PUBMED

Fac. Veterinaria
PUBMED
Es una de las bases de datos bibliográficas más completas en el área
biomédica. Cubre las áreas de medicina, oncología, enfermería, odontología,
veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. Permite el acceso a la base
de datos Medline, compilada por la NLM (Nacional Library of Medicine),
complementada con otras bases de datos como preMedline (citas enviadas
por los editores), Genbak y Complete Genoma.
Contiene más de 15 millones de referencias bibliográficas de artículos de
revista, con una cobertura temporal desde 1950 y se actualiza diariamente.
Medline contiene subbases: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary
Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Dental Journals, Nursing
Journals, PubMed Central que pueden consultarse individualmente pulsando
la opción Limits y seleccionando Subsets.
BUSQUEDA EN PUBMED
Esta base de datos nos da la opción de buscar desde la pantalla principal en
una sola ventana de búsqueda o acceder a la Búsqueda avanzada.
Ventana para
introducir
búsqueda
Búsqueda avanzada
Para cualquier búsqueda necesitaremos conocer los operadores booleanos y
el truncamiento
¿Cómo utilizar los operadores booleanos?
Los operadores booleanos establecen las relaciones entre los términos
cuando elaboramos una estrategia de búsqueda. Distinguimos tres
operadores básicos.
AND El sistema recupera los artículos en los que aparecen todos los
términos que hemos escrito unidos por el operador AND.
P.Ej. Obesity and Diabetes recuperará los artículos cuyo registro contenga
los dos términos
1
OR El sistema recupera los términos unidos por OR tanto si están los dos
juntos como si están separados.
P.Ej. Obesity OR Diabetes recuperará los artículos que traten de obesidad,
de diabetes y de obesidad relacionada con la diabetes. Lógicamente, el
número de artículos recuperados es mucho mayor.
NOT Este operador elimina el segundo término de la búsqueda.
P.Ej. Obesity NOT Diabetes recuperará los artículos que traten de la
obesidad pero no relacionada con la diabetes.
Uso del paréntesis
PubMed entiende los operadores booleanos en la ecuación de búsqueda de
izquierda a derecha. El uso del paréntesis nos permite relacionar un término
con cualquiera de los que están incluidos en el paréntesis.
Por ejemplo
En este caso encontraremos los artículos que contengan el término caballo y el
término anemia en cualquiera de sus dos variantes ortográficas.
Si no se hubiese utilizado el paréntesis el sistema habría unido los términos horse
y anemia y en segundo lugar habría buscado todos los registros que contuviesen
el término anaemia
Otra forma de búsqueda es mediante truncamiento
Para búsquedas más amplias. Se añade a la raiz de la palabra que
buscamos un asterisco * . De esta forma el sistema buscará las palabras
que tengan esa raiz.
P. Ej.
Cardio* encontrará las palabras que comiencen por Cardio- (cardiology,
cardiovascular, cardiopathology...)
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Ventana de búsqueda en la página principal
Para iniciar la búsqueda en PubMed introducimos el/los término/s o frase
buscada en el formulario de búsqueda y pulsamos Go.
Si introducimos varios términos o un concepto compuesto por más de una
palabra, PubMed combina automáticamente los términos con AND. Si
queremos buscar una frase exacta, la escribiremos entre comillas.
Buscar por un campo concreto
Cada campo de un registro bibliográfico se identifica con una etiqueta de
dos o más letras (identificadores de campo). Si queremos buscar en un
campo concreto desde la página principal, debemos añadir a continuación
del término el identificador de campo entre corchetes [ ]
En este tipo de búsqueda el identificador de campo se puede escribir
indistintamente en mayúsculas o minúsculas y tampoco importa si hay
espacio o no entre el término y los corchetes.
