambia función) Carboxilación (Lys, Pro en colágeno, estabilidad estructural) Glicosilación (Asn; Thr; receptores de hormonas, anticuerpos) Nucleotidilación (Tyr; adición de AMP regula actividad) Lipidación (Gly, Cys; localización en membrana) Ubiquitinación (Lys; degradación localización, función) Proteólisis (pro-insulina a insulina; actividad) Adición de grupos prostéticos (grupo hemo, hemoglobina) Modificación covalente de aminoácidos Modificación post-traduccional por fosforilación ATP ADP fosforilación cinasa Proteína desfosforilación fosfatasa P P Proteína La fosforilasa b se convierte a su forma activa (fosforilasa a) por fosforilación. Ésta es llevada a cabo por una cinasa. Para que la fosforilasa a vuela a ser inactiva es necesario desfosforilarla. Esto lo realiza una fosfatasa. Diferentes cinasas reconocen diferentes secuencias consenso, dentro de las cuales fosforilan un determinado aminoácido Secuencias consenso para proteína cinasas Efecto de la fosforilación en la glicógeno sintasa Sitios de fosforilación en la glicógeno sintetasa ligando Insulina Factor de crecimiento Transducción de señales mediada por fosforilación receptor ATP ADP P Cinasa 1 Cinasa 1 activa inactiva Cascada de fosforilaciones ATP ADP P P Cinasa 2 inactiva Cinasa 2 activa ATP ADP P P Cinasa 3 inactiva P Cinasa 3 activa Proteína inactiva P Proteína activa Respuesta celular La fosforilación es una modificación post-traduccional covalente y reversible Clasificación de las cinasas: Ser/Thr cinasas Tyr cinasas His cinasas Cys cinasas Asp/Glu cinasas Aminoácidos fosforilables: -OH serina; treonina; tirosina -NH arginina; histidina; lisina -SH cisteína -COO- aspártico; glutámico Defosforilación por fosfatasas: Ser/Thr Tyr PP1 PP4 PTP1B PP2A PP5 PP2B PP6 PP2C Funciones de la fosforilación • Regulación de la proliferación celular/ oncogénesis • Diferenciación celular • Control del ciclo celular • Forma celular y adhesión • Transducción intracelular de señales • Control metabólico • Regulación de la transcripción • Regulación de canales iónicos • Regulación de la traducción Metilación, fosforilación y acetilación de histonas Regulan la transcripción en eucariontes Proteólisis de zimógenos Algunas proteínas deben ser cortadas por proteasas para ser activas Direccionamiento de las proteínas a la localización celular adecuada Algunas secuencias señal (péptidos de tránsito) que determinan el destino de las proteínas KDEL Direccionamiento co-traduccional de proteínas destinadas a retículo endoplásmico Secuencia señal (amino-terminal) Complejo SRP•GDP reconoce la secuencia señal Receptor de SRP en la membrana de RE unión a GTP, hidrólisis y liberación de SRP El retículo endoplásmico rugoso tiene adosados los ribosomas Una vez que cumple su función, el péptido señal es cortado Inserción co-traduccional de proteínas a membrana Glicosilación co-traduccional de proteínas destinadas a retículo endoplásmico Glicosilación post-traduccional de proteínas en aparato de Golgi RER cis-Golgi media-Golgi Golgi trans-Golgi lisosoma vesícula secretora membrana Tipos de glicosilación N-glicosilación RE (residuo Asn) O-glicosilación Golgi (residuos Ser/Thr) Tráfico a lisosomas Lisosomas (animales) Vacuola (plantas) Sitio de degradación, pH 5, enzimas hidrolíticas Modificación de proteínas para Lisosomas: Manosa-6-fosfato Direccionamiento a mitocondria Las proteínas tienen señal amino-terminal Deben ser desplegadas por chaperonas del citoplasma Atraviesan dos membranas por los translocadores TOM y TIM) En la matriz mitocondrial otra chaperona vuelve a plegar la proteína Direccionamiento a cloroplasto Las proteínas tienen señal amino-terminal Proceso de translocación similar a mitocondria (TOC y TIC) Desplegado y plegado similar a mitocondria Soll & Shleiff, 2004 Direccionamiento a núcleo Señal de localización nuclear (NLS) Señal de exportación nuclear (NES) Importinas y CAS Ran-GTP Ran-GDP Conti et al., 2006 Curr Opin Struct Biol Ubiquitinación de proteínas Biochem. J. (2004) 379 (513– 525) Diferentes funciones de la ubiquitinación proteosoma degradación Internalización membrana Tráfico por endosomas Activa reparación de DNA proteosoma degradación Las proteínas deben ser poli-ubiquitiniladas para ser dirigidas al proteosoma donde serán degradadas Degradación en el proteosoma