P.Ej. Tuberculosis [TI] AND nunn [AU]
Los identificadores de campo más frecuentes son:
[ALL] Todos los campos
[AU, AUTH] Autor
[TI, TITL] Palabras del título
[TA, JOUR] Nombre de la publicación (revista)
[MH, MESH] Término Mesh. Los términos Mesh es vocabulario controlado
(Tesauro) de términos biomédicos que se usan como descriptores de cada
artículo.
[PS] Nombre personal Busca artículos sobre un individuo como tema
[TW,WORD] Palabras del texto Recupera artículos en los que el término
elegido aparece en titulo, resumen, términos Mesh, subencabezamientos,
nombres de substancias químicas, nombre de persona como tema y campos
de identificación secundaria.
[LA, LANG] Idioma. Idioma en el que se publicó el artículo
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Búsqueda avanzada
La finalidad principal de esta búsqueda es combinar varios campos a la vez pero
ofrece todas las posibilidades de las pestañas que encontramos en la pantalla
principal, excepto Clipboard (Límites, índice, historial y detalles)
En la pantalla de búsqueda avanzada, encontramos:
1. Uso de Details
La opción Details, presente en la visualización de resultados, permite ver la
estrategia de búsqueda en la forma en que fue traducida por el mapeo
automático de términos. Puede guardar o editar la estrategia.
Se puede guardar desde el botón URL que nos muestra la dirección de Internet
que contiene la estrategia de búsqueda y luego guardarla como favorito o
bookmark
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2. Historial de búsqueda
Vemos todas las búsquedas que ya hemos realizado con acceso a los
resultados
3. Formulario de búsqueda
Posibilidad de buscar por campos y combinarlos.
Si está marcado All of these combinará los términos con AND
Si está marcado Any of these combinará los términos con OR
Add more citation Search fields nos permite añadir nuevos campos a la búsqueda.
Por defecto nos añadirá los campos de título, volumen, número y páginas de la
publicación
Posibilidad de añadir
nuevos campos
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Los campos que pueden tener índice (autor, título de publicación, idioma,
autor corporativo …), lo encontramos en el propio campo de búsqueda
pulsando en Index
En el caso concreto de autores si buscamos un autor concreto debemos
escribirlo entre comillas “Smith AT”. De otro modo si elegimos el término
Smith A. para nuestra búsqueda encontrará todos los autores que que
tengan una A en sus iniciales.
En el caso de los títulos de revista, la introducción de un término del título
de la publicación hará que la base de datos nos dé información sobre las
revistas que tienen ese término en su título
4. Establecer LIMITES
Los límites de autores, publicación o fecha los establecemos en la búsqueda
por campos.
En el caso de la fecha de publicación la pestaña de la página principal nos
permite otras opciones que la búsqueda avanzada
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Limitar la fecha de publicación del artículo
Limitar la fecha en que el artículo se añadió a PubMed
En ambos casos un menú desplegable nos permite elegir periodo de tiempo
entre los últimos 30 días y los últimos 10 años, o bien elegir una fecha
concreta en Specify date range.
Esta opción nos permite limitar la fecha a dos años, o dos fechas, concretas
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Los límites de la búsqueda avanzada, nos permiten limitar los siguientes
conceptos
Full text, Free full text and Abstract
Permite acotar la búsqueda a los artículos que estén a texto completo, a
texto completo gratuito o que proporcionen resumen. En el primer caso lo
más habitual es que el enlace a texto completo nos de información de
dónde adquirir el artículo.
Human or Animal (Humanos o Animales). Permite la selección del
grupo en estudio
Gender (Género). Puede limitar los estudios humanos por género
(maculino o femenino)
Language (Idioma). Nos permite elegir el idioma original del artículo.
Subsets (Subtemas). El menú desplegable de Subsets permite limitar la
búsqueda a diversos temas concretos contenidos en PubMed. Las opciones
son:
● Core clinical Journals: Selección de articulos aparecidos en
revistas relevantes para la práctica médica
● Dental Journals: Limitará la búsqueda a revistas incluidas en el
Index to Dental Literatura
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● Nursing Journals: Limitará la búsqueda a revistas de enfermería
incluidas en el Internacional Nursing Index.
● AIDS: Localiza referencias sobre el SIDA
● Bioethics: Limita la búsqueda a la ética, cuidado de salud e
investigación biomédica.
● Cancer: Limita la búsqueda al campo de la oncología. Incluye las
referencias de la desaparecida base de datos CancerLit del National
Cancer Institute.
● Commplementary medicine. Límita la búsqueda al campo de la
medicina complementaria
● History of medicine. Restringido a la Historia de la medicina.
● Space Life Sciences: Límita a las Ciencias del Espacio. Elaborado
por la NASA.
● Systematic reviews: Limita a artículos de revisión
● Toxicology: Limita la búsqueda a artículos sobre toxicología,
efectos farmacológicos, bioquímicos y fisiológicos de medicamentos y
otras sustancias químicas.
● OldMedline: recupera referencias bibliográficas desde 1959 hasta
1965
● PubMed Central: Colección digital de artículos gratuitos a texto
completo suministrado por las editoriales
Type of article (Tipo de artículo). Permite limitar la búsqueda según el
tipo de estudio publicado
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Ages (Edades). Permite seleccionar un grupo de edad específico en los
estudios humanos
5. Indice por campos
Es otra forma de acceso a los índices igual a la pestaña Indice/preview de la
página principal
Elegimos el campo y en la ventana de búsqueda escribimos el término que
queremos buscar y al pulsar Index nos mostrará el término tecleado y los
que le siguen en la lista. Podemos elegir el término que deseemos y
pulsando Preview o AND lo añade a la estrategia de búsqueda. Se pueden
añadir diversos términos con el operador booleano que elijamos.
Si se quieren seleccionar varios términos lo haremos mediante la tecla
control.
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Visualización de los documentos encontrados
Una vez realizada una búsqueda el sistema nos permite visualizar los
documentos encontrados con diferentes presentaciones.
Por defecto presenta los datos con la presentación de Summary.
Los resultados aparecen de esta forma
Pestaña de
acceso a Limites
Ultimas
búsquedas
realizadas
Artículos
relacionados
En la parte inferior del registro aparecen dos enlaces de interés.
Free article in PMC Si el artículo tiene acceso al texto completo
Related records. Registros relacionados
De los formatos restantes los más habituales son los siguientes:
Brief. Autor y 30 primeros caracteres del título con el PMDI (Nº de
identificación en PubMed)
Abstract. Referencia bibliográfica, enlace con la sede del editor (si está
disponible), status de la cita, título, indicación de si el artículo está en un
idioma que no sea inglés, autores, dirección postal del autor, resumen (si
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está disponible), tipo de publicación (excepto si son artículo de revista),
PMDI
Abstract plus. Ofrece, además, enlaces relacionados directamente en la
pantalla.
Citation. Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación de si el
artículo está en un idioma que no sea inglés, autores, dirección postal del
autor, resumen (si está disponible), tipo de publicación (excepto si son
artículo de revista), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers, y términos
MESH.
MEDLINE Cita completa con etiquetas de 2 letras que identifican cada
campo. Hay que tener en cuenta este tipo de visualización porque será
necesario utilizarla en caso de que queramos gestionar y controlar
las referencias buscadas mediante un programa de gestión de citas.
Uso de los resultados de una búsqueda
Salvar resultados de una búsqueda
Una vez realizada una búsqueda podemos querer guardar el resultado de
ésta. Elegimos los artículos que son de interés y los marcaremos en la
casilla destinada a ello en el margen izquierdo del artículo.
Marco los
registros que
me interesan
Tenemos las siguientes opciones:
Imprimir los resultados desde la opción Imprimir desde el navegador. En
ese caso mejor que estén en formato texto.
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Enviar por e-mail. Elegimos la opción e-mail en Send to y pulsamos este
botón. Elegimos las opciones (formato texto o html) y dirección de correo a
la que los remitimos.
Guardar en un archivo. Para ello seleccionamos File en Send to desde el
menú del navegador Archivo-Guardar
Guardarlos en Clipboard
Si se desean guardar resultados de distintas búsquedas se pueden ir
añadiendo a Clipboard desde Send to, hasta un máximo de 500
referencias y, después, trabajar con ellos
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La finalidad es imprimirlas o enviarlas al final. Se podrán consultar desde
Clipboard en el menú bajo la ventana de búsqueda. Para borrar referencias
se seleccionan en Clipboard y se pulsa Clip remove desde Send to.
El Clipboard se pierde después de 8 horas de inactividad.
Las citas en Clipboard se pueden guardar e imprimir de la misma manera
que las opciones de búsqueda
Si lo que queremos es guardar y gestionar los resultados de ésta y otras
búsquedas deberemos contar con un programa gestor de citas
bibliográficas. Si es así marcaremos lo registros a exportar en un formato
MEDLINE ya que este podrá ser entendido por el programa. Guardamos los
resultados en el Escritorio o en un archivo y después desde el programa
Endnote, Procite... lo importamos para manejarlo y gestionarlo.
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OTRAS OPCIONES DE INTERÉS EN PUBMED
Otras Bases de Datos
El acceso a las siguientes bases de datos está disponible encima del
formulario de búsqueda.
Nucleotide: Secuencias de ADN del GenBank
Protein: Secuencias de aminoácidos (proteínas)
Genome: Acceso a citas y gráficos del genoma completo y cromosomas.
Structure: Estructuras moleculares en 3-D de la Molecular Modeling
Database (MMDB)
PM PubMed Central: Archivo digital gratuito de artículos de revista a texto
completo.
Taxonomy: Bae de datos que contiene los nombres de todos los organismos
que se encuentran representados en todas las bases de datos genéticas.
OMIM Online Mendelian Inheritance in Man: Base de datos de genes
humanos y alteraciones genéticas.
En el menú de la izquierda nos da acceso a otras opciones de interés. De la
parte que se refiere a Recursos relacionados (Related Resources)
destacaremos
Artículos a texto completo
Podemos hacer una búsqueda sólo en
artículos que estén a texto completo
con acceso gratuíto haciendo la
consulta
en
PubMed
Central
Podemos elegir esta opción en los
Límites a través de Subsets o bien en
el menú lateral de la parte izquierda.
Servicios de Pubmed
De la parte que se refiere a Servicios
de
PubMed
(PubMed
Services)
destacaremos
Mesh
Database,
Journals Database, Single Citation,
Clinical Queries y My NCBI
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Mesh Database
El Medical Subject Headings (Descriptores de Ciencias de la Salud) es un
vocabulario controlado de términos biomédicos que identifican el contenido
de cada artículo en la base de datos Medline.
Recoge más de 33.000 términos en una estructura jerárquica a partir de 15
grandes
categorías.
Estos
términos
pueden
restringirse
con
subencabezamientos.
Es útil para saber los términos que utiliza la base de datos. Nos orientará
igualmente sobre términos relacionados con el de nuestra búsqueda.
Cuando introducimos un término que no es MESH, el sistema nos mostrará
el término aceptado. P. Ej. Si buscamos “Mongolism”, el término que nos
mostrará como aceptado será “Down syndrome”.
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Si pinchamos en el término ofrece una descripción de éste, seguido de los
Subheadings (Subencabezamientos que pueden acompañarle), la
posiblidad de limitarlo al “Major Topic” (tema principal en el artículo) o
bien “Do not explode this term” (no dividir este termino en otros más
específicos)
Desde Links añadirá el término elegido a la ventana de búsqueda de
Pubmed si así lo señalamos.
También podemos seleccionar el término en la casilla de la
izquierda y pulsar Send to – Search box with AND, OR o NOT
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Para comenzar la búsqueda hay que pulsar “Search PubMed”
Single Citation Matcher
Es de utilidad para la búsqueda de referencias concretas. Nos permite
buscar en una publicación por su título, año de publicación, volumen... y
también por autor y título del artículo.
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Clinical Queries
Es un buscador especializado que tiene incorporados filtros para diversas
búsquedas especializadas:
- Search by Clinical Study Category
- Find Systematic Reviews
- Medical Genetics Searches
Clinical Study Category
Propone 5 categorías: Therapy (terapéutica), diagnosis (diagnóstico),
etiology (etiología), prognosis (pronóstico) y Clinical prediction guides
Systematic reviews
Localiza los artículos de revisiones sistemáticas y meta-análisis, revisiones
de ensayos clínicos, conferencias de consenso, guías de práctica clínica …
Medical Genetics
Recupera registros relacionados con la genética médica. Se pueden aplicar
diferentes criterios de búsqueda: diagnosis, diagnosis diferencial, pruebas
genéticas …
Journal Database
Esta opción permite buscar las revistas indizadas en PubMed por diversos
criterios: título, abreviatura del título o ISSN (Internacional Standard Serial
Number)
correspondiente.
También
podemos
consultarlas
por
especialidades, o bien aquellas que permiten acceder al texto completo
desde PubMed.
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Por ejemplo la revista “Advances in Cancer Research” podrá localizarse por
su título completo, por el título abreviado (Adv. Cancer res.) o por su ISSN
0065-230X
Una vez recuperada una revista podemos recuperar todas las referencias
que haya en ella pulsando Links y seleccionando PubMed
My NCBI
Para activar la opción “My NCBI” es necesario registrarse previamente. Para
ello pulsaremos Register en el recuadro de la parte superior derecha de la
página
Si ya somos usuarios registrados, para activar la opción de “My NCBI”,
debemos introducir nuestras claves en Sing in
Mi perfil en PubMed me permite, además de crear las alertas de búsqueda,
establecer una personalización
Mis búsquedas, colecciones y
bibliográfias guardadas
Mis filtros establecidos
Mis preferencias: formato del
registro, marcar términos de
búsqueda …
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Destacamos:
1. Guardar la búsqueda y recibir alertas
Salvar
búsquedas
Una vez
salvada la
búsqueda,
me da la
opción de
crear alerta
sobre la
búsqueda
para recibirla
en el correo
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2. Establecer hasta 5 filtros personalizados
Para visualizar los filtros que PubMed permite aplicar tus búsquedas
. Como filtros más utilizados aparecen:
personalizadas pulsamos el icono
●
●
●
●
●
●
●
●
●
Articles that review the literature on a subject (Artículos de revisión)
Clinical trial (Ensayos clínicos)
English (En lengua inglesa)
English and Human (En lengua inglesa y limitado a humanos)
Free full text (Texto completo gratis)
Full text (Acceso web a texto completo pero puede exigir suscripción)
Humans (Limitado a humanos)
Items with abstract (Artículos con resumen)
Published in the last 5 years (Artículos publicados en los últimos 5 años)
La pestaña Browse nos permite modificar las opciones de este filtro y
establecer filtros personalizados:
● Linkout: permite accedeer a filtros externos incluido la colección de
revistas de una biblioteca. Para ver la relación de Centros que han activado
esta opción, pulsar Libraries. Las opciones de acceso a los textos
completos esta disponible en Miscellaneous
● Links: vínculos a otras bases de datos
● Properties: filtro por áreas de interés: edades, género, idioma, tipos de
estudio, fecha de publicación, áreas de interés (enfermería, odontología …)
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El establecer unos límites en mi perfil permite ver en la página de búsqueda
pestañas que nos llevan a un nº distinto de resultados según el límite
establecido. En este caso se han establecido 3 posibles límites (para
artículos a texto completo, publicados en los últimos 5 años y que estén en
español.)
